![Page 1: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/1.jpg)
Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu
Benjamín Skála
vedoucí práce: Václav Hypša
![Page 2: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/2.jpg)
Endosymbionti hmyzu
• bakterie žijící v tělních buňkách
• primární X sekundární
Moran, 2006
![Page 3: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/3.jpg)
P-endosymbionti
• mutualistický vztah s hostitelem
• vertikální přenos
• redukce genomu
• koevoluce s hostitelem
• Buchnera, Wigglesworthia, Blochmannia
![Page 4: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/4.jpg)
![Page 5: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/5.jpg)
Molekulární fylogenetika
• metodologické problémy:• vysoký obsah AT• potenciální horizontální přenos genů
• příbuzenské vztahy jsou zatím nejasné
![Page 6: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/6.jpg)
groEL Herbeck et al., 2005
![Page 7: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/7.jpg)
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
![Page 8: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/8.jpg)
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.
![Page 9: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/9.jpg)
Flegr, 2005
![Page 10: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/10.jpg)
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.
• Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím horizontálního přenosu genů (HGT) u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)
![Page 11: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/11.jpg)
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.
• Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)
• Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete.
![Page 12: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/12.jpg)
Otázky
• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??
• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.
• Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)
• Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete.• Jaké symbiotické „houbovité organismy“ byly nalezeny u mšic?
![Page 13: Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062321/56812b1f550346895d8f17de/html5/thumbnails/13.jpg)
Xet-Mull, 2004
Některé mšice tribu Cerataphidini obsahují tzv. YLS – yeast-like symbiont
vřeckovýtrusné houby (Ascomycota),Sordariomycetes
Hypomyces lactifluorum