临床检验通讯 -...

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检验科分子诊断项目简介 一.MTHFR 基因分型检测 1. 检测原理: 5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)是叶酸 代谢中的关键酶。它可以将 5,10 一亚甲基四氢叶 酸还原为 5-甲基四氢叶酸, 从而作为甲基的间接 供体参与体内嘌呤、嘧啶的合成及 DNARNA蛋白质的甲基化,同时维持体内同型半胱氨酸 HomocysteineHcy)的代谢平衡。MTHFR 677 C->T 的改变可导致 MTHFR 酶活性降低, 造成叶酸代谢障碍,从而引发多种疾病,其中以高 同型半胱氨酸血症引起的脑卒中以及新生儿缺陷 最为严重。MTHFR 基因(677 位点)存在遗传多态 性,即:CC 型(野生型)、CT(突变杂合型)和 TT(突变纯合型)。 此项检测是基于基因芯片技术。基因芯片的测 序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的 核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基 片表面固定了序列已知的八核苷酸探针。当溶液中 带有荧光标记的核酸序列,与基因芯片上对应位置 的核酸探针产生互补匹配时,通过确定荧光强度 得到样品 DNA 扩增产物与每个基因位点的野生型 和突变 最强的探针位置,获得一组序列完全互补的探针序 列。据此可重组出靶核酸的序列。 具体检测过程为从人外周血细胞中提取基因组 DNAMTHFR 基因特异引物经过 PCR 扩增后, 将带有生物素标记的扩增产物与固定在醛基基片 上的 MTHFR 基因型检测探针进行特异性杂交反 应,并通过酶促显色反应,使特异性杂交信号呈现 出颜色;通过对芯片进行扫描,型探针杂交形成的 杂交图像;经过软件分析该图像,判断待检样品的 基因型。 2. 标本要求: 抗凝血 2ml,血常规管(即 EDTA 抗凝管)。 3. 临床意义: MTHFR 基因 677 位由 C 突变为 T 可导致蛋白 一级结构中丙氨酸被缬氨酸替代,从而降低蛋白活 性和热稳定性,导致叶酸代谢通路异常。由于叶酸 的缺乏可能导致: 1)孕妇妊娠高血压和习惯性流产 2)新生儿出生缺陷(如:神经管缺陷、唐氏综 合症和唇腭裂) 3)高同型半胱氨酸血症,增加动脉粥样硬化、 冠心病和脑卒中的发病风险。 临床检验通讯 临床检验通讯 2016 年第 3 2016 10 31 主办:检验科 主编:陈葳 副主编:王亚文

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Page 1: 临床检验通讯 - 西安交通大学...此项检测是基于基因芯片技术。实验程序为: 从血液样品中提取基因组DNA、PCR扩增目的序 列、芯片杂交反应和芯片识读仪扫描得出基因分型

检验科分子诊断项目简介

一.MTHFR基因分型检测

1. 检测原理:

5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)是叶酸

代谢中的关键酶。它可以将 5,10一亚甲基四氢叶

酸还原为 5-甲基四氢叶酸, 从而作为甲基的间接

供体参与体内嘌呤、嘧啶的合成及 DNA、RNA、

蛋白质的甲基化,同时维持体内同型半胱氨酸

(Homocysteine,Hcy)的代谢平衡。MTHFR 基

因 677位C->T的改变可导致MTHFR酶活性降低,

造成叶酸代谢障碍,从而引发多种疾病,其中以高

同型半胱氨酸血症引起的脑卒中以及新生儿缺陷

最为严重。MTHFR基因(677位点)存在遗传多态

性,即:CC型(野生型)、CT(突变杂合型)和

TT(突变纯合型)。

此项检测是基于基因芯片技术。基因芯片的测

序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的

核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基

片表面固定了序列已知的八核苷酸探针。当溶液中

带有荧光标记的核酸序列,与基因芯片上对应位置

的核酸探针产生互补匹配时,通过确定荧光强度

得到样品DNA扩增产物与每个基因位点的野生型

和突变

最强的探针位置,获得一组序列完全互补的探针序

列。据此可重组出靶核酸的序列。

具体检测过程为从人外周血细胞中提取基因组

DNA;用 MTHFR基因特异引物经过 PCR扩增后,

将带有生物素标记的扩增产物与固定在醛基基片

上的 MTHFR基因型检测探针进行特异性杂交反

应,并通过酶促显色反应,使特异性杂交信号呈现

出颜色;通过对芯片进行扫描,型探针杂交形成的

杂交图像;经过软件分析该图像,判断待检样品的

基因型。

2. 标本要求:

抗凝血 2ml,血常规管(即 EDTA抗凝管)。

3. 临床意义:

MTHFR基因 677位由 C突变为 T可导致蛋白

一级结构中丙氨酸被缬氨酸替代,从而降低蛋白活

性和热稳定性,导致叶酸代谢通路异常。由于叶酸

的缺乏可能导致:

(1)孕妇妊娠高血压和习惯性流产

(2)新生儿出生缺陷(如:神经管缺陷、唐氏综

合症和唇腭裂)

(3)高同型半胱氨酸血症,增加动脉粥样硬化、

冠心病和脑卒中的发病风险。

临床检验通讯临床检验通讯2016 年第 3 期 2016 年 10 月 31 日

主办:检验科 主编:陈葳 副主编:王亚文

Page 2: 临床检验通讯 - 西安交通大学...此项检测是基于基因芯片技术。实验程序为: 从血液样品中提取基因组DNA、PCR扩增目的序 列、芯片杂交反应和芯片识读仪扫描得出基因分型

因此,基因检测的意义在于:

1)指导孕妇合理补充叶酸

参照《中国居民膳食营养素参考摄入量》和美

国疾控预防中心建议,推荐孕期每天补充 400 微

克叶酸,将显著降低新生儿的出生缺陷。对于

MTHFR基因异常的人,酶活性明显降低,对叶酸

代谢造成障碍,导致新生儿神经管缺陷、唇腭裂等

疾病的发病风险明显增高。对于这类人需要补充更

多的叶酸才能达到预期的效果。

2)提示凝血倾向,揭示脑卒中、冠心病发病风险

MTHFR基因正常的人,摄入的叶酸能够在

体内顺利代谢,同型半胱氨酸的水平较低。这类人

脑中风、冠心病和静脉血栓的发病风险较低。

MTHFR基因异常的人,摄入的叶酸在体内的代谢

途径受阻,可能引起高同型半胱氨酸血症,干扰内

皮细胞的抗凝功能,导致凝血倾向增高,因此发生

脑中风、冠心病以及静脉血栓的风险也增高,基因

突变患者(CT、TT型)需要通过补充叶酸摄取来

预防心血管疾病。

利用基因检测筛选出 HCY高风险人群,早发

现早预防。使发生过脑卒中的患者降低再次发病的

概率,使没有发病的患者降低发病率,延缓发病时

间,甚至不发病。

4. 结果解释:

(1)针对于妇产科:

MTHFR基因 CT型,尤其是 TT型孕妇:对

于孕龄女性需每日补充 400ug叶酸,建议在孕前 3

个月每日补充 2-3次叶酸,每次 400微克。分次小

剂量补充比一次性大剂量补充效果好。而孕早期建

议每日补充 600-800ug叶酸,孕中期和晚期也可适

当补充叶酸此外还应加强膳食中叶酸的摄取。且需

严密监视血压防止妊娠高血压的发生。

MTHFR 基因 CC型孕妇:只需按推荐剂量每

日补充 400ug叶酸即可,同时注意膳食中的叶酸摄

取。

叶酸摄入不宜过量,长期过量服用(每日超过

1000ug),会干扰孕妇的锌代谢,同样会影响胎儿

发育。还可能引起体内的 B12缺乏,导致胎儿神

经系统受损。

具体叶酸用量可总结为表格中所示:

基因型 孕前(备孕阶段) 孕早期 孕中期 孕晚期

CC型 400ug 400 ug加强食物

中摄取

加强食物

中摄取

CT型 800 ug 600 ug加强食物

中摄取

加强食物

中摄取

TT型1200 ug (2个月

后改 800 ug)800 ug

400 ug或

加强食物

中摄取

400 ug或

加强食物

中摄取

(2)针对于神经内科、老年病科和心内科

MTHFR基因 CC型患者在经过叶酸合并相关

药物治疗使血液同型半胱氨酸水平降至正常后,要

注意膳食中的叶酸摄取,严密控制血压且定期复查

血液中同型半胱氨酸水平,若血压或同型半胱氨酸

水平有所升高则遵医嘱及时补充叶酸和采取降压

措施以免出现不良后果。

MTHFR基因 CT型,尤其是 TT型患者在经过

叶酸合并相关药物治疗使血液同型半胱氨酸水平

降至正常后,还需不间断补充叶酸以维持正常的同

型半胱氨酸水平。TT型患者可每日或隔日补充约

1000微克叶酸,同时严密控制血压且定期复查血

液中同型半胱氨酸水平。

二. CYP2C19基因分型检测

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1. 检测原理:

肝药酶 CYP2C19是药物代谢酶细胞色素 P450

家族中的一员,它是药物代谢的第一相酶,在很大

程度上决定着药物的代谢速率与药物的清除率。

CYP2C19基因存在至少 18种多态性,包括*2,*3,

*4…*17…等突变类型,其中的*2,*3两个位点可

覆盖 99%以上中国突变人群。本项目检测人基因

组 CYP2C19基因两个位点:*2 G681A,*3 G636A,

通过基因型评估 CYP2C19酶代谢能力。该基因型

可分为:野生型(*1/*1);突变杂合型(*1/*2)、

(*1/*3);突变纯合型(*2/*3)、(*3/*3)、(*2/*2)。

目前药物基因组学研究发现,CYP2C19不同基因

型人群间药物动力学特征存在较大差异。

氯吡格雷是一种前体药物,只有通过机体的代

谢才会产生抗凝血的生物活性,在被肝酶

CYP2C19代谢转化为其活性形式之前,该药品不

具有抗血小板凝集的作用。因此,基因突变尤其是

突变纯合型的患者,肝药酶活性会非常差甚至没有

活性,所以不能将氯吡格雷代谢为可发挥抗凝作用

的活性成分,使患者难以获益甚至延误病情。据此

建议拟使用氯吡格雷的患者在尽量用药前进行基

因型检测,科学评估氯吡格雷的使用剂量以及是否

适合服用氯吡格雷进行抗凝治疗。

此项检测是基于基因芯片技术。实验程序为:

从血液样品中提取基因组 DNA、PCR扩增目的序

列、芯片杂交反应和芯片识读仪扫描得出基因分型

结果。CYP2C19基因检测结果分为 6种类型,即:

*1*1型、*1*2型、*1*3型、*2*2型、*3*3型和

*2*3型。

2. 标本要求:

抗凝血 2ml,血常规管(即 EDTA抗凝管)。

3. 临床意义:

指导经由 CYP2C19 代谢的药物的临床应用。

该基因检测重点应用于抗血小板聚集抑制剂(如氯

吡格雷)、质子泵抑制剂、抗抑郁药,抗癫痫药、

肿瘤药等,提高用药的安全有效性,减少毒副反应

或无效用药情况的发生:

(1)氯吡格雷是经 CYP2C19酶代谢后才产生作

用的前体药物,*2、*3 突变基因携带者服用氯吡

格雷时须注意无效风险,建议考虑增加剂量或者换

药;

(2)快代谢类型者(*1/*1)服用质子泵抑制剂

奥美拉唑、兰索拉唑时,按经验给药剂量可能不足,

建议适当加量;

(3)*2/*3突变基因携带者服用正常剂量伏立康

唑可能产生较高血药浓度导致肝毒性,建议适当减

量;

(4)同时经过 CYP2C19酶代谢的两种药物,*2、

*3突变基因携带者尽可能避免同时服用。

(5)药物于人体的代谢过程十分复杂,受年龄、

种族、环境等多种因素影响,临床医生可根据患者

临床表现,将 CYP2C19基因型作为临床指标之一,

结合自己的专业知识作出判断。

临床上常用的经由 CYP2C19代谢的药物

质子泵抑

制剂抗抑郁药 抗癫痫类 其他

Omepra

zeolFluoxetine Imipramine

Valproic

acidVoriconazole

奥美拉

氟西汀

(百忧

解)

丙咪嗪 丙戊酸伏立康唑(抗

真菌药)

Lansopr

azole

Citalopra

m

Moclobemi

dePhenytoin Progesterone

兰索拉

唑西酞普兰 吗氯贝胺 苯妥英

黄体酮(孕激

素)

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Pantopra

zole

Escitalopr

am

Trimiprami

ne

Phenobarb

ituoneRifampicin

泮托拉

艾司西酞

普兰曲米帕明 苯巴比妥

利福平(抗菌

药物)

Rabepra

zole

Amitriptyl

ineEtizolam Diazepam Clopidogrel

雷贝拉

唑阿米替林 依替唑仑 安定

氯吡格雷(抗

血小板聚集

抑制剂)

Clomipla

mineNelfinavir

氯米帕明那非那韦(抗

HIV病毒)

Clobazam Proguanil

氯巴占氯胍(抗疟疾

药)

Cyclophosph

amide

环磷酰胺(抗

肿瘤药)

三.华法林基因分型检测

1. 检测原理:

华法林主要用于预防和治疗深静脉血栓、肺栓

塞,预防心脏瓣膜置换术、髋关节置换术以及房颤

引起的血栓栓塞并发症,但临床发现其疗效和出血

反应个体差异极大,且药物起效和失效缓慢,需要

频繁调整药物剂量 、凝血酶原时间(PT)和国际

标准化比值(INR),所以剂量很难掌握,这些因

素大大阻碍了华法林临床使用的易用性。

因为华法林在体内的代谢和药效受基因变异的

影响较大,因此检测华法林体内代谢酶相关基因

CYP2C9*2, *3 和作用靶点基因 VKORC1 的

G-1639A多态位点,有助于临床鉴别华法林药物敏

感性不同的患者。其中 CYP2C9 为药物代谢酶基

因,该酶的基因多态性已经被认为与小剂量华法林

引起较高的出血并发症的发生率相关;而

VKORC1即维生素 K环氧化物还原酶复合物 1基

因,为华法林的作用靶点,VKORC1 的基因多态

性已显示出对华法林的治疗效果有很大影响。不同

基因型在人群中的分布频率及对华法林使用剂量

的影响如下表所示:

具体检测原理:从人外周血细胞中提取基因组

DNA;用两组 CYP2C9基因特异引物和一组

VKORC1 -1639A基因特异引物经过 PCR扩增后,

将带有生物素标记的扩增产物与固定在醛基基片

上的 CYP2C9和 VKORC1 -1639A基因型检测探针

进行特异性杂交反应,并通过酶促显色反应,使特

异性杂交信号呈现出颜色;通过对芯片进行扫描,

得到样品DNA扩增产物与每个基因位点的野生型

和突变型探针杂交形成的杂交图像;经过软件分析

该图像,判断待检样品的基因型。与“金标准”双向

测序比对,结果的检出率为 98.55%,正确性为

99.70%。

实验程序:从血液样品中提取基因组 DNA、

PCR扩增目的序列、芯片杂交反应和芯片识读仪

扫描得出基因分型结果。

2. 标本要求:

抗凝血 2ml,血常规管(即 EDTA抗凝管)。

3. 临床意义:

等位基因 华法林剂量变化 中国人频率

CYP2C9*1 正常 97%

CYP2C9*2 降低 <1%

CYP2C9*3 降低 3%

VKORC1 -1639A 降低 82%

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快速确定华法林剂量范围,减少 INR值监测频

度,提高患者依从性,保证疗效,减少出血风险。

华法林剂量范围计算可通过国际华法林药物基因

组学联合会制定的平台(http://www.Warfarin

Dosing.org)获得,该平台搜集了 5700例使用华法

林治疗的病人(其中亚洲人 1229例),通过大量数

据,制定了华法林的剂量运算法,结果显示,它明

显优于传统固定剂量方案。

将华法林的基因检测结果和 INR监控相结合,

可以更有效、迅速地调整华法林维持剂量,从而在

达到疗效的同时减少华法林的出血风险。

4. 结果解释:

目前临床上可用三种方式根据基因检测结果确

定华法林起始剂量

(1)根据基因型检测结果确定华法林起始剂量

时,也可以参考美国 FDA认可的不同基因型华法

林起始剂量表(mg/天):

(2)利用单机版测算软件进行计算(需提供病

人相关信息)

以下所有指标都决定华法林起始剂量的计算,

请勿缺项

性别 男 □ 女 □

年龄 __

民族 __

身高(厘米)__

体重(公斤)__

是否正在服用如下药物: □ 卡马新平

□ 苯妥英钠 □ 利福平

是否正在服用:□ 胺碘酮

( 3)国际华法林药物基因组学联合会网

(www.warfarindosing.org)

四.ALDH 2基因分型检测

1. 检测原理:

ALDH2即乙醛脱氢酶 2基因,编码乙醛脱氢酶

和硝酸酯酶两种异构酶,存在于人体肝脏微粒体

中,对应与人基因组 ALDH2位点 G1510A,编码

蛋白质 Glu504Lys。基因型可分为:野生型

(Glu504Glu)、突变型(突变杂合型 Glu504Lys

及突变纯合型 Lys504Lys)。ALDH2基因与硝酸

甘油代谢和酒精代谢密切相关,不同 ALDH2基因

型人群间对硝酸甘油和酒精代谢存在非常大的差

异。此项检测也是基于基因芯片技术。

2. 标本要求:

抗凝血 2ml,用血常规管(即 EDTA抗凝管)。

3. 临床意义:

(1)指导临床正确使用硝酸甘油,减少用药无

效情况。ALDH2是硝酸甘油的有效代谢物一氧化

氮形成的关键。如果病人基因中携带有 ALDH2

(Glu504lys)突变,ALDH2的硝酸脂酶活性会降

低 10倍以上,使硝酸甘油无法产生一氧化氮,难

以发挥药效。在亚洲人群中,30%-50%的个体都携

带有 ALDH2突变基因。

(2)揭示个体酒精代谢能力的不同。ALDH2基

因与酒精在人体内的分解代谢有关。ALDH2基因

突变将使酒精在体内的代谢过程受阻,导致大量乙

醛滞留在体内,损伤肝脏,导致脂肪肝、肝硬化,

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甚至肝癌。

(3)揭示重大疾病的高危倾向。ALDH2基因突

变还与增加食道癌、口咽癌和胃癌、冠心病、心肌

梗死等风险相关。

4. 结果解释:

该基因检测的结果表示及用药提示如图:(“+”

表示所属该基因型 )

目基因型

硝酸酯

酶活性

对药物

的影响

乙醛脱氢

酶活性

对酒精解

毒能力

A

L

D

H2

Glu504Glu +100%

硝酸甘

油无效

概率较

100%

高强

Glu504Lys -8-15%

硝酸甘

油无效

概率高

13-14%

中弱

Lys504Lys -6-7%

硝酸甘

油无效

概率很

2%

低极弱

如上图所示:ALDH2基因检测结果分为三种:

1)对于基因型为 Glu504Glu的患者硝酸酯酶和乙

醛脱氢酶活性均为 100%,则患者使用硝酸甘油进

行急救时会得到比较好的效果,且酒精的解毒能力

也比较好,适度饮酒的话对肝脏的损伤也比较小。

2)对于基因型为 Glu504 Lys 的患者硝酸酯酶的活

性降低至正常的 8-15%,而乙醛脱氢酶活性降为正

常的 13-14%,此类患者使用硝酸甘油进行急救效

果会比较弱很难达到良好预后,且酒精的解毒能力

也比较差,饮酒的话对肝脏的损伤也比较大。

3)对于基因型为 Lys504Lys的患者硝酸酯酶和活

性仅为正常的 6-7%,而乙醛脱氢酶活性仅为正常

的 2%,则患者使用硝酸甘油进行急救时效果会非

常差,建议根据医嘱选用其他的药物,且酒精的解

毒能力也非常差,饮酒对肝脏的损伤也会非常大建

议尽量避免饮酒,尤其是单次过量饮酒。

五. 病原微生物核酸检测项目

基因诊断室目前开展感染性疾病病原体核酸检

验项目共分 6大类:病毒肝炎类、性传播疾病类、

呼吸道病原体类、消化道病原体类、肿瘤相关病毒

类以及优生优育类。

1. 病毒肝炎类:包括乙肝病毒核酸定量、乙肝基

因分型、乙肝 YMDD耐药位点检测、丙肝病毒核

酸定量、丙肝基因分型。

2. 性传播疾病类:沙眼衣原体核酸检测、解尿支

原体核酸检测、淋球菌核酸检测、人乳头瘤(6,

11型)核酸检测及单纯疱疹病毒 II型核酸检测。

3. 呼吸道病原体类:结核分枝杆菌核酸检测、肺

炎支原体/衣原体核酸检测。

4. 消化道病原体类:柯萨奇病毒核酸检测、肠道

病毒 71型核酸检测。

5. 肿瘤相关病毒类:人乳头瘤(16,18型)核酸

检测、EB病毒核酸检测。

6. 优生优育类:人巨细胞病毒核酸检测。

病原微生物核酸检测新组合项目介绍

为了临床医生护士更便捷的为患者服务,现将

相关检查项目进行组合,以便提高工作效率和疾病

诊断质量。

1. EB病毒二项:

EB病毒是多种恶性肿瘤(如鼻咽癌)的病因之

一,它主要感染人类口咽部的上皮细胞和 B 淋巴

细胞。EBV 核酸检测二项组合:包括血液核鼻咽

拭子两类标本的组合,联合检测的目的是为了提高

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EB病毒的阳性检出率。

2. 巨细胞病毒二项:

巨细胞病毒二项组合:指对受检者血液和尿液

中可能存在的巨细胞病毒同时检测,以弥补单一类

型样本送检检出率不足的缺陷,提高检测阳性率。

3. 灌洗液病原体检测三项:

灌洗液病原体检测三项组合:包括结核分枝杆

菌核酸定量、肺炎支原体核酸定量以及肺炎衣原体

核酸定量检测。

4. 脑脊液病原体五项:

脑脊液病原体检测五项组合:指同时检测脑脊

液样本结合分枝杆菌、EB病毒、巨细胞病毒、单

纯疱疹病毒病毒以及柯萨奇病毒。可提高样本的利

用率及扩展病原菌的检测范围。

5. 生殖道病原体五项:

生殖道病原体检测五项组合:指同时检测生殖

道分泌物中潜在的乳头瘤病毒 16,18型、乳头瘤

病毒 6,11型、沙眼衣原体、解脲脲原体以及淋球

菌五类病原微生物。

标本采集及注意事项:

(1)鼻咽拭子标本由医护人员用咽拭子收集鼻咽

部分泌物,密封送检。

(2)血清标本用一次性真空采血器抽取受检者静

脉血 2ml。

(3)血浆样本用一次性 EDTA-Na2抗凝剂的玻璃

管,采血 2ml,轻轻颠倒混匀 5-10次,密闭送检。

(4)尿液标本,采集晨尿中段尿 1-5ml于一次性

无菌尿杯中,密闭送检。

(5)浆膜腔积液、脑脊液、肺泡灌洗液、乳汁等

采用无菌管,一次性采集 1-5ml。

标本一经采集,则应尽快送检,室温保存不能

超过 2小时。无法立即送检者,于 2-8℃保存不能

超过 7天。长途运输时应采用 0℃冰壶。

检验结果解释:

对于检测阳性的报告,只表明该样本中有病毒

遗传物质,并不能表明有活病毒存在。阴性结果说

明病毒复制载量低于试剂检测灵敏度,小于检测下

限,处在不复制或低复制状态,但并不能排除样本

中无病毒存在。

即将开展的病原微生物核酸检测项目介绍

1. 乙型肝炎病毒(HBV)耐药突变检测(实时定

量焦磷酸序列分析法)

(1)检测原理:

本项目用于人血浆血清样本中 HBV 耐药突变

的分析检测,共包括 rt169,rt173,rt180,rt181,

rt184,rt194,rt202,rt204,rt236,rt250等 10个

突变位点,可适用于病毒性乙型肝炎类核苷药物耐

药突变辅助诊断及抗病毒治疗疗效监测。

测试基于三个主要步骤:(1)样本制备,分离

纯化 HBV DNA;(2)目的片段的 PCR扩增;(3)

10个耐药突变位点的测序检测。

试剂盒采用离心式核酸纯化柱实现病毒核酸纯

化。病毒经裂解后,核酸被选择性吸附在核酸纯化

柱的硅胶膜上,接着通过洗涤步骤有效去除二价阳

离子和蛋白质等 PCR反应抑制物,最后将病毒核

酸从核酸纯化柱上洗脱下来,完成纯化。经过纯化

的病毒核酸不含蛋白质、核酸酶和其他杂质。

HBV DNA纯化后,采用 PCR荧光探针法扩增

目的片段,扩增反应采用了生物素标记的引物,同

时将特异性荧光探针水解而释放发光基团,通过检

测及分析自由发光基团受激产生的荧光信号可实

Page 8: 临床检验通讯 - 西安交通大学...此项检测是基于基因芯片技术。实验程序为: 从血液样品中提取基因组DNA、PCR扩增目的序 列、芯片杂交反应和芯片识读仪扫描得出基因分型

现对 HBV的实时扩增检测。

确认了 HBV 目的片段的扩增之后,通过焦磷

酸测序完成对产物的突变检测分析。焦磷酸测序技

术采用基于合成的测序(边合成边测序),将引物

上每一个 dNTP 的聚合与一次荧光信号的释放偶

联起来,通过检测荧光的释放和强度,达到实时测

定序列的目的,从而对 DNA序列进行精确分析和

定量分析。

(2)临床意义:

目前检测乙肝病毒耐药突变的方法主要有直接

测序法、线性探针分析法、限制性片段长度多态性

分析及基因芯片等技术。上述方法都是基于 PCR

基础上的操作,且只有 YMDD 耐药突变的实时荧

光定量 PCR检测技术应用于临床进行定性检测,

尚无比较全面和满意的针对多种耐药基因突变定

性和定量检测变异株的方法。 焦磷酸测序技术具

有准确率高,灵活性大,重复性强,操作简单等优

势,已经广泛应用于多个研究领域。尤在 SNP分

析方面有较大的技术优势。借助焦磷酸测序技术的

发展,建立焦磷酸测序技术检测拉米夫定和阿德福

韦酯治疗乙肝所致乙肝病毒基因耐药突变的定量

检测方法,为临床乙肝耐药诊断和治疗提供依据。

乙肝 DRT焦磷酸检测意义在于为临床提供合理的

用药方案,突变位点与药物响应能力如下图所示:

2. HCV基因分型(焦磷酸测序法)

(1)检测原理:(同 HBV-DRT)

(2)临床意义:

HCV分为 6个基因型与 68个亚型。HCV各个

基因型在世界的范围内呈现不同的分布,基因 1、

2、 3 型,在世界范围内分布广范,但也根据地理

位置分布比例有所差异。 1a 与 1b 型主要分布美

国与欧洲。在日本,1b 型占所有 HCV 感染者的

73%,而基因 4 型主要出现在北非与中东地区。

就我国而言,HCV基因 1~6型在我国均有分布,

大部分地区以 1b 型最常见,2a 型次之。在我国

HCV4型与 5型罕见感染,最常见的混合型感染是

1b/2a混合感染。在西南地区比较常见 3b型感染,

而珠三角地区 6a型却是最常见的亚型。

目前我科室开展的RT-PCR法检测HCV分型仅

能区分 1型和非 1型,即将开展的焦磷酸测序法能

够一次检测 9个 HCV基因型及亚型,更好满足临

床要求,测序结果与基因型判断如下图:

Page 9: 临床检验通讯 - 西安交通大学...此项检测是基于基因芯片技术。实验程序为: 从血液样品中提取基因组DNA、PCR扩增目的序 列、芯片杂交反应和芯片识读仪扫描得出基因分型

临床意义如下:

1)流行病学标志:基因分布存在地理差异

2)急性 HCV感染的转归:92%1b型急性感染

患者会进展为慢性化,而其他类型仅 35%~50%。

3)与肝脏疾病程度有关: 在慢性 HCV 患者

中,lb型的肝脏病变较其它类型更严重。

4)对干扰素治疗的应答:1b 型、高水平的

HCV-RNA是唯一对α-干扰素治疗无应答的独立性

预测因子。普通α-干扰素治疗 24 周,2 型的患者

对干扰素的完全应答占 60%-70%,而 1 型患者仅

占 10%-15%。长效干扰素:HCV 1型对其治疗的

持久病毒学应答率为 28%,而 2/3型患者中持久病

毒学应答率为 56%.

细菌耐药监测

一、细菌分布

2016年第 3季度我院共送检 13372份标本,分

离出非重复病原菌 2666株,分离率 19.94%,其中

肠杆菌科细菌 1035株,占 38.81%,非发酵菌 601

株,占 22.53%,葡萄球菌属 267株,占 10.01%,

肠球菌属 339株,占 12.71%,念珠菌 147株,占

5.51% ,链球菌 126株,占 4.72%。其中分离数量

位于前十位的细菌为大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、

铜绿假单胞菌、屎肠球菌、鲍曼不动杆菌、嗜麦芽

窄食单胞菌、金黄色葡萄球菌、粪肠球菌、表皮葡

萄球菌、白色念珠菌。细菌分布与上季度相比,大

肠埃希菌依然位于首位,铜绿假单胞菌的分离数量

有所上升,其余细菌分布变化不大。

二、耐药性分析

根据统计分析,我院 CRE检出率较上季度及去

年同季度均有增加,CRPA 和 MRSA 与上月及去

年同季度均有明显下降。多重耐药形势依然严峻,

具体如下表:

注:CRE:耐碳青霉烯类抗菌药物肠杆菌科细菌

CR-PA:耐碳氢霉烯类铜绿假单胞菌

CR-AB:耐碳青霉烯类抗菌药物鲍曼不动杆菌

MRSA:耐甲氧西林金黄色葡萄球菌。

VRE:耐万古霉素肠球菌

耐药类型

2016年第 3

季度检出

率%

2016年第

2季度检

出率%

2015年第 3

季度检出

率%

CRE(大肠) 3.7 0 1.6

CRE(肺克) 8 5.2 2

CR-PA 32.7 39.1 44.4

CR-AB 76.5 77.6 76.3

MRSA 27.1 42.1 41.5

VRE 2.9(屎肠)

0(粪肠)

0(屎肠)

0(粪肠)

0.6(屎肠)

0(粪肠)

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责任编辑:曾晓艳、马晨、袁莉