el·lipse 45: "five years, five kilometres"

8
PARC RECERCA BIOMÈDICA BARCELONA CONNECTEM CIÈNCIA I DIVERSITAT EN UN ESPAI CREATIU ÚNIC Juny de 2011 NÚM. 45 www.prbb.org GRATUÏT DESTACAT / HIGHLIGHT en el grau d’internacionalització de la recerca que desenvolupen. L’informe destaca la novena posició d’Espanya en el rànquing mundial per nombre de publica- cions i el fet que les institucions catalanes segueixen sobresortint tant en producció com en visibili- tat respecte de la resta de l’Estat. IMIM and CRG rank highly According to the report entitled Bibliometric indicators of Span- ish scientific activity 2008, by the SCIMago group, the CRG and the Bon posicionament de l’IMIM i el CRG Segons l’informe Indicadores bi- bliométricos de la actividad cientí- fica española 2008, realitzat pel grup SCImago per encàrrec de la Fundación Española para la Cien- cia y la Tecnología (FECYT), el CRG i l’IMIM es troben en primera i quarta posició, respectivament, entre les institucions sanitàries espanyoles amb una major rà- tio de citacions per document. Ambdues institucions com- parteixen, a més, llocs destacats IMIM are in first and fourth posi- tions respectively amongst the Spanish health institutions with high ratios of citations per docu- ment. Both institutions also do well with respect to the degree of internationalisation of their re- search. The report highlights that Spain is ninth in the world rankings by number of publications, as well as the fact that the Catalan insti- tutions continue to excel, both in production and visibility, with respect to the rest of the country © Robert Cudmore (via Flickr) Cinc anys, cinc kilòmetres l’horari laboral, per fer activitats que els uneixen, tant esportives com culturals, solidàries o fes- tives; massivament o en petit comitè. El teatre, el cant coral, la capoeira, el ioga, les danses africanes, el futbol, el bàsquet, els esmorzars i mercats solida- ris, les sortides dels runners, les festes que cada any reuneixen un gran nombre de residents o el campionat de vòlei platja amb més de 500 participants en són alguns exemples. Totes aquestes activitats, moltes d’elles iniciatives dels residents i organitzades per ells mateixos, així com les relacions i amistats que hi han sorgit, han facilitat la convivència entre tots els residents del parc, i han generat oportunitats i ganes de col·laborar en projectes co- muns. El PRBB ha avançat molt en aquests cinc anys, i l’empen- ta dels seus residents hi ha tin- gut molt a veure. Five years, five kilometres W ith the slogan "He- alth and kilometres" emblazoned on their orange shirts, on May 30, nearly 100 PRBB residents assembled in the inner square of the park to run five kilometres together along the sea front. The initiati- ve, which a group of runners of the PRBB came up with, symbo- lises the celebration of the 5th anniversary of the park: five ye- ars, five kilometres. Over these past five years more than 1,300 residents have worked together, making advances in bi- omedical research and finding ways of improving people's he- alth. They have done it all sharing, day in and day out, not only many hours of work, but also leisure ti- me. These more relaxed moments have helped both the scientists and support staff of the PRBB to get to know one another better. They have got together, outside working hours, for joint sporting, cultural, supportive or festive acti- vities, in big groups and small. The theatre, choir, capoeira, yoga, Afri- can dancing, football, basketball, charitable breakfasts and markets, the outings of runners, the parties which each year bring together a large number of residents and the beach volleyball championship which has over 500 participants are some examples. All of these activities, many of them initiatives of the residents which they organised themsel- ves, and the relationships and friendships that have been for- med, have made the coexistence of all the residents of the park easier, and have led to opportu- nities and the desire to coope- rate in joint projects. The PRBB has advanced considerably in five years, and the drive and energy of the residents has been intrinsic Maruxa Martínez-Campos A mb el lema «Salut i kilò- metres» gravat a les sa- marretes de color taronja, quasi 100 residents del PRBB van sortir el 30 de maig de la plaça in- terior del parc per córrer plegats cinc kilòmetres al llarg del Passeig Marítim. La iniciativa, sorgida d’un grup de corredors del PRBB, tenia com a objectiu simbòlic ce- lebrar el 5è aniversari del parc: cinc anys, cinc kilòmetres. Durant aquests cinc anys, més de 1.300 residents han treballat junts per fer avenços en la recer- ca biomèdica i trobar formes de millorar la salut de la població. I ho han fet tot compartint el seu dia a dia: moltes hores de feina, però també alguns moments d’oci, que han servit perquè tant els científics com el personal de suport del PRBB s’hagin cone- gut millor. S’han trobat, fora de Editorial IIS-Hospital del Mar T he new Hospital del Mar Health Research Institu- te is in the final process of being accredited to join the network of research institutes linked to the National Health Service. Such institutes are being created by the Ministry of Science and Innovation to encourage the association of hospitals with universities and research organisations, with the aim of bringing together basic, epidemiological and clinical re- search, and promoting the con- cept of a hospital as a research centre. The constitution of the IIS-Hospital del Mar will rein- force its external recognition and will open a new avenue for obtaining competitive resour- ces, fostering translational re- search. The IIS-Hospital del Mar gathers professionals from the UAB, UPF, IMIM, CRG, CMRB, CREAL and PRBB around the Hospital del Mar, and is mana- ged by the FIMIM. It includes eight research programmes and the organisational framework has been established in an agreement approved by the par- ticipating institutions. Miguel López-Botet IIS-Hospital del Mar E l nou Institut d’Inves- tigació Sanitària Hospi- tal del Mar es troba en el procés final d’acreditació per integrar-se en la xarxa d’instituts de recerca vinculats al Servei Nacional de Salut. Aquests instituts s’estan creant per fomentar l’associació dels hospitals amb universitats i altres organismes de recerca, amb l’objectiu d’apropar la re- cerca bàsica, epidemiològica i clínica, i potenciar el concepte d’hospital com a centre de re- cerca. La constitució de l’IIS- Hospital del Mar reforçarà el seu reconeixement extern i obrirà una nova via d’obtenció de recursos competitius, pre- ferentment en el camp de la investigació translacional. L’IIS-Hospital del Mar agrupa professionals de la UAB, la UPF, l’IMIM, el CRG, el CMRB, el CREAL i el PRBB al voltant de l’Hospital del Mar, i el seu ens de gestió és la FIMIM. La seva organitza- ció científica s’estructura en vuit programes de recerca i el seu marc organitzatiu s’ha establert en un conveni apro- vat per les institucions parti- cipants. Miguel López-Botet © Jordi Casañas

Upload: prbb

Post on 11-Mar-2016

244 views

Category:

Documents


2 download

DESCRIPTION

In the June issue of The Ellipse, the monthly newspaper of the PRBB, you can learn how about 100 residents of the PRBB met to run 5km to celebrate 5 years since the park creation. In addition, Toni Gabaldón, from the CRG, explains his research in comparative genomics; UPF researchers publish in Science the relationship between DNA compaction and the stress cell response; several studies from the IMIM help the benefits of olive oil to be recognized by the European Food Safety Authority; Audrey de Nazelle, from CREAL, reveals the utility of smartphones for epidemiological studies; and scientists from the CMRB show how the LSD1 enzyme helps stem cells to decide between renewal or differentiation. You can also discover who has won the PRBB award or how statistics can support research, among many other things. Enjoy it!

TRANSCRIPT

Page 1: El·lipse 45: "Five years, five kilometres"

Parc recercaBiomèdica Barcelona

connectem ciència i diversitat en un esPai creatiu únic Juny de 2011 NÚM. 45 www.prbb.org GRATUÏT

DESTACAT / HIGHLIGHT

en el grau d’internacionalització de la recerca que desenvolupen. L’informe destaca la novena posició d’Espanya en el rànquing mundial per nombre de publica-cions i el fet que les institucions catalanes segueixen sobresortint tant en producció com en visibili-tat respecte de la resta de l’Estat.

IMIM and CRG rank highly

According to the report entitled Bibliometric indicators of Span­ish scientific activity 2008, by the SCIMago group, the CRG and the

Bon posicionament de l’IMIM i el CRG

Segons l’informe Indicadores bi­bliométricos de la actividad cientí­fica española 2008, realitzat pel grup SCImago per encàrrec de la Fundación Española para la Cien-cia y la Tecnología (FECYT), el CRG i l’IMIM es troben en primera i quarta posició, respectivament, entre les institucions sa nitàries espanyoles amb una major rà-tio de citacions per document. Ambdues institucions com-parteixen, a més, llocs destacats

IMIM are in first and fourth posi-tions respectively amongst the Spanish health institutions with high ratios of citations per docu-ment. Both institutions also do well with respect to the degree of internationalisation of their re-search. The report highlights that Spain is ninth in the world rankings by number of publications, as well as the fact that the Catalan insti-tutions continue to excel, both in production and visibility, with respect to the rest of the country■ ©

Rob

ert

Cud

mor

e (v

ia F

lickr

)

Cinc anys, cinc kilòmetresl’horari laboral, per fer activitats que els uneixen, tant esportives com culturals, solidàries o fes-tives; massivament o en petit comitè. El teatre, el cant coral, la capoeira, el ioga, les danses africanes, el futbol, el bàsquet, els esmorzars i mercats solida-ris, les sortides dels runners, les festes que cada any reuneixen un gran nombre de residents o el campionat de vòlei platja amb més de 500 participants en són alguns exemples. Totes aquestes activitats, moltes d’elles iniciatives dels residents i organitzades per ells mateixos, així com les relacions i amistats que hi han sorgit, han facilitat la convivència entre tots els residents del parc, i han generat oportunitats i ganes de col·laborar en projectes co-muns. El PRBB ha avançat molt en aquests cinc anys, i l’empen-ta dels seus residents hi ha tin-gut molt a veure.

Five years, five kilometres

W ith the slogan "He-alth and kilometres" emblazoned on their

orange shirts, on May 30, nearly 100 PRBB residents assembled in the inner square of the park to run five kilometres together along the sea front. The initiati-ve, which a group of runners of the PRBB came up with, symbo-lises the celebration of the 5th anniversary of the park: five ye-ars, five kilometres. Over these past five years more than 1,300 residents have worked together, making advances in bi-omedical research and finding ways of improving people's he-alth. They have done it all sharing, day in and day out, not only many hours of work, but also leisure ti-me. These more relaxed moments have helped both the scientists and support staff of the PRBB to get to know one another better.

They have got together, outside working hours, for joint sporting, cultural, supportive or festive acti-vities, in big groups and small. The theatre, choir, capoeira, yoga, Afri-can dancing, football, basketball, charitable breakfasts and markets, the outings of runners, the parties which each year bring together a large number of residents and the beach volleyball championship which has over 500 participants are some examples. All of these activities, many of them initiatives of the residents which they organised themsel-ves, and the relationships and friendships that have been for-med, have made the coexistence of all the residents of the park easier, and have led to opportu-nities and the desire to coope-rate in joint projects. The PRBB has advanced considerably in five years, and the drive and energy of the residents has been intrinsic ■

Maruxa Martínez-Campos

Amb el lema «Salut i kilò-metres» gravat a les sa-marretes de color taronja,

quasi 100 residents del PRBB van sortir el 30 de maig de la plaça in-terior del parc per córrer plegats cinc kilòmetres al llarg del Passeig Marítim. La iniciativa, sorgida d’un grup de corredors del PRBB, tenia com a objectiu simbòlic ce-lebrar el 5è aniversari del parc: cinc anys, cinc kilòmetres. Durant aquests cinc anys, més de 1.300 residents han treballat junts per fer avenços en la recer-ca biomèdica i trobar formes de millorar la salut de la població. I ho han fet tot compartint el seu dia a dia: moltes hores de feina, però també alguns moments d’oci, que han servit perquè tant els científics com el personal de suport del PRBB s’hagin cone-gut millor. S’han trobat, fora de

Editorial

IIS-Hospital del Mar

The new Hospital del Mar Health Research Institu-te is in the final process

of being accredited to join the network of research institutes linked to the National Health Service. Such institutes are being created by the Ministry of Science and Innovation to encourage the association of hospitals with universities and research organisations, with the aim of bringing together basic, epidemiological and clinical re-search, and promoting the con-cept of a hospital as a research centre. The constitution of the IIS-Hospital del Mar will rein-force its external recognition and will open a new avenue for obtaining competitive resour-ces, fostering translational re-search. The IIS-Hospital del Mar gathers professionals from the UAB, UPF, IMIM, CRG, CMRB, CREAL and PRBB around the Hospital del Mar, and is mana-ged by the FIMIM. It includes eight research programmes and the organisational framework has been established in an agreement approved by the par-ticipating institutions.

Miguel López-Botet

IIS-Hospital del Mar

El nou Institut d’Inves-tigació Sanitària Hospi-tal del Mar es troba en

el procés final d’acreditació per integrar-se en la xarxa d’instituts de recerca vinculats al Servei Nacional de Salut. Aquests instituts s’estan creant per fomentar l’associació dels hospitals amb universitats i altres organismes de recerca, amb l’objectiu d’apropar la re-cerca bàsica, epidemiològica i clínica, i potenciar el concepte d’hospital com a centre de re-cerca. La constitució de l’IIS-Hospital del Mar reforçarà el seu reconeixement extern i obrirà una nova via d’obtenció de recursos competitius, pre-ferentment en el camp de la investigació translacional. L’IIS-Hospital del Mar agrupa professionals de la UAB, la UPF, l’IMIM, el CRG, el CMRB, el CREAL i el PRBB al voltant de l’Hospital del Mar, i el seu ens de gestió és la FIMIM. La seva organitza-ció científica s’estructura en vuit programes de recerca i el seu marc organitzatiu s’ha establert en un conveni apro-vat per les institucions parti-cipants.

Miguel López-Botet

© J

ordi

Cas

añas

Page 2: El·lipse 45: "Five years, five kilometres"

Ciència www.prbb.org | juny de 2011 2

NOTÍCIA CIENTÍFICA / SCIENTIFIC NEWS

«Som a l’edat d’or de la genòmica comparativa»TONI GABALDÓN – GRUP DE GENÒMICA COMPARATIVA DEL CRG

quasi 3.000 espècies i la tendència és que cada any es dupliqui –comenta el cap del grup–. Tenim una quantitat d’informació genètica inimaginable fa tres anys. Sen-to que estem a l’edat d’or de la genòmica comparativa. Ens calen, però, eines capaces d’aprofitar aquesta informació. Ara mateix, el nombre de seqüències disponibles augmen-ta molt més ràpid que la potència dels ordi-nadors». Encara que l’arbre de la vida és un concepte bàsic en qualsevol estudi evolutiu, no està lliure de controvèrsies. Actualment es discuteix si realment hi ha un arbre de la vida o si és més aviat una xarxa. I en això hi té molt a veure la HGT, perquè si els gens no es passen només de generació en generació, si-nó entre espècies, això modifica la forma de l’arbre i fa que s’assembli a una xarxa. Finalment, el grup estudia com fongs que normalment són part de la flora intestinal es converteixen en patògens oportunistes en individus immunodeprimits, com ara persones amb sida o pacients que han patit quimioteràpia. «Hi ha milers d’espècies que viuen al nostre cos i només una petita pro-porció es converteix en patògens. Per enten-dre el perquè, estem seqüenciant fongs d’es-pècies patògenes i no patògenes, i de soques més i menys virulentes», explica Gabaldón. El grup està catalogant tots els canvis que troben al genoma d’aquestes espècies i en fa arbres filogenètics. En col·laboració amb experts experimentals, han introduït les di-ferents soques en macròfags humans per es-tudiar quins gens s’expressen i entendre com reaccionen els fongs quan es troben amb la primera línia de defensa humana, i com res-pon aquesta defensa a cada tipus de fong.

"We're in the golden age of comparative genomics"

Valencian Toni Gabaldón arrived at the PRBB in 2008. Since then he has created a group with a mixed

education in biology and computer scien-ce which is devoted to the comparison of genomes from an evolutionary stand point. Two main questions underlie their rese-arch: which evolutionary processes take place and how these affect gene function. The group has several of their own lines of research as well as many collaborative projects. The diversity of studies leads to collaboration with people from around the world, from the United States and Europe to Brazil and Malaysia. Their research is based on phylogenetic trees. These reveal the evolutionary relati-onships between genes of different species and are based on the comparison of DNA sequences. Analysis of the trees provides information about which genes have been duplicated or lost and which have accu-mulated the most changes. "Previously, we created a tree by com-paring a single gene in several different species. Now we look at the entire geno-me, some 22,000 genes, meaning we ha-ve to analyse 22,000 trees at the same ti-me", explains Gabaldón. For this reason, one of his lines of research is the develop-ment of information technology tools ca-pable of analysing this huge number of tre-es together, and detecting patterns. These programs have enabled the group to parti-cipate in the annotation of some genomes,

Maruxa Martínez-Campos

El valencià Toni Gabaldón va arribar al PRBB el 2008. D’aleshores ençà ha creat un grup amb una formació mix-

ta de biologia i informàtica que es dedica a comparar genomes des d’un punt de vista evolutiu. Dues preguntes són a la base de la seva recerca: quins processos evolutius tenen lloc i com afecten la funció dels gens. El grup té diverses línies de recerca prò-pies i moltes col·laboracions. La diversitat dels seus estudis el porta a col·laborar amb gent d’arreu del món, des dels Estats Units i Europa fins al Brasil o Malàisia. La seva recerca es basa en els arbres filo-genètics. Aquests arbres mostren les rela-cions evolutives entre els gens de diferents espècies i estan basats en la comparació de seqüències d’ADN. L’anàlisi dels arbres dóna informació sobre quins gens s’han duplicat o perdut o quins han acumulat més canvis. «Abans es creava un arbre comparant un sol gen en unes quantes espècies diferents. Ara mirem tot el genoma, uns 22.000 gens; o sigui, que hem d’analitzar 22.000 arbres alhora», explica Gabaldón. Per això, una de les seves línies de recerca és el desenvolu-pament d’eines informàtiques amb capaci-tat per analitzar aquest gran nombre d’ar-bres alhora i per detectar patrons. Aquests programes han permès al grup participar en l’anotació d’alguns genomes, com el del pugó, publicat l’any passat, o el del linx, que s’acaba de seqüenciar fa uns mesos. El grup estudia qüestions molt diver-ses, sempre amb la mateixa metodologia: comparar seqüències i generar i analitzar arbres. Un dels interessos del grup és en-tendre què passa després de la duplicació de gens: si el nou gen es perd o es diferencia i com és de ràpid aquest procés.

La transferència horitzontal de gens

Una altra àrea d'estudi és la transferència horitzontal de gens (HGT), és a dir, el pas de gens d’una espècie a una altra: «Es creia que només passava a nivell de bacteris, pe-rò nosaltres hem demostrat que en fongs és molt freqüent, i també s’ha vist en insectes». L’arbre de la vida és un altre dels seus te-mes d’interès, el qual intenta plasmar les relacions evolutives entre totes les espècies existents. Fins ara s’havia fet amb uns quants gens, però «ara tenim el genoma complet de

such as of the aphid, published last year, and the lynx, sequenced a few months ago. The group studies very diverse topics, always using the same methodology: the comparison of sequences and the gene-ration and analysis of trees. One of the in-terests of the group is to understand what happens after gene duplication: whether the new gene is lost or differentiated, and how fast this process is.

Horizontal gene transfer

Another issue is horizontal gene transfer (HGT), i.e., the passage of genes from one species to another: "It was thought that this only happened on a bacterial level, but we have shown that in fungi it is very frequent, and it has also been seen in insects". The Tree of Life is another of their areas of interest. It attempts to reflect the evolu-tionary relationships between all existing species. So far this has been done with only a few genes, but "we now have the complete genome of almost 3,000 speci-es and the trend is to double this amount every year –says the head of the group–. I feel we’re in the golden age of comparati-ve genomics. But we need tools to take ad-vantage of this information. Right now, the number of available sequences is increa-sing much faster than computing power". Although the tree of life is a basic concept, it is not without controversy. Currently un-der discussion is whether the tree of life is actually a network. And HGT is important for this issue: if genes are not only passed from one generation to the next, but also between species, the shape of the tree is modified and looks more like a network. Finally, the group is looking at how fun-gi which normally are part of the intestinal flora become opportunistic pathogens in immunocompromised individuals, such as people with AIDS. "There are thou-sands of species that live in our body and only a small proportion of these become pathogens. To understand why, we are se-quencing pathogenic and non-pathogenic species of fungi, and strains which are mo-re and less virulent", says Gabaldón. The group is cataloguing all of the genomic changes they find and constructing phylo-genetic trees. In collaboration with experi-mental experts, they have introduced the different strains into human macrophages to study how the fungi react to them■

El món en un petit grup: nou persones de Veneçuela, França, Croàcia, Mèxic, Grècia, Polònia i Espanya / The world in a nutshell: the nine group members come from Venezuela, France,

Croatia, Mexico, Greece, Poland and Spain

PERFIL DE GRUP / GROUP PROFILE

«Amb els nostres estudis, hem demostrat que el consum d’oli d’oliva augmenta els ni-vells de lipoproteïna d’alta densitat (HDL), el colesterol bo, i que això és directament proporcional al contingut de polifenols que conté. També hem constatat la implicació dels polifenols en la disminució de l’oxida-ció lipídica, un dels principals factors de risc de malaltia cardiovascular», afirma Co-vas. La coordinadora del grup ha estat guar-donada recentment amb un premi atorgat pels productors d’oli d’oliva de Catalunya.

Rosa Manaut/Marta Calsina

L’Autoritat Europea de Seguretat Alimentària (EFSA) ha realitzat un dictamen científic sobre les pro-

pietats saludables de l’oli d’oliva. Aques-ta certificació ha estat possible gràcies a l’aportació del grup de recerca en risc car-diovascular i nutrició de l’IMIM (Institut de Recerca Hospital del Mar), dirigit per Maribel Covas.

The properties of olive oil, recognised by Europe

The European Food Safety Authority (EFSA) has conducted a scientific report on the healthy properties

of olive oil. This certification was made possible thanks to the contribution of the cardiovascular risk and nutrition rese-arch group of the IMIM (Hospital del Mar Research Institute), directed by Maribel Covas.

Les propietats de l’oli d’oliva, reconegudes per Europa "Our studies have demonstrated that the consumption of olive oil increa-ses the levels of high density lipopro-tein (HDL) and good cholesterol, and that this is directly proportional to its polyphenol content. We have also noted the involvement of polyphenols in the reduction of lipid oxidation, a leading risk factor for cardiovascular disease", says Covas. The head of the group was recently awarded a prize by the Catalan olive oil producers ■

Page 3: El·lipse 45: "Five years, five kilometres"

7 febrer de 2011 | www.prbb.org 3 juny de 2011 | www.prbb.org Ciència

Laia Cendrós

Investigadors del CRG han descobert un nou mecanisme per a la classifica-ció i distribució de les proteïnes que

han d’abandonar la cèl·lula en mamífers. El laboratori de Vivek Malhotra ja havia descrit anteriorment el paper d’una proteï-na del citosquelet, l’actina, en la distribució de les proteïnes durant la via de secreció. Ara els investigadors descriuen, en un ar-ticle a Developmental Cell, la implicació de l’actina en el manteniment de l’equilibri del calci a la regió trans del Golgi, la principal estació de classificació de proteïnes de la via de secreció. Com que les proteïnes de secreció, com ara la insulina, els neurotransmissors o els

Com troben el camí les proteïnes anticossos, tenen diversos destins, fins ara es creia que per ser distribuïdes necessi-taven receptors específics. «Hem descrit un mecanisme que no implica receptors específics, sinó que és la concentració de calci a la regió trans del Golgi, crucial per a una bona distribució de les proteïnes», explica Julia von Blume, autora del tre-ball. «És un subtil equilibri que es manté gràcies a la interacció del citosquelet d’ac-tina, proteïnes de remodelació de l’actina i un transportador d’ions de calci. Si aquest equilibri es trenca, un gran nombre de proteïnes no arribaran al seu destí», afe-geix. Segons els autors, aquest descobriment ajudarà a entendre millor patologies com ara la diabetis o l’asma, així com la morfo-gènesi de la pell i dels ossos.

How proteins find their way

Researchers from the CRG have dis-covered a new mechanism for the classification and distribution of

the proteins that have to leave the cell, in mammals. The lab led by Vivek Malhotra had al-ready described the role of a cytoskeleton protein, actin, in the distribution of pro-teins in the secretory pathway. Now the researchers, in an article in Developmen­tal Cell, have described the involvement of actin in maintaining the balance of calcium in the Trans-Golgi Network, the main sorting station for protein secretory pathway. Since the secreted proteins, like insu-lin, neurotransmitters and antibodies,

have various destinations, it was believed until now that their distribution needed specific receptors. "We have described a mechanism that does not involve specific receptors. Instead it is the concentration of calcium in the Trans-Golgi Network which is crucial for a good distribution of proteins", explains Julia von Blume, one of the authors. "It's a subtle balance that is maintained by the interaction of the actin cytoskeleton, actin remodelling proteins and a calcium ion transporter. If this balance is broken, a large number of proteins will not reach their destination", she adds. According to the authors, this discovery will enable a better understanding of dise-ases such as diabetes and asthma, as well as skin and bone morphogenesis ■

Laia Cendrós

Dos investigadors del CRG han descobert un nou mecanisme pel qual mutacions en el gen

BRCA1 poden induir càncer de ma-ma. El treball, que publica la revista Cancer Research, explica el creixement de cèl·lules canceroses amb defectes de BRCA1 a dos nivells: per l’increment de la quantitat de receptor de progestero-na a les cèl·lules i pel seu efecte sobre l’expressió de gens que activen la proli-feració cel·lular. Mutacions al gen BRCA1 poden causar càncer de mama en el 80% dels casos, ai-xí com càncer d’ovari en un 54%. Una de les explicacions d’aquesta especificitat de

Relacionen la progesterona amb el càncer de mama hereditari

BRCA1 per desenvolupar càncer en teixits amb gran acció d’hormones femenines és la funció del gen en la regulació de l’acti-vitat d’aquestes hormones. Miguel Beato i Verónica Calvo han demostrat ara que, quan el gen BRCA1 està mutat, la cèl·lula té més receptors de progesterona, de manera que aug-menta el seu efecte sobre la proliferació cel·lular. Els descobriments posen de manifest la relació directa entre un excés en els efectes de progesterona i el risc de desenvolupar càncer de mama. Això po-dria ajudar a dissenyar millors terà pies que actuïn directament sobre les mo-lècules implicades. Aquesta aportació també podria comportar nous canvis en la prescripció de tractaments anticon-ceptius hormonals.

Progesterone linked to hereditary breast cancer

Two researchers from the CRG ha-ve discovered a new mechanism by which mutations in the gene

BRCA1 can induce breast cancer. The study, published in the journal Cancer Re­search, explains the growth of cancerous cells with BRCA1 defects on two levels: through an increase in the quantity of progesterone receptor in the cells and by its effect on the expression of genes which trigger cell proliferation. Mutations in the gene BRCA1 may cause breast cancer in 80% of cases, and ovarian cancer in 54% of cases. One of the explanations for this specificity of BRCA1 to develop cancer in tissues with

high activity of female hormones is the function of the gene in regulating the activity of these hormones. Miguel Beato and Verónica Calvo ha-ve now demonstrated that when the BRCA1 gene is mutated, the cell has mo-re progesterone receptors, which increa-ses its effect on cell proliferation. The findings reveal the direct relation-ship between an excess of the effects of pro-gesterone and the risk of developing breast cancer. This could help in the design of new therapies to act directly on the molecules involved. It could also lead to changes in the prescription of hormonal contraceptives, as it happened when the relationship between oestrogen levels and the risk of developing breast cancer was demons-trated■

NOTÍCIES CIENTÍFIQUES / SCIENTIFIC NEWS

Núria Pérez

Científics suïssos i catalans han de-mostrat que la diversitat de res-posta a un estímul extern en una

població de cèl·lules depèn del grau de compactació de l’ADN de cada cèl·lula. Aquest descobriment, publicat a la re-vista Science, proporciona el mecanisme molecular a través del qual les cèl·lules fixen un llindar que determinarà de qui-na manera respondran davant d’una si-tuació d’estrès ambiental. Totes les cèl·lules han de ser capa-ces d’adaptar-se als canvis que es pro-dueixen en el seu entorn per sobreviure a les situacions d’estrès cel·lular. Aquesta resposta d’adaptació es basa en una re-programació de l’expressió dels gens de cada cèl·lula. L’equip ha descobert que, davant d’un determinat estímul d’estrès, unes cèl·lules responen i d’altres no, ge-nerant una variabilitat entre la població en la seva resposta a l’estrès. Així, mal-grat que totes les cèl·lules tenen el ma-teix ADN, l’expressió dels seus gens és

Diferent resposta cel·lular a un mateix estrès

diferent. En el seu treball, els investiga-dors descriuen el grau de compactació de l’ADN com la causa principal d’aques-ta variabilitat. El treball s’ha dut a terme gràcies a la col·laboració entre un grup de Zuric di-rigit per Matthias Peter i el grup dirigit per Francesc Posas i Eulàlia de Nadal a la UPF.

Cells respond differently to the same stresses

Swiss and Catalan scientists have demonstrated that the diversity of response to external stimuli in a po-

pulation of cells depends on the degree of DNA compaction in each cell. The dis-covery, published in the journal Science,

provides the molecular mechanism by which cells set a threshold which deter-mines how they respond to a situation of environmental stress. All cells must be capable of adapting to changes in their environment in order to survive situations of cell stress. This adaptive response is coordinated by spe-cialised proteins and based on a repro-gramming of the genetic expression of each cell. The team has discovered that faced with a determined stress stimulus, some cells respond while others do not, generating variability among the popula-tion in their response to the stress. Thus, although all of the cells have the same DNA, their genetic expression is diffe-rent. In their work, the researchers des-cribe the degree of compaction of DNA as the principal cause of this variability. The work was carried out thanks to the collaboration between a group from the Institute of Biochemistry (IBC) at the ETH Institute of Technology (ETH) in Zurich, led by Matthias Peter, and the cell sig-naling research group at the UPF led by Francesc Posas and Eulàlia Nadal■

Francesc Posas, Eulàlia de Nadal i Mariona Nadal-Ribelles

Page 4: El·lipse 45: "Five years, five kilometres"

Ciència www.prbb.org | abril de 2011 4Ciència www.prbb.org | juny de 2011 4

PERFIL / PROFILEAudrey de Nazelle va arribar fa tres anys i mig de la University of North Carolina Chapel Hill, on va fer un doctorat en Ciències Ambientals. Aquesta matemàtica francesa, activista ecologista des de jove, sempre ha tingut clara la importància de les polítiques en salut pública. Actual-ment està fent un postdoc al grup de Mark Nieuwenhuijsen del CREAL, i juntament amb ell lidera el projecte TAPAS, que va començar el 2009 i finalitzarà el 2012.

Audrey de Nazelle arrived here three years ago from the University of Nor-th Carolina Chapel Hill where she had done a PhD in Environmental Scien-ce. This French mathematician, an ecological activist from a young age, has always understood the importance of politics in public health. She is currently doing a postdoc in Mark Nieuwenhuijsen’s group at CREAL, and together with him is leading the TAPAS project, which started in 2009 and which will run until 2012.

«Hem estat els primers a fer servir smart phones en un estudi real amb voluntaris»

Per a què serveix aquest tipus d’informació?Per exemple, per analitzar el tipus de ru-ta que la gent fa servir i de què depèn que triïn un mitjà de transport o un altre. Tam-bé podem comparar les seves rutes amb els mapes de contaminació que tenim i analitzar la seva exposició.

Els smart phones són el futur de les anàlisis d’exposició?Crec que sí que ho són. Aquesta tecnologia i d’altres com la teledetecció són part del que s’anomena «ubiquitous sensing». Pel que sabem, nosaltres hem estat els primers a fer servir aquesta tecnologia d’smart phones en un estudi real amb voluntaris. Però, si pensem que hi ha bilions de persones que fan servir el telèfon mòbil i que es podrien convertir en voluntaris que recullen dades, el potencial és immens. A més del que hem fet ara, es podrien afegir sensors de soroll, de contaminació, etc., i tot lligat a la localit-zació exacta.

Maruxa Martínez-Campos

Qui participa a TAPAS i quin és el seu objectiu?

Nosaltres en som els coordinadors, però hi ha implicats grups de re-cerca de sis països europeus. Vo-

lem entendre l’impacte de les polítiques de transport actiu, com caminar o anar en bicicleta, en la salut de les persones. Estem fent models quantitatius per tal de mesurar aquest impacte en sis ciutats: Barcelona, Basilea, Copenhaguen, París, Praga i Varsòvia. Per a això utilitzem tant dades de la bibliografia existent com da-des locals.

Per a què serviran aquests models?La idea és que es podrà escollir una po-lítica específica de transport actiu, per exemple, la introducció d’una xarxa de carrils bici o d’una tarifa de congestió com la de Londres, i preveure els efectes en la salut que es deriven de la seva apli-cació. Esperem que serveixi com una eina que ajudi els polítics a l’hora de prendre decisions.

De quina mena d’efectes estem parlant?Bàsicament, un increment del transport actiu comporta un augment de l’activitat física en la població. A més, la reducció de transports motoritzats implica menys gasos emesos i, per tant, una millora en la qualitat de l’aire i un fre al canvi climà-tic. Però en els nostres estudis no obli-dem els possibles efectes adversos, com ara un augment d’accidents o una major inhalació de contaminants per part dels qui caminen o van en bici.

Quins estudis heu fet fins ara?Hem fet un primer model teòric sobre el sistema del Bicing i estudis experimentals que ens permetran ampliar el nostre co-neixement. Un és una enquesta a 800 per-sones per entendre el seu comportament respecte al transport actiu. Hem comple-mentat l’enquesta amb un estudi pilot amb 35 voluntaris per obtenir mesuraments més objectius. Durant cinc dies van dur a sobre uns aparells que recollien la seva lo-calització amb un GPS i el seu nivell d’ac-tivitat física amb un software incorporat a un smart phone.

ENTREVISTA / INTERVIEW

AUDREY DE NAZELLE – COORDINADORA DEL PROJECTE TAPAS (CREAL)

CONFERÈNCIES PRBB-CRG / CONFERENCES PRBB-CRG Conference Programme financed by the CRG and the PRBB

“We are the first to use smartphones in a real study with volunteers”

Who is participating in TAPAS and what is its aim?

We are the coordinators, but there are research groups from six European countries

involved. We want to understand the health impact of policies on active trans-port, such as walking or cycling, and we are using quantitative models to mea-sure this impact in six cities: Barcelona, Basel, Copenhagen, Paris, Prague, and Warsaw. To do this we use both the exis-ting literature and local data.

What are these models for?The idea is that one can choose a specific policy of active transport, for example the introduction of a network of bike lanes or a congestion charge such as there is in London, and predict the effects on health that come about because of this. We ho-

pe that the models will serve as a tool to assist policy makers with their decisions.

What kind of effects are we talking about?Basically, an increase in active trans-port means an increase in the physical activity of the population. In addition, a reduction of motorised modes of trans-port means less gases emitted and the-refore an improvement in air quality and climate change mitigation. But our stu-dies do not ignore the possible adverse effects such as an increase in accidents or a greater inhalation of contaminants by those who walk or cycle.

What studies have you done so far?We made a first theoretical model of the Bicing system and undertook experimen-tal studies that allowed us to increase our knowledge. These included a survey of 800 people to understand their beha-viour with respect to active transport. We supplemented the survey with a pilot study of 35 volunteers to obtain more ob-jective measurements. For five days they carried around devices which gathered data about their location with a GPS, as well as their level of physical activity using a piece of built-in smartphone software.

What is this kind of information useful for?We can, for example, analyse the types of routes that people use and what their choice of means of transport depends on. We can also compare their routes with po-llution maps and analyse their exposure.

So smartphones are the future of exposure analysis?I think so, yes. Both this technology and other developments, such as re-mote sensing, which are part of what is known as "ubiquitious sensing". As far as we know, we were the first people to use this smartphone technology in a real study with volunteers. But if we think that there are billions of people who use mobi-le phones, and that they could all become data collection volunteers, the potential is enormous. In addition to what we have already done we could add noise or pollu-tion sensors, for example, with everything pinpointed to its exact location ■

YOSEF SHILOH, Friday June 3. Shiloh, from the De-partment of Human Molecular Genetics & Bioche-mistry of the Sackler School of Medicine at the Tel Aviv University, Israel, investigates the DNA damage response. This research stems from his interest in

the human genetic disorder ataxia-telangiectasia (A-T), in which a central axis of the DNA damage response is missing. To investigate this system he uses cell biology methods, gene targeting in mice, and systems biology methods including high-throughput screens, advanced proteomics and bioinformatics. He has been invited by Juan Valcárcel (CRG).

GUSTAVO CAETANO ANOLLES, Tuesday June 7. Caetano Anolles, from the College of Agricultural, Consumer, and Environmental Sciences at the University of Illinois, Urbana-Champaign, USA, is interested in finding creative ways to mine, visua-

lize and integrate data from structural and functional genomic research. In particular, he studies the evolution of macromo-lecular structures, the function and structure of proteins and ncRNA, the evolution of biological networks, the spontaneous mutation process and the interaction of plants and microbes. He has been invited by Jaume Bertranpetit (UPF).

MIGUEL SACEDA, Monday June 6. Saceda, from the Instituto de Biología Molecular y Celular at the Universidad Miguel Hernández and the Fun-dación del Hospital General Universitario de Elche, Spain, focuses on four research fields: the

molecular mechanisms of cancer cells chemoresistance; the development of new cancer treatments for chemore-sistant tumours; histone deacetylase inhibitors as new ther-apeutics drugs in cancer, and the molecular mechanisms of apoptosis as potential new targets in cancer. Saceda has been invited by Xavier Mayol (IMIM-Hospital del Mar).

Page 5: El·lipse 45: "Five years, five kilometres"

7 febrer de 2011 | www.prbb.org 5 juny de 2011 | www.prbb.org Ciència

STEFAN DIMITROV, Friday June 17. Dimitrov, from the Department of Cell Differentiation and Transformation of the Institut Albert Bonniot in Grenoble, France, is working on the epigenetic functions of histone variants and the role of au-

rora kinases in mitosis and cancer development. These prob-lems are addressed by a combination of molecular and cell biology methods and newly developed physical and biophysi-cal techniques, including protein-DNA UV laser crosslinking and footprinting, elasticity measurements of a single mitot-ic chromosome, optical tweezers for single chromatin fiber stretching, AFM and electron cryo-microscopy or FRAP. He has been invited by Miguel Beato (CRG).

ANDREAS VILLUNGER, Monday June 27. Villunger, from the Division of Developmental Immunology at the Biocenter, Innsbruck Medical University in Inns-bruck, Austria, works on multiple aspects of cell death signalling. In particular, he focuses on the

role and function of pro-apoptotic Bcl-2 family members of the BH3-only subgroup as well as initiator caspases in normal de-velopment and diseases of the haematopoietic system. Some of his ongoing projects include the analysis of the relevance of the BH3-only protein PUMA/bbc3 for the effects of anti-cancer therapy and tumour suppression or the identification of cas-pase substrates. He has been invited by José Yélamos López (IMIM-Hospital del Mar).

SUSANA COHEN-CORY, Monday June 20. Cohen-Cory, from the Department of Neurobiology and Behavior at the University of California in Irvine, USA, is investigating the molecular and cellular mechanisms that control neuron differentiation

and synapse formation, in particular, in the living brain. She is currently focusing on the involvement of neurotrophins during synapse stabilization in actively competing visual in-puts or the differential effects of neurotrophins on pre- ver-sus post- synaptic structures. She is also interested in elu-cidating molecular interactions between neurotrophins and other guidance cues that control synaptogenesis in the de-veloping brain. She has been invited by Berta Alsina (UPF).

Laia Cendrós

En un treball publicat recentment a PLoS Genetics, investigadors del CRG descriuen com el genoma

humà aconsegueix empaquetar-se en una cèl·lula d'esperma. En la majoria de les cèl·lules, l’ADN s’enrotlla al voltant de complexos proteics anomenats nu-cleosomes, que el mantenen compactat i regulen quins gens s’activen i quins es desactiven. En l’esperma, l’ADN ha d’es-tar encara més compactat per tal de cabre en el cap del petit espermatozoide. Com a resultat, els nucleosomes dels esperma-tozoides es mantenen tan sols en alguns llocs del genoma, i són substituïts, en la major part, per altres proteïnes capaces d’una major compactació. Tanya Vavouri, que va fer aquest estu-di al CRG i és ara cap de grup a l'IMPPC, i Ben Lehner, cap del grup de Sistemes Genètics del CRG, van trobar que és la mateixa seqüència del genoma, i en con-cret la proporció de bases G i C respecte a les d’A i T, la que determina on es con-serven els nucleosomes en espermato-zoides madurs. «El genoma humà presenta variacions locals en el contingut de les bases G+C i A+T. El nostre treball suggereix que una raó per a l’existència d’aquesta varia-ció pot ser especificar com l’ADN s’ha d’empaquetar en l’esperma», comenta Vavouri.

Com s’empaqueta l’ADN en un espermatozou «Sorprenentment, els nucleosomes es conserven en els llocs d’inici d’al-guns dels gens més importants –afegeix Lehner–. Com que els nucleosomes són modificats a l’esperma, la seva retenció en aquests llocs podria permetre trans-metre informació addicional a la gene-ració següent. Aquesta és una idea molt interessant que cal investigar més».

How DNA is packaged into a sperm cell

In a work recently published in PLoS Genetics, CRG researchers describe how the human genome is packaged

into a sperm cell. In most cells the DNA is wound around protein complexes ca-lled nucleosomes that keep it compacted and regulate how genes are turned on or off. In sperm, DNA must be even mo-re tightly compacted to fit into the tiny sperm head. As a result, sperm nucleo-somes are only retained at a few sites, being replaced across most of the geno-me by other proteins that lead to higher compaction. Tanya Vavouri, who did this study at the CRG and has now become group leader at the IMPPC, and Ben Lehner, head of the ge-netic systems group at the CRG, have found that it is the sequence of the genome itself that determines where nucleosomes are retained. DNA consists of four bases –A,T,C, and G– and it is the number of G and C ba-ses that is important for the retention of nu-cleosomes in mature spermatozoa.

“The human genome shows local variation in the content of G and C ver­sus A and T bases. Our work suggests that a reason for this may be to spe-cify how DNA is packaged into sperm”, comments Vavouri. “Strikingly nucle-osomes are retained at the start sites of

some of the most important genes –ad-ded Lehner–. Nucleosomes are modified in sperm, and so one could imagine that they may be transmitting extra informa-tion to the next generation at these lo-cations. This is a really exciting idea that should be investigated further” ■

NOTÍCIES CIENTÍFIQUES / SCIENTIFIC NEWS

Les regions d’ADN amb alt contingut GC (groc) coincideixen amb les que retenen els nucleosomes (vermell) / Genomic regions with high GC content (yellow) coincide

with those in which nucleosomes are retained (red)

Ania Liste

Publicada a Nature Cell Biology, una recerca d’investigadors del CMRB corrobora que l’enzim modificador

d’histones LSD1 controla el balanç entre l’autorenovació i la diferenciació de les cèl·lules mare embrionàries humanes. «És com un guardià que manté la pluripo-tència de les cèl·lules mare embrionàries, vigilant que no es diferenciïn en altres cèl-lules o teixits, però que alhora les manté preparades per diferenciar-se quan arri-

Renovar-se o diferenciar-se: LSD1 ajuda les cèl·lules mare a decidir

ba el moment adequat», explica Antonio Adamo, primer signant de l’article. Les histones són proteïnes que regulen l’organització del material genètic. Els au-tors precisen que LSD1 actua evitant que l’expressió dels gens de diferenciació es dispari inadequadament. Això s’aconse-gueix mantenint un balanç de marques epigenètiques que ajusten l’activitat dels gens i, per tant, són clau per determinar la identitat cel·lular. El proper pas serà estudiar la funció de l’enzim LSD1 durant la diferenciació en diferents teixits.

To renew or to differentiate: LSD1 helps stem cells decide

Published in Nature Cell Biology, a study by CMRB researchers con-firms that the histone modifying

enzyme LSD1 controls the balance between self-renewal and differentiation in human embryonic stem cells. "It's like a guardian who maintains the pluripotency of em-bryonic stem cells, taking care that they do not differentiate into other cells or tis-sues, but at the same time keeping them ready to differentiate when the appropria-

te time comes", explains Antonio Adamo, first author of the article. Histones are proteins which regulate the organisation of genetic material. The authors specify that LSD1 acts by preven-ting the expression of differentiation ge-nes initiating improperly. This is achieved by maintaining a balance of epigenetic markers that adjust gene activity and are therefore key in determining cell identity. The next step will be to study the func-tion of the enzyme LSD1 during differen-tiation in different tissues”, conclude the researchers ■

Page 6: El·lipse 45: "Five years, five kilometres"

Diversitat www.prbb.org | juny de 2011 6

Joan Vila

Mai en la història de la humanitat s’havien recollit tantes dades sobre el que ens envolta com

ara. Estan informatitzades les visites que es fan al metge de capçalera, les altes hos-pitalàries, els resultats de les ressonàn cies magnètiques o les característiques dels accidents de trànsit. Les dades donen in-formació molt útil si s’analitzen correcta-ment. Sovint, però, les dades presenten pro-blemes. És el cas, per exemple, de la man-ca de dades (missing) en un estudi perquè els que hi participen no acudeixen a totes les visites programades. També sorgeixen problemes quan en analitzar milions de bases d’ADN es troben relacions entre mutacions i malalties que no són reals, sinó fruit de l’atzar (falsos positius). Els estadístics han de saber mesurar i plas-mar l’efecte d’aquests problemes en els resultats de l’estudi. La modelització de les dades fa que prenguin formes que fan més fàcil la seva

Laia Cendrós

Més de dos-cents especialistes in-ternacionals es van aplegar el maig al CRG per tal de celebrar

la reunió final del projecte Consolider Epi-genètica, on es van presentar els resultats obtinguts pels nou grups de recerca que hi han participat. L’objectiu del projecte era desentrellar el codi epigenètic, basat no en la seqüència d’ADN en si mateixa, sinó en l’estructura i la compactació de l’ADN. «La genètica i la biologia molecular dels propers vint anys se centraran en l’epigenè-

En aquesta imatge pseudoacolorida obtinguda per Gemma Pérez de la UPF es pot observar la millor reso-

lució aconseguida per la microscòpia de depleció per emissió estimulada (stimula­ted emission depletion, STED), a la dreta, comparada amb la microscòpia confocal, a l’esquerra. L’STED és un dels mètodes de superresolució desenvolupats recentment que superen el límit de difracció en la mi-croscòpia òptica, i la unitat de microscòpia avançada CRG/UPF té un dels dos únics sistemes STED que hi ha actualment a Es-panya. Els punts de la imatge mostren la distri-bució de PatL1, un component dels pro­cessing bodies (PB), grànuls citoplasmà-tics dinàmics que estan conservats entre

Epigenetics, an essential field in biology

More than two hundred interna-tional specialists gathered on May 12 and 13 at the CRG to

celebrate the end of the Consolider Epi-genetics project and see the results pre-sented by the nine participating research groups. The aim of the project was to un-tangle the epigenetic code, based not on the DNA sequence itself but rather on the DNA structure and compaction. "Over the next twenty years genetics and molecular biology will be focused on

tica», afirma Miguel Beato, organitzador de la reunió i director del CRG. «Queda mol-ta tecnologia per desenvolupar en aquest camp», insisteix. El projecte ha reunit els millors grups de recerca espanyols en aquest camp i ha donat lloc en quatre anys a la publicació d’uns 150 articles. «Catalunya i Espanya estan jugant un paper important en la re-cerca epigenètica a Europa i, per això, el projecte Consolider Epigenètica ha estat crucial. És una llàstima que no tingui con-tinuïtat. Seria raonable que els projectes que han donat bons resultats fossin ava-luats i recolçats», declara Beato.

tots els eucariotes. Els PB són massa petits i estan massa a prop per ser diferen ciats mitjançant microscòpia confocal, que té una resolució màxima de 200 nm. La mi-croscòpia STED, en canvi, és capaç de re-soldre distàncies de menys de 80 nm, de manera que pot mostrar en detall la mida i distribució dels PB (barra = 1 µm).

Breaking the diffraction barrier

In this pseudocolored image by Gem-ma Perez from the UPF, we can ob-serve the improvement in resolution

of stimulated emission depletion (STED) microscopy (right), compared with con-focal microscopy (left). STED is one of the recently developed super-resolution

methods that have broken the diffraction limit in light microscopy, and the CRG/UPF advanced light microscopy unit has one of the only two STED systems cur-rently available in Spain. The dots in the image show the dis-tribution of PatL1, a component of pro-cessing bodies (PB). These are dynamic cytoplasmatic granules that are conser-

epigenetics", states Miguel Beato, orga-niser of the meeting and director of the CRG. "There still remains much techno-logy to develop in this field", he insists. The project has brought together the top Spanish research groups working in the field and has resulted in about 150 papers being published over the four years. "Cata-lonia and Spain are playing an important role in European epigenetic research, and the Consolider Epigenetics programme has been crucial. It's a shame that it is to be dis-continued. It would be reasonable that the projects which have been successful were assessed for continuation", says Beato.

and diseases may be found which are not real, but rather chance (false positives). Sta-tisticians have to find ways to measure the effect of these problems in the results of the study. Modelling the data means it assumes forms that make it easier to analyse. For example, people’s heights follow a distri-bution known as 'normal' (symmetrical, with the majority of individuals grouped

around the average), the number of traffic accidents shows a Poisson distribution (the mean and the variability are equal), while the number of people who die in an intensive care unit has a binomial distribu-tion. Most of the data fits a known distribu-tion or a mixture of distributions, but it is not always easy to find the most appropri-ate. Expressing results as figures is, indeed, an art ■

Com pot ajudar l’estadística a la recerca?

Epigenètica, un camp essencial en la biologia

Trencant la barrera de la difracció

anàlisi. Així doncs, per exemple, l’alçada de les persones segueix una distribució anomenada «normal» (simètrica; la majo-ria d’individus al voltant de la mitjana) i el nombre d’accidents de trànsit segueix una distribució de Poisson, mentre que el nom-bre de persones que moren en una unitat de cures intensives segueix una distribució binomial. La majoria de dades s’adapten a una distribució coneguda o a una barreja de distribucions, però no sempre és fàcil trobar la més adequada. Expressar resultats en forma de figura és, de fet, tot un art.

How can statistics help research?

Never before in human history has so much data been gathered on the things around us. Visits to the

GP, discharged patients, MRI results and characteristics of traffic accidents are all computerised. All these data can provide useful information if properly analysed. Often, however, the data presents pro-blems. For example, data will be missing if the participants do not attend all scheduled visits. Or relationships between mutations

CIÈNCIA AL DESCOBERT / SCIENCE UNCOVERED

NOTÍCIA CIENTÍFICA / SCIENTIFIC NEWS

FOTO CIENTÍFICA / SCIENTIFIC PHOTO

Distribució normal (alçada) i distribució de Poisson (nombre d'accidents) Normal distribution (height) and poisson distribution (number of accidents)

ved among eukaryotes. PBs are too small and sometimes are in too close vicinity to be properly rendered by confocal ima-ging, which has a maximal resolution of 200 nm. In contrast, STED microscopy is capable of resolving distances of <80 nm and can therefore show more details of the processing bodies sizes and distribu-tion (bar= 1 µm) ■

Page 7: El·lipse 45: "Five years, five kilometres"

7 febrer de 2011 | www.prbb.org 7 juny de 2011 | www.prbb.org Diversitat

RETRAT / PORTRAIT

Joana Guerra(Sant Pere de Ribes, 1986)

PhD student, UPF

Quins són els teus hobbies?La música i l’esport: toco el piano i la guitarra, i jugo en un equip de vòlei.

Què et faria totalment feliç?Que la gent fos conscient que abans de la mort hi ha vida. Potser així canalitzaríem les energies a fer-la fàcil per a tots i no destruir-la.

Què és el que més et molesta?Quan estic fent una argumentació i la gent m’interromp. No ho suporto!

Quin és el teu personatge favorit?Totes aquelles dones que durant la història han lluitat i, sovint, han donat la seva vida per aconseguir la igualtat.

Quin és el teu millor defecte?No saber estar sense fer res.

Quin talent t’agradaria tenir?Dibuixar.

El teu lema?Prefereixo penedir-me del que he fet abans de penedir-me del que no he fet.

Which are your hobbies?Music and sports. I play the piano and the guitar, and I am part of a volleyball team.

What would make you happy?That people were aware that before death there’s life. Maybe this way we would focus our energies in making life easier for everyone, rather than destroying it.

What bothers you most?When I am making a point and someone interrupts me. I can’t stand it!

Who is your favourite person in fiction or real life?All the women who have fought and often even given their life in order to achieve equality.

What is your best defect?I cannot be without doing something.

What talent would you like to have?Drawing.

Your motto?I would rather regret something I have done than something I haven’t done ■

conflicting information?”, around 150 pri-mary school students will discover that there are scents that not everyone can perceive, that we need both eyes to see in three dimensions, and that fish 'listen' with their whole body. The boys and girls, aged between 8 and 12, can put on a white coat and explore the world of the senses and perception for an entire morning, through experiments that they themselves do in the laboratory. In ad-dition, they have the opportunity to visit the centre’s facilities. The new workshop expands the educa-tional programme “Science at the CRG” which up to now has been offering “The cell, a well-organized factory”, where stu-dents look at several aspects of the cell and its function. "The programme aims to arouse interest in science and disco-very among young people and publicise the research that is being done both at the centre and in Catalonia", says Miguel Be-ato, director of the CRG. Both workshops take place several times a month, and schools can book a place via the website www.bcn.cat/educacio/pae■

Lliurament del VI Premi PRBB

Mònica Rodríguez

El dissabte 14 de maig es va realitzar l’acte de lliurament del VI Premi PRBB, organitzat per la UPF i el PRBB

i que s’atorga als millors treballs de recerca d’estudiants de secundària en l’àmbit de les ciències de la salut i de la vida. En aquesta sisena edició es van presentar 123 treballs provinents de 29 comarques de Catalunya. Un 70% dels participants van declarar que es volen dedicar a la medicina o a la recerca bio-

Laia Cendrós

Gràcies al nou taller que el CRG ha inaugurat el maig amb el nom «Els sentits i el cervell, informació con-

tradictòria?», uns 150 alumnes de primària descobriran que hi ha olors que no tothom percep, que es necessiten tots dos ulls per veure en tres dimensions i que els peixos «hi senten» per tot el cos. Els nens i nenes entre 8 i 12 anys ara poden posar-se la bata blanca i explorar el món dels sentits i la percepció durant tot un matí, a partir d’experiments que ells mateixos fan al laboratori. A més, també tenen l’oportunitat de visitar les instal·lacions del centre. El nou taller amplia el programa edu-catiu «Ciència al CRG», que fins ara ofe-ria el taller «La cèl·lula, una fàbrica ben organitzada», on l’alumnat es qüestiona diversos aspectes sobre la cèl·lula i el seu funcionament. «L’objectiu del programa és despertar l’interès per la ciència i la desco-berta entre els més joves i també donar a conèixer la recerca que s’està fent al centre

i a Catalunya», indica Miguel Beato, direc-tor del CRG. Ambdós tallers es realitzen diverses vegades al mes, i les escoles poden reservar plaça mitjançant el web www.bcn.cat/educacio/pae.

Little scientists discover the mysteries of the senses

Thanks to the new workshop which the CRG has inaugurated in May, named “The senses and the brain,

Petits científics descobreixen els misteris dels sentits

mèdica, mentre que un 11% encara estaven indecisos. L’acte va tenir lloc a l’Auditori i va estar obert a tots els participants i els seus amics i familiars. Els més de 80 assistents van po-der visitar l’edifici, veure l’exposició de tots els treballs a la plaça del PRBB i escoltar la presentació del treball guanyador, «Lavate­ra olbia (espècie autòctona en regressió)», de Ferran Cirac, estudiant de l’IES Vilatzara, de Vilassar Mar. El segon premi va ser atorgat a Sergi Ca-sadó, de l’Escola Pia de Sant Antoni, i el ter-cer, a David Mas, de l’Institut Mare de Déu de les Escoles Pies. Els premis d'enguany han consistit en un iPad i en passar un dia en un grup de recerca del PRBB per al pri-mer premi, un netbook per al segon premi i una col·lecció de llibres de divulgació cien-tífica per al tercer premi.

VI Premi PRBB award ceremony

The award ceremony of the VI Premi PRBB, organized by the UPF and the PRBB, took place on Saturday May

14. This prize is given each year to the best research work by high school students in the field of health and life sciences. In this sixth edition 123 works were submitted from 29 regions of Catalonia. About 70% of the participants said they would like to work on medicine or biomedical research, whilst 11% were still undecided about what to study. The ceremony took place at the audito-rium and it was open to all participants, friends and family. More than 80 attendees visited the building, looked at all the works exposed at the inner square and listened to the presentation of the winner work, “Lavatera olbia (autoctonous species in regression)”, by Ferran Cirac, a student of the IES Vilatzara, de Vilassar de Mar. The second and third prizes were awarded to Sergi Casadó of the Esco-la Pia de Sant Antoni and David Mas of the Institut Mare de Déu de les Esco-les Pies. This year, the first prize was an iPad and a day with a research group at the PRBB. The second prize was a net-book and the third one a collection of science popularisation books ■

NOTÍCIES GENERALS / GENERAL NEWS

CAMPANYA DE PREVENCIÓ / PREVENTION CAMPAIGN

Jordi Camí felicita el guanyador, Ferran Cirac Jordi Camí and the winner, Ferran Cirac

© J

ordi

Cas

añas

Alumnes de l’escola Patronat Domènech Students from the Patronat Domènech school

Es canvien les etiquetes dels productes químics. L’1 de desembre de 2010 es van co-mençar a canviar les etiquetes que identifi-quen els productes químics potencialment perillosos, per tal d’homogeneïtzar-les amb la resta de països del món. El sistema antic conviurà amb el nou fins a l’1 de desembre de 2012, data a partir de la qual només es farà servir el sistema nou. Durant el mes de maig s’ha realitzat una campanya informati-va sobre aquest tema, la primera de les dot-ze campanyes mensuals que es realitzaran al PRBB sobre prevenció de riscos laborals.

Chemical product labels are changing. From December 1, 2010, all labels of hazar-dous products have started to change with the aim of creating a global standard across all countries in the world. Both the new system and the old one will be valid until December 1, 2012. From that time onwards only the new system will be used. To make sure everyone gets to know the new labels, an information campaign has taken place in May. It is the first of the 12 monthly cam-paigns that will take place at the PRBB re-garding risk prevention at work ■

NOTÍCIA BREU / BRIEF NEWS

Nous espais d'incubació UPF Business Shuttle. A partir de l’1 de juny estaran dispo-nibles els nous espais d'incubació de la UPF Business Shuttle, que inclouen projectes de l’àrea de la biomedicina al PRBB. Els 290 m2

estaran gestionats per la Unitat d'Innovació i Parcs de Recerca de la UPF i s’ubicaran a la se-gona planta de l'edifici de la nova incubadora Almogàvers Business Factory, impulsada per Barcelona Activa. Abans de l’estiu s'hi instal-laran qGenomics, una spin­off recent consti-tuïda per la UPF i el CRG, i Chemotargets, una spin­off de l’IMIM creada el 2006.

New UPF Business Shuttle Incubator. As of June 1 there will be new incubation spa-ces available which are to include projects from the biomedical groups at the PRBB. The 290 m2 site will be managed by the Unit for In-novation and Research Parks of the UPF and is located on the second floor of the Almogàvers Business Factory building, a new business in-cubator driven forwards by Barcelona Activa. Two companies are set to move in before the summer: qGenomics, a recent spin-off from the UPF and CRG, and Chemotargets, a spin-off from the IMIM, founded in 2006 ■

Page 8: El·lipse 45: "Five years, five kilometres"

Si voleu enviar una «carta al director» per a la seva publicació a l’El·lipse, si us plau envieu el vostre text a [email protected] you would like to send a “letter to the editor” for its publication in El·lipse, please send it to [email protected]

Direcció:Jordi Camí, Reimund Fickert i Elvira López

Assessor: Manuel Lamas

Redacció i edició:Maruxa Martínez-Campos

Gestió: Isabel Ràfols

Comitè editorial:Rosa Manaut (IMIM/Hospital del Mar)

Maribel Pérez (Hospital del Mar) Gisela Sanmartin (CREAL)

Marc Permanyer (UPF)Núria Pérez (UPF)

Glòria Lligadas (CRG)Ania Liste (CMRB)

Mònica Rodríguez (PRBB)María Escrivá (FPM)

Centres: Institut de Recerca de l’Hospital del Mar (IMIM)

Departament de Ciències Experimentals i de la Salut de la Universitat

Pompeu Fabra (CEXS-UPF)Centre de Regulació Genòmica (CRG)

Centre de Medicina Regenerativa de Barcelona (CMRB)

Centre de Recerca en Epidemiologia Ambiental (CREAL)

Fundació Pasqual Maragall (FPM)

Adreça:Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona (PRBB)

c/ Dr. Aiguader, 88 • E-08003 Barcelona E-mail: [email protected]

Web: www.prbb.org

Maquetació i impressió:Taller Editorial CEGE (www.tallereditorial.com)

Imprès en paper reciclat

Dipòsit legal: B. 23.796-2009 Si voleu una còpia gratuita d’aquest diari

si us plau contacteu-nos a [email protected]

Edifici www.prbb.org | juny de 2011 8

Envieu les vostres fotos del PRBB a / Send your pictures of the PRBB to: [email protected]

LA FOTO DEL MES / PHOTO OF THE MONTH

Foto Jelena Stanisavljevic (IMIM) / Photo by Jelena Stanisavljevic (IMIM)

AGENDA

NOTÍCIES BREUS / BRIEF NEWS

10a convocatòria de Novartis per una beca postdoctoral en genòmica. L’objec-tiu d’aquestes beques, que es convoquen anual ment, és contribuir a l’impuls de la recerca genòmica a Espanya. Enguany s'ofereix un contracte de dos anys per a la incorporació d'un d’investigador postdoc-toral als laboratoris del CRG. «L’aportació de fons privats és molt important per man-tenir i millorar la qualitat de la recerca que es duu a terme a Espanya», expressa Miguel Beato, director del CRG. El procés de selec-ció s’acaba d’obrir i es tancarà l’1 de setem-bre de 2011. Per a més informació, podeu consultar la web www.novartis.es.

10th edition of the Novartis postdocto-ral fellowships in genomics. These grants seek to contribute to the promotion of ge-nomics research in Spain. This year they offer a two-year contrac for the incorporati-on of a postdoctoral researcher to the CRG. "The contribution of private funds is very important to maintain and improve the quality of research carried out in Spain", explains Miguel Beato, director of the CRG. The selection process has just opened and will close on September 1, 2011. For more information please visit www.novartis.es.

Creu Roja atorga la Medalla d’Or a la Fun-dació Pasqual Maragall. Amb aquest guar-dó, Creu Roja Espanyola reconeix la tasca de la fundació en la recerca i divulgació de la malaltia d’Alzheimer. L'acte de lliurament va estar presidit per la Reina Sofia el 10 de maig passat a Logronyo, amb motiu de la comme-moració del Dia Mundial de la Creu Roja i la Mitja Lluna Roja. En representació de la fun-dació van recollir el guardó Pasqual Maragall i Diana Garrigosa.

Pasqual Maragall Foundation awarded with the Red Cross Gold Medal. With this award the Spanish Red Cross acknowledges the work carried out by the foundation in promoting research into and knowledge of Alzheimer's disease. The ceremony was presided over by Queen Sofia on May 10 in Logroño, on World Red Cross and Red Crescent commemoration day. The award was received by Pasqual Maragall and Dia-na Garrigosa on behalf of the foundation.

Nou portal sobre fibromiàlgia i fatiga crò-nica. Els hospitals del Mar i l’Esperança han posat en marxa un nou portal per tal de fomentar l’autogestió de la salut dels afec-tats per aquestes malalties: www.parcde salutmar.cat/fibromialgia. La pàgina web conté informació sobre el funcionament de la Unitat de Fibromiàlgia i Síndrome de Fa-tiga Crònica dels hospitals i continguts d’in-terès, com ara símptomes de les malalties, així com informació dirigida als professio-nals sobre el diagnòstic i tractament i sobre els projectes actuals de recerca. A més, s’ha creat un espai de relació metge-pacient.

New portal on fibromyalgia and chronic fatigue. The Hospitals del Mar and l’Es-perança have launched a new portal to encourage and improve health self-mana-gement of those affected by these diseases: www.parcdesalutmar.cat/fibromialgia. The website contains information about the Fibromyalgia and Chronic Fatigue Syndro-me Unit of these hospitals and content on symptoms and disease prevention, as well as information aimed at professionals on diagnosis and treatment and current rese-arch projects. There is also a space for phy-sician-patient relationships ■

El «I Curs de formació per a personal experimentador», organitzat pel PRBB i l’Escola Bonanova i acre-

ditat per la Generalitat de Catalunya, va tenir lloc el maig passat. Hi van participar 22 persones provinents d'institucions de recerca, de la indústria farmacèutica i de mòduls de formació professional. El curs, obligatori per als tècnics que tre-ballen amb animals d’investigació, és el primer que es fa a Espanya a través d’una escola de formació professional. «La va-loració dels participants ha estat molt positiva. La idea és repetir aquest curs cada any», explica Juan Martín Caballe-ro, director de l’estabulari. D’altra banda, una col·laboració de l’empresa Harlan amb el PRBB ha donat lloc a les primeres Jornades de Formació Continuada per a professionals que treballen amb animals

d’investigació. Aquest curs consta de sis seminaris, que tindran lloc al PRBB en-tre maig i novembre de 2011. Els temes tractats inclouran l’obtenció de ratolins transgènics o la seguretat biològica, entre d’altres. Els seminaris són gratuïts, prèvia inscripció a [email protected].

Learning about research with animals

The "I Training course for experi-mental personnel", organised by the PRBB and the Escola Bonano-

va and accredited by the Catalan govern-ment, was held last May. There were 22 participants from research institutions, the pharmaceutical industry and profes-sional training programmes. The course, which is compulsory for all of the techni-cians who work with research animals, is the first carried out in Spain through a professional training school. "The par-ticipants’ assessment was very positive. Now the idea is to repeat this course each year", explained Juan Martín Caballero, director of the animal facility. In additi-on, a collaboration of the PRBB with the company Harlan has resulted in the first Continued Training Seminars directed at professionals who work with research animals, from caregivers to researchers. This course consists of six seminars to be held at the PRBB between May and No-vember 2011. The topics covered include, among others, how to obtain transgenic mice or biological safety. The seminars are free, but registration is needed at [email protected]

2, 9, 16, 21 i 30 de juny. Intervals course on scientific writing, with Carolyn Newey, 4pm.

7 i 8 de juny. Intervals course “How to write a grant proposal”, with Bruna Vi-ves and Michela Bertero.

10 de juny. II CRG Postdoc Symposium: "Proteins vs RNAs in gene regulation: a fight with no rules", at the PRBB Audi-torium. Free registration at www.crg.eu.

16 de juny. INMA Conference on toxi-city and child development, by Philippe Grandjean at CosmoCaixa, 7pm. INMA Symposium on June 17. Registration before June 3 at www.proyectoinma.org

15 i 22 de juny. Intervals course on au-dio podcasts. From 3pm.

17 de juny. Deadline for registration to “Johns Hopkins Fall Institute in Health Policy and Medical Care” which will take place in November: www.jhsph.edu/dept/hpm.

21 i 22 de juny. “Bioinformatics for integrative genomics” at the UPF Mar-Campus. http://bg.upf.edu/course-big.

Per a més informació, entreu al portal prbb.net.

For more information please go to the prbb.net portal.

FORMACIÓ/ TRAINING

Cursos sobre l’ús d’animals

Participants del curs Participants of the course