EtiologiFaktor penyebab labiopalatoschisis belum pasti, tetapi ada dua faktor resiko terjadinya penyakit ini, yaitu : Faktor Herediter Mutasi gen Kelainan kromosom, seperti Triautosom Perkawinan antar penderita Faktor eksternal/lingkungan Faktor usia ibu Obat-obatan yang dapat merusak sel muda (mengganggu mitosis), mis: sototatika dan radiasi Nutrisi Penyakit infeksi sifilis, virus rubella Radiasi Stress emosional Trauma pada trimester pertama Kekurangan asam folat Defisiensi Zn waktu hamil Defisiensi vitamin B6 Mengkonsumsi alkohol & narkotika