genomska selekcija pri rjavi pasmi v sloveniji · genomska selekcija pri rjavi pasmi v sloveniji...
TRANSCRIPT
-
GenomskaGenomska selekcija pri rjavi pasmi selekcija pri rjavi pasmi
v Slovenijiv Sloveniji
doc. dr. Klemen Potočnik
Preska, četrtek, 18.12.2013
ZVEZA REJCEV GOVEDI RJAVE PASME SLOVENIJE
Biotehniška fakulteta
Univerza vLjubljani
-
Lastnosti povezane s kakovostjo proizvodovLastnosti povezane s kakovostjo proizvodov
A 30
Beta – laktoglobulin
Kapa kazein
Beta kazein
MK ω-3 : ω-6 = 1 : 2-3
-
Kapa kazeinKapa kazein
Možne genetske oblike alela: B, A, E,..
Rjava pasma praviloma le A in B
Primerjava genotipa AA : BB
◦ cca. 25 % daljši čas koagulacije
◦ cca. 50% manjša čvrstost koaguluma
◦ cca. 10% manjši izplen sira
Npr. 6000 l/lak × 5 lak = 30000 l ≈ 3000 kg sira
Razlika cca. 7 % = 210 kg sira × 5€ = 1000 €
-
Beta kazeinBeta kazein
◦ Original A2
◦ Mutacija A2 v A1 (nekaj 1000 let nazaj)
◦ Razlike med populacijami
◦ HOL 50-50
◦ GUE < 10% A1
◦ BSW ~ 25%
◦ SIM ????
Etiologija:
diabetes tipa 1,
ishemična bolezen srca,
kot modifikator nevroloških bolezni (avtizem)
-
InterGenomicsInterGenomics –– DGV DGV -- GEBVGEBV Lastnosti
◦ Enako kot za Interbull Mlečnost
Dolgoživost
Telesne lastnosti
Somatske celice
Iztok mleka
Servis
◦ Pomlad 2013 57 bikov – MD
◦ Trenutno v teku 34 bikov- MD
2 telički – MD
4 teličke - LD
120 € + DDV
80 € + DDV
Kapa kazein + 10 €
Beta kazein + 10 €
BH2?
-
Rezultati zadnjega obračunaRezultati zadnjega obračuna
DGV – direktne genomske PV
◦ PV po lastnostih
◦ Parametri genotipizacije
Dodatno
◦ Kapa kazein
◦ Beta kazein
Rezultat
◦ Genomski izvid
◦ Priloge – še v razvoju
-
Potek obračuna Potek obračuna
Zaključeno zbiranje vzorcev
◦ 1. teden oktobra
Posredovanje vzorcev v laboratorij
◦ 2. teden oktobra
Rezultati iz laboratorija
◦ 2. teden novembra (kazeini do 4. tedna novembra)
Obdelava in posredovanje na Interbull
◦ 3. teden novembra
Prejem rezultatov Interbull - Intergenomics
◦ 1. teden decembra
Obdelava in priprava genomskih izvidov
◦ 2. teden decembra
-
Podatki zadnjega obračuna Podatki zadnjega obračuna
40 vzorcev
◦ 34 bikcev – 56 K čip
◦ 2 telički – 56 K čip
◦ 4 teličke – LD čip
Rezultati
◦ Kapa kazein
◦ Beta kazein
◦ DGV obračun
-
Kapa in beta kazein
-
Povezava med IBM in SSI -
KK
-
Povezava med IBM in SSI -
BK
-
Povezava med som.cel. in SSI -
BK
-
Povezava med dolg. in SSI -
BK
-
Genomski izvid
-
Genomski izvid
-
PODATKOVNO SKLADIŠČEPODATKOVNO SKLADIŠČE
-
Dostop do podatkovnega skladiščaDostop do podatkovnega skladišča
http://rodica.bf.uni-lj.si
-
Dostop do podatkovnega skladiščaDostop do podatkovnega skladišča
http://rodica.bf.uni-lj.si/govedo
Informacije o
posamezni živali
nacionalni obračun(i)
Informacije o
posamezni živali
Interbull obračun(i)
Prva stran
Splošne informacije o
obračunih
Statično
Pred pripravljeni izpisi
Dinamično
Izpis na zahtevo
Pripravljamo izpis za Pripravljamo izpis za
uporabnike
http://rodica.bf.uni-lj.si/govedohttp://rodica.bf.uni-lj.si/govedohttp://rodica.bf.uni-lj.si/govedo
-
____ __ _____________ __ _________HVALA ZA POZORNOSTHVALA ZA POZORNOST