シカジーニアス 分子疫学解析potキット(黄色ブドウ球菌用...
TRANSCRIPT
シカジーニアス 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用)
Cica Geneus Staph POT KIT
特長
■キットの構成 (120回分)
1.0mL ×1本
1.0mL ×1本
0.5mL ×1本
0.5mL ×1本
1.0mL ×1本
1.0mL ×1本
試薬A
試薬B
試薬C
試薬D
試薬E
試薬F
AptaTaq DNA Master(5×Conc.)
PCRサプリメント
プライマーミックスα
プライマーミックスβ
ポジティブコントロール
6× ローディングバッファー
■操作手順
個別名称 容 量
®
®
*2
*2 AptaTaq DNA Master(5×Conc.)は、Roche Diagnostics K.Kの商品です。*3 シカジーニアス DNA抽出試薬は別売です。®
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)は医療関連感染の主な原因菌であり、この蔓延防止には菌体間の相同性などを解析し、適切な拡散予防策を講じる必要があります。藤田医科大学の鈴木匡弘先生により開発されたPCR-based ORF Typing(POT法)*1 は、マルチプレックスPCRを用いて複数の特定遺伝子を同時に増幅し、アガロース電気泳動で検出された増幅バンドパターンを解析し、菌体間の相同性を比較する方法です。
*1 製品のラインナップが増えた為、POTの意味を広義に変更させて頂きました。
黄色ブドウ球菌を単離する(培養)
DNA抽出 を行いテンプレートDNAを調製
2種類のマルチプレックスPCR
アガロースゲル電気泳動(別途準備)
バンドパターンの読み取りPOT値の算出各検体での
POT値の比較解析
*3
1. Suzuki.M et.al. J.Appl.Microbiol. 101(4):938-947 (2006)2. Suzuki.M et.al. J.Appl.Microbiol. 107(4):1367-1374 (2009)
●最適化したマルチプレックスPCRなので、約4時間以内で分子疫学解析が可能です。●パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)のように特殊な装置は不要です。●解析結果を数値化(POT値)することで、菌体間の相同性を比較できます。
参考文献
BGa-01(201908)
①2つのマルチプレックスPCR の電気泳動結果(図1)からバンドパターン(表1)を読み取ります。②この電気泳動のバンドの有無の結果を用いて、POT 値解析用の計算シートに二進法で入力し、3つのカテゴリーの POT 値を算出します。 ⅰ femA が陽性の場合、その検体は黄色ブドウ球菌(S. aureus)であることが確認できます。また、MRSA の場合、POT 1 の値の合計は64 以上になります。 ⅱ 検体間の POT 値を比較することで、菌体間の相同性を客観的に推測出来ます。 ⅲ 集団感染から得られた菌体はPOT 1 ~ 3 の POT 値が全て同一になります。(例:図1の6と7、8と9)
● POT値解析用の計算シートは弊社製品ホームページに掲載しております。
Reactionmixture 1
Reactionmixture 2
POT No.femAPOT 1-1POT 1-2POT 1-3POT 2-1POT 2-2POT 2-3POT 2-4POT 2-5POT 2-6POT 2-7POT 2-8femAPOT 1-4POT 1-5POT 1-6POT 1-7POT 3-1POT 3-2POT 3-3POT 3-4POT 3-5POT 3-6POT 3-7
増幅サイズ(bp)601530449355304271228197161131106816014773883202732431971711401159578
POT 係数
6432161286432168421
84216432168421
ターゲット領域S. aureus positive controlmecAmec gene complex class BSCCmec type Ⅱa specificTn554プロファージプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージGenomic IslandS. aureus positive controlcassette chromosome recombinase A2遺伝的バックグラウンド遺伝的バックグラウンドmec gene complex class Aプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージ
製品番号
08180-96
08180-97
08178-96
製品番号
72046
46510-79
14575-43
49914-40
01089-23
包 装
10 枚
1 L
10 mL
250 gel lanes
100 g
希望価格(円)
2,800
5,000
5,000
13,000
27,000
製品名
クロモアガーMRSAスクリーン培地
10×TBE緩衝液
臭化エチジウム溶液(2 mg/mL、点眼瓶入)
Quick-Load Purple 50 bp DNA Ladder
アガロースKANTO HC(短フラグメント用)
製品番号
08187-96
08062-96
08362-97
08106-97
包 装
50回分
30回分
30回分
30回分
希望価格(円)
64,000
42,000
42,000
45,000
製品名
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(緑膿菌用)
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(アシネトバクター属菌用)
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(大腸菌用)
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(C. ディフィシル用)
包 装
120回分
30回分
120回分
希望価格(円)
83,000
38,000
22,000
保 存
冷凍(-20~-25 ℃)
冷蔵(2 ℃~8 ℃)
製品名
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用)
シカジーニアス® DNA抽出試薬
POTキットシリーズ 関連試薬
*希望価格は税抜きです。★上記の他に必要な機材などがございますので、弊社営業所もしくは販売店へお問合せください。●藤田医科大学 鈴木匡弘先生のご厚意により、電気泳動パターンの実例データをご提供いただきました。●本キットは愛知県から特許許諾を得て、製造販売しております。他メーカーの商品に関するライセンスについては、各メーカーにご確認ください。