![Page 1: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/1.jpg)
Projektgruppen
Jørn Pedersen
Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, Jukka Pösö
Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand
NAV avlsværdital for HoldbarhedJørn Pedersen og Anders Fogh
![Page 2: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/2.jpg)
Oversigt
• NAV-holdbarhedsprojektet
• Hvilke data indgår – og hvordan
• Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer
• Resultater, ændringer
• Base
• Udvikling over tid (trends)
• Korrelationer mellem det gamle og nye indeks
• Relation til andre egenskaber
• Værdi i NTM
2
![Page 3: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/3.jpg)
Tidligere anvendte holdbarhedsmodeller
• DNK, FIN: Funktionel holdbarhed = ydelseskorrigeret
Overlevelsesmodel (“Survival KIT”)
• SWE: Produktiv holdbarhed = ikke korrigeret for ydelse
Lineær model med 3 egenskaber:
• Overlevelse til 2. laktation – enten-eller egenskab
• Overlevelse til 3. laktation – enten-eller egenskab
• Overlevelse til 4. laktation – enten-eller egenskab
3
![Page 4: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/4.jpg)
Projektgruppens opgaver
• Formål:
Udvikling af NAV avlsværdital for holdbarhed
• 3 race grupper: RDC, HOL(+DRH), JER• Ens model for alle 3 lande
• Ens genetiske parametre for alle 3 lande
• Produktiv holdbarhed dvs. ukorrigeret for ydelse
4
![Page 5: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/5.jpg)
Opgaver i projektet
• Definition af egenskaben (projektgruppen)
• Model
• Beregning af genetiske parametre Heritabiliteter– genetiske og miljømæssige korrelationer
• Analyser
• “Rekursiv” - proces
5
![Page 6: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/6.jpg)
Holdbarhedsegenskaber
• DAGE11: Dage fra 1. kælving til slutningen af 1. laktation (informationsegenskab)• DAGE12: Dage fra 1. kælving til slutningen af 2. laktation (informationsegenskab)
• DAGE13: Dage fra 1. kælving til slutningen af 3. laktation (avlsværdi)
• DAGE14: Dage fra 1. kælving til slutningen af 4. laktation (informationsegenskab)• DAGE15: Dage fra 1. kælving til slutningen af 5. laktation (informationsegenskab)
Maximalt 365 dage per laktation er inkluderet365 dage per laktation, hvis koen overlever til næste laktation
(dvs. ingen ”straf” for god frugtbarhed)
DAGE13 er den avlsværdi, som bliver omregnet til et indeks og bliver publiceret
6
![Page 7: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/7.jpg)
Edit of data
Oplysninger om kælvninger og afgange kombineres
• Kun 1. til 5. laktation anvendes
• Køer, der indgår, har kælvet efter 1.1.1985 for DNK og SWE - og efter 1.1.1988 for FIN
• Alle køer skal starte med en 1. kælvning
• Alle kælvninger/laktationer, som indgår skal være fra samme besætning
• Efter besætningsskift anses observationerne for at være manglende (det der er i orden slettes ikke)
• Alder ved 1. kælvning skal ligge mellem 450 og 1280 dage • Køer med ukendt fødselsdato indgår ikke
7
![Page 8: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/8.jpg)
“Opportunity” perioderEksempel: Hvis en ko afgår efter 20 dage i en laktation indgår oplysningen IKKE før
den har haft mulighed for at leve 365 dage
“Opportunity” perioder
• DAGE11: Oplysning anvendes først 365 dage efter 1. kælvning
• DAGE12: Oplysning anvendes først 365 dage efter 2. kælvning
• DAGE13: Oplysning anvendes først 365 dage efter 3. kælvning
• DAGE14: Oplysning anvendes først 365 dage efter 4. kælvning
• DAGE15: Oplysning anvendes først 365 dage efter 5. kælvning
Vigtig oplysning:
• Dato for dataudtræk
• Dato for besætningsophør (dato for sidst kendte 1. kælvning)8
![Page 9: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/9.jpg)
Gennemsnit for HOL, RDM og JER med1. kælvning 2000-2004
9
DAGE11 DAGE12 DAGE13 DAGE14 DAGE15
HOL 327 539 659 719 747
RDM 327 541 663 723 751
JER 323 545 685 767 813
Minimum 0 0 0 0 0
Maksimum 365 730 1095 1460 1825
![Page 10: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/10.jpg)
Animal Model Multi-trait med 5 egenskaber
Effekter i modellen• Alder ved 1. kælvning
• Kælvningssæson (år x måned - 1. kælvning)
• Besætning x 5 års periode (år for 1. kælvning)
• Heterosiseffekter (mange hos RDM/RDC)
• Genetiske grupper modelleret som fantom forældre (race x tid)
• Besætning x 1. kælvningsår (tilfældig)
• Ko (tilfældig genetisk effekt)
10
![Page 11: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/11.jpg)
Genetiske parametreHeritabiliteter
11
DAGE11 DAGE12 DAGE13 DAGE14 DAGE15
HOL 0.035 0.052 0.062 0.069 0.072
RDM 0.029 0.044 0.057 0.066 0.072
JER 0.035 0.051 0.060 0.063 0.064
![Page 12: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/12.jpg)
Holstein genetiske korrelationer
RDM og JER: Næsten samme resultater
12
DAGE11 DAGE12 DAGE13 DAGE14 DAGE15
DAGE11 0.94 0.89 0.86 0.84
DAGE12 0.99 0.97 0.96
DAGE13 0.996 0.989
DAGE14 0.998
DAGE15
![Page 13: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/13.jpg)
Oversigt – hvor er vi nået til
• NAV-holdbarhedsprojektet
• Hvilke data indgår – og hvordan
• Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer
• Resultater, ændringer
• Base: Generel ændring – tidsuafhængig
• Trends: Generel ændring – tidsafhængig
• Korrelationer: Individuelle ændringer
• Relation til andre egenskaber
• Værdi i NTM
13
![Page 14: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/14.jpg)
Base ændringerTidligere: Tyre født 15.8.2002 – 15.8.2004August 2010: Køer født 15.8.2005 – 15.8.2007 Skyldes IKKE den nye model
14
Base ændring
VirkningI NTM
HOL ÷6.5 ÷0.72
RDM ÷2.0 ÷0.16
JER ÷5.7 ÷0.68
![Page 15: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/15.jpg)
Holstein – udvikling i holdbarhedsindeks
15
![Page 16: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/16.jpg)
RDM – udvikling i holdbarhedsindeks
![Page 17: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/17.jpg)
Jersey – udvikling i holdbarhedsindeks
17
![Page 18: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/18.jpg)
Korrelationer mellem det gamle og det nye holdbarhedsindeks pr. år
Tyre født 1997-2003
18
HOL RDC JER
DNK 0.81 0.77 0.73
FIN 0.84 0.80
SWE 0.86 0.84
![Page 19: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/19.jpg)
19
![Page 20: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/20.jpg)
Korrelationer pr. årgang: Individuelle ændringerHvorfor så lave korrelationer?
• FIN, DNK:
• Ikke ydelseskorrigeret holdbarhed
• Lineær model versus ”overlevelse” – tidlig afgang lidt tæller mere
• SWE:
• Dage baseret – versus enten-eller
• Dage baseret mod laktationsbaseret (den gamle svenske model havde stor sammenhæng med frugtbarhed)
• Lidt lavere korrelationer i DNK - end i FIN og SWE
• Mange faktorer – ikke en enkelt afgørende faktor20
![Page 21: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/21.jpg)
RDC: Korrelationer med andre indekserGns. pr. år i perioden 1997-2003
YdelseFrugt-barhed
YverSundh.
Andre sygd. Krop Lemmer
Malkeorg.
DNK Gl -0.10 0.10 0.51 0.25 -0.30 0.21 0.32
Nyt 0.24 0.19 0.43 0.28 -0.27 0.13 0.24
FIN Gl -0.27 0.33 0.52 0.31 -0.14 0.11 0.40
Nyt 0.08 0.21 0.40 0.26 -0.02 0.11 0.35
SWE Gl 0.06 0.43 0.31 0.27 -0.06 0.06 0.19
Nyt 0.25 0.25 0.30 0.29 -0.10 0.07 0.19
![Page 22: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/22.jpg)
Korrelationer mellem ny holdbarhed og andre egenskaber
Tyre født 1997-2003
22
YdelseFrugt-barhed
Yver-sund-hed
Andre syg-
domme Krop LemmerMalke-
organer
HOL 0.17 0.42 0.40 0.50 -0.14 0.13 0.25
RDM 0.24 0.19 0.43 0.28 -0.27 0.13 0.24
JER 0.14 0.12 0.47 0.29 -0.15 0.26 0.27
![Page 23: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/23.jpg)
Standardisering af variationTyre født 1997-1998
23
Dage indeholdt i 1 indeksenhed
RDC HOL JER
DAGE11 1.15 1.25 1.34
DAGE12 3.70 4.15 4.09
DAGE13 6.75 7.24 7.12DAGE14 9.43 9.64 9.59
DAGE15 11.29 11.10 11.39
![Page 24: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/24.jpg)
Værdi af holdbarhedindeks i NTMBasal økonomisk værdi er ikke påvirket (kr./dag)
Hvordan kan en ændret metode ændrer værdi/vægt:
• Ændret definition af egenskaben: Principielt uændret
• Ændret indhold af en indeksenhed (standardisering af variationen)
• Specielt for holdbarhed: Overførslen af værdi til Yversundhed, Andre sygdomme, Frugtbarhed, Malkeorganer og Lemmer&klove
Beslutning: Uændret vægtning
(0.11, 0.08, 0.12 for HOL+DRH, RDM og JER)24
![Page 25: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/25.jpg)
Afslutning: NAV-holdbarhed
Ny fælles model er udviklet
• Baseændring – skyldes IKKE den nye model
• Store ændringer i genetisk fremgang
• Lidt store individuelle ændringer
Fremtidsplaner
• Evt. overlevelsesmodel
25
![Page 26: NAV avlsværdital for Holdbarhed Jørn Pedersen og Anders Fogh](https://reader036.vdocuments.pub/reader036/viewer/2022062422/56813569550346895d9ccf5d/html5/thumbnails/26.jpg)
Anerkendelse
Det Europæiske Fællesskab og Fødevareministeriet ved Direktoratet for FødevareErhverv har deltaget i finansieringen af denne aktivitet.
DNA-ordog