대한의료관련감염관리학회 학술대회 - koshic.org대한의료관련감염관리학회...
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대한의료관련감염관리학회 학술대회 2016년 5월 26일(목) 15:40-17:40
서울아산병원 동관 6층 대강당
서울성심병원 김지형
3:16 천감기
• 기능, 가격, 모든 것을 종합
① Excel 자료정리
② SPSS 학교에서 준다면 설치
③ 통계 시작 : dBSTAT
④ Web-R : 표만들기, 메타분석
⑤ R
3:16 천감기
• SPSS 좋다. 편하다?
• SAS 너무 비싸서/어렵다
• Stata 가정의학과/내과
• MedCalc 쉽다. 의학에 특화.
• R 어렵다 web-R.org
• dBSTAT 아주 쉽다. 의학에 특화.
3:16 천감기
• 비용
–무료 R, web-R
–dBSTAT <평생 5만원
–MedCalc : 평생 400달러 전후
–Stata : 평생 100 만원 전후
–SPSS
3:16 천감기
• 기능
R
SPSS dBSTAT Medcalc
Web-R Excel
3:16 천감기
• Web-R과 dBSTAT의 장점
–한국사람이 만들어서
–의사가 만들어서 의학 특화
–수정 변경이 빠르다
–가격이 싸다
–편하다
3:16 천감기
• 명목 변수
–Chi-squared test
–McNemar test
–Kappa test ……
–Raw data
Drug Cure
A S
A F
B F
B F
B S
A S
B F
3:16 천감기
• 명목 변수 – Chi-squared test
– McNemar test
– Kappa test ……
– Raw data
–exact test : SPSS, R
–Weighted Kappa 등 dBSTAT, MedCalc
Drug Cure
A S
A F
B F
B F
B S
A S
B F
3:16 천감기
• 명목변수 – Chi-squared test
– McNemar test
– Kappa test ……
–Contingency table
–dBSTAT, MedCalc, web-R 편리
S F
A 34 23
B 13 29
3:16 천감기
• 명목변수 – Chi-squared test
– McNemar test
– Kappa test ……
–Contingency table
3:16 천감기
• 명목변수 – Chi-squared test
– McNemar test
– Kappa test ……
–Contingency table
–MedCalc
3:16 천감기
• 명목변수 – Chi-squared test
– McNemar test
– Kappa test ……
–Contingency table
–Web-R
3:16 천감기
• 연속변수 (MedCalc)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (MedCalc)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (MedCalc)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (MedCalc)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (MedCalc)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (MedCalc)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (MedCalc)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (MedCalc)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (MedCalc)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (SPSS)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (SPSS)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (SPSS)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (SPSS)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (SPSS)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (SPSS)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (dBSTAT)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (dBSTAT)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (dBSTAT)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (dBSTAT)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (dBSTAT)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (dBSTAT)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (Web-R)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (Web-R)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (Web-R)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수 (Web-R)
–T-TEST
–ANOVA
–ANCOVA
–RM ANOVA
3:16 천감기
• 연속변수
–메뉴가 제일 쉬운 것
dBSTAT, Web-R
–그래프가 자연스러운 것
dBSTAT, MedCalc
–결과가 보기 쉬운 것
MedCalc, dBSTAT
3:16 천감기
• 비모수 검정(MedCalc)
–Mann-Whitney test
–Kruskal-Wallis test
3:16 천감기
• 비모수 검정(MedCalc)
–Mann-Whitney test
–Kruskal-Wallis test
3:16 천감기
• 비모수 검정(MedCalc)
–Mann-Whitney test
–Kruskal-Wallis test
3:16 천감기
• 비모수 검정(MedCalc)
–Mann-Whitney test
–Kruskal-Wallis test
3:16 천감기
• 비모수 검정(dBSTAT)
–Mann-Whitney test
–Kruskal-Wallis test
3:16 천감기
• 비모수 검정(dBSTAT)
–Mann-Whitney test
–Kruskal-Wallis test
3:16 천감기
• 비모수 검정(web-r)
–Mann-Whitney test
–Kruskal-Wallis test
3:16 천감기
• 비모수 검정
–Kruskal-Wallis test 사후 검정
–MedCalc, dBSTAT, Web-R
–모두 가능
3:16 천감기
• 비모수 검정
–MedCalc, dBSTAT, Web-R
3:16 천감기
• 비모수 검정
–MedCalc, dBSTAT, Web-R
3:16 천감기
• 비모수 검정
–MedCalc, dBSTAT, Web-R
3:16 천감기
• 비모수 검정
–MedCalc, dBSTAT, Web-R
3:16 천감기
• 비모수 검정
–MedCalc, dBSTAT, Web-R
3:16 천감기
• 비모수 검정
–MedCalc, dBSTAT, Web-R 동등하게
–SPSS 비모수 검정을 별도로.
3:16 천감기
• 진단 통계 –민감도/특이도 –Bland Altman plot –Agreement ICC, CCC, Kappa, weighted Kappa, Kendal w
–Crobach α –ROC, ROC 비교
3:16 천감기
• 진단 통계 SPSS –민감도/특이도 –Bland Altman plot –Agreement ICC, CCC, Kappa, weighted Kappa, Kendal w
–Crobach α –ROC, ROC 비교
3:16 천감기
• 진단 통계 MedCalc –민감도/특이도 –“Bland Altman plot” –Agreement ICC, CCC, Kappa, weighted Kappa, Kendal w
–“Crobach α” –ROC, “ROC 비교”
3:16 천감기
• 진단 통계 dBSTAT –민감도/특이도 –Bland Altman plot –Agreement “ICC”, CCC, Kappa, weighted Kappa, Kendal w
–Crobach α –ROC, “ROC 비교”
3:16 천감기
• 진단 통계 Web-R –‘민감도/특이도’ –Bland Altman plot –Agreement ICC, CCC, Kappa, weighted Kappa, Kendal w
–Crobach α –ROC, ROC 비교
3:16 천감기
• 생존 분석
–KM curve
–생존곡선 비교
–Cox regression
3:16 천감기
• 생존 분석
dBSTAT
MedCalc
SPSS
Log-rank Gehan-Breslow Tarone-Ware
Peto-Peto Modified Peto-Peto Fleming-Harrington
Web-R
3:16 천감기
• 생존 분석
–Life Table method
SPSS 와 dBSTAT
3:16 천감기
• 생존 분석
–KM curve ; no at risk
Web-R, MedCalc
3:16 천감기
• 생존 분석
–Cox regression 후 HR plot
Web-R, dBSTAT, SAS, Excel
3:16 천감기
• 더미변수 reference 처리
–dBSTAT First
–Web-R Last
–MedCalc, SPSS Last ↔ First
3:16 천감기
• 더미변수 reference 처리
–Web-R
FIRST
LAST
3:16 천감기
• 더미변수 reference 처리
default 전환가능 가독성 plot
SPSS last + --
MedCalc last + ++ +
dBSTAT first + ++
Web-R last + ++
SAS last ++ ++ ++
3:16 천감기
• 회귀 진단
default 가독성
SPSS
MedCalc
dBSTAT + ++
Web-R + +
• 대부분 의학 통계는 dBSTAT, MedCalc, Web-R
• 진단통계는 SPSS (X)
• 통계와 그래프 dBSTAT • ROC, BA plot MedCalc • 메타분석 Web-R, MedCalc • GEE(Generalized Estimating Equation),
LMM(Linear Mixed Models) SPSS
• Web-R 표만들기, logistic regression, Cox regression (단변수 분석 & 다변수 분석)
반복 작업을 효율적으로
• Web-R 표만들기, logistic regression, Cox regression (단변수 분석 & 다변수 분석)
반복 작업을 효율적으로
3:16 천감기
• 기능, 가격, 모든 것을 종합
① Excel 자료정리
② SPSS 학교에서 준다면 설치
③ 통계 시작 : dBSTAT
④ Web-R : 표만들기, 메타분석
⑤ R
3:16 천감기
• Excel 미리미리 유효성 검사
–간단하고
–정해진 값만을 입력 예)M,F or 40~80
3:16 천감기
• 수집 : Excel 데이터 유효성 검사
• 자료정리 : Excel
• 통계패키지 : 기술통계 (대충 파악)
3:16 천감기
• 불러오기-SPSS와 MedCalc
–대소문자 못 찾아 낸다.
–SPSS 같은 필드명, not open
• DATA 전처리가 중요하다.
• 엑셀로 충분히 찾아 보자.
• 통계프로그램이 찾아 주면 좋다.