Download - Numerische Klassifikation TWINSPAN Dr. Heike Culmsee Vegetationsanalyse & Phytodiversität
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Numerische KlassifikationTWINSPAN
Dr. Heike CulmseeVegetationsanalyse & Phytodiversität
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Multivariate Methoden in der Vegetationsökologie
Methodengruppe: Clusteranalyse
Ziel: numerische Klassifikation
Definition: Cluster (Gruppen, Haufen) von Objekten (z.B. pflanzensoziologische Aufnahmen) oder Variablen (z.B. Arten, Umwelteigenschaften), deren Mitglieder einander ähnlich sind, während sich die Gruppen voneinander stärker unterscheiden
Darstellungsweise: Dendrogramm
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Clusteranalysen – methodische Schritte
Erstellung einer Rohdaten-Matrix
Errechnung einer (Un-)Ähnlichkeits-Matrix
Anwendung einer Klassifikationsmethode Dendrogramm
Interpretation
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Classification methods
non-hierarchical(e.g. vegetation groups in map)
hierarchical
divisiveagglomerative (classical cluster
analysis)
monothetic
polythetic (TWINSPAN)
Klassifikation: Methodenübersicht
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Clusteranalysen – Dendrogramm
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TWINSPAN
Two-Way Indicator Species Analysis
divisiv
polythetisch
Hill, M. O. 1979, TWINSPAN - a FORTRAN program for arranging multivariate data in an ordered two-way table by classification of the individuals and attributes. Ecology & Systematics, Cornell University, Ithaca, New York.
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TWINSPAN - Schritt für Schritt
1. Ordination des Datensatzes (Korrespondenzanalyse, CA)
2. Ermittlung der Werte der CA-Achse 1 für alle Bestände (Aufnahmen)
3. Ermittlung des Mittelwertes der CA-Achse-1-Werte 2 Gruppen von Aufnahmen
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4. Wie ist die Verteilung der Arten in den beiden Gruppen? Ermittlung von „Indikatorarten“ (Arten mit Schwerpunkt am positiven oder negativen Achsenende)
5. Ermittlung der Rangfolge der Indikatorarten
na+ na
Ia = n+ n
n+ Gesamtzahl der Aufnahmen auf der positiven Seite der Ordinationsachse 1
n Gesamtzahl der Aufnahmen auf der negativen Seite der Ordinationsachse 1
na+ Zahl der Aufnahmen auf der positiven Seite, mit Art a
na Zahl der Aufnahmen auf der negativen Seite, mit Art a
TWINSPAN - Schritt für Schritt
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6. Bestimmte Zahl von Indikatorarten mit höchsten Werten für |I| wird festgelegt (positive und negative).
Indikatorwert der Arten ist abhängig von der Frequenz der Arten und von ihrer VerteilungBeispiel: 2/5 0/5 = 0,4 3/5 1/5 = 0,4
7. Berechnung eines Indikatorwertes für jede Aufnahme
Addition von positiven und negativen Werten der in einer Aufnahme vorkommenden Indikatorarten
TWINSPAN - Schritt für Schritt
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TWINSPAN - Schritt für Schritt
8. Dichotomisierung des Datensatzes auf Grundlage des Indikatorwertes der Aufnahmen Grenzwertermittlung Anwendung eines Algorithmus zur Bewertung solcher Aufnahmen, bei denen die Zuordnung nach ihrem Indikatorwert und nach ihrer Stellung auf der Ordinationsachse zu widersprüchlichen Ergebnissen führt (Grenzfälle, Missweisungen)
Die bisherigen Schritte beschreiben nur einen Dichotomisierungsschritt, daher... 9.ff. Für jeden weiteren Unterteilungsschritt in der Hierarchie
werden die Schritte wiederholt. Wie oft? Die Zahl der Gruppen wird subjektiv vorgegeben Die kleinstmögliche Zahl an Aufnahmen je Gruppe wird
ebenfalls vorgegeben
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Wie verhält sich TWINSPAN gegenüber seltenen Arten?
Wegen hoher Empfindlichkeit von CA gegenüber Ausreißern (outlier) nimmt TWINSPAN ein
Downweighting seltener Arten vor.
Wie bezieht TWINSPAN Abundanzen in die Klassifikation ein?
Berücksichtigung über CA-Ordination allein bleibt unbefriedigend; daher...
Einführung eines Konzeptes mit „Pseudospecies“
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TWINSPAN – was sind Pseudospecies?
Pseudospecies repräsentieren die Abundanz einer Art durch zusätzliche „Arten“ gleichen Namens;
die Zahl der Pseudospecies einer Art ist proportional zur Abundanz der Art.
Vorteil: Abundanzen können „Indikatorarten“ sein (Indikatorwert ab bestimmter Deckung)
Nachteil: z. B. sind P. major 3, 4 und 5 redundant, daher: bei Indikatorarten wird eine reale Art durch nur eine Pseudospecies repräsentiert, und zwar durch die mit dem höchsten Indikatorwert.
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In der Tabelle repräsentierte Vegetationseinheiten (Benennung und Zuordnung der Aufnahmen nach A. Eichholz 1997, Dipl.-arb., Wiesen und Magerrasen am Südhang des Hohen Hagen): 1-2 Gentiano-Koelerietum pyramidatae (Enzian-Schillergras-Rasen)
1 Gentiano-Koelerietum typicum; 2 Gentiano-Koelerietum trisetetosum 3-5 Arrhenatheretum elatioris (Glatthafer-Wiese)
1 Arrhenatheretum elatioris ranunculetosum bulbosi, Pimpinella-Variante; 2 Arrhenatheretum elatioris ranunculetosum bulbosi, typ. Var.;
3 Arrhenatheretum elatioris typicum