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感染管理・ 疫学調査 PCRキット 関連試薬 関連試薬 核酸抽出・精製キット 核酸抽出試薬 核酸精製 キット 培地 関連機器 ※製品の詳細は、HPおよび専用パンフレットをご参照下さい。 Cica Geneus ® PCR kit series 遺伝子 検出 関連製品ガイド 遺伝子検出関連製品ガイド Vol.5

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Page 1: 遺伝子検出関連製品ガイド Vol - Kanto...感染管理・ 疫学調査 PCRキット 関連試薬 関連試薬 核酸抽出・精製キット 核酸抽出試薬 核酸精製

感染管理・疫学調査

PCRキット 関連試薬

関連試薬

核酸抽出・精製キット

核酸抽出試薬 核酸精製キット

培地 関連機器

※製品の詳細は、HPおよび専用パンフレットをご参照下さい。

Cica Geneus® PCR kit series

遺伝子検出関連製品ガイド遺伝子検出関連製品ガイド Vol.5

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1

目次

解析

電気泳動(Mupid® など)

シカジーニアス®PCRキットシリーズ

シカジーニアス®核酸抽出試薬シリーズ

分離培地(クロモアガーなど)

シカジーニアス®核酸精製キットシリーズ

サンプル

目次 ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ P1分離培地(クロモアガーシリーズ) ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ P2シカジーニアス® 核酸抽出試薬シリーズ ・・・・・・・・・・・・・・・・ P3-4シカジーニアス® 核酸精製キットシリーズ ・・・・・・・・・・・・・・・・ P5-6シカジーニアス® PCRキットシリーズ ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ P7-8シカジーニアス® POTキットシリーズ ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ P9-10リアルタイムPCRキット(Roche社製) ・・・・・・・・・・・・・・・・ P11関連培地・試薬 ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ P12キャピラリー電気泳動装置QIAxcel(QIAGEN社製) ・・・・・・ P13-14PCR装置・関連機器・消耗品・機材 ・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・ P15-19

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関東化学は1978年に初めてオキソイド社の微生物関連試薬を国内供給し、1995年からはクロモアガー社の酵素基質培地をラインナップに加え、新しい技術を皆様に提供して参りました。なかでも発色基質を使用したクロモアガーシリーズは、目的微生物のコロニーを特異的に色分けして分離・鑑別できる培地です。また、薬剤耐性菌を効率的に分離できるスクリーニング培地なども数多く取り揃えており、お客様の効率的な分離培養をサポートいたします。

製品番号720467210872118721017214172150

包装10枚10枚10枚10枚10枚10枚

保存冷蔵(2℃~8℃)冷蔵(2℃~8℃)冷蔵(2℃~8℃)冷蔵(2℃~8℃)冷蔵(2℃~8℃)冷蔵(2℃~8℃)

製品名クロモアガー MRSAスクリーン培地クロモアガー MDRPスクリーン培地クロモアガー MDRAスクリーン培地クロモアガー ESBL 生培地クロモアガー mSuper CARBA 生培地クロモアガー mSuper CARBA / C3GR 分画培地

希望価格(円)2,8003,5003,2003,1003,5003,500

分離培地(クロモアガーシリーズなど)

特  長

コロニーの色で識別可能多彩なラインナップ様々な分画培地

微生物の種類をコロニーの色分けで鑑別可能様々な薬剤耐性菌のスクリーニング培地をご用意ご要望の多い分画培地を多数ラインナップ

主な製品概要

主な製品情報

※希望価格は税抜きです。2

*他の製品ラインナップはP12をご参照ください。

クロモアガー MRSAMRSAスクリーニング用の酵素基質培地です。24時間で低度耐性MRSAを含め分離・鑑別ができます。

クロモアガー MDRP

クロモアガー ESBL

MDRPスクリーニング用の酵素基質培地です。コロニーの色で多剤耐性緑膿菌の鑑別ができます。

ESBL産生菌用の酵素基質培地です。コロニーの色で主なESBL産生菌の鑑別ができます。

藤 色:MRSA白色または青色:その他の細菌

青緑色:MDRP紺 色:高度耐性      spp.紫 色:高度耐性 spp.

赤色:透明褐色のハロー:メタリックブルー:

Kleibsiella Enterobacter

ESBL産生菌用の酵素基質培地です。コロニーの色で主なESBL産生菌の鑑別ができます。

Kleibsiella, Citrobacter, Enterobacter

クロモアガー MDRAMDRAスクリーニング用の酵素基質培地です。24時間で多剤耐性アシネトバクター属菌の分離・鑑別ができます。

赤 色:MDRA青色:その他の細菌

クロモアガー C3GR第三世代セファロスポリン耐性腸内細菌スクリーニング用の酵素基質培地です。

赤 色:C3GR耐性茶色かつハロー:C3GR耐性メタリックブルー、白色など:C3GR耐性腸細菌

第三世代セファロスポリン耐性腸内細菌スクリーニング用の酵素基質培地です。

*C3GRは第三世代セファロスポリンの略称です。

クロモアガー mSuper CARBAカルバペネマーゼ産生腸内細菌(CPE)スクリーニング用の酵素基質培地です。

赤 色: (CPE)メタリックブルー:その他の腸内細菌(CPE)無色透明:腸内細菌以外の     カルバペネマーゼ産生グラム陰性菌

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シカジーニアス® 核酸抽出試薬シリーズ

シカジーニアス® 抽出試薬は、微生物や動物などの細胞からゲノムDNA、トータルRNAを効率よく抽出するための試薬です。本試薬と目的試料を混合し、インキュベートするだけの簡単な操作で、PCRテンプレートが調製できます。目的試料にあわせたプロトコールもございますのでお気軽にお問い合わせ下さい。

シカジーニアス®DNA抽出試薬僅か10分でPCRテンプレートの調製ができます。

M    1 kbラダーマーカー1  ネガティブコントロール2  ポジティブコントロール    (5 ng/µLの精製DNA)3~8 DNA抽出液の    10倍段階希釈液

■サンプル Staphylococcus aureus ATCC® 6538TM (2.8×108 cfu/mL相当)■検出遺伝子 16S rDNA(リボソームDNA)■培養条件 LB 液体培地(30℃で18時間培養)

製品番号

08178-96

08210-96

08199-96

08211-96

包装

120回分

120回分

120回分

120回分

保存

冷蔵(2℃~8℃)

冷蔵(2℃~8℃)

冷蔵(2℃~8℃)

冷蔵(2℃~8℃)

製品名

シカジーニアス® DNA抽出試薬

シカジーニアス® DNA抽出試薬ST

シカジーニアス® DNA抽出試薬AN

シカジーニアス® RNA抽出試薬

希望価格(円)

22,000

24,000

24,000

28,000

製品概要

製品情報

シカジーニアス® DNA抽出試薬  シカジーニアス® DNA抽出試薬ST シカジーニアス® DNA抽出試薬AN シカジーニアス® RNA抽出試薬

スタンダードな核酸抽出試薬抽出効率が高いストロングタイプ動物組織サンプルに最適RT-PCR用のRNA抽出に最適

操作例(シカジーニアス® DNA抽出試薬)

1) 試薬a、試薬bを1:10の比率で混合し、DNA抽出試薬混合液を調製します。

2) 調製したDNA抽出試薬混合液を100 µLマイクロチューブに入れます。

3) コロニーもしくは培養液を上記マイクロチューブに入れ、軽く混合します。

4) 72℃で6分間、94℃で3分間インキュベートします。

5) この反応液の上清をテンプレートDNAとします。

試料 10 μL

上清を回収

a液 10 μLb液 100 μL試薬 100 μL

インキュベート

上清を回収

インキュベート使用直前に2液を混合してお使いください。使用直前に2液を混合してお使いください。

72℃ー6分94℃ー3分72℃ー6分94℃ー3分

※希望価格は税抜きです。

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4

適合一覧

適合性

検 体

シカジーニアス® 核酸抽出試薬シリーズ

DNA抽出試薬

オリジナル ST ANRNA抽出試薬

大腸菌(コロニー)

エルシニア(コロニー)

百日咳菌(コロニー)

カンピロバクター(コロニー)

サルモネラ(コロニー)

腸炎ビブリオ(コロニー)

黄色ブドウ球菌(コロニー)

C. ディフィシル(コロニー)

ウェルシュ菌(コロニー)

ジフテリア(コロニー)

腸球菌(コロニー)

枯草菌(培養液)

枯草菌(芽胞)

セレウス菌(コロニー)

ヒトマイコプラズマ(コロニー)

ウシマイコプラズマ(コロニー)

出芽酵母(コロニー)

カンジダ(コロニー)

ヒト血清

ヒトEDTA全血

ヒトEDTA血漿

ヒト尿

ヒト糞便

ヒト唾液

ヒト涙液

※6

※1

※1

※1

※1 ※2

※1

※1

※3 ※3 ※4

※5

※6

×

×

×

×

○+

○+

○+

○+

○+

○+

○+

○+

○+

×

添加回収試験

(検体に外来遺伝子を添加しPCRで検出)

マウステール

動物培養細胞(NIH3T3)

ヒトEDTA全血

※1 遺伝子抽出後に溶液が高粘性になる※2 遺伝子抽出後に溶液が高粘性になる、DNA分解が不十分※3 検体が完全には死滅しない※4 検体が完全には死滅しない、DNA分解が不十分※5 検出感度不足である可能性がある※6 抽出効率が低い

◎ :適合(有意に優れている)○+ : 適合(有意差はほとんどないが、サンプル濃度等の   条件次第で優位に優れる場合がある)○ :適合△ :適用可能であるが注意を要する× :不適合 - :未実施

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シカジーニアス® 核酸精製キットシリーズ

特  長

製品番号08197-9608204-9608204-9708202-9608203-9608207-9608207-9708111-9608111-9708215-9608057-9608058-96

包装100 回分100 回分250 回分100回分50 回分50 回分200 回分50 回分200回分50回分50回分50回分

35,00035,00072,00040,00025,00010,00034,50012,00036,00028,00031,00036,000

製品名シカジーニアス® DNAプレップキット(血液&組織用)

シカジーニアス® トータルDNAプレップキット(組織用)

シカジーニアス® DNAプレップキット(植物用)シカジーニアス® DNAプレップキット(糞便用)

シカジーニアス® プラスミドプレップキット

シカジーニアス® PCR&ゲルプレップキット

シカジーニアス® DNA/RNAプレップキット(ウイルス用)シカジーニアス® RNAプレップキット(組織用)シカジーニアス® RNAプレップキット(植物用)

製品情報

※希望価格は税抜きです。

希望価格(円)

Type G Type V Type WType FType D Type Q

シカジーニアス® 核酸精製キットシリーズは、スピンカラムを使用した核酸精製キットです。簡単な操作で迅速に高純度な核酸を精製できます。また、精製した核酸は酵素反応、シーケンシング、形質転換など様々な用途に使用できます。製品ラインナップは順次増加予定です。

簡易な操作性 簡単操作で迅速に核酸を精製可能豊富な製品ラインナップ  サンプルに応じた最適なカラムをご用意コンタミリスクの回避 各緩衝液には内蓋でシール加工

 DNA 用カラムは化粧箱包装 よりコンタミが気になるRNA 用カラムは個別包装でお届け !!

各Bufferは内蓋でシールし、輸送時の液漏れ・コンタミリスクを低減!!

サンプルに応じて最適なカラムをご用意 !!

 サンプルに応じた最適なカラムをご用意

保存室温

室温

室温室温

室温

室温

冷蔵(2℃~8℃)室温室温

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シカジーニアス® 核酸精製キットシリーズ

セレクションガイド

アプリケーション例(DNA/RNAプレップキット(ウイルス用))

核酸のタイプ サンプル 推奨製品

DNA

ゲノム

・動物組織・培養細胞・グラム陰性菌

・哺乳類全血・昆虫/ワーム・げっ歯類の尾

・動物組織・培養細胞・グラム陰性菌・グラム陽性菌・肺炎球菌・哺乳類全血・口腔スワブ

・白血球層・毛髪・体液・唾液・精液・げっ歯類の尾

・植物細胞・植物組織

・カルス・真菌

・ヒト便・動物便

・鶏盲腸便

・大腸菌

・PCR産物

・電気泳動後のアガロースゲル

・無細胞体液・細胞培養液・血漿

・血清・スワブ・尿

・動物細胞・培養細胞

・全血細胞・バクテリア

・植物細胞    ・植物組織

シカジーニアス®

DNAプレップキット(血液&組織用)

シカジーニアス® トータルDNAプレップキット(組織用)

シカジーニアス®

DNAプレップキット(植物用)シカジーニアス®

DNAプレップキット(糞便用)シカジーニアス®

プラスミドプレップキット

シカジーニアス® PCR&ゲルプレップキット

シカジーニアス® PCR&ゲルプレップキット

シカジーニアス®

DNA/RNAプレップキット(ウイルス用)

シカジーニアス®

RNAプレップキット(組織用)シカジーニアス®

RNAプレップキット(植物用)

total RNARNA

ウイルス核酸DNA/RNA

DNA断片

プラスミド

溶解 結合

遠心  遠心 

洗浄

遠心 

溶出

遠心 

精製物

図 1 図 21 2 3 4 1  2  3 4 5 6 7

Lane 1 : HSV-1感染細胞Lane 2,3 : HSV-1試料Lane 4 : Negative control

Lane 1 : HSV-1試料( 6×10 pfu )Lane 2 : HSV-1試料( 6×10 pfu )Lane 3 : HSV-1試料( 6×10 pfu )Lane 4 : HSV-1試料( 6×10 pfu )Lane 5 : HSV-1試料( 6 pfu )Lane 6 : Negative control ( PCR )Lane 7 : Negative control

HSV-1 (DNAウイルス) からのDNA抽出例

図1 本製品を用いてHSV-1感染細胞とHSV-1試料からDNA抽出・精製後、PCRを行った。その後、アガロースゲルにて電気泳動を行った。

図2 本製品を用いて段階希釈を行ったHSV-1試料からDNA抽出・精製後、PCRを行った。その後、アガロースゲルにて電気泳動を行った。

2

3

4

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シカジーニアス® PCRキットシリーズ

製品番号

08087-96

08179-96

08112-96

08114-96

08115-96

包装

100回分

50回分

30回分

30回分

30回分

保存

冷凍(-20℃~-25℃)

冷凍(-20℃~-25℃)

冷凍(-20℃~-25℃)

冷凍(-20℃~-25℃)

冷凍(-20℃~-25℃)

製品名

シカジーニアス® 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用)

シカジーニアス® コアグラーゼ検出セット(黄色ブドウ球菌用)

シカジーニアス® ESBL遺伝子型検出キット

シカジーニアス® カルバペネマーゼ遺伝子型検出キット

シカジーニアス® 毒素遺伝子検出キット(C. difficile用)

希望価格(円)

85,000

50,000

38,000

38,000

42,000

試験研究用 PCRキットシリーズ

分離培養核酸抽出 電気泳動 解析

シカジーニアス® PCRキットシリーズは、汎用的な機器で安価かつ迅速に標的遺伝子の解析に利用できます。また、特別な技術が不要ですので、どなたにも簡単に使用することができます。

アガロース KANTO LE製品番号01098-2320,000円/100g

クロモアガーmSuperCARBA生培地製品番号721413,500円/10枚

シカジーニアス® DNA抽出試薬

製品番号08178-9622,000円/120回分

製品情報

特  長

操作例(シカジーニアス® カルバペネマーゼ遺伝型検出キットの場合)

サンプル(咽頭、鼻腔など)

迅速な解析 数時間で解析が可能高い汎用性 一般的なPCR装置と電気泳動槽で解析が可能

※希望価格は税抜きです。

※必要な試薬・機器に関しては12-18ページをご覧下さい。

PCR

シカジーニアス® カルバペネマーゼ遺伝子型

検出キット製品番号08114-9638,000円/30回分

アガロース KANTO LE

★本キットは研究用として販売しております。ヒトや動物を対象にした医療や臨床診断の目的には使用しないでください。

近年、薬剤剤耐性菌が世界的に大きな問題になっており、日常的な対策の必要性が高まってきています。

関東化学では、幅広くβ-ラクタム系抗生物質を分解する酵素である、基質特異性拡張型β-ラクタマーゼ(Extended Spectrum β-Lactamase:ESBL)、

カルバペネマーゼの遺伝子検出キットを販売しております。

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シカジーニアス® PCRキットシリーズ

シカジーニアス® ESBL遺伝子型検出キットの解析例

図1 電気泳動例100:100 bpラダー、 PC: ポジティブコントロール (試薬E) 、1:CTX-M-1型陽性菌株、2:CTX-M-9型陽性菌株、3:TEM型陽性菌株、4:CTX-M-2型陽性菌株、5:CTX-M-8型陽性菌株、6:SHV型陽性菌株、N:ネガティブコントロール(TE緩衝液)

① 実験条件は添付文書を参考にしてください。 ② 2つのマルチプレックス PCRの電気泳動結果(図1)から、  ポジティブコントロールのバンドと比較して、ESBL 遺伝子型(表1)を  推定してください。

● 本製品では、菌種を推定することはできません。● 菌株により、複数の ESBL 遺伝子を保有する場合があります。● ESBL 遺伝子はプラスミド上に存在する為、検体の保存状態により保有状況が  初回検出時と異なる場合があります。● ESBL 遺伝子の保有状況と薬剤感受性試験の結果が異なる場合があります。● 電気泳動の緩衝液は、TAE 緩衝液をご使用ください。  TBE 緩衝液を使用した場合、非特異的バンドが検出される場合があります。● 本製品は試験研究用として販売しております。ヒトや動物を対象とした  医療や臨床診断の目的には使用できません。

表1 検出対象遺伝子とその増幅サイズ

Reaction mixture.1

Reaction mixture.2

増幅サイズ(bp)800688565713404246

検出対象遺伝子 bla TEM bla CTX-M-1 group bla CTX-M-9 group bla SHV bla CTX-M-2 group bla CTX-M-8 group

● TEM型、SHV型、CTX-M-1 group、CTX-M-2 group、CTX-M-8 group、CTX-M-9 groupの 遺伝子型が検出可能です。

図1 電気泳動例100:100 bpラダー、 PC: ポジティブコントロール (試薬E) 、1:IMP-1陽性菌株、2:VIM陽性菌株、3:KPC陽性菌株、4:NDM型陽性菌株、5:OXA-48型陽性菌株、N:ネガティブコントロール(TE緩衝液)

① 実験条件は添付文書を参考にしてください。 ② 2つのマルチプレックス PCRの電気泳動結果(図1)から、  ポジティブコントロールのバンドと比較して、カルバペネマーゼ遺伝子(表1)  を推定してください。

● 本製品では、菌種を推定することはできません。● 菌株により、複数のカルバペネマーゼ遺伝子を保有する場合があります。● 適用範囲のカルバペネマーゼ遺伝子はプラスミド上に存在する為、  菌株の保管状況によってはプラスミドが脱落する場合があります。● 本キットでは、代表的なカルバペネマーゼ遺伝子を検出できますが、 一部、検出できないカルバペネマーゼ遺伝子もあります。●クロモアガー mSuperCARBA 生培地(72141)で分離される カルバペネム耐性腸内細菌科細菌(CRE)であっても、 カルバペネマーゼ産生腸内細菌科細菌(CPE)ではない場合があります。● 電気泳動の緩衝液は、TAE 緩衝液をご使用ください。  TBE 緩衝液を使用した場合、非特異的バンドが検出される場合があります。● 本製品は試験研究用として販売しております。ヒトや動物を対象とした  医療や臨床診断の目的には使用できません。

表1 検出対象遺伝子とその増幅サイズ

Reaction mixture.1

Reaction mixture.2

増幅サイズ(bp)587398798621438

検出対象遺伝子 bla IMP-1bla VIMbla KPCbla NDMbla OXA-48

● IMP-1型、VIM型、KPC型、NDM型、OXA-48型の遺伝子型が検出可能です。

シカジーニアス® カルバペネマーゼ遺伝子型検出キットの解析例

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試験研究用 POTキットシリーズPOT (PCR-based ORF Typing)キットとは、マルチプレックスPCRの原理を用いた分子疫学解析のためのPCRキットです。

約4時間以内に分子疫学解析が可能PFGEまたはMLSTと同程度の識別(キットによって識別能は異なります)電気泳動像の解析結果を数値化(POT値)し、菌体間の相同性の比較、管理が可能

特長

9

シカジーニアス® POTキットシリーズ

アシネトバクター属菌用

大腸菌用

POT

POT

POT

緑膿菌は、自然環境中に存在する代表的な常在菌の一種です。医療関連感染においては、主要な抗生物質に対して広く耐性を獲得した多剤耐性緑膿菌(MDRP)が問題となっています。本キットでは、菌株の識別、一部ST型の推定、薬剤耐性遺伝子(VIM,IMP)の保有状況の確認が行えます。

緑膿菌用

アシネトバクター属菌は、医療環境を含め、自然環境中に広く存在する日和見感染菌です。近年、各種抗生物質に対して広く耐性を獲得した多剤耐性アシネトバクター属(MDRA)が問題となっています。本キットでは、アシネトバクター属菌の菌種の識別、A. baumannii の菌株の識別、ST型、国際流行クローン(International clone Ⅰ/Ⅱ)の推定が行えます。

大腸菌は、自然環境中に広く存在する日和見感染菌です。医療環境においては、食中毒や院内感染といった集団感染の原因になることが多く、感染管理が重要となります。本キットでは、菌株の識別、一部ST型(特にST131)の推定、ESBL原因遺伝子(CTX-M-1,2,9)の保有状況の確認が行えます。

黄色ブドウ球菌用POT

メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)は医療関連感染の主な原因菌であり、この蔓延防止には菌体間の相同性などを解析し、適切な拡散予防策を講じる必要があります。

製品番号

08180-96

08180-97

08187-96

08062-96

08362-97

包装

120回分

30回分

50回分

30回分

30回分

保存

冷凍(-20℃~-25℃)

冷凍(-20℃~-25℃)

冷凍(-20℃~-25℃)

冷凍(-20℃~-25℃)

製品名

シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用)

シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(緑膿菌用)

シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(アシネトバクター属菌用)

シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(大腸菌用)

希望価格(円)

83,000

38,000

64,000

42,000

42,000※希望価格は税抜きです。★本キットは研究用として販売しております。ヒトや動物を対象にした医療や臨床診断の目的には使用しないでください。

製品情報

本キットでは、菌株の識別、MRSAクローンのCC型、SCCmec型の推定が行えます。

迅速な解析     高い識別能

 

比較・管理が容易

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シカジーニアス® POTキットシリーズ

解析結果(エクセル計算シートは弊社製品HPに掲載しております)

シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用)の解析例

図 1 電気泳動パターンの実例(各 n=2)50:50bpラダーマーカーP:ポジティブコントロール1:ATCC® 700699(MRSA Mu50)2:ATCC® BAA-1556(MRSA USA300)3:ATCC® 43300(MRSA)4:ATCC® 25923(MSSA)5:ATCC® 29213(MSSA)6,7:集団感染事例1から得られた臨床分離株8,9:集団感染事例 2から得られた臨床分離株

表1 検出ORFの種類(ターゲット領域)とそのPCR増幅産物サイズ

Reactionmixture 1

Reactionmixture 2

①2 つのマルチプレックス PCR の電気泳動結果(図1)からバンドパターン(表1)を読み取ります。②この電気泳動のバンドの有無の結果を用いて、POT 法専用の計算式に二進法で入力し、3つのカテゴリーの POT 値を算出します。 ⅰ femA が陽性の場合、その検体は黄色ブドウ球菌(S.aureus)であることが確認できます。また、MRSA の場合、POT 1 の値の合計は 64 以上になります。 ⅱ 検体間の POT 値を比較することで、菌体間の関係性を客観的に推測出来ます。 ⅲ 集団感染から得られた菌体は POT 1 ~ 3 の POT 値が全て同一になります。(例:図1の6と7、8と9)

バンドパターンの読み取り

646465707377859398104104104104106106108110

5989891218955581259728918530

VV不明VII bII ut不明II aIIVIVIVIVIVIVIVIV

PVL産生株が多い。ETB産生株が多い壊れたSCCmec type II b保有株の可能性ETA産生株が多い小児流行クローン。ETB産生株が多いSCCmec type II, subtype不明壊れたSCCmec type II a保有株の可能性院内感染型MRSA(NY/Japanクローン)

USA300の多くは106-77-113

PVL産生株が多い

表2 代表的なMRSAとPOT1値との関係

POTナンバー 増幅サイズ(bp) ターゲット領域femAPOT 1-1POT 1-2POT 1-3POT 2-1POT 2-2POT 2-3POT 2-4POT 2-5POT 2-6POT 2-7POT 2-8femAPOT 1-4POT 1-5POT 1-6POT 1-7POT 3-1POT 3-2POT 3-3POT 3-4POT 3-5POT 3-6POT 3-7

601530449355304271228197161131104816014773883202732431971711401159578

S.aureus positive controlmecAmec gene complex class BSCCmec typeⅡ a specificTn554プロファージプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージGenomic IslandS.aureus positive controlcassette chromosome recombinase A2遺伝的バックグラウンド遺伝的バックグラウンドmec gene complex class Aプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージ

疫学調査感染制御への適用

菌体の特性および関係性確認

POT値への変換

図1におけるサンプル番号1 2 3 4 5 6 7 8 9カテゴリー

POT1POT2POT3

9325596

10677113

9513666

61635

458112

93190103

93190103

73156120

73156120

同一菌株同士と推定

備考SCCmecCCPOT1 解析能

2000~2007年に10施設で分離された黄色ブドウ球菌552株について、POT法とPFGE法で識別試験を行った結果(菌株の内訳は、NY/Japanクローン MRSA388株、その他のMRSA82株、メチシリン感受性黄色ブドウ球菌(MSSA)82株)、POT法のSimpson's indexは約0.99であり、PFGE法と同等の識別能を有しておりました。

Suzuki.M et.al. J.Appl.Microbiol. 101(4):938-947 (2006)Suzuki.M et.al. J.Appl.Microbiol. 107(4):1367-1374 (2009)

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11

迅速な解析     電気泳動が不要なリアルタイムPCR法多彩なラインナップ 薬剤耐性菌遺伝子などを検出可能

リアルタイムPCR用プローブミックス

リアルタイムPCRキット

ロシュ・ダイアグノスティックス株式会社の取り扱うリアルタイムPCRキットです。ヒト疾患系の項目を中心としたキットをラインナップしています。それぞれのキットには、プライマーとプローブ、ポジティブコントロールを含んでいます。

特  長

製品情報

製品番号

49777-05

49777-32

49777-33

49777-34

49777-35

包装

500回分

200回分

1000回分

500回分

5000回分

保存

冷凍(-20℃以下)

冷凍(-20℃以下)

冷凍(-20℃以下)

冷凍(-20℃以下)

冷凍(-20℃以下)

製品名

FastStart Essential DNA Probes Master (LC Nano / 96 用)

LightCycler® Multiplex RNA Virus Master

LightCycler® 480 Probe Master

希望価格(円)

41,000 

39,800 

178,000 

53,000 

412,000 

製品番号

49777-06

49777-07

49777-08

49777-09

49777-10

49777-11

49777-12

49777-13

49777-14

49777-15

49777-16

49777-17

49777-18

49777-19

49777-21

49777-23

包装

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

96回分

保存

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

4℃~25℃

製品名

LightMix® Modular Giardia

LightMix® Modular Dientamoeba

LightMix® Modular Blastocystis

LightMix® Modular Campylobacter

LightMix® Modular Shigella

LightMix® Modular Plesiomonas

LightMix® Modular STX1-EHEC

LightMix® Modular STX2-EHEC

LightMix® Modular Influenza A

LightMix® Modular Influenza B

LightMix® Modular Coronavirus SA1 upstream E-gene

LightMix® Modular Corona Orf1a

LightMix® Modular NDM1-ESBL

LightMix® Modular OXA-48-ESBL

LightMix® Modular IMP-ESBL(640)

LightMix® Modular TREC

希望価格(円)

28,000

28,000

28,000

28,000

28,000

28,000

28,000

28,000

28,000

28,000

38,000

28,000

28,000

28,000

28,000

28,000

※希望価格は税抜きです。

リアルタイムPCRキット (Roche社製)

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12

関連培地・試薬

アガロース

製品番号46510-7946508-7946509-7940326-2414097-0014566-0801021-0004232-2314575-4301016-9624080-9624079-96

包装1 L1 L1 L100g500g1 L

500 mL100g10 mL500 μL2 mL×62 mL×6

製品名10 × TBE緩衝液50 × TAE緩衝液10 × TAE緩衝液2-アミノ-2-ヒドロキシメチル-1.3-プロパンジオール(Tris)エチレンジアミン四酢酸二水素二ナトリウム二水和物0.5M EDTA酢酸ほう酸臭化エチジウム溶液(2mg/mL、点眼瓶入り)アプタタックDNAマスター(5倍濃縮)6倍濃縮ローディング バッファー6倍濃縮ローディング バッファー オレンジG

希望価格(円)

製品番号01097-2301097-7901095-2301095-7901088-2301088-7901098-2301098-7901089-2301089-7901096-9601096-0801090-2301090-79

包装100 g1 kg100 g1 kg100 g1 kg100 g1 kg100 g1 kg50 g500 g100 g1 kg

希望価格(円)11,000☆

12,000☆

17,000☆

20,000☆

27,000☆

19,000☆

19,000☆

製品名

アガロース KANTO

アガロース KANTO S

アガロース KANTO ME(中電気浸透度)

アガロース KANTO LE(低電気浸透度)

アガロース KANTO HC(短フラグメント用)

アガロース KANTO LM(低融点)

アガロース KANTO ST(高ゲル強度)

DNAラダー(NEB社製)

製品名Quick‐Load Purple 50bp DNA Ladder Quick‐Load Purple 100 bp DNA LadderTriDye 100 bp DNA Ladder Quick‐Load Purple 1kb DNA LadderTriDye 1kb DNA LadderQuick‐Load Purple 2‐log DNA LadderTriDye 2‐log DNA Ladder

ディスク薬剤耐性菌用分離生培地 

試薬  

希望価格(円)

製品番号740547405574056

包装50 セット50 セット50 セット

製品名AmpC/ESBL鑑別ディスクカルバペネマーゼ鑑別ディスクカルバペネマーゼ鑑別ディスクPlus

12,00015,00015,000

希望価格(円)

☆は弊社価格照会品です。

5,00010,0004,5002,7006,60011,0001,0001,8005,00020,0008,50011,000

製品番号72090 720917212972130 72012 72013720157202472018 72080 7207872081 72082717532-2717532-1 717584-5 717584-1717584-7

製品名

クロモアガー STEC生培地

クロモアガー STEC/SS V分画培地

クロモアガー O157生培地

クロモアガー O157 SEL生培地

クロモアガー O157 TAM生培地

クロモアガー O26・O157(SEL)生培地

クロモアガー O26・O157(SEL)/SSエクストラ分画培地

CT-SMAC寒天培地 (SEL)

CT-SMAC(SEL)/SSエクストラ分画生培地

CT-SMAC(SEL)/SSエクストラ(SEL)分画生培地

包装10 枚

10 枚×1010 枚

10 枚×1010 枚

10 枚×1010 枚×210 枚×210 枚×10 10 枚×210 枚×1010 枚×210 枚×1010 枚×2 10 枚×1010 枚×210 枚×1010 枚×2

2,60025,0003,00029,0002,80022,0004,8006,00028,0005,20025,0006,00029,0003,00015,0003,00014,0003,000

クロモアガーオリエンタシオン/ESBL

製品番号49914-4049899-4549881-6049899-4649881-5949899-2449881-61

包装250 gel lanes125 gel lanes125 gel lanes125 gel lanes125 gel lanes250 gel lanes125 gel lanes

希望価格(円)13,00012,00010,00010,00011,00012,00012,000

希望価格(円)製品番号7204672054 7207572125721017212072131721087211872076 721417214872150

製品名

クロモアガー MRSAスクリーン培地 クロモアガー MRSA/スタッフアウレウス分画培地クロモアガー C3GRスクリーン培地クロモアガー ESBLクロモアガー オリエンタシオン/ESBL分画培地クロモアガー KPC/ESBL分画培地クロモアガー MDRPスクリーン培地クロモアガー MDRAスクリーン培地クロモアガー VREスクリーン培地クロモアガー mSuperCARBA生培地クロモアガー mSuperCARBA/ESBL分画培地クロモアガー mSuperCARBA/C3GR分画培地

包装10 枚

10 枚×1010 枚×210 枚10 枚10 枚10 枚10 枚10 枚10 枚10 枚10 枚10 枚

2,80022,0006,0003,1003,1002,8003,5003,5003,2003,0003,5003,5003,500

簡易鑑別試験紙

希望価格(円)製品番号717560-1717560-4717560-2717560-5717560-3717560-6717560-7

製品名シカベータテスト Ⅰシカベータテスト Ⅰ ミニシカベータテスト MBLシカベータテスト MBLミニシカベータテスト CVAシカベータテスト CVAミニシカベータテスト Cミニ

包装40 回10 回40 回10 回40 回10 回10 回

5,5002,0005,5002,0005,5002,7002,700

腸管出血性大腸菌用分離生培地

※希望価格は税抜きです。

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キャピラリー電気泳動装置QIAxcel (QIAGEN社製)

QIAxcel Advanced は、DNA/RNAゲル解析に代わる、キャピラリー電気泳動装置です。 簡単な操作で、1ランあたり最高96サンプルの完全自動化解析が可能です。さらに、12サンプルのDNAフラグメント解析を3-10分ほどの短時間で行えます。また、QIAxcel Advancedには解析用のノートPC、QIAxcel ScreenGel Softwareが付属しており、データの解析とドキュメンテーションを簡便に行えます。多検体の効率的な解析にご活用ください。

マニュアル操作なしに最大96サンプルの高速解析が可能12サンプルのDNAフラグメントを、3-10分で解析0.1 ng/μLの核酸濃度でも正確な結果3-5 bpの高い分解能で正確な解析即使用可能なゲルカートリッジで安全かつ簡便なシステム解析に便利なデジタルデータを出力

製品番号49191-0249191-0449191-1749191-30

          製品名QIAxcel AdvancedQIAxcel DNA High Resolution Kit QX アラインメントマーカー 50 bp/1 kbQX DNA サイズマーカー 50‒800 bp v2.0

容量1 台

1,200 回分1.5 mL50 µL

希望価格(円)3,900,000127,00023,00014,000

メーカー型番9002200929002929526929561

特長

Qiaxcel Advanced 解析例

製品情報

多検体の解析が容易     迅速な解析高感度高分解能      高い安全性データ解析が容易

シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用)の増幅産物の解析 (17検体を解析する場合)

※ 使用したゲル ・ マーカー等  アガロース KANTO HC 、 TBEバッファー 、 50 bp Ladder

● アガロースゲル電気泳動にて解析

所要時間 : 各ゲルにつき約130分

NC M PC 1 2 3 4 5 6 7 NC M PC 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17

ゲル作成 : 30分アガロースゲル電気泳動 : 60分EtBr染色 : 染色 30分、脱色 10分

NC M PC 1 2 3 4 5 6 7 NC M PC 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17

Reaction mixture 1

Reaction mixture 2

※ 使用したキット ・ アラインメントマーカー  QIAxcel DNA High Resolution Kit 、 QX アラインメントマーカー 50 bp/1 kb

● QIAxcelにて解析Reaction mixture 1

Reaction mixture 2

PC 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17

PC 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17

所要時間 : 約32分ゲル作成 : 0分キャピラリー電気泳動 : 約8分 × 4ラン分EtBr染色 : 0分

※ 3年保証付き(保証の範囲に関しましては、弊社営業所または販売店までお問い合わせください。)

© QIAGEN, all rights reserved

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キャピラリー電気泳動装置QIAxcel ー オプション機能

POT値算出補助機能

NEW !

分離培養核酸抽出 電気泳動

解析PCR

QIAxcel Advanced のピークコーリング機能とPOT値計算ソフト(オプション)を使用することで、電気泳動結果からPOT値の自動算出が可能になりました。

POT値算出

目視・手入力

キャピラリー電気泳動

POT値計算ソフトを用いて自動計算

※ 本ツールはPOT値解析のための補助ツールになります。出力された結果は、必ず目視にて確認・判断を行ってください。※ POTキット推奨条件、POT値計算ソフト等の詳細に関してましては、弊社営業まで直接お問い合わせください。

Ⅰ : POTキット推奨条件にてPCR産物を泳動、 QIAxcel Advanced の機能を用いて、 mix1、 mix2それぞれのポジティブコントロールをマーカーに設定し、検体のバンドの値付けを行う。

Ⅱ : QIAxcel Advanced のピークコーリング機能を用いて、各POTキット推奨条件にて目的の検体の  ピークコーリングを行う。

Ⅲ : ピークコーリングの結果を出力し、POT値計算ソフト(オプション)に入力する。

Ⅳ : POT値が自動的に計算される。

● POT値算出補助機能 概要

バンドの値付けを行った例。それぞれの増幅産物のバンド(ピーク)の大きさが算出されます。

黄色ブドウ球菌 検体PCR産物(mix1) 黄色ブドウ球菌 検体PCR産物(mix2)

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PCR装置・消耗品

包装1 台1 台1 台

製品名LightCycler® 96LightCycler® 480 (384 ウェル)LightCycler® 480 (96 ウェル)

希望価格(円)3,800,0007,400,0006,800,000

リアルタイムPCR装置(Roche社製) 

LightCycler 消耗品(Roche社製)  

サーマルサイクラー(ASTEC社製) 

LightCycler® 96 LightCycler® 480

製品番号49777-0149777-2449777-25

包装10 ×12 strips & caps10 ×12 strips & caps

50 plates50 plates50 plates50 plates50 foils

製品名LightCycler® 8-Tube Strips (clear)LightCycler® 8-Tube Strips (white)LightCycler® 480 Multiwell Plate 96, whiteLightCycler® 480 Multiwell Plate 384 whiteLightCycler® 480 Multiwell Plate 96 clearLightCycler® 480 Multiwell plate 384 clearLightCycler® 480 Sealing Foil

希望価格(円)15,00015,00050,00050,00050,00050,00012,000

製品番号49777-0249777-0349777-0449777-2749777-2849777-3049777-31

包装1 台1 台1 台1 台1 台

製品名ジーンアトラス322 (32ウェル)ジーンアトラス482 (48ウェル)ジーンアトラスE02 エコノミー仕様ジーンアトラスG02 グラジエント仕様ジーンアトラスS02 スタンダード仕様

希望価格(円)320,000375,000480,000570,000530,000

製品番号49909-0049909-0249909-0149909-0349909-04

ジーンアトラス322 ジーンアトラス482ジーンアトラス

グラジエント スタンダードエコノミー

※希望価格は税抜きです。

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関連機器・消耗品

ジーンアトラス 消耗品(ASTEC社製) 

電気泳動槽(Mupid社製) 

ゲル撮影装置

包装1000 本1000 本125 個125 個10 枚10 枚10 枚10 枚

希望価格(円)7,0007,00012,0003,0005,0008,0006,0008,000

製品番号49909-0749909-0849909-0949909-1049909-1149909-1249909-1349909-14

包装1 台1 台1 台1 台1 台

メーカーOPTIMAASTECASTEC

MAESTROGEN日本ジェネティクス

希望価格(円)339,000455,000189,00070,000

1,200,000

製品番号49908-0049909-0549909-0649903-6249761-01

SCOPE 21 ゲルシーンタブレット デュアルUVトランスイルミネーター

※ ゲル撮影装置 SCOPE21にはSDHCカードが付属していません。別途必要となります。※ ゲルシーンタブレットGST-33でゲルの撮影をする場合、別途デュアルUVトランスイルミネーターが必要になります。※ FAS-Ⅴは200万画素高感度CCDカメラ、Blue/Green LEDイルミネーター搭載モデルです。

製品名シンウォールチューブ ドーム 0.2 mLシンウォールチューブ フラット 0.2 mL8連 シンウォールチューブ 0.2 mL AT-0288連 シンウォールチューブ キャップ 0.2 mL AT-028用96穴プレート ノンスカート AP-9696穴プレート用シリコンラバーマットAP-96用96穴プレート ハーフスカート AP-96HS96穴プレート用シリコンラバーマット AP-96HS用

製品名ゲル撮影装置 SCOPE21ゲル撮影装置 ゲルシーンタブレットGST-33デュアルUVトランスイルミネーター UVA-15UltraSlim-UVFAS-Ⅴ フルシステム (プリンター付)

UltraSlim-UV

※希望価格は税抜きです。

包装1 台1 台1 台1 台

製品名Mupid-One (耐熱性容器標準附属)Mupid-exUMupid-2plusMupid-2X(買換え専用)

希望価格(円)62,00056,95040,76025,520

製品番号49904-3749904-0149904-0049904-17

Mupid-exU Mupid-2plus

*Mupid-2Xにはゲルメーカーセットは付属しておりません。ゲルメーカーセットは2plusと共通です。

1 セット1 セット

ゲルメーカーセット-HR (耐熱性) Muplid-2plus/2X/exU対応Mupid-exU用ゲルメーカーセット-HR (耐熱性)

12,57010,470

49904-1249904-26

製品番号

Mupid-One

FAS-Ⅴ

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関連機器

小型遠心分離機(hanil社製)

超純水装置(日本ポール社製)

※希望価格は税抜きです。

Micro12

最大約12,000 G(13,500 rpm)・タイマー付・回転数調整機能付

8 連チューブ用ローター

純水(TypeⅡ) > 5< 30< 0.1*1

< 1/mL*1

< 0.001*2

超純水(TypeⅠ) 18.2< 5< 0.1*1

< 1/mL*1

< 0.001*1

項目比抵抗値(MΩ・cm@25℃) TOC(ppb)バクテリア(cfu/mL)粒子(>0.2μm) エンドトキシン(EU/mL)

*1 バクテリア用POU設置時  *2 エンドトキシン用POU設置時

対象システム カスカーダⅡ.Ⅰ.5カスカーダⅡ.Ⅰ.10カスカーダⅡ.Ⅰ.20カスカーダⅡ.Ⅰ.30

製品番号 97012-0097012-0397012-0797012-11

RO製造量 5 L/h10 L/h20 L/h30 L/h

リザーバータンク35 L35 L70 L105 L

希望価格(円)☆☆☆☆

包装1台1台

メーカーhanilhanil

製品名Micro12 小型微量高速遠心機8連PCRチューブ用ローター

希望価格(円)73,00018,000

製品番号49075-0749075-09

超微量分光光度計(Thermo Fisher SCIENTIFIC 社製)

NanoDrop Oneグローバルスタンダードな超微量分光光度計・核酸やタンパクの定量に最適・最小サンプル量は1.0 μL・パソコン不要のスタンドアロンタイプ

包装1台1台1台1台1台

メーカーThermo Fisher SCIENTIFICThermo Fisher SCIENTIFICThermo Fisher SCIENTIFICThermo Fisher SCIENTIFICThermo Fisher SCIENTIFIC

製品名NanoDrop OneNanoDrop OneC (キュベット対応)NanoDrop Lite NanoDrop Lite (プリンター付き)NanoDrop 8000

希望価格(円)1,750,0002,050,000920,000980,0003,800,000

製品番号49755-0049755-0149755-0249755-0549755-03

【NanoDrop Lite】 NanoDropの精度と再現性をより身近にしたパーソナルモデル

【NanoDrop 8000】 8サンプルの同時測定が可能

【NanoDrop One】 オールインワンの次世代NanoDrop         サンプルのコンタミネーションの影響の補正、気泡混入時のアラートなど、様々な機能が付属

☆は弊社価格照会品です。

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関連機器・機材

製品番号

70018-04

70018-3170018-3370018-3570266-66 70266-73 70266-8670267-0270267-1070267-1770018-42

包装

3 本

1 本1 本1 本

96 本×10 96 本×1096 本×1096 本×1096 本×1096 本×101本

スターターキット トランスファーペッテS 0.5‐10/10-100/100-1000 μLトランスファーペッテS 0.5-10 μLトランスファーペッテS 10-100 μLトランスファーペッテS 100-1000 μLピペットチップボックス BIO-CERT® 0.5-20 μLピペットチップボックス BIO-CERT® 2-200 μLピペットチップボックス BIO-CERT® 50-1000 μLフィルターチップボックス BIO-CERT® 0.5-10 μLフィルターチップボックス BIO-CERT® 5-100 μLフィルターチップボックス BIO-CERT® 50-1000 μL卓上スタンド トランスファーペッテS用 6本掛け

希望価格(円)

90,000

30,00030,00030,00030,00028,00031,00040,00035,00034,00020,000

マイクロピペッター (BRAND社製)

スターターキット

製品名

ブロックインキュベーター (ASTEC社製)

製品番号49909-1849909-1949909-2049909-3549909-2149909-2749909-28

包装1 台1 台1 台1 台1 台1 台1 台

製品名BI-516S ブロックインキュベーター BI-516C ブロックインキュベーター BI-516H ブロックインキュベーター BI-526 ブロックインキュベーターBI-526T ブロックインキュベーター カバーヒーター付BI-536 ブロックインキュベーターBI-536T ブロックインキュベーター カバーヒーター付

希望価格(円)195,000175,000130,000275,000290,000300,000330,000

BI-516 BI-536

BI-526

・ホルダーは載せ替えるだけの簡単設計・BI-536はマイクロプレートが使用可能・便利な液晶画面(BI-526,536)・PID制御による安定した温度コントロール

製品番号49909-2249909-2349909-2449909-2549909-26

包装1 台1 台1 台1 台1 台

製品名TM-00 スライドグラス用TM-02 0.2 mL 80 本用TM-05 0.5 mL 48 本用 TM-15 1.5 mL 30 本用TM-20 混合 0.5 mL 24 本、 1.5 mL 15 本

希望価格(円)17,00019,00019,00019,00019,000

製品番号49909-3449909-3049909-3149909-3249909-33

包装1 台1 台1 台1 台1 台

製品名TM-000 スライドグラス用TM-960 0.2 mL 96 本用TM-050 0.5 mL 77 本用 TM-150 1.5 mL 30 本用TM-200 混合 0.5 mL 35 本、 1.5 mL 20 本

希望価格(円)16,00030,00030,00030,00030,000

●サンプルホルダー(BI-516、526共通)

●サンプルホルダー(BI-536、536T専用)

Page 20: 遺伝子検出関連製品ガイド Vol - Kanto...感染管理・ 疫学調査 PCRキット 関連試薬 関連試薬 核酸抽出・精製キット 核酸抽出試薬 核酸精製

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BGa-09(201708)

※希望価格は税抜きです。

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製品番号

49898-8949898-9049898-9149898-7049899-0449914-9349914-9449914-9549899-0849899-0949899-1049761-0070027-0096930-2396930-24

用途

PCRチューブ用ラックPCRチューブ用ラックPCRチューブ用ラック試薬冷蔵保存用クーラー試薬冷蔵保存用クーラー試薬冷凍保存用ラック試薬冷凍保存用ラック試薬冷凍保存用ラック

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ディスポーサブルループディスポーサブルループ

メーカー

NEBNEBNEBNEBNEBNEBNEBNEBNEBNEBNEB

Fast GeneBRAND関東化学関東化学

希望価格(円)

1,2004,8009,6007,60018,5001,2004,8009,6002,1001,8001,80040,0005,0009,5009,500

製品名

PCRラックPCRラック (5個)PCRラック (10個)NEB COOLER NEB COOLER (3個)NEBミニフリーズボックス(1個)NEBミニフリーズボックス(5個)NEBミニフリーズボックス(10個)NEBチューブオープナー(10個)NEBジョイントラック ホワイト (3個)NEBジョイントラック オレンジ(3個)Mini Centrifuge マイクロテストチューブ 1.5 mL 蓋付滅菌ディスポループ 1 μL (20本×50)滅菌ディスポループ 10 μL (20本×50)

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19

※8連チューブ用ローター付