estructura de los Ácidos nucleicos
TRANSCRIPT
ESTRUCTURA
DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS
MONÓMEROS
POLIMERIZACIÓN
ESTRUCTURA DEL ADN
ESTRUCTURA DEL ARN
PROPIEDADES
CLASES DE ACIDOS NUCLEICOS
FUNCIONES
DESNATURALIZACIÓN
PRECIPITACIÓN
ABSORCIÓN UV
ALTERACIONES
Propiedades
pH extremos
temperatura > 80 °C
Desnaturalización del ADN
Ruptura de puentes de H
Desapilamiento de bases
hibridización
urea
formamida
Desnaturalización
Bioquímica 2009 A. Esteves Facultad de Ciencias
Al aumentar la temperatura las bases se desapilan y los enlaces de H se rompen
A temperaturas altas, aún las zonas ricas en GC se desaparean las
Area rica en pares de bases A/T
DNA doble
cadena
DNA parcialmente desenrollado
DNA totalmente desnaturalizado, hebras separadas
A medida que la solución baja de temperatura, las regiones complementarias de ambas cadenas se aparean
Area de nucleación
Una vez iniciada la nucleación el proceso se completa rápidamente.
Desnaturalización
In vivo el proceso de desnaturalización y renaturalización tienen lugar durante la
Desnaturalización
TRANSCRIPCION y la REPLICACION
•Se define la temperatura en la cual el 50% de la molécula está desnaturalizada como:
Temperatura de fusión
(Tm)
Desnaturalización
Temperatura
Desnaturalización
Temperatura
• Cada molécula de ADN tiene una temperatura de desnaturalización (o de fusión) característica
•¿De qué depende esta temperatura, en condiciones de pH y fuerza iónica definidas?
• ¿Cómo afecta la Tm la fuerza iónica?
Desnaturalización
• Cada molécula de ADN tiene una temperatura de desnaturalización (o de fusión) característica
•¿De qué depende esta temperatura, en condiciones de pH y fuerza iónica definidas?
• ¿Cómo afecta la Tm la fuerza iónica?
Desnaturalización
Temperatura
del contenido en GC (ó AT)
Desnaturalización
Temperatura
Desnaturalización
Temperatura
• Cada molécula de ADN tiene una temperatura de desnaturalización (o de fusión) característica
•¿De qué depende esta temperatura, en condiciones de pH y fuerza iónica definidas?
• ¿Cómo afecta la Tm la fuerza iónica?
Desnaturalización
Temperatura
Desnaturalización
Tm- Fuerza iónica
< m < Tm > m >Tm
Propiedades Absorción de la luz
Absorbancia 260nm = 1 equivale a 50 mg/ml ADN doble hebra
La transición de la forma doble hebra a monohebra puede detectarse por una disminución en la viscosidad o mediante un incremento de la absorción de luz ultravioleta (260nm).
Propiedades Absorción de la luz
EFECTO HPERCRÓMICO
PRECIPITACION
Constante diélectrica
pH
Fuerza iónica
Temperatura
Propiedades Precipitación
desaminación C U
hidrólisis del enlace glucosídico
metilación
Propiedades Alteraciones
¿Cómo se descifra una secuencia de ADN? ¿Qué información nos brinda?
Propiedades
Secuencia
Métodos de secuenciación (1977) • Sanger • Maxam y Gilbert
• identificar mutaciones • predicciones de potenciales enfermedades • como se regula un gen • que proteína expresa • relaciones filogenéticas
H FABP Bos taurus
H FABP Sus scrofa
H FABP Hs
FABP Mus musculus
H FABP Gallus gallus
H FABP Xl
H FABP Dr
Rep1
M ensis CRABP
Ms CRABP
P xylostella CRABP
D plexippus CRABP
Bm CRABP
Bt CRABP1
Mus musculus CRABP1
Homo sapiens CRABP2
Daio rerio CRABP2
DrCRABP2
Xl CRABP2
MmCRABP2
Hs CRABP2
Bt CRABP2
Ss CRABP2
C.clemensi CRABP2
C rogercresseyi CRABP2
Nucleosoma
Fibras de cromatina
Bucles de cromatina
Cromosomas
doble hebra de ADN se organiza en
El ADN en la célula eucariota El ADN en la célula eucariota
El ADN en la célula procariota
ARN Monohebra
Tres formas
Contienen uracilo en lugar de timina
Estructuras trimidensionales complejas
ARNr
ARNm
ARNt
• Estructuras muy complejas • Formas helicoidales (forma A más favorecida) • Apareamientos W y C • Otros apareamientos ( G-U) • No hay estructuras regulares • Bucles y salientes formas por zonas no apareadas
Estructura de los Ácidos Nucleicos
Estructura de los Ácidos Nucleicos
ARNm
Asa D (Dihidrouridina)
Asa variable
Anticodón
Asa anticodón
Brazo aceptor
Asa U (pseudouridina)
Estructura del ARN ARNt
Asa D
Asa variable
Asa anticodón
Brazo aceptor
Asa U Base
discriminadora Tallo aceptor
Tallo anticodón
Estructura del ARN
ARNr 5.8S 160 nucleótidos
ARNr 5 S 120 nucleótidos
ARNr 28S 4700 nucleótidos
49 proteínas
ARNr 18S
33 proteínas
ARN Ribosomal Eucariota
RESUMEN
• La molécula de ADN está formada por dos hélices antiparalelas y complementarias.
• Las moléculas de ARN están formadas por una sola hebra y existen cuatro tipos fundamentales: ARNm, ARNt, ARNr y pequeños ARNs.
• Los ácidos nucleicos absorben la luz ultravioleta a 260nm
• Presentan efecto hipercrómico
• Pueden desnaturalizarse y renaturalizarse
• La temperatura de fusión es un parámetro específico que depende del % de bases A/T o G/C
• Las modificaciones en el ADN que dan lugar a modificaciones permanentes reciben el nombre de mutaciones.