funzione delle proteine interazioni transitorie con altre molecole. ligandi: altre molecole anche...
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FUNZIONE DELLE PROTEINE
Interazioni transitorie con altre molecole.
LIGANDI: altre molecole anche proteiche.
Il sito di legame è complementare ai ligandi per forma, dimensione, carica, idrofilia e idrofobicità. L’interazione è specifica e discriminante.
Il sito di legame si può adattare al legante: adattamento indotto.
Negli enzimi le interazioni sono forti e provocano/ facilitano reazioni chimiche. I ligandi diventano substrati che si legano nel sito catalitico o sito attivo.
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MIOGLOBINA:L’ossigeno si lega al gruppo EME
Porfirina
Gruppo EME
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Legame reversibile esempio mioglobina e emoglobina
Gruppo prostetico: EME
Per trasportare l’ossigeno che è poco solubile in acqua e quindi diffonde lentamente specialmente in grandi organismi.
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P + L PL
[PL]Ka = [P][L]
[PL]Ka [L] = [P]
siti di legame occupati= totale dei siti di legame
Ka[L][P]= Ka[L][P]+[P]
Ka[L]= Ka[L]+1
[L]= [L]+_1_ Ka
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INTERAZIONI TRA EME E MIOGLOBINA
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Confronto tra le strutture della mioglobina e della subunità dell’emoglobina
Identicità di amminoacidi in solo 27 posizioni
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Interazioni dominanti tra le subunità dell’emoglobina
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Il legame dell’ossigeno all’emoglobina è di tipo cooperativo e provoca un notevole cambiamento di conformazione,
si passa dallo stato T a quella R
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Legame cooperativo dell’ossigenoL’emoglobina è una proteina allosterica
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Varianti dell’emoglobina e malattie molecolariL’anemia a cellule falciformi
Un unico amminoacdo è cambiato, valina al posto acido glutammico
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Immuniglobuline
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Proteine che provocano il movimento,Actina e miosina
Filamenti spessi
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a)
b)
c)
d)e)
ATP
Pi
ADP
Filamento di actina
Filamento spesso
di miosina
L’ATP si lega alla testa di miosina e causa
la dissociazione dell’actina
L’ATP saldamente legato è idrolizzato e avviene una modificazione
conformazionale. ADP e Pi restano legati alla testa della miosina
La testa della miosina si attacca al
filamento di actina e il Pi
viene rilasciato
Il rilascio del Pi innesca la generazione della “forza contrattile, una modificazione conformazionale nella testa della miosina che fa scorrere i filamenti di miosina su
quelli di actina. In questo processo viene rilasciato l’ADP