NIH-image
Autoradiographie
et analyse d’images
• Ordinateur Mac Quadra 950
• 1 caméra vidéo n&b montée sur macroscope Wild
• 1 caméra vidéo n&b sur scanner
• programme NIH-image
• location:
sous sol salle 127
Matériel
Ordinateur Quadra 950
• Grand écran 20” haute résolution
• 36 MB mémoire RAM
• 1.5 GB espace disque !
• 1 image 380KB
• Lecteur magnéto-optique pour disques 650MB
Caméra vidéo sur macroscope
• résolution 512x768
• macroscope avec table lumineuse stabilisée
• grossissement
x6.5 - x32
avec des lentilles
x3.2 - x64
LI
LII-III
LIV
LV
LVI
SCWM
500 µm
Prise d’image
Caméra vidéo sur scanner
Permet l’importation d’images et de dessins de grande taille:
contours dessinés avec caméra-lucidaphotographies microscopie électronique
NIH-image• grande facilité d’utilisation
• interface pour digitalisation
• toutes fonctions de:– morphométrie– densitométrie
• nombreuses macros et possibilité d’en créer facilement
• Version 1.61, constamment mis à jour
• sur Mac uniquement mais il existe un clône pour PC
area length major axis minor axis1 348183 2426 936 4732 155369 1439 491 4033 199455 1635 546 4654 94775 1179 438 2765 151805 1566 561 3456 160772 1479 530 387
Analyse morphométrique
Autoradiogramme
Micro-échelle:
8 bandes avec différentes concentrations de 14C
Relation entre l’autoradiogramme et la coupe
histologique
DG
dessin
DG
+
dessin
Analyse densitométrique
Analyse quantitative
-40%
-20%
0%
20%
40%
60%
80%
100%
A B C D E C/BD
NOR (n=11) brl (n=8) Tg8 (n=7) C3H (n=4)
0
1540nC i/gr
IV
V
VI
II/III
I
I V
V
V I
I I / I I II
I V
V
V I
I I / I I II
I VV
V I
I I / I I I
I
I VV
V I
I I / I I I
I
I VV
V I
I I / I I I
I
BC
D C
D ensitom etric quantifica tion in corona l sections
0 200 400 600 800 1000 1200
LI
LII-III
LIV
LVa
LVb
LVI
Right
Left
Analyse quantitative
couche à couche
Plus d’informations ?
Gilles Bronchti 5199
et/ou
un superbe manuel sur place
mais c’est tellement facile . . .