efficient dna database laboratory strategy for high through-put str typing of reference samples

6
Ef®cient DNA database laboratory strategy for high through-put STR typing of reference samples Walther Parson * , Martin Steinlechner Institute of Legal Medicine, University of Innsbruck, Muellerstrasse 44, A-6020 Innsbruck, Austria Received 10 September 2000; received in revised form 10 January 2001; accepted 10 January 2001 Abstract DNA intelligence databases were installed successfully in various countries during the past few years. It is a general trend that laboratories performing STR analysis for DNA databases have to adjust to increased sample through-put, especially when dealing with a high number of reference samples. In contrast to routine forensic casework analysis, where samples of suspects and unknown samples are interpreted with regard to the speci®c circumstances of the case and are kept distinctly apart from other cases, DNA databases consist of single, primarily unlinked DNA pro®les. Problems areas associated with the high number of anonymous DNA pro®les are the risk of logistic errors, such as sample mix-up during the laboratory procedure, and the risk of typing errors during manual transcription of data and/or results. Thus, DNA databases clearly require new laboratory strategies to rise to the challenge. This paper presents an ef®cient automated laboratory strategy on the platform of a laboratory management information system LIMS) with the Austrian DNA Intelligence Database as example. Two goals were tackled in particular: ®rst, data safety by avoiding both manual interaction during critical laboratory steps i.e. when DNA is transferred form one tube into another), and errors due to manual transcription of sample information and results. Secondly, ef®cient sample processing by automizing the laboratory procedure with the help of robotic instruments, thus, giving the DNA staff more time to analyze data. # 2001 Elsevier Science Ireland Ltd. All rights reserved. Keywords: DNA intelligence database; Short tandem repeats; Automation; Robotics; LIMS; Forensic analysis 1. Introduction DNA intelligence databases are modern tools for the executive force investigating crime [1±5]. The database serves as holder of DNA pro®les derived from unknown casework samples and reference samples. The DNA pro®les collected in the database can be compared in order to link a crime scene to a suspect or to show connections between different crime scenes. The database is usually equipped with software facilitating the comparison of all types of DNA pro®les stored. There are several possibilities how DNA pro®les can be linked together, such as ``perfect matches'' between the pro®les of crime scene samples i.e. samples derived from pieces of evidence) and reference samples, or crime scene samples among themselves. Also ``imperfect matches'', like the concordance of a single pro®le with a part of a mixture pro®le can be discovered, and serve as indication for a link between two samples. It depends on the legal and political situation of a country, which types of crime and reference samples may be loaded onto the national database for matching purposes [4±6]. Due to the police security act, the Austrian DNA Intelligence Database is authorized to store DNA pro®les of convicted and suspected persons, and crime scene samples from a de®ned catalogue of crimes, including murder, crime against health and life, robbery, burglary, arson, and blackmail. The Austrian DNA Intelligence Database was inaugu- rated 1st October 1997. It consists of two components, the DNA database as such, which is located at the Ministry of the Interior in the capital city Vienna, and the laboratory unit situated at the Institute of Legal Medicine, University of Innsbruck. Functionally, personal data of suspects are Forensic Science International 122 2001) 1±6 * Corresponding author. Tel.: 43-512-507-3303; fax: 43-512-507-2764. E-mail address: [email protected] W. Parson). 0379-0738/01/$ ± see front matter # 2001 Elsevier Science Ireland Ltd. All rights reserved. PII:S0379-073801)00404-2

Upload: walther-parson

Post on 04-Jul-2016

213 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Efficient DNA database laboratory strategy for high through-put STR typing of reference samples

�������� � � � � �� � ��� ���� ��� ���� ��� ��������������� ��� ������ �� ��������� � �����

� ����� � ����� ! ���� ��������������������� � ��� ��������� ���������� � ���������� ��� ��������� ��� ������ ���������� �������

�����"�� #$ ��������� %$$$& �����"�� �� ��"���� ���� #$ ' �� �� %$$#& ������� #$ ' �� �� %$$#

��������

� ������������ � � � ��� (��� ���� ���� ������������ �� " ����� ��������� ������ ��� � �� ��( �� ��) *� �� ����� � �����

�� � � ��� ������ ���������� ��� � ����� ��� � � � � ��� � "� �� �+��� �� ����� ��� � ���� ����������� ������ ��� (���

�� ���� (��� ���� ������ �� ��������� � �����) *� ����� �� �� ������� �������� � ��(��, � ����� (���� � ����� �� ��������

�� ��,��(� � ����� �� ����������� (��� ��� �� �� ��� ������� �������� ���� �� ��� � �� �� �� ,��� ���������� � �� ����

����� � ��� � � � � ��� ������� �� ������ ���� ���� �����,�� � �������) �������� �� � ����� ��� (��� ��� ����

������ �� �������� � ������� �� ��� ���, �� �������� ������ ���� � � ���� ��-��� ������ ��� � ��� ���� ��������� ��

��� ���, �� ������ ������ ������ � �� � �� ���������� �� � � ��.�� �������) ���� � � � � ��� ��� ��� ��/���� ��(

� ��� ���� ��� ������ �� ���� �� ��� �� ������)

���� � ��� �������� � �������� ���� ��� � ��� ���� ��� ���� �� ��� �� ����� �� � ��� ���� � � ������ ������ ����

������ 01*!�2 (��� ��� ������ � � *����������� � � �� � �- ����) �(� �� �� (��� � �,��� �� � ������ �3 ���� � �

� ���� �� "������ ���� � �� � ����� ����� ������ ������ � � ��� ���� ����� 0�)�) (��� � �� �� �������� ���� ��� ���� ����

������2 �� ������ ��� �� � �� � �� ���������� �� � ���� ������ ���� �� �������) �������� �������� � ���� ���������� ��

�����4��� ��� � ��� ���� ��������� (��� ��� ���� �� ������� ����������� ���� ��"��� ��� � �� �� ���� ���� �� � ��4�

� � ) � %$$# ����"��� ������� *��� �� 1��) ��� ������ �����"��)

�������� � ������������ � � � ��& ����� � ���� ���� ��& ����� ����& ��������& 1*!�& 5������� � �����

� ���� ������

� ������������ � � � ��� �� ������ ����� ��� ���

�-�����"� ����� ��"����� ���� ����� 6#789) ��� � � � ��

���"�� � ������ �� � ������� ����"�� ���� ��,��(�

� ��(��, � ����� �� ��������� � �����) ��� � �������

��������� �� ��� � � � �� � � �� ���� ��� �� ����� �� ���,

����� ����� �� ������� �� �� ���( ����������� ���(���

��������� ����� ������) ��� � � � �� �� ��� ��� �/������

(��� ����( �� � ����� ���� ��� ���� ����� �� �� ����� ��

� ������� ������) ����� �� ��"�� � ������������� ��(

� ������� � � �� ���,�� �������� ���� � ::�������

� �����;; ���(��� ��� ������� �� ����� ����� � �����

0�)�) � ����� ����"�� ���� ������ �� �"������2 �� ���������

� ����� �� ����� ����� � ����� ���� �������"��) ����

::��������� � �����;; ��,� ��� ������� ��� �� ������

������ (��� � �� �� ��-���� ������ � � �� �����"����

�� ���"� � ����� ���� ��� ���, ���(��� �(� � �����) *�

������� �� ��� ��� � �� ������� � ���� ���� �� �������

(���� ����� �� ����� �� ��������� � ����� � � �� �� ���

���� ��� � ���� � � � � �� ��� � ������ �������� 6<7=9) ��

�� ��� ������ �������� �� ��� ������ � � *�����������

� � �� �� ������4�� �� ����� � ������� �� ���"�����

�� ��������� ������� �� ����� ����� � ����� ����

������ � � ����� �� ������ ��������� ������ ����� � ����

�� ��� �� ���� ������� ����� �� ���� �� �� �,� ��)

��� ������ � � *����������� � � �� ( � �� ����

� ��� #�� >������ #??@) *� �������� �� �(� ���������� ���

� � � � �� � ���� (���� �� ��� ��� � ��� !������� �� ���

*������� �� ��� � ��� � ���� A���� �� ��� � ��� ���� ����

���� ��� � ��� *�������� �� 1�� � !������� B��"������ ��

*�������,) 5������� ��� ������ � � � �� �������� ��

5������� ������� *����� ���� � #%% 0%$$#2 #7=

� C������������ �����) ���)3 �<D�8#%�8$@�DD$D&

� -3 �<D�8#%�8$@�%@=<)

!�"�� �������3 ( �����)� ����E���,) �) � 0�) � ����2)

$D@?�$@DF.$#.G 7 ��� ����� � ���� � %$$# ����"��� ������� *��� �� 1��) ��� ������ �����"��)

�**3 � $ D @ ? � $ @ D F 0 $ # 2 $ $ < $ < � %

Page 2: Efficient DNA database laboratory strategy for high through-put STR typing of reference samples

� � ��� �-�����"��� � ��� !������� �� ��� *������� ��

A���� (����� ��� � ��� ���� �� *�������, ����� �� ������

��� � ����) ��� ������ ���������� ���� ���(��� ��� ������

� � � � �� ��� � �� ������� �� ���� ���� � ���������

�� ��� ���+��� (���� � � �� �� ��� ������� �� ����� �� ����

��� ������ � � ��������� ���� ��/���������) *� ( � ��� �� ���

� ��� � �,� �� ��������� ��� � � � ���� ��� �-������

� � � �� � ��� !������� �� ��� *������� ������� ������ �

� � ����������� �� ������ �� �������� �� ���"�����

�������) 5�� ���� ������� � ������ � ��������� (��� ��"��

����� �� ��� � � ��� ���� �� ����� �� ����� ��� �������

��� � ������ ���� (��� ���"������ � ���������� ��

������ � � � ) *� ����� �� � ����� �� ��� ��������� �� � ,���

������� �� ��������� � ����� ��� ���+��� � �������� �

�����/����� �������� �� ��� �-������ ������ �� �"������ ��

��� ����� �� ��������)

� ��������� �� ����� � � ��� ������� ���������

�#$# ���� �� ��������� �������� ��"% ��

��� � ��� ���� ��"����� �� � ��� ������ ,��� ��� � ,�

��� ��������� � ���� � �� �� �� �� ���� � ��� �� � �����)

���� ,�� �� �������� �� � ��"����� (��� ��� ������ �� ���

��������� �� ��� ��� ��������� ��� � ����� ���� ��� ���� �

��� ��� �� � ,��)

��� ,�� ���� ���3

� �(� ������� ���� � ��� �� ��"���� 0>��� �( �� 5��4��

B��2&

� �(� ������� #)8 �� �� ����� ����� ������ (��� #)< �� ����

���� %����� ��� 0!���, H��� ��2 �� (���� ��� ��� ��

��"���� �� �� �������� �� ������&

� �� �, *����� 0�I*��5%# ���� �� ��� ������ ��� � ,���

������������ �� ������ � � � �� ��� �������2&

� ������ � �� ����������� ���������� ��� ���������&

� � �� �� ���"��&

� � �� �� �� ��� �� �� � ��� ��"����� ��� �� ������ ����

� �, �� ��� � ��� ����)

��� �� ����� ����� ��� �� �, *����� �� ��� ����� � ��

�� ��� ��"����� ������� ��� ,�� (��� � �,�� �� �� ���������

�� ���������� �� ��� � �� ���/�� � ����� ������ ���� ��

���� ��� �� ��� ������) ��� � ����� �� �������� �� ����������

�� ��� � ��� ���� ����� �� ������� ��� �� ��� ,���) J����� �����

� �,�� ��� �� ����� ����� ����� (��� %����� ��� (���

�-����� �� BA������ 0���� ��� #$ ��2 ��� <8 ���)

�#�# ��������� ����&�� ��� ��"% � "�����"���

� ���� � � ������ �� (��,K�( �� ��� � ����� �� ���

� � � �� � ��� ���� �� ������� ��� �� 5��) # ���������� ���

�������� � � �� �� ��� � ���� ����������)

� �-�� ����� ��/������ �� � �� �C�������� ��

��������� �� ���� �� ���� ������� ���������� �� �� ����

������ ����� ������ ��� ���� 0�1��> D$$$ �����.������

�(��4��� ��2) ��� �1��> �� ���� ���� �� � ������ � ���� ��

��� �����C� � ��� ���� �� ����� �� � ���� � ����� (���� ��

����� ��� �� ���������� � ��� � ���K�( 0����C !�����

K�( !L C��� ��� ���� C������ BI2) ��� �� ����� ��

��� ���������� �� ��"������ ��� �-�� ����� �� �C�������� ��

������ ���� (��� ���� L����� H��L 0������ 2 ���������

������� ��� �������� �-�� ����� ���� ��� ���� ��� �

�-�� �����) ��� �-�� ����� ���� 0�������� � ���� L�����

H��L ������ 2 (��,� �� ��� � ��� �� � �� �� ���� ������

�� �� ���������� �� ��� ����( �� �� �1��> 0����B5��

A������ #)#)%2)

5�� ��� ������ � ��� ���� ��������� ���� ���� ����� �����

�� �� ����� ����� �� ������ �� 6@93

� 5���� ����� ����3 ���� � �( �� �� �������� �� ��� � ��� �

���� �� #)8 �� � ����� � ����� �� ����� ���� �������� ��

��� ,��) � �� �-�� ���� ����� � FM C����- #$$ ��������

0J��� � C� B�� 6F92 �� $)8 �� �� ������� �� I

0%$ ��.�� J��������� ! ������ H��� ��2 �� ��� �

"����� �� #)< �� �� ������� ( ��� 01�C������" L�1C�

�� �� !���, H��� ��2 �� ��� �-�� ����� ���� �� ���

����� ��� # � � =$�C ����� ��� ����) �����/������ ���

������ ���� �� � ���� �� ?8�C ��� #8 ���)

� ������ ����� ����3 � ��/��� �� ��� �-�� ���� � ��

�� �������� ���� ������ #)8 �� "� � �� ��� ������� ��������)

���� �� ����� ���� ���"�� ���� � ����������� �� � ���

��� �C�������� � (��� � ���� �� ������ ��� ���

�-�� ���� � ���� ��� � �����)

� ����� ����� ����3 �C� �� ������ �� ��� ����� �� ?=�(���

���������� �� ��) ��� ������ ����� ���� !������- 0�H!

6? #$92 �� ������ �� ��� � �C� "����� �� %$ �� ����������

�� $)% �! � �� ��� #)8 �! !�C�% # � �C� J�����

�� #)%8 B � / H��� 0�� J��������� 5����� C��� C�

B��2 �� �������� �� ?=$$ ������������ 0�� J���

������� 5����� C��� C�2 ���������� D$ ������ �� ?#�C��� D$ � 8F�C ��� #8$ � �� @%�C ��� D$ � ��������� �

����� � ��� ��� ���� �� ��4��� ���" ���� ���� � ?8�C ���

#F ���) �������������� ����� �� $)$= �! 0�����������2

$)% �! 0�L$#2 $)#8 �! 0%#�##2 $)$= �! 0#F�8#2

$)#8 �! 0F�##@?2 $)%8 �! 0"��2 �� $)#$ �! 05H�2)

� 5����� ����� ����3 ��/���� 0% ��2 �� ��� ������� ����

�������� �� �� �������� ���� ������ ?=�(��� ����������

�� �� �� �������� (��� #= �� ������4�� ���� ���� ��

# �� ������ � � �� �� �� �� 0H����� � 8$$ � �� ��

J��������� 5����� C��� C�2 ��� ����� � ?8�C ���

% ��� ������������ �� ��� �� �� ��� �� C� D#$

H������ �� ��4�� 0�� J��������� 5����� C��� C�2)

��������������� �� � ����� ��� ����� �� �� �� ����������

� ����������� �� ��� � ��� ������) ����� ��� � �����

��� ������� ���� �������� 0����� ����� ����� �� ����2 ��

���� ���� �� ��� �-�� ���� � �� ������ � �%$�C)

�#'# (��� ��� ����

� ( � � �� � ��4�� ����� H����� � �� ����� ����( ��

0A������ %)#2 �� ���� �������� ���� H�������� ����( ��

% )# *������ �# +���� ��,��� - .������� +������ ������������ $�� /���$0 $1�

Page 3: Efficient DNA database laboratory strategy for high through-put STR typing of reference samples

5��) #) >"��"��( �� ��� � ��� ���� ������� �������� �� ������� �� ����������� ����)

)# *������ �# +���� ��,��� - .������� +������ ������������ $�� /���$0 $1� D

Page 4: Efficient DNA database laboratory strategy for high through-put STR typing of reference samples

0A������ %)$ ���� �� J��������� 5����� C��� C�2) � � ���

��� ���� ��� � ������ ������ �� ����� � ����� ( � ��"���

���� ��� ��� ������� ���� �������� �� �������� ���

" �� ��� �������� 0H�������� ����� �� ��� ���5����

������� �� J���������2) H����� � � ����� �� � �� �

���������� �� ��� � ������� �� H�������� �� ���������

�(��� �� ������������� �� �(� �-��������� � �����) J���

������� 0�-������ � ����2 �� �������� ���� � ��� ����

� � ������ ������ ���� ������ 01*!�2 ��� ���� ���

���� ����� �� ��� ������) C������ �� ������� �� ���( ����

�� � � �� ���������) � ����� (��� ��"������ � ������� ��

���������� � ������� �� � ��4�� �� ��� �����"����)

�������� �� ��� � ���� �� ��� ��������� ������� �����

� ����� �� ���( ���� ���� ��� � �� � ����� ��� ���� ���

�-�� ����� ��.�� ���� ��� �C� 05��) #2) 5�� ��� (��� ���

��� ������ �� � ���� �� ��� ���� �� ���� ��� � ����� ���

������ �� �� �������� ���� ��� � � � ��)

�#�# ��������� ����"����� "�����"��� �����" /��+0

� ����� � 1*!� ����( �� ( � ��"������ ��� ��� � � � ��

� ��� ���� � � ��� �� � � ���� �� ������� ��� ������

� ��� ���� ������� � (��� � ��� �� ����� �� � � ���(���

��� � ��� ���� �� ��� � � � � ��) ��� ����( �� ( �

����� ���� � ��� *�������� �� 1�� � !������� � !�����

���� ������ %)$�� ��� �����"����� ����( �� � �, �� (����

���(� �-������� �� �� �������� ���� (��� �������� ��

����( �� � �, ��� ���� � � ��� ��� #)?� 0� ����� ��������

�� �� ������� J����(��, >L2 ����B5�� A������ #)#%

0������� �� �1��> D$$$ ������� ������ �����.������

�(��4��� ��2 �� �J* ����( �� � �, ���) *� ���"����

(��,K�( ������ (���� � ���� �� �������� �������

� �-�� ����� � ������ ���� ��������� �� � �����

����� ���� ��������� ��� ������� �������� �� ��� �� ��� �� ���

� ����) J� �� ����� ��� � ����� ������ ���� �� ���� �

������� ���� ��� � ���� �� ���� ��� �� �������� �������� ��

��� � ���) *� �� � ( � � �� � ����� �� ������ ���� � �

������ �������� �� � �� ���� �� ��� ������ ���������

��������� �� ��������� �� ��� ��� ������ ���� ��� � � � ��

�� ��� !������� �� ��� *�������)

� ������� �� ���������

��� ������ � ���� � � *����������� � � ��

1 ��� ���� ( � ����������� �� �������� � � ��� ����

���������� ������� � ��(��, � ����� �� �� �� �� ����

=$$ � �����.�� �) 5�� ��� � � � �� ���+��� ��( � ����

� � ������ �� � ��� ���� ��� ���� ( � ������ �� ����� ��

����� �� � ���� �����������) ���� ( � ��� ����"�� �� +���

�-� ����� � ���(�� ��� �� ����������� �� ���� ����

��� ������ ��������� �� ��� ��������� � �����) �����

���� ������ (��,K�( ( � ��� ������� ��� ��� �� ��� �"�� ��

������ ��� �� ������4 ���� �� � �� � ���� ����� �� ��

� ���(��, ��� �������� ���� ��������� �� ��� ���������

� ���� �� ��� 1*!� 0��� ��� 6# ## #%92) J���� ( �� ��

��� � �� �� � ����� ��� (��,��� � � � �� � �� �������� �

�� ��� ��4 ���� � �������� ��� ��������� ( � ��������

�� ������ �� ������� ����,� ����� ���� ����������� ���

���������"� ����� �� ��� � �����)

�������� � ����� �� �� �� �� ���� � ��� ��� (��� ������

� ������ ��� � � ����� � ���� � "� ��������� �� �� ���)

*� ����� �� ��� �� ������� � ���� /� ���� � ��/� �� ,��

( � �������� �� ��"������ � ��� � � � �� � ��� ����)

'#$# 2,� ��"% ��� ���

��� ������������ �� ������� ,�� ( � ��� �� ��� ��"�����

������ �� ��� �� ����� �� �� �� ��� ���+��� ��� ��� �����(���

�� ����3

5���� �� ������ �� ����� (��� �������� (��� ������� �

��"���� ��� � ,��� ��������� � ����� (���� �� �� ���4��

��� � ������ ��������� �� ��� �� ����� �� /� ���� �� ���

� ����� ���� �� ��� � �����) � �� ��� �������� � �����

������ ��� �� ��� �� �� ��� �� ��� �������� �������� �"��

(��� ������� ����� ��������� ������ ���� ���������� 0����

���.(�����2) *� ����� �� ��� �������� �� ��������� � �����

�� ��� ����� �� �� ��� �� ��� ��� �� ��� ���, �� ���������

����� �� ��� �� �� �� ���� ���� ��) ���� ���� � ��� ��

� ����� ����� ��� ��"� � �� ���� /� ���� ��� ��� �������

�� ���� ������ �������� ������� �� ��� � �� �� ��� ������

� ,��� ��� � ����� �� ����������� ��"��"�� ��� ���, ��

� ���� � ���� ��� �� �� ������� �� ������) *� � �����

������� ����� %@%F ���� � ��� �� � ����� (��� ��"����� ���

����� ��� � �� � ��� ���� ������ � ��������� ��"� �-����

��� ��� ��� �� ����� ���� � ��� �� � ����� ����� � �� �����

� ,�� �� �� �� �� ��� ,��) ��� ��������� �� �� ��� �������

���� ����� � ����� ( � ���������"��� �� ���� 0��� �������

D)D ��������� ��2 �� � � �� �-�� ���� �� �� ������� ��

������ �� ��� � ����� ����� �� ��������)

�������� ��� ,�� � ����� ��� � � �� ��������� ����

�� ��� � ������ ���� ���� ��� �-������ � � � �� �� ���

(��, � ��� !������� �� ��� *�������) �� �� ��� � �� �� � ���

� ����� ������ ���� ( � �� ���� �� ��� �� �, *�����

�I*��5%# 0(���� � � ���� ���� �� ��� ������ ������ ���

::� �� ;;2 ����������� �� ������ � � � �� �������

(��� �������� ��� ����� �� ��� � � ���� �� ��� �

������) �"��������� � � ���� � �� ������ � � � (���

�������� ��� � ��� ���� � �� ����� � ��/����� �� ��� � �

���������� � ()

������� ��� ����� ��4�� ,�� ���������� �������� ��� ������

"����� �� ����� ������� ���) ��� ,��� (��� ���� �� �����������

�� %D ����� � ������ �� ����� �� ������ (���� ���� ��������

���� ���� ��� ���) � ,��� �" �� �� �� ��� 1*!� �� �� � �� ��

� � ��� ��� � ��� ���(��� ��� ��� � ��� �� ��� ����� ���

������� ���� ��� ��� ,���)

5�� ��� ��� � �� �� � ������� � ��� ��� (��� ���� ���(��

��� ��� ������������ �� � ���� ��� �� �� �� ���4�� ����

����� ��� ��� � � ��� ���� (���� ( � ����� ��� �� ��

� �����) *� (� � � ��������� ��������� ��� �� ��"���� ��

� ������ ������/��� ��� ��������� ���� �� ��� �������

���������� (���� � "� ���� ���� ���� ��������)

< )# *������ �# +���� ��,��� - .������� +������ ������������ $�� /���$0 $1�

Page 5: Efficient DNA database laboratory strategy for high through-put STR typing of reference samples

'#�# *34 "���5������� ��� � �����%,������

��� ������������ /� ���� �� � �-�� ���� ���� ���� �

��� �� � ����� ������ ��� ����������� �� ���� �� �� ���4��

��������� ��� ��� � �����) ���� �� ����� ��� ��� ���� ��

( � ��� ��������� �� "��� /� ���� ���� �� �-�� ���� � �

���� (���� � "� ��/����� ������ ����� ���� �� �� �����

�����) *� ����� ����� � �������� ����� (��� ����������

��� 8$ ����"��� �� (�� ���, ����� �(� ���� � ��� �� � ��

���� �� ������� ����"��� � " �� ������ �� ��������� �������

� ,��� ��� � ����� 0� � ��� ���(�2) >� "�� �� �

�������� ����� �� ��� ����� �� #$7%$ ��.�� (��� ����������

(��� ����� ��� �-�� ����� �������� ��������� ��"� 0�

�������� ����� ���������� �� N� ������� �� J���������

5����� C��� C�2) ��� ��������- � "� ���� ������� (��� #38

�������� �� ��� �) >� ��� � ��� �� ���� ����� #38 ��������

�� ��� �-�� ���� � ( � ���� ��� �� ��� �1��> �������

���� �� ��� � �� ������� ?=�(��� ���������� �� �� ������

� ( � ���� �� ��� �C� � �������-)

'#'# +�����������

J��(��� >������ #??@ �� '��� #??? #8 @@= ���������

� ����� (��� ����� ����� �H! �� ��� ������� ����������

�� ��� ���� ��� � � � ��) ��� �"�� �� ������ ��������� �� ���

�� ��- ��� ���� �-������ ??)??M 0� ��� #2) >��� �(�

� ����� � "� � ��� � ������� �� �(� � ����� � ���� ��

������ � ��) ��� ��������� �� ��� ��� ����� ���� ���

������ � ���� ������ ( � ?%)@DM) ���� ���� ���� �� � FM

�� ��� � ����� � � �� �� ���� ���) >� ����� ��� � +����� ( �

����� ������������ (��� �C� ( � ���� ��� ����� ����

����� �� � �������� ����) >��� �������� �� ��� � �����

� � �� �� �-�� ���� � �� 0$)F<M2 �� ����� �� ��"� ��������

��� ������) � ��� � �� D% � ����� 0$)%M2 (��� �������� �����

���������- �C� ��� ��� ������ ���� �� ����� � �� �����

��4�� ��������� �� � �� ������ � ����� ������� ��� �� �� ��

� ��� 0�)�) "�� ����� %D �"��� �� (��� 5H� � ������2)

��� ���� ������� � �� � � �� � ���� �-�� ���� �� ���

� ������ ��������) ��� ���� �� �� �� ������ �� ��� ��� ��� ��

%����� ��� ������ ������ �� ����� ���� ��� ������������

/� ���� �� ��� ��������� � ���� � ��������� ��� � �����)

*� ��������� ����� �� (���� ���� � ��� ��� (��� �����

����� �� �������� @ 0$)%=M2 ��� �� %@%F � ����� � "�

� ��� � ������� �� #< 0$)8#M2 � "� �� ������ � ��) *� ����

� �� ������ ��� ���� � ���� �� ��� � ����� � ��� ������� ����

�� �������� � ����� �� ( � ����� ��"�� � ����� �� � � �����

���(�� " �� ��� /� ���� �"�� ��������� ��� ���� � ���� ��

��� �������� � �����)

'#�# 6�� ��� ������ �� ��% ������� � ��� ����

������ 8M �� ��� � ������� 07 � @@%2 (��� ������

� ��� �� ����������� � ����� �� ��� ������ ���� � ��� ��

� ����) �����"�� � ��� ���(��� ��� � ������ ��

����� ����� � ���� �� ��������� � ���� ( � �����"�� ��

��� � � � � �� ��� ������ ���� � ��� �� �� ��� �������

( � ����� �� ����� �� ������ ��� ��� ������) C����� ����

� ����� (��� ��������� �� ��� � �� ( � � ���� � �����

�-���� �� � ��� ��� �� ���� � ����� �� � <F � ����� (���

�����) ��� @@% � ����� � "� ��� � �� ������� � ���

� ����� �� ��� ���� ���� � ��� �� � �����) ��� ��������

� ��� �� ��� ������ ���� � ����� (��� "��� ����� � �� �����

�� ��� ���� � ����� 0� ��� #2) ����� ������� ������� �� � ���

���� �� �� ��� ������ ���� � ��� �� � ���� �� %����� ��� �

���� ������ ���� ��� ��� ��� ��"��� ����� ��� /� ���� ��

� ��� ��� � ����� �� �� � %����� ��� �� � ������� ��

�� ������ �� ���� �� ������)

'#8# !5������ ��� ��"� ��"�

��� ������� � ������ ���� � ����� �� �� ��� � ����

��� �� #@ =$# � ����� �� ��������� � ����� ���������

(����� %$ ������) *�������� ��� ���� ������� �� ������

�� ���� ������ � ���� ��+������� ��� � ��� �� <D ���������

� ����� %$ F@= � ������� (��� ��������� �� �� ��

�� ����� � �����) ���� ������ � � �� ���,�� ��(� ����

<#@8 � ����� ��������� �� ������ �� �� �) ��� "�� ��

������ �� � � ����� ���� � ���� �������� �� ��� ���� �

������ ( � @)FD � �� ��������� ��� ���� �� �� ��/�����

��� ���� ��)

� �����������

��� ������������ �� � ���� ��� ������ ���� ��� ����

��� ��� � � � � �� � ��� ���� � �� �� �������� �� �������

���� ������ �� � ����� (��� ��� ��"� �� �� ������ ��

�� ��) ��� ,��� ��� ��� ������� �� ���� ���+��� ( � ���

������������ �� ,�� (���� ����� ��� ��� /� ���� �� ���

� � ���� � ���� ��� � ����� �� 1*!� (���� ����

������� � ���� �������� �� ������4�� ��� ��4 ���� � (��,

�� � � ���� ��� ������ �������) ! �� � � ��� ���� �����

(��� ,��� � ������� ��"�� ��� ��� �� � ���� ��"�� ( �

� ��� #

��������� �� �� ��� � � � � �� � ��� ���� ��� ����

��� � ������ �� � ����� ��"����� ��� #8@@= #$$M

5��� ��� ������� � ����� ������ #<?%= ?%)@DM

���� ��� �-�� ����� #D% $)F<M

���� ��� ��������- �C� F8# 8)D?M

���� ��� ���������- �C� D% $)%$M

� ��� � �������� %

O��� �������� %

C�������� � ����� @@% #$$M

5��� ��� ������� � ����� ������ @D< ??)$FM

���� ��� �-�� ����� #% #)88M

���� ��� ��������- �C� %8 D)%<M

���� ��� ���������- �C� # $)#D

� ��� � �������� $

O��� �������� $

)# *������ �# +���� ��,��� - .������� +������ ������������ $�� /���$0 $1� 8

Page 6: Efficient DNA database laboratory strategy for high through-put STR typing of reference samples

����"�� ���� ��� ���� (���� �� ( � �� �������� ���� ���

���� � ��� �� ( � � ,��)

!� �(���� 0'��� %$$$2 ����-�� ���� D$ $$$ � �����

(��� � ��4�� (��� ��� ���� �� ��� � ��� ���� ��� ���� �������

��� ��"�) *� '��� #??? ���5���� �H!���� ( � ������

����� � ��������- �C� ������ ���� ,�� 0�� J���������

5����� C��� C�2 (���� ��� ��� ���� ��� ��������� �� ����

���� ���� ������ 0� � ��� ���(�2) ��� ����� �� ��������

� �� ��� ,� ��� ������ �� ��� " ��� �� ��� ��� ����)

�������� �������

��� ������ (���� ��,� �� �� �, ��� �� �� � ��� *�������� ��

1�� � !������� ��� ����� ����� ����� ����"����� �� �����

��� � ��"�������� �� ����� ����� ��� ���������� ��� ������

���+���) �� (���� ��� ��,� �� �� �, ��� � � � �� �� �� � �

�� !������� �� ��� *������� 0���) **.#$2 ��� ��� �-�������

������ ����) ���� ����� ( � ��������� �� �� �� �� ���

::>��������������� ���� �� �, '���� P�������;; 0������ �

���� � J �, �)3 �?@.<2)

�� �������

6#9 )') ������ ��� � ���� � � � � � �� 5������� ���) *��) FF

0#??@2 DD7<%)

6%9 �) ���������� C���� � � � � � �� ��� ��� �� H��� ��

�) J���������) #= 0#??F2 8#$78##)

6D9 �) L���� 5��������3 ��� 5J*;� � ���� � � � � � �� �)

J���������) #= 0#??F2 ?F@)

6<9 �)!) ��������� � � � � ��� ��� �������� �������� ���� ��

������ Q ��� ���� ��� ������� � ��� � �� ������� �

� �����4 ���� ��3 ����������� �� ��� ������ ������ �

��������� �� L�� � *������� ���� ������ C����� ����

#??F ��) <$7<<)

689 �) � ���� !) ������������ �) ������� ��� �)!) ���������

���� � � ������������ � � � ��� �� ������ Q ������ ��

��� ������� ���� ���� ��3 ����������� �� ��� ?�� ��������� ��

L�� � *������� ���� ������ C����� ���� #??F ��) 8%78<)

6=9 �)!) ��������� C) ������� �)) ! ���� 0���)2 ��3 ��������

���� �� ��� ������ � ��������� ����� � �� 1�� � *����� ��

� ������ �� 5������� !������� 5������� ���) *��) FF

0#??@2 #7##$)

6@9 �) � ���� !) ������������ J) J����� �) I�P��� �)

������� ��� 1 ��� ���� ��� ���� �� ��� ������ � �

*����������� � � �� ��3 ����������� �� ��� ������

������ � ��������� �� L�� � *������� ���� ������

C����� ���� #??F ��) 8?7=$)

6F9 �)�) � ��� )�) !��4��� �) L������ CL�1�R #$$ �

������ ��� ������ �-�� ����� �� � ��� �C��� ��� ������

���� �������� � ���� � J��������/��� #$ 0<2 0#??#2 8$=78#D)

6?9 �) �� �,�� C) I������ �) � ���� ) >������ �) C� ����

1) J ����� ') ������ C) �������� �) L �� ') C� �� � �)

B�/�� �� �) H��� ��� " ��� ���� �� @������ ��������- ��� ����

��� ��� �� �������� � ��(��,) � �� *) !�-����� ���� ���� � ����

�� ������� ������� *��) ') 1��) !��) #$? 0#??=2 #F=7#?<)

6#$9 �) �� �,�� C) I������ �) H��� �� �) C ��� ') �������� )

>������ ) ���� � �) B�/�� �� �) H��� ��� " ��� ���� ��

@������ ��������- ��� ���� ��� ��� �� �������� � ��(��,) � ��

**) ����� ��� � ��(��, ������� �� ������� � ��� *��) ') 1��)

!��) #$? 0#??=2 #?87%$<)

6##9 �) L��(��� ') J���,�� �) �� ���� �) C �� �) � ��� �)

!��4 !) C���, I) J��(� I) �����" � � ����� ������ ���

������� ������ ��� ���� � ���� ���������� (����� �

� � � ���� ���� ��3 ����������� �� ��� F�� ��������� ��

L�� � *������� ���� ������ C����� ���� #??@ ��) %$7%<)

6#%9 )') ������ �) �� �,�� D$$ � ����� ��� (��, Q ���

�������"����� �� ������ ��"�������� �� � ������������

� � � ��� ��3 ����������� �� ��� ?�� ��������� �� L�� �

*������� ���� ������ C����� ���� #??F ��) 887=%)

= )# *������ �# +���� ��,��� - .������� +������ ������������ $�� /���$0 $1�