Selezione e patologie ereditarie
Luigi GalloLuigi Gallo
Dipartimento Scienze ZootecnicheFacoltà di Agraria
Università di Padova
• dopo l’uomo, il cane è la specie per la quale sono state identificate più patologie/alterazioni a base ereditaria (Ostrander et al., 2000);
• grado di rischio relativo rispetto ad altre specie animali appare particolarmente evidente per patologie scheletriche, oculari e cardiovascolari (Willis, 1989);
Patologie ereditarie nel cane
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150
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1 2 3 4 5 6
Patologie a probabile base genetica(Burns, 1952; Fox, 1966; Robinson, 1972, Wegner, 1975; Patterson, 1977; Robinson, 1982; Monaco, 1993; Ostrander et al., 2000)
• attualmente identificate 370 patologie a accertata, probabile o possibile base genetica;
• 5 – 10 nuove anomalie riportate ogni anno;
Motivi:• grado di controllo medico cui è sottoposto il cane;
• restrizioni flusso genetico tra razze (LG) e intenso processo di selezione, con uso talora rilevante consanguineità, hanno facilitato l’espressione fenotipica di geni recessivi;
Data base aggiornato su patologie a base ereditaria:http://www.angis.org.au/Databases/BIRX/omia/
Patologie ereditarie nel cane
Tuttavia, è opportuno considerare che:
• la maggioranza della patologie segnalate interessa esclusivamente/prevalentemente una/ poche razze;
• l’incidenza di molte patologie è spesso limitata;
• solo un n° ridotto di anomalie (patologie oculari, DA) presenta diffusione generalizzata e/o livelli di incidenza rilevanti entro razza;
Patologie ereditarie nel cane
diffusione DA, archivio OFA, 2000(su 128 razze con 100 casi/razza)
0
5
10
15
20
25
30
35
40
<=10% 11 - 20% 21 - 30% > 30%
razze con incidenza soggetti displasici
%
• Selezione: procedura con cui gli allevatori possono modificare l’assetto genetico di una razza;
• riduzione incidenza patologie ereditarie: finalità prioritaria programmi selettivi;
Presupposto di base: conoscenza popolazione
• diffusione tra razze? incidenza? effetti su qualità vita/benessere/longevità animali?
• caratterizzazione genetica della patologia, ossia identificazione della base genetica che sostiene l’anomalia in esame
Patologie ereditarie e selezione
A tale scopo sono necessari:
• adeguata base dati relativamente al carattere di interesse;
• disponibilità di rapporti di parentela estesi e accurati;
In questa fase:
• centrale il ruolo delle Associazioni degli allevatori (ENCI, Club di razza);
• fondamentale la reale volontà di collaborazione tra allevatori
Conoscenza della popolazione
richiami e terminologia• fenotipo: fenotipo:
insieme degli aspetti esteriori che caratterizza ogni individuo;
è la risultante di due categorie di fattori:• genetici (genotipo)genetici (genotipo), fissati fin dal
concepimento, in cui l’individuo eredita il proprio patrimonio genetico per ½ da padre e per ½ madre;
• non genetici (ambiente), aggregato eterogeneo di fattori che modulano, amplificano o riducono la ‘caratteristiche potenziali’ definite dal genotipo;
• in linea generale: P = G + A• in alcuni casi: P = G
richiami e terminologia
• carattere: un qualsiasi aspetto fenotipico di interesse
che può essere misurato, classificato o valutato;
la manifestazione fenotipica di un carattere può essere controllata (in parte o in tutto) da geni;
• gene: unità elementare dell’informazione genetica; controlla (o contribuisce a controllare,
assieme a pochi o a molti altri geni) la manifestazione di uno specifico carattere;
richiami e terminologia
• ogni gene contiene una “dose doppia” di informazione genetica (alleli), proveniente per metà dal padre e per metà dalla madre (ex: AA, Aa)…
• …ma all’atto della riproduzione l’informazione genetica viene trasmessa alla discendenza in “dose singola”, ossia i geni alla riproduzione segregano (Aa trasmette a un singolo figlio A oppure a)
• La maggioranza delle patologie per le quali è stata identificata la modalità di controllo genetico presenta un comportamento di tipo mendeliano;
• Caratteristiche principali:
variabilità categorica; caratteri controllati da uno/pochi geni potenzialmente identificabili singolarmente;
l’espressione fenotipica del carattere dipende esclusivamente dal genotipo dell’individuo;
Basi genetiche delle patologie ereditarie
• selezione contro gene dominante generalmente agevole:
il gene si esprime anche negli eterozigoti;
problema limitato all’identificazione dei soggetti fenotipicamente affetti;
le anomalie sostenute da geni dominanti sono relativamente poco frequenti e dovrebbero essere agevolmente eradicabili
Anomalie di tipo mendeliano a comportamento dominantedominante
Problemi nella selezione/particolarità:
• in alcuni casi il gene è mantenuto nella razza perché produce anche effetti desiderati nei portatori (ma deve essere “gestito);
• la manifestazione patologica si esprime ad età tardiva/dopo l’inizio dell’attività riproduttiva;
• il gene ha penetranza incompleta
Anomalie di tipo mendeliano a comportamento dominantedominante
•la patologia si manifesta solo negli aa, ma il gene a permane nella popolazione, viene trasmesso e può diffondersi grazie agli Aa;
•la riproduzione dei soli non affetti comporta la (inconsapevole) messa in atto di 3 tipi accoppiamenti:
Accoppiamento Progenie attesa (%)
AA Aa aa AA x AA 100 - - AA x Aa 50 50 - Aa x Aa 25 50 25
Anomalie di tipo mendeliano a comportamento recessivorecessivo
• anche quando l’incidenza degli animali affetti è molto bassa, la frequenza degli eterozigoti è sensibilmente superiore:
% affetti (aa) % portatori sani (Aa) 0.01 2 0.1 6 1 18 10 44
Anomalie di tipo mendeliano a comportamento recessivorecessivo
• selezione vs geni recessivi risultati via via decrescenti
Risposta attesa alla selezione contro un gene recessivo
• non è possibile eliminare il gene, a meno che…
identificazione eterozigoti:• aumento risposta alla selezione• consente eliminazione del gene
a) via tradizionaletutti normali
AA• Backcross(A? x aa)
(A? x Aa) 1 affetto Aa
• procedure complesse, dispendiose in termini di tempo e costi, difficilmente affrontabili a livello di singoli allevamenti
Selezione contro un gene recessivo
b) via innovativa (biotecnologie)• diagnosi basata su test del DNA;• identificazione del genotipo al locus in esame (possibile già ad età precoce);
• alcuni test già disponibili (OFA, 2000):- intossicazione da Cu (Wilson’s disease) Bed. Ter- von Willebrand’s disease varie razze- PRA Irish terrier- distrofia retina varie razze- deficienza fosfofruttochinasiCocker e Spr. Spaniel- cistinuria Terranova
• prospettiva: >> disponibilità test diagnostici
Selezione contro un gene recessivo
Caratteristiche principali:
• variabilità continua tra estremi biologici, con > frequenza per valori intermedi (distr. normale);
• controllati da un n° sconosciuto (comunque elevato) di geni il cui effetto complessivo è la somma di tanti effetti (complesso poligenico additivo);
• l’espressione fenotipica del carattere dipende sia dal genotipo che da fattori extragenetici (ambiente);
alcune patologie a diffusione generalizzata (scheletriche, cardiovascolari )
Anomalie polifattoriali (poligeniche)
Caratteri quantitativi: P = G + A
• l’unico elemento direttamente misurabile è il P;
• quando un allevatore esamina un riproduttore, non è interessato a P, ma alla sua capacità di trasmettere caratteristiche favorevoli alla progenie ( G);
• A è una grossa fonte di disturbo nella stima di G;
Quanto pesano gli effetti genetici sulla variabilità di uno specifico carattere quantitativo?
h2 = G(A)/P
• h2: indice di trasmissibilità di un carattere
quantitativo;• varia tra 0 e 1;• è una stima
Ereditabilità (h2)
• stima fenotipo di un congruo n° soggetti e relazioni di parentela (conoscenza popolazione);
• parametro fondamentale per MG caratteri quantitativi; indicazioni su:
possibilità di miglioramento tramite selezione opportunità di selezionare per un carattere velocità di risposta alla selezione metodi di valutazioni genetica dei riproduttori: per h2 bassa, performance test è poco accurato, ossia offre una cattiva stima del valore genetico dei riproduttori
Ereditabilità (h2)
• Selezione scelta e accoppiamento individui ritenuti geneticamente migliori in allevamento/popolazione;
Caratt quantitativi: risposta alla selezione
m
m1
• risposta alla selezione (R): differenza tra valore genetico medio progenie e valore genetico medio generazione parentale;
• iterazione del processo ad ogni generazione accumulo nelle generazioni successive di pool genico via via più favorevole;
Caratt quantitativi: risposta alla selezione
Evoluzione incidenza DA nel PT (Hedhammar,1986; Swenson, 1896)
40
60
80
100
120
140
75 80 85 90
non affettoleggeromedio + grave
• risposta alla selezione (R): differenza tra valore genetico medio progenie e valore genetico medio generazione parentale;
• iterazione del processo ad ogni generazione accumulo nelle generazioni successive di pool genico via via più favorevole;
• Risposta alla selezione: fx di diversi fattori, tra i quali:
- intensità di selezione (n° individui scelti/n° individui disponibili x riprod): > i > S > R;- accuratezza stima del valore genetico riproduttori (h2; quantità e qualità informazioni disponibili)
Caratt quantitativi: risposta alla selezione
•DA: carattere poligenico
h2 DA: 25 – 40%
- data base spesso limitati- poche razze- modalità espressione grado DA non sempre omogenee- dati italiani ??
• i fattori ambientali (ex: regime alimentare durante la fase di crescita) possono modulare l’espressione della DA ma non possono, da soli, creare DA
L’esempio della displasia dell’anca
• diversi schemi proposti ed attuati dalla fine anni 50;
• obiettivo generale (Willis, 1989):
riduzione incidenza forme più gravi di DA nelle razze interessate mantenendo inalterate le virtù della razza (i.e. DA non può essere l’unico obiettivo di selezione) e utilizzando criteri di selezione accettabili dagli allevatori
• punti comuni: diagnosi radiografica età minima di testaggio ( 12 mesi) sistemi di diagnosi che prevedono più classi di manifestazione della patologia tra i due estremi biologici (carattere quantitativo)
Schemi selezione contro DA
• sottoporre il > n° possibile di riproduttori a diagnosi;
• condividere le informazioni fenotipiche; • evitare il “doping” dei data base (screening preliminare dei giovani riproduttori e relativa “censura” casi gravi);
• non utilizzare nella riproduzione i soggetti a > rischio DA; accoppiamento di: non affetti con non affetti non affetti derivanti da ascendenti non affetti non affetti con collaterali esenti / a bassa DA selezionare stalloni che producono progenie esente / a bassa DA utilizzare per rimonta soggetti migliori della media di allevamento per la DA
Presupposti (minimi) per ottenere G
• esame radiografico = valutazione fenotipica (perf. test);
• per h2 limitata, performance test poco accurato;• progenie da genitori esenti è mediamente migliore di progenie da genitori non esenti, ma non garantisce ottenimento di progenie sempre e comunque esente;
• stime più accurate del valore genetico dei riproduttori procedure statistiche che utilizzano le info sul riproduttore assieme a quelle di progenie, collaterali e ascendenti per ottenere la miglior stima possibile del valore genetico (EBV)
Stima h2 DA su dati italiani e determinazione EBV per riproduttori di alcune razze è in corso presso Dip. Sc. Zootecniche PD in collaborazione con Centrale lettura FE
Selezione contro DA: attenzione!
??
• diagnosi: radiografia vertebre toraciche, lombari e sacrali• presenza e grado sviluppo osteofiti secondo 4 classi (0: assente – 3: max) per 20 spazi intervertebrali• per ogni soggetto: 20 osservazioni• prime indicazioni diffusione nel boxer:
< 15 % soggetti totalmente esenti; 70 % soggetti con presenza di osteofiti in più di 1 spazio intervertebrale; 40 % soggetti con almeno 1 osteofita grado 3; 20 % soggetti con almeno 2 osteofiti grado 3
• correlazione + con DA??• giustificata l’ipotesi di sottoporre i riproduttori Boxer a controllo per predisporre indicatori utilizzabili dagli allevatori nei loro programmi di accoppiamento
Spondilosi deformante Boxer
• Langeland e Lingaas (1995), OMIA (2000): spondilosi patologia a base poligenica;
• stime h2 attualmente solo indicative (pochi soggetti testati, parametri estremamente imprecisi);
Collaborazione Centrale lettura FE –
Univ. PD: • messa a punto di un “indice fenotipico spondilosi” (IS): indicatore aggregato che considera il n° di spazi intervertebrali colpiti, il grado di sviluppo degli osteofiti presenti e la gravità clinica degli osteofiti a seconda del distretto anatomico colpito (Carnier et al., 2000);
• stima parametri genetici (h2 e correlazione genetica con DA);
• EBV per spondilosi per i riproduttori testati
caratteristiche genetiche spondilosi?
L’efficacia del lavoro selettivo dipende dalla capacità e possibilità dell’allevatore di valutare correttamente il merito genetico dei riproduttori e di utilizzarli al meglio
Fasi di lavoro:
1. conoscenza popolazione (misura generalizzata fenotipo; struttura genetica caratteri)2. obiettivi di selezione (n° e importanza relativa)3. valutazione genetica riproduttori (reali possibilità; accuratezza)4. criteri e strategie di utilizzazione riproduttori5. monitoraggio risultati e eventuali aggiustamenti
Per chiudere
The elimination of anomalies:
• above all, breeders need to learn to work
together…;
•…unless breeders learn to cooperate, they will
not be able to do much against defects…;
• no breeder is operating on a big enough scale
to discover everything and only when records are
pooled do things become obvious
Willis (1989) Genetics of the dog