Download - S'informer sur une maladie avec une tablette
S’informer sur une
maladieavec une tablette
Philippe [email protected]
Pour le téléchargement voir page suivante
Version décembre 2014
COMMENT TÉLÉCHARGER SUR VOTRE TABLETTE LA
PRÉSENTATION « S’INFORMER SUR UNE MALADIE »
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• Téléchargez sur votre tablette le PowerPoint « s’informer sur une maladie »
Présentation
L’information pour tous
La levée des obstacles
Les outils
CISMeF
BDBfr
Objectif 01 02 03
Les maladies dans CISMeF
TerminologieDescripteurAffiliationSéquence (1)Séquence (2
Les maladies dans la BDBfr
RequêtesRésultatsSéquence (1)Séquence (2)
Objectif: s’informer en santé en simplifiant les requêtes eten sélectionnant les sources
Salford Business School launches unique open access online course par university of Salford Licence CC BY
Objectif
L’information pour tous
En leur temps, CISMeF (1995) et PubMed
(1997) ont été les 2 premières initiatives
marquantes pour explorer le Web santé.
Les obstacles rencontrés avec ces 2 outils de recherche
(langage et syntaxe) ont laissé le champ libre à Google
(1999) pour monopoliser l’attention des internautes.
Aujourd’hui, il convient d’aider les patients à dépasser le
stade Google-Doctissimo-Wikipédia et les professionnels de
santé à sortir de la stricte spécificité de leur profession
(infirmière, dentiste, pharmacien, médecin…)
Au projet
d’information pour
tous répond le
souhait d’un tronc
commun de
formation initiale
pour tous les
professionnels de
santéapprendre à travailler
ensemble en formation
initiale
http://bit.ly/1xKBowr
L’information pour tous impose un niveau de littératie* adapté
Children Reading Pratham Books and Akshara par Pratham Books Licence CC BY
*Littératie = aptitude à comprendre l’information écrite
Objectif
La levée des obstacles
Plusieurs obstacles
sont levés par
l’utilisation de 2
outils de recherche :
- CISMeF pour les
patients et les
professionnels,
- et la BDBfr pour
les professionnels.
La langue anglaise et la syntaxe des outils de
recherche sont les 2 obstacles à franchir.
Pour cela, la solution passe par la recherche d’un niveau
de littératie adapté à chaque cible.
Cela suppose de limiter le champ d’exploration aux
sources francophones et de choisir dans les outils de
recherche les procédures les plus simples… sans mégoter
sur la qualité du résultat.
On se croit par fois dans « Mission impossible », mais
l’objectif peut être atteint si l’on y croit suffisamment.
L’information sur les maladies est recherchée dans CISMeF et dans la BDBfr
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Les outils
CISMeF
Le catalogue et index des sites médicaux
francophones (CISMeF) est le principal outil
de recherche des documents médicaux
disponibles en texte intégral sur le Web
francophone.
La fiabilité des documents est vérifiée avant leur
intégration dans le catalogue.
Depuis 1995, CISMeF n’a cessé d’enrichir son contenu
(près de 110 000 sites et documents en octobre 2014).
Les atouts
• Texte intégral
• Diversité des
documents
• Sélection des
sources
• Options
Patient
Recommandation
Enseignement
Les outils
BDBfr
Le projet d’une base de données
bibliographiques médicale en français (BDBfr)
est porté par CISMeF.
Cette base de données est « consultable gratuitement sur
l’Internet » et rassemble « les principaux contenus
scientifiques de santé en français ».
Il s’agite essentiellement d’articles de la presse médicale
francophone. L’accès au texte intégral n’est pas toujours
possible. Quand il l’est, il est soit payant (texte intégral
sur abonnement), soit gratuit (texte intégral gratuit).
La base.de
données contient
des références
d’articles en
provenance :
- des périodiques
francophones
indexés dans
PubMed/MEDLINE ;
- des publications
de l’éditeur
Masson-Elsevier.
CISMeF
Terminologie
Un thesaurus est un
ensemble de termes
ayant entre eux des
relations
hiérarchiques.
Le thesaurus de
CISMeF (version
française de celui de
PubMed) rassemble
les Medical Subject
Headings (d’où
l’acronyme MeSH)
CISMeF est interrogé de préférence avec les termes du thesaurus MeSH.
C’est avec ces termes que les documents de CISMeF sont
indexés. Il est donc logique et fortement conseillé de les
utiliser pour explorer le catalogue.
Le Portail terminologique de santé de CISMeF traduit les
mots clés du langage courant en termes du langage
MeSH*, utilisés pour interroger CISMeF.
* Un grand nombre de termes MeSH (version française)
sont identiques aux mots clés du langage courant, mais
certains ne le sont pas…
CISMeF
Descripteurs
Rhumatismes
Arthrose
Coxarthrose
Gonarthrose
Ostéo-arthrite vertébrale
L’arborescence des
termes MeSH relatifs
à l’arthrose
(osteoarthritis).
Les descripteurs sont les termes du thesaurus
MeSH
Il y a 27 149 descripteurs dans le thesaurus MeSH 2014.
Ces descripteurs ont, entre eux, des relations
hiérarchiques présentées sous la forme d’une
arborescence de termes (v. encadré).
Cet « arbre » comporte 16 branches maitresses dont une
rassemble toutes les maladies (branche Diseases).
Les qualificatifs « complètent le tableau » du langage
MeSH. Ces qualificatifs, au nombre de 83, précisent le
sens des descripteurs.
CISMeF
Qualificatifs
Pour les maladies :
étiologie,
épidémiologie,
diagnostic, thérapie,
complications,
chirurgie,
radiothérapie…
Dans la page suivante sont énumérés les
qualificatifs compatibles avec les descripteurs
de la catégorie « maladies ».
En effet, parmi les 83 qualificatifs, certains correspondent
aux maladies, d’autres aux médicaments, d’autres aux
investigations diagnostiques. En fait, chaque catégorie du
thesaurus a son « lot » de qualificatifs.
Comme les descripteurs, les qualificatifs ont, entre eux,
des relations hiérarchiques. Celles des qualificatifs de la
catégorie maladie sont indiqués dans la liste.
Organisation et administration
Economie
Physiologie
Génétique
Immunologie
Métabolisme
Enzymologie
LCR
Sang
Urine
Physiopathologie
Statistiques et données numériques
Epidémiologie
Ethnologie
Mortalité
Thérapie
Chirurgie
Diétothérapie
Prévention et contrôle
Radiothérapie
Rééducation et réadaptation
Soins infirmiers
Classification
Psychologie
Analyse
LCR
Sang
Urine
Anatomie et histologie
Cytologie
Anatomie pathologique
Embryologie
Diagnostic
Anatomie pathologique
Echographie
Radiographie
Scintigraphie
Etiologie
Complications
Congénital
Embryologie
Génétique
Immunologie
Induit chimiquement
Microbiologie
Virologie
Parasitologie
Médecine Vétérinaire
L’affiliation descripteur/qualificatif est au cœur des requêtes dans CISMeF
Mother and daughter par dr_tr Licence CC BY
CISMeF
L’affiliation descripteur/qualificatif
Arthrose/diagnostic
Arthrose/radiographie
Diagnostic par imagerie
Imagerie par résonance
magnétique
Indexation d’un article
de la Revue médicale
suisse intitulé
« Imagerie et
arthrose ».
Cette indexation
comporte 2 affiliations.
Chaque document de CISMeF est indexé avec
une ou plusieurs affiliations
descripteur/qualificatif (v. encadré)
Une affiliations descripteur/qualificatif est un mariage
entre un descripteur et un qualificatif (v. les pages
précédentes).
Dans une affiliation, le descripteur et le qualificatif sont
accolés, simplement séparés par un slash.
Exemples : asthme/diagnostic ;
tumeurs colorectales/chirurgie ; arthrose/radiographie
CISMeF
Deux séquences
Dans la première
séquence, la requête
est limitée aux
documents concernant
les patients.
Dans la seconde, la
requête comporte une
affiliation et une
option
(recommandation ou
enseignement).
L’information pour tous nécessite de
simplifier (schématiser) les procédures et
d’afficher à l’écran des documents aisément
compréhensibles
C’est la raison pour laquelle deux séquences de
recherche sont proposées.
La première est destinée aux patients et la seconde l’est
aux professionnels de santé, en sachant que rien
n’empêche les patients d’accomplir le parcours de cette
deuxième séquence.
CISMeF
Action !
La première action consiste à traduire le mot-clé en descripteur MeSH en
sollicitant le Portail terminologique de santé (page d’accueil de CISMeF).
L’action suivante se passe dans la page de résultat de la traduction (Portail
HeTOP). Il s’agit d’activer :
- soit le bouton CISMeF pour afficher une nouvelle page ;
- soit l’onglet PubMed/Doc’CISMeF pour sélectionner un qualificatif et une ressource
La dernière action finalise les 2 précédentes :
- en sélectionnant (case à cocher) une ressource (éventualité nouvelle page),
- ou en activant le bouton CISMeF BP ou UMVF selon la ressource (éventualité
sélection qualificatif et ressource).
CISMeF
Séquence 1 (patient)
L’accès au Portail
terminologique de
santé se fait par la
fenêtre du Portail dans
la page d’accueil de
CISMeF.
Dans la première séquence, la requête est
limitée à un descripteur et aux documents
destinés aux patients.
La démarche consiste à traduire le mot clé en
descripteur MeSH et à sélectionner le type de
ressource information patient et grand public.
La traduction se fait dans le portail terminologique de
santé (accessible depuis la page d’accueil de CISMeF)
et la sélection dans la page de résultat.
CISMeF
Les 3 plans de la séquence 1
Traduction du mot clé en descripteur MeSH grâce au Portail terminologique de santé.
Activation du bouton CISMeF (en bas de la page) après affichage de la traduction dans HeTOP
Sélection du type de ressource information patient et grand public dans la page de résultat
1
2
3
CISMeF
Séquence 2 (professionnel de santé)
Par rapport à la
séquence 1, la
séquence 2 est d’un
niveau de complexité
plus grand, concernant
aussi bien les
procédures que les
textes
Dans la 2è séquence, la requête comporte
une affiliation descripteur/qualificatif. Un
type de ressource peut y être associé :
enseignement ou recommandations
La « construction » de l’affiliation comprend 2 temps :
un temps traduction du mot clé en descripteur MeSH
et un temps affiliation d’un qualificatif au descripteur.
La sélection de la ressource est faite en même temps
que celle du qualificatif.
CISMeF
Les 3 plans de la séquence 2
Traduction du mot clé en descripteur MeSH grâce au Portail terminologique de santé.
Affichage des qualificatifs par activation de l’onglet PubMed/Doc’CISMeF dans le Portail HeTOP
Sélection du qualificatif et de la ressource (sous les qualificatifs). Activation du bouton adhoc.
1
2
3
La BDBfr est une base de données bibliographiques en français destinée à l’information des professionnels de santé
Nurse wearing uniform from British HondurasCourtesy of the US National Library of Medicine, Bethesda, Maryland
BDBfr
La formulation des requêtes
Comme dans PubMed,
un champ indique la
nature ou la
localisation d’un mot
clé.
Ainsi, une maladie
peut être :
- un descripteur (.mc)
- un mot du titre (.ti)
- un mot de tous les
champs (.tc).
Sous la fenêtre d’interrogation de la BDBfr
figurent deux mentions. L’une concerne le
langage MeSH, l’autre les champs.
C’est l’indication que la BDBfr. est interrogée avec les
mêmes descripteurs (et les mêmes affiliations
descripteur/qualificatif) que CISMeF… mais que, en plus,
leur nature (mot clé) est spécifiée par un champ.
Ce champ est .mc
Exemples : asthme.mc ; asthme/diagnostic.mc ;
gonarthrose/chirurgie.mc; bronchite/complications.mc
BDBfr
Le contenu de la page de résultats
La base de données
bibliographiques
médicale en français
rassemble :
- les références des
articles de la presse
médicale francophone
indexés dans PubMed ;
- les références des
articles de l’éditeur
Masson/Elsevier.
Dans la page de résultats de la BDBfr sont
rassemblés des références, des informations et
des liens en rapport avec des articles.
Pour chaque référence, les informations concernent le(s)
type(s) de ressources et l’accès au texte intégral (gratuit ou
sur abonnement).
Les liens intéressent :
- le site EMC|consulte quand la référence est celle d’un
article de l’éditeur Masson/Elsevier ;
- la référence de l’article dans PubMed.
Deux séquences destinées aux professionnels de santé : entre sensibilité et précision
Banlancing act par tanakawho Licence CC BY
BDBfr
Deux séquences
Attention ! :
Le filtre ajouté après
l’affichage du résultat
de l’équation de
recherche restreint le
champ de la requête
qu’elle soit (au départ)
sensible ou précise.
Le degré de restriction
dépend du filtre.
L’information des professionnels de santé
peut être envisagée de deux façons :
sensible (large) ou précise (restreinte).
C’est la raison pour laquelle deux requêtes sont
programmées : l’une avec un descripteur
correspondant à une maladie (information sensible),
l’autre avec une affiliation descripteur/qualificatif dans
laquelle un qualificatif précise le sens du descripteur
(information précise).
L’action se déroule en 3 temps : dans CISMeF, puis dans la fenêtre d’interrogation de la BDBfr, enfin dans la page de résultat de la BDBfr
Action !
and… action par Latin Snake Licence Cc BY
BDBfr
Séquence 1 (descripteur)
La sélection de l’option
« texte intégral
gratuit » restreint
sensiblement le champ
de la recherche.
En effet, en moyenne,
moins de 10% des
articles sont
disponibles en texte
intégral.
Dans cette séquence, la requête est formulée
avec le descripteur correspondant à la
maladie et le filtre texte intégral gratuit.
Le descripteur est accompagné du champ .mc
Dans la page de résultats le filtre est sélectionné en
cochant la case correspondante.
Cette séquence doit permettre au professionnel de santé
de prendre connaissance des articles en rapport avec la
maladie sans avoir besoin de se déplacer dans une
bibliothèque universitaire ou de payer l’article à l’éditeur.
BDBfr
Les 3 plans de la séquence 1
Traduction du mot clé en descripteur MeSH grâce au Portail terminologique de santé.
Entrée du descripteur MeSH avec son champ .mc dans la fenêtre d’interrogation de la BDBfr
Sélection de l’option texte intégral gratuit dans la page de résultats.
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2
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BDBfr
Séquence 2 (affiliation)
Pour obtenir le texte
intégral dont l’accès
n’est pas gratuit dans
la BDBfr, il faut le
récupérer dans une
B.U ou l’acheter à
l’éditeur :
- par le lien avec cet
éditeur,
- ou par le lien avec
PubMed.
La requête est formulée avec une affiliation
et le filtre revue de la littérature, afin
d’obtenir une information synthétique.
L’affiliation descripteur/qualificatif est accompagnée du
champ .mc
Dans la page de résultats le filtre est sélectionné en
cochant la case correspondante.
Cette séquence affiche des références d’articles dont un
grand nombre ne sont pas disponibles gratuitement en
texte intégral.
BDBfr
Les 3 plans de la séquence 2
Traduction du mot clé en descripteur MeSH grâce au Portail terminologique de santé etvérification des qualificatifs pouvant lui être affiliés (onglet PubMed/CISMeF de HeTOP)
Entrée de l’affiliation accompagnée du champ .mc dans la fenêtre d’interrogation de la BDBfr.
Sélection de l’option revue de la littérature dans la page de résultats.
1
2
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MERCI
Aux photographes qui ont illustré ce slidedoc :University of Salfordhttps://www.flickr.com/photos/32104790@N02/9718507502
Pratham Bookshttps://www.flickr.com/photos/prathambooks/3292434390/
U.S National Library of Medicinehttps://www.flickr.com/photos/nlmhmd/4644489973/
Hamed Saberhttps://www.flickr.com/photos/44124425616@N01/512309138/
dr_trhttps://www.flickr.com/photos/dr_tr/4780145333/
John Sebhttps://www.flickr.com/photos/johnseb/6948503978/
U.S National Library of Medicinehttps://www.flickr.com/photos/nlmhmd/8616715370/
tanakawhohttps://www.flickr.com/photos/28481088@N00/1504252690/
Latin Snakehttps://www.flickr.com/photos/34807320@N00/5614033198/
A Nancy Duarte qui a créé les slidedocs et les modèles de maquette qui permettent de participer à l’aventure de ces « présentations à lire ». http://www.duarte.com/fr/slidedocs/http://docedu.fr/WordPress/archives/1285
Aux blogueuses Farfadoc, docteurmilie, docteur Gécé et Géluile MD qui ont publié le 16 octobre 2014 sur leurs blogs respectifs un billet sur le thème de la pédagogie médicale.Elles y ont exprimé leur soutien à l’initiative « apprendre à travailler ensemble » de l’Afdet.
L’objectif du slidedoc « S’informer sur une maladie » est de donner (sur certains thèmes) à tous les professionnels de santé le même type d’information.http://www.afdet.net/AFDET_fichup/archive-686.pdf
A Patrick Balouet (Collège des hautes études en médecine) qui m’a sollicité pour animer une formation pluri professionnelle sur les référentiels en médecine.Cette sollicitation est à l’origine de ce slidedoc.