Download - Power analysis aneb Co to vlastně znamená
![Page 1: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/1.jpg)
Power analysisaneb
Co to vlastně znamená
P<0.05
A hlavně co znamená P>0.05
(Podle Scheiner & Gurevitch 2001: Desing and analysis of ecological experiments. 2nd ed. Oxford Univ. Press)
![Page 2: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/2.jpg)
Rozhodovací tabulka
![Page 3: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/3.jpg)
Effect size
• Absolute effect size – zásahem vzroste biomasa o 100 g.m-2
• Relative effect size – zásahem vzroste biomasa o 5%
• Standardized effect size – standardizováno variabilitou s.d.
![Page 4: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/4.jpg)
Síla testu závisí na effect size
Při malém počtu replikací neprokážeme i docela velký efekt, při velkém počtu replikací prokážeme i efekt, který nemá biologický význam
![Page 5: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/5.jpg)
Na co nám odpoví Power analysis
• Dává nám závislost síly testu na velikosti efektu, variabilitě dat a velikosti sledovaného výběru (sledovaných výběrů)
• Pomůže nám naplánovat experimet, nebo se hodí v případě, že test vyšel neprůkazně
![Page 6: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/6.jpg)
Example 1 – correlation coefficient
• Relationship between no of species and biomass (and I expect linear relationship)
• How many quadrat I need to get significant result?
• Factors which I need to know – Expected value of correlation coefficient in the
(statistical) „population“ (i.e. The effect size, the size of deviation from the H0)
– Required power of the test
![Page 7: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/7.jpg)
![Page 8: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/8.jpg)
![Page 9: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/9.jpg)
![Page 10: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/10.jpg)
Example 2 – t-test
• Difference in no of species between mown and unmown plots (independent samples)
• What I need to know: Expected difference, „population“ sigma – homoscedascity expected
• S.E.S.= Difference/sigma
• Required power of the test
• How many quadrats I need
![Page 11: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/11.jpg)
Es = S.E.S. = Difference/Sigma
![Page 12: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/12.jpg)
![Page 13: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/13.jpg)
Možné otázky• Biologický smysl má zvýšení produkce semen po
odstranění konkurenta o 10% (číslo vycucané z prstu nebo podložené nějakou evoluční úvahou); zvýšení produkce hnojením je rentabilní, jen pokud výnos vzroste od jednu tunu na hektar.
• Předpokládá se, že znám variabilitu dat (kvalifikovaně odhadnu, nebo znám z předchozích pokusů)
• Kolik potřebuji opakování v každé skupině, abych takový efekt prokázal (tj. abych nulovou hypotézu o neexistenci efektu zamítl na 5% hladině významnosti) s pravděpodobností alespoň 90% (síla testu, tj 1-β)
• Nebo: Jakou jsem měl šanci daný efekt prokázat při daných velikostech výběru
![Page 14: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/14.jpg)
Zavádějící slovo „significant“
• Významný statisticky nemusí znamenat významný biologicky
• (Skoro) každá nulová hypotéza je nepravdivá – pak záleží často jen na počtu replikací, které jsme schopni udělat, zda dostaneme signifikantní výsledek (naštěstí jsme většinou omezeni v počtu replikací – pozor na možnosti „computerized sampling“)
• Power analysis
![Page 15: Power analysis aneb Co to vlastně znamená](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022081506/56814f9a550346895dbd5876/html5/thumbnails/15.jpg)
Mě se líbí přístup:
Pozor – co je pod a co je nad zero effect není zde z hlediska logiky zamítnutí důležité
Tento přístup lze použít pro plánování počtu replikací (jak široký potřebuju CI)
Když uvedu CI, tak mi to dává představu, i když nemám a priori stanovenou minimální velikost bioélogicky smysluplného efektu