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TP1, Recherche de Parenté chez les VertébrésEtablissement de Phylogénie
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Rappel du cours :
1. Comment appelle-t-on les caractères communs pour plusieurs espèces qui appartiennent aussi à leur ancêtre commun ?Des caractères homologues
2. A quel échelle peut-on comparer les caractères des vertébrés ?Macroscopique (anatomie, morphologie, embryon), cellulaire, moléculaire
3. Qu’est ce qu’une analogie ?Deux caractères qui se ressemblent mais qui ne sont pas hérités d’un ancêtre commun.
4. Pourquoi parle-t-on d’état primitif (ancestral) ou évolué (dérivé) pour un caractère ?
Etat primitif : état le plus anciennement apparuEtat évolué : état apparu plus récemment par modification de l’état primitif
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Schéma d’un arbre phylogénique
Espèce 1 Espèce 2 Espèce 3 Espèce 4Espèces actuelles ou fossiles
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Schéma d’un arbre phylogénique
Espèce 1 Espèce 2fossile
Espèce 3 Espèce 4Espèces actuelles ou fossiles
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Schéma d’un arbre phylogénique
Espèce 2fossile
Espèce 3 Espèce 4Espèces actuelles ou fossiles
Plus vieil ancêtre commun
Nœud : ancêtre communInnovation génétique
Passage d’un état ancestralancestral à un état dérivédérivé
Espèce 1
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4. Quels caractères doit-on choisir pour représenter la phylogénie la plus probable ?
Des caractères homologues
Identifier les innovations génétiques
Repérer pour chaque innovation l’état dérivé et l’état ancestral
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Lien vers tableau de caractère de l’exo 2 du TP1
1. Remplir la matrice des taxons : sardine, aigle, chat, dauphin et caractères : organes respiratoires, placenta et pièces basales
2. Coder les états de caractères de la matrice.Choisir un taxon extra-groupe (celui avec le plus d’états ancestraux)Colorer les états primitifs suivant l’extra-groupeChoisir une couleur pour les états dérivésChoisir « Colorer de la même manière les états identiques » (plutôt que « colorer case par case »)Cliquer sur les états dérivés à colorer dans le tableauVérifier
3. Editer l’arbreRemplir la matrice de la feuille de TP
Suivre les indications de la fiche de TPPour indiquer les évolutions génétiques sur l’arbre, vous pouvez vous aider en cliquant sur « exploration de l’arbre »A chaque nœud apparait alors les innovations nouvelles acquises par l’ancêtre commun.
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Schéma d’un arbre phylogénétique
Pièce basale uniqueet poumons
Placenta
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Squelette osseuxSchéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés
Doigts
Amnios
2 fen. temp.Allaitement
Choisir un caractère supplémentaire : fenêtre temporaleRemplir la matrice ainsi formée
Fen. md.
Plumes
et 1 fen.temp.et poils
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Squelette osseuxSchéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés
Doigts
Amnios
2 fen. temp.Allaitement
Fen. md.
Plumes
et 1 fen.temp.et poils
Mammifères OiseauxReptiles AmphibiensPoissons
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Squelette osseuxSchéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés
Doigts
Amnios
2 fen. temp.Allaitement
Fen. md.
Plumes
et 1 fen.temp.et poils
Mammifères OiseauxReptiles AmphibiensPoissons
Peau à mucus
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Squelette osseuxSchéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés
Doigts
Amnios
2 fen. temp.Allaitement
Fen. md.
Plumes
et 1 fen.temp.et poils
Mammifères Oiseaux Amphibiens
Peau à mucus
Sauropsides
AmniotesAmniotesTétrapodes
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Schéma de l’arbre phylogénétique des vertébrés
- 220
Temps (millions d’année)
- 300
- 360
- 150
Squelette osseux
Doigts
Amnios
2 fen. temp.Allaitement
Fen. md.
Plumes
et 1 fen.temp.et poils
Peau à mucus
A partir de la page 28 et 29 :
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Tableaux :Poste de travail,Commun srv jules,Biologie cochard
![Page 15: TP1, Recherche de Parenté chez les Vertébrés Etablissement de Phylogénie](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022052218/551d9d8d497959293b8c23be/html5/thumbnails/15.jpg)
Arbre correspondant au tableau de caractère TS1-1
Une pièce basale
Amnios
2 fen. temp.1 fen.temp.
Mammifères Sauropsides
AmniotesAmniotes
![Page 16: TP1, Recherche de Parenté chez les Vertébrés Etablissement de Phylogénie](https://reader034.vdocuments.pub/reader034/viewer/2022052218/551d9d8d497959293b8c23be/html5/thumbnails/16.jpg)
Arbre correspondant au tableau de caractère TS1-2
Présence de pattes
Amnios et 4 cavités cardiaques
3 cavités cardiaques
Placenta
MammifèresAmphibiensAmniotesAmniotes
Tétrapodes
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Correction du sujet 2A Pondichéry 2004
Homme Manchot Chimpanzé Tortue Kangourou
Homme
Manchot
Chimpanzé
Tortue
Kangourou
Matrice des distances :
0
0
0
0
0
8 0 10 4
8 10 8
10 4
9
Homme
Chimpanzé
Kangourou
ManchotTortue
Arbre phylogénétique de quelques vertébrés