g énmanipuláció ecetmuslicában: p elem technikák
DESCRIPTION
G énmanipuláció ecetmuslicában: P elem technikák. A P elem technikák: enhanszerek és gének csapdázása. A mutátor elem felépítése meghatározza a P elem mutagenezis jellegét. enhanszer csapdázás – génexpresszió, mutagenezis, klónozás Géncsapdázás – génexpresszió, mutagenezis, klónozás - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
GGénmanipuláció ecetmuslicában: P elem technikákénmanipuláció ecetmuslicában: P elem technikák
A P elem technikák: enhanszerek A P elem technikák: enhanszerek és gének csapdázásaés gének csapdázása
A mutátor elem felépítése meghatározza A mutátor elem felépítése meghatározza a P elem mutagenezis jellegéta P elem mutagenezis jellegét
enhanszer csapdázásenhanszer csapdázás – génexpresszió, mutagenezis, klónozás
GéncsapdázásGéncsapdázás – génexpresszió, mutagenezis, klónozás
irányított génexpresszióirányított génexpresszió – génfunkció vizsgálata, kölcsönhatások
epitóp jelölésepitóp jelölés – géntermékek követése és tisztítása, in vivo analízis
irányított génszupresszióirányított génszupresszió – génfunkció vizsgálata, null fenotípus
helyspecifikus rekombinációhelyspecifikus rekombináció- génfunkció vizsgálata, többfunkciós gének
irányított géncsereirányított géncsere – mutagenezis, gén és protein funkció vizsgálata
A P-lacW enhanszer csapdázó elem A P-lacW enhanszer csapdázó elem felépítésefelépítése
Génexpresszió Génexpresszió követését teszi követését teszi
lehetővélehetővé
Marker gén lehetővé Marker gén lehetővé teszi a P elem teszi a P elem
követésétkövetését
Bakteriális szekvencia Bakteriális szekvencia a DNS klónozást teszi a DNS klónozást teszi
lehetővélehetővé
P{PZ} enhanszer csapdázó elemben a rosy marker gén található a mini-white helyett
P promóterHsp70 terminátor
szekvencia
lacZlacZ mini-whitemini-white ori ampori amp
EE BB
enhanszerenhanszergéngén
A A patched patched gén közelébe inszertálódott P-lacZ gén közelébe inszertálódott P-lacZ elem expressziós mintázata imágókorongokban elem expressziós mintázata imágókorongokban
lábláb szárnyszárny szemszem
A P-Gal4 alapú enhanszer csapdázás A P-Gal4 alapú enhanszer csapdázás mechanizmusamechanizmusa
P promóterHsp70 terminátor
szekvencia
Gal4Gal4 mini-whitemini-white ori ampori amp
EE BB
enhanszerenhanszer
5xUAS
lacZ/gfplacZ/gfp
géngén
detektálásdetektálás
Gal4Gal4
GFP riporter expressziója P-Gal4 enhanszer GFP riporter expressziója P-Gal4 enhanszer csapdázó vonalakbancsapdázó vonalakban
Enhanszer csapdázó inszerciók létrehozásaEnhanszer csapdázó inszerciók létrehozása
P-lacZP-lacZ
P(wP(w++))
P(P(ΔΔ2-3), Sb2-3), Sb
TM6, TbTM6, TbX
P-lacZP-lacZ
P(P(ΔΔ2-3), Sb2-3), Sb
YY
YY
YY
WW--
WW-- WW--
WW--
WW--
YY
WW--
P-lacZP-lacZ P-lacZP-lacZ
vagyvagy
X
„„jump-starter” hímekjump-starter” hímek
mutátor törzsmutátor törzs transzpozáz forrástranszpozáz forrás
lacZ lacZ expressziójának detektálásaexpressziójának detektálása
A enhanszer csapdázás előnyeiA enhanszer csapdázás előnyei
A riporter gén expressziója speciális sejtmarkerként használhatóA riporter gén expressziója speciális sejtmarkerként használható
Követhetők a sejtek az egyedfejlődés soránKövethetők a sejtek az egyedfejlődés során
Egyedi identitást adhat a sejteknek olyan stádiumban, amikor Egyedi identitást adhat a sejteknek olyan stádiumban, amikor morfológiailag még nem különülnek elmorfológiailag még nem különülnek el
Gyakran nem érinti a gén funkcióját, vagy hipomorf allélt Gyakran nem érinti a gén funkcióját, vagy hipomorf allélt eredményezeredményez
Egyszerű mutációs analízist, és gyors klónozást tesz lehetővéEgyszerű mutációs analízist, és gyors klónozást tesz lehetővé
Az enhanszer csapdázás korlátaiAz enhanszer csapdázás korlátai
Sok enhanszer csapdázó inszerció nem okoz mutációtSok enhanszer csapdázó inszerció nem okoz mutációt
Nem mindig egyértelmű, hogy egy enhanszer szekvencia melyik gén Nem mindig egyértelmű, hogy egy enhanszer szekvencia melyik gén expresszióját befolyásoljaexpresszióját befolyásolja
Gyakran az érintett gén távol helyezkedik el az enhanszertőlGyakran az érintett gén távol helyezkedik el az enhanszertől
Egy riporter gén aktivitását egyszerre több enhanszer szekvencia is Egy riporter gén aktivitását egyszerre több enhanszer szekvencia is befolyásolhatja befolyásolhatja
A kettősen jelölő pGT1 géncsapdázó elem A kettősen jelölő pGT1 géncsapdázó elem felépítésefelépítése
Gal4Gal4 mini-whitemini-whitehs-neohs-neo
SASA SDSD
promóterpromóter exon1exon1 exon2exon2 exon3exon3 poli-Apoli-A
poli-Aexon1exon1 Gal4Gal4 poli-Amini-whitemini-white exon2exon2 exon3exon3
5xUAS
lacZ/gfplacZ/gfp detektálásdetektálás
Gal4Gal4
ww++ szemszín szemszín
GGénmanipuláció ecetmuslicában: P elem technikákénmanipuláció ecetmuslicában: P elem technikák
A P elem technikák: irányított A P elem technikák: irányított génexpressziógénexpresszió
Irányított génexpresszió a Gal4 moduláris Irányított génexpresszió a Gal4 moduláris rendszerben - 1rendszerben - 1
P promóterHsp70 terminátor
szekvencia
Gal4Gal4 mini-whitemini-white ori ampori amp
EE BB
enhanszerenhanszer
5xUAS
vizsgált génvizsgált gén
géngén
Gal4Gal4
Irányított génexpresszió mechanizmusa -2Irányított génexpresszió mechanizmusa -2
géngénmini-whitemini-white ori ampori amp
UASUASpromóterpromóter
Gal4Gal4 mini-whitemini-white ori ampori amp
Enhanszer csapdázás különleges esete: Enhanszer csapdázás különleges esete: sejtek eliminációjasejtek eliminációja
P promóterHsp70 terminátor
szekvencia
Gal4Gal4 mini-whitemini-white ori ampori amp
EE BB
enhanszerenhanszer
5xUAS
gyilkos géngyilkos gén
géngén
Gal4Gal4
ricin, diftéria toxinricin, diftéria toxinreaper, grim, hidreaper, grim, hid
tetanusz toxintetanusz toxin
poli-A
mini-whitemini-white
SASA SDSD
GFPGFP
FRTFRT FRTFRT
FLP rekombinázFLP rekombináz
GFPGFPpromóterpromóter exon1exon1 exon2exon2 exon3exon3 poli-Apoli-A
SASA SDSD
GFPGFP
Az epitóp jelölés mechanizmusaAz epitóp jelölés mechanizmusa
GFP epitóppal jelölt proteinek GFP epitóppal jelölt proteinek kifejeződésekifejeződése