Setelah menggunakan tools-tools tersebut (CLD, Affinity Diagram) maka kami memperoleh satu masalah pokok yang selanjutnya akan diuji menggunakan fishbone diagram sehingga mendapatkan akar permasalahannya, masalah tersebut adalah Peningkatan Penggunaan Kendaraan Pribadi.

Dari masing-masing aspek tersebut, dilakukan proses breakdown dengan pertimbangan berupa data, hingga didapatkan hasil kesimpulan masalah yang terjadi dalam sistem transportasi UGM sebagai berikut:1. Jangkauan rute transportasi umum tidak mencakup seluruh wilayah kampus UGMJangkauan rute transportasi umum dianggap sebagai salah satu root cause yang terjadi karena berada pada level bawah dari aspek minat penggunaan transportasi umum yang masih rendah.2. Kesadaran civitas akademik untuk mematuhi regulasi yang masih rendahCivitas akademik yang memiliki kecenderungan untuk tidak mematuhi regulasi yang dibuat pihak UGM menyebabkan banyaknya penggunaan kendaraan pribadi di wilayah kampus, yang sebenarnya sudah dibatasi, khususnya bagi mahasiswa baru.3. Ketersediaan kantong-kantong parkirKetersediaan kantong parkir di sekitar kampus UGM menjadi salah satu faktor penyebab kecenderungan penggunaan kendaraan pribadi di wilayah kampus UGM. Walaupun kapasitas kantong parkir sudah tidak memadahi, namun jumlah penggunaan kendaraan pribadi tetap mengalami peningkatan dari tahun ke tahun.