genética vallín-reza, eréndira julieta; trejo-medinilla ......genética poblacional del cromosoma...
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2012Vol 8 No 32
doi 103823090
Geneacutetica Poblacional Del
Cromosoma ldquoYrdquo En El Estado De
Zacatecas Meacutexico
Unidad Acadeacutemica de Ciencias Quiacutemicas Programa Acadeacutemico Quiacutemico Farmaceacuteutico Bioacutelogo Universidad Autoacutenoma de Zacatecas Aacuterea Ciencias de la Salud
Correspondencia
tmedinillafmyahoocommx
Valliacuten-Reza Ereacutendira Julieta Trejo-Medinilla Flor de Mariacutea
Resumen
Las distribuciones de frecuencias aleacutelicas y datos poblacionales para 16 repeticiones cortas en tandem del cromosoma Y incluidas en PowerPlex Systems (Promega) y AmpFlSTR Yfiler (Applied Biosystems) fueron obtenidos de una muestra de 130 individuos varones sanos no relacionados de la poblacioacuten de Zacatecas (regioacuten centro-norte de Meacutexico) Un total de 130 haplotipos fueron identificados de los cuales 127 fueron uacutenicos y 3 haplotipos diferentes El locus DYS385 ab tuvo maacutes diversidad geacutenica (09172) y la diversidad de haplotipo fue de 99994 Sobre la frecuencia aleacutelica el alelo 13 de DYS392 fue el maacutes frecuente con 07384 Los STRs analizados tienen un poder de discriminacioacuten de 9769 Un anaacutelisis a la par confirmoacute que nuestra poblacioacuten es muy similar con poblaciones espantildeolas
Palabras clave ADN frecuencias aleacutelicas Zacatecas (Meacutexico) STR haplotipos PCR
Populations Genetics of ldquoYrdquo Chromosome in the State of Zacatecas Mexico
Abstract
Allele frequency distributions and population data for 16 Y-chromosome short tan-dem repeats (STRs) included in the PowerPlex Y Systems (Promega) and AmpFlSTR Yfiler (Applied Biosystems) were obtained from a sample of 130 healthy unrelated males living in Zacatecas (north-central region of Mexico) A total of 130 haplotypes were identified of which 127 were unique and 3 were different haplotypes The DYS385 ab locus had more gene diversity (09172) and the haplotype diversity was 9994 As for allelic frequency the allele 13 from DYS393 was more frequent with 07384 The STRs analized have a discrimination power of 9769 Pairwise analysis confirmed that our population is very similar with Spanish populations
Key words deoxyribonucleic acid (DNA) allelic frequency Zacatecas (Mexico) short tandem repeat (STR) haplotypes polymerase chain reaction (PCR)
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Introduccioacuten
A lo largo de la historia siempre ha existido un gran intereacutes por conocer la identidad de los individuos Identificar a una persona establecer su individualidad es determinar aquellos rasgos o conjunto de cualidades que la distinguen de todas las demaacutes y que hacen que sea ella misma Todos los indi-viduos de la especie humana son ideacutenticos entre siacute en un 995 de su ADN y soacutelo en el 05 restante (~10 millones de nucleoacutetidos) residen las diferencias entre unos y otros y que nos hacen seres uacutenicos (salvo en el caso de gemelos univitelinos que son geneacuteticamente ideacutenticos) Dentro de esta pequentildea proporcioacuten de ADN distintivo existen regiones hi-pervariables o polimoacuterficas que son las que nos permiten usar la informacioacuten geneacutetica con fines de identificacioacuten [1 2 3 4]
La tipificacioacuten de STR del cromosoma Y ha sido una herra-mienta de gran importancia en anaacutelisis forenses [5] Recien-temente la comisioacuten de ADN de la Internacional Society for Forensic Genetics (ISFG) ha publicado guiacuteas con recomenda-ciones sobre el uso de polimorfismos de Y-STRs en identifica-cioacuten humana y anaacutelisis de parentescos [6] De igual manera en Meacutexico [7] se ha iniciado con la elaboracioacuten de bases de datos que den soporte a los anaacutelisis forenses que se han estado llevando a cabo a nivel Judicial y Federal Nuestro anaacutelisis es un esfuerzo para colaborar en la creacioacuten de bases de datos que apoyen los resultados emitidos de geneacutetica forense en nuestro estado
La geneacutetica forense ha revolucionado en los uacuteltimos antildeos gracias a las teacutecnicas de biologiacutea molecular en especial por el descubrimiento de las regiones hipervariables la introduccioacuten de la reaccioacuten en cadena de la polimerasa (PCR) y la elec-troforesis capilar Esto ha permitido el estudio y la medicioacuten de la variabilidad geneacutetica a nivel molecular y han supuesto una de las mayores innovaciones especialmente en aspectos relacionados con la investigacioacuten de personas o restos ca-daveacutericos anaacutelisis de vestigios bioloacutegicos en criminaliacutestica e investigacioacuten bioloacutegica de paternidad [8 9]
Los microsateacutelites poseen una herencia mendeliana simple lo que significa que un individuo hereda uno de los alelos de cada progenitor En el caso de los STRs del cromosoma Y estos son heredados de padre a hijo (varoacuten) mas no a la hija Los marcadores utilizados en anaacutelisis patrilineal en regiones de no recombinacioacuten son transmitidos en bloque a los des-cendientes varones [10 11]
Material y meacutetodos
Muestras
La recoleccioacuten de muestras se realizo mediante hisopado bucal y sangre utilizando tarjetas FTA reg [Whatman] Las muestras eran secadas a temperatura ambiente se guardaron y etique-taron para ser llevadas al laboratorio de geneacutetica donde se guardaron en refrigeracioacuten a -20degC hasta su extraccioacuten donde se utilizoacute una resina quelante llamada Chelex reg [BIO-RAD]
Anaacutelisis del ADN
Se amplificaron de manera simultaacutenea 11 locis del kit co-mercial PowerPlex (DYS389I DYS390 DYS389II DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS392 DYS437 DYS438) en 89 muestras en las 41 muestras restantes de utilizoacute el kit Y-filer de AppliedBiosystems amplificando 5 loci maacutes (DYS456 DYS458 DYS635 Y GATA H4 DYS448) En la PCR para el kit Y-filer se utilizaron los siguientes reacti-vos 3 microl de ADN 475 microl de Buffer 10X 25 microl de primer 025 microl de Taq Polimerasa y como diluyente 15 microl de agua desionizada Para el kit PowerPlex la concentracioacuten de los reactivos fue 15 microl de ADN 12 microl de primer 12 microl de Buffer 02 microl de Taq Polimerasa y como diluyente 94 microl de agua desionizada esteacuteril Las etapas en el amplificacioacuten en el termociclador consistieron de la incubacioacuten inicial (95degC-11min) desnaturalizacioacuten (94degC-1min) alineacioacuten (61degC-1min) extensioacuten (72degC-1min) extensioacuten final (60degC-80min) Despueacutes de que las muestras fueron amplificadas se procede a separar el ADN utilizando un secuenciador automaacutetico ABIPrims3130 de Applied Biosystems que funciona a traveacutes de la electro-foresis capilar La muestra a analizar es preparada con 97 microl formamida 03 microl LIZ (marcador interno) y 1 microl de muestra amplificada
Anaacutelisis de datos
Las frecuencias aleacutelicas y haplotiacutepicas fueron obtenidas por conteo de alelos La diversidad haplotiacutepica fue calculada con la ecuacioacuten de Nei h = n (1-SPi) n-1 donde laquonraquo es el total de haplotipos y laquoPiraquo es la frecuencia aleacutelica Tambieacuten deter-minamos la diversidad geacutenica de cada marcador utilizando la foacutermula 1-SPi y el poder de discriminacioacuten para determinar la precisioacuten de nuestros resultados y lo obtuvimos dividiendo el total de haplotipos diferentes entre el total de haplotipos [12 13]
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Resultados
En primer lugar se determinoacute las frecuencias aleacutelicas de cada marcador y la diversidad geacutenica en cada uno de ellos y pos-teriormente las frecuencias haplotiacutepicas asiacute como su diversi-dad geneacutetica que pueden ser observadas en las tablas 1 y 2 Los haplotipos de la poblacioacuten son enlistados de manera completa en la tabla 9 al final de este artiacuteculo
Se enlista en la tabla 3 las frecuencias aleacutelicas del marcador DYS385ab el cual es el que contiene una mayor diversidad geacutenica
De las 130 muestras analizadas se obtuvieron 127 haploti-pos diferentes El valor de diversidad geacutenica fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) y en cuanto a frecuencia aleacutelica el alelo maacutes frecuente fue el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) La diversi-dad haplotiacutepica fue de 9994 El poder de discriminacioacuten fue 9769 El estudio comparativo con algunos paiacuteses es-pantildeoles nos muestra que no hay grandes diferencias entre las frecuencias de nuestra poblacioacuten con las de poblaciones espantildeolas
Tabla 1 Frecuencias aleacutelicas de 16 loci Y-STR (n = 130)
Alelo DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS393 DYS391
7 0
8 00076 0
9 0 00384
10 0 0 0 05692
11 0 00076 00230 03538
12 01384 0 01153 00307
13 002439 06076 03307 07384 0
14 007317 02461 00243 04538 01153
15 04390 00076 00975 01384 0
16 03414 02682 00384 0
17 01219 03685 00307
18 0 0 01951 0
19 0 00487 0
20 00076 0
21 00076
22 00461
23 02230
24 06153 0
25 00846 0
26 00153 00076
27 0 00076
28 01384
29 03615
30 03153
31 01230
32 00461
33 0
DG 06699 05510 05620 07333 07437 06630 04275 05484
DG=Diversidad geacutenica
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Tabla 2 Frecuencias aleacutelicas de 16 loci Y-STR (n = 130)
Alelo DYS439 DYS635 DYS392 Y GATA H4 DYS437 DYS448 DYS438
7 0
8 0 0 0 00230
9 0 0 0 00538
10 00615 0 00243 02076
11 03923 02076 03170 02692
12 04153 00461 01923 04230
13 01307 04384 00153 00230 00230
14 0 01923 05384
15 0 00615 03923
16 00538 00461
17 0 0 00243
18 0 01219
19 04390
20 00487 02926
21 00307 00975
22 03170 00243
23 03902 0
24 01463 0
25 0
26 0
DG 06527 07225 07189 08617 05535 06961 07015
DG=Diversidad geacutenica
Tabla 3 Frecuencias aleacutelicas para el marcador DYS385ab
Alelos Contados Frecuencia Alelos Contados Frecuencia
10-15 1 00076 14-16 6 00461
11-13 3 00230 14-17 4 00307
11-132 1 00076 14-18 6 00461
11-14 33 02538 14-19 2 00153
11-15 6 00461 14-20 2 00153
11-16 2 00153 14-23 1 00076
12-13 2 00153 15-16 5 00384
12-14 6 00461 15-17 3 00230
12-15 2 00153 15-18 2 00153
12-16 1 00076 15-19 2 00153
13-14 4 00307 15-20 3 00230
13-15 1 00076 15-21 1 00076
13-16 1 00076 16-17 7 00538
13-17 3 00230 16-19 1 00076
13-18 2 00153 17-18 1 00076
13-19 1 00076 17-19 1 00076
14-15 2 00153
Diversidad geacutenica 09172
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Estudio comparativo con otras poblaciones
Los resultados obtenidos en nuestra poblacioacuten fueron com-paradas utilizando 4 marcadores (DYS19 DYS389II DYS390 DYS393) con los datos publicados de algunas poblaciones espantildeolas (catalana vasca y gallega) [14]
Hemos detectado un mayor nuacutemero de alelos en nuestra poblacioacuten siendo el maacutes comuacuten el alelo 14 al igual que para gallegos catalanos y vascos Los alelos menos representados son el 10 18 y 19 ya que no aparecieron en ninguna de las poblaciones Asiacute como el alelo 11 y 17 que soacutelo aparecen una vez Posiblemente la diferente distribucioacuten de alelos en nuestra poblacioacuten respecto a las citadas se deba al tamantildeo de la muestra
Tabla 4 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 en las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 93 25 52
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00076 0 0 0
Alelo 12 0 0 0 0
Alelo 13 03307 01613 00400 00770
Alelo 14 04538 06236 08000 07890
Alelo 15 01384 01398 01600 00960
Alelo 16 00384 00645 0 00380
Alelo 17 00307 00107 0 0
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Tabla 5 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 31 56
Alelo 24 0 00176 0 00180
Alelo 25 0 01380 00650 01980
Alelo 26 00076 05259 05800 03930
Alelo 27 00076 01983 02260 03390
Alelo 28 01384 01034 01290 00180
Alelo 29 03615 00086 0 00360
Alelo 30 03153 00086 0 0
Alelo 31 01230 0 0 0
Alelo 32 00461 0 0 0
Alelo 33 0 0 0 0
Alelo 34 0 0 0 0
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Graacutefico 1 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Graacutefico 2 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 6 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 29 53
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Alelo 20 00076 0 0 0
Alelo 21 00076 00259 0 0
Alelo 22 00461 00345 00690 0
Alelo 23 02230 02672 01720 01700
Alelo 24 06153 05345 06900 07730
Alelo 25 00846 01379 00690 00570
Alelo 26 00153 0 0 0
Alelo 27 0 0 0 0
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Graacutefico 3 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 7 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 32 42
Alelo 8 00076 0 0 0
Alelo 9 0 0 0 0
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00230 00086 0 0
Alelo 12 01153 01380 00630 00710
Alelo 13 07354 07327 08120 08340
Alelo 14 01153 01035 01250 00950
Alelo 15 0 00172 0 0
Alelo 16 0 0 0 0
Graacutefico 4 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
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Hemos encontrado 7 alelos en nuestra poblacioacuten El alelo maacutes comuacuten es el 29 mientras que en las demaacutes poblaciones estudiadas el alelo maacutes comuacuten es el 26
En este marcador hemos hallado 7 alelos en nuestra pobla-cioacuten nuacutemero que se reduce para gallegos vascos y catala-nes El maacutes frecuente es el alelo 24 dato compartido con las demaacutes poblaciones
No hemos encontrado diferencias significativas para este sis-tema al compararlo con la poblacioacuten zacatecana
Para este marcador en nuestra poblacioacuten hemos observado 5 alelos siendo maacutes comuacuten el alelo 13 en las cuatro pobla-ciones estudiadas
Discusioacuten
Los marcadores ubicados en el cromosoma masculino resul-tan de gran utilidad en el establecimiento de viacutenculos bioloacutegi-cos de parentesco y en la investigacioacuten de criacutemenes sexuales con una obvia limitacioacuten todos los individuos de la misma liacutenea paterna compartiraacuten ideacutentica informacioacuten en estos ha-plotipos por lo cual no seraacute posible desvincular individuos re-lacionados por viacutea paterna de la posible existencia de viacutenculo de parentesco o filiacioacuten si soacutelo analizamos marcadores pre-sentes en este cromosoma En consecuencia las evidencias deberaacuten ser en todos los casos evaluadas tambieacuten mediante marcadores autosoacutemicos Cuando en criminaliacutestica por ejem-plo se analiza el ADN de una mancha de sangre encontrada en el lugar del delito y se requiere compararla con el ADN de un sospechoso es necesario conocer cual es la frecuencia en la poblacioacuten de los haplotipos encontrados para que en caso de que coincidan pueda darse un valor de probabilidad de que esa mancha de sangre procede de dicho sospechoso
Obviamente estudiar todos los haplotipos de una poblacioacuten es imposible por lo que se toma una muestra representativa (ngt100) y se analiza en ella las frecuencias de los alelos de los diferentes marcadores que seraacuten utilizados para la iden-tificacioacuten geneacutetica Por tanto las frecuencias geacutenicas obte-nidas en un estudio poblacional no son valores exactos sino estimaciones con un margen de error
Aplicacioacuten estadiacutestica en un caso forense a propoacutesito de un caso
Estadiacutestica con haplotipos de Y-STR
En el caso de los marcadores Y-STR la regla del producto basado en la multiplicacioacuten de las frecuencias aleacutelicas a traveacutes
de los marcadores no puede ser aplicada La frecuencia del haplotipo Y-STR es comuacutenmente determinada por el meacutetodo de conteo Suponiendo que hay una base de datos poblacio-nal de tamantildeo n con la cuenta de la base de datos x para un haplotipo particular La frecuencia del haplotipo puede ser es-timada por la proporcioacuten de la muestra cuando xgt 0 p=xn
Un intervalo de confidencia de liacutemite superior puede ser co-locado en una frecuencia de perfiles usando
En casos donde el perfil no ha sido observado en una base de datos el liacutemite superior sobre el intervalo de confianza es 1-α 1N Donde α es el coeficiente de coincidencia (005 para 95 de intervalo de confidencia) y N es el nuacutemero de individuos en la base de datos
El haplotipo obtenido de las muestras problema obtenidas de la menor y el obtenido del C fueron verificados contra la base de datos de referencia de haplotipos del cromosoma Y en wwwYHRDorg [15] y en la base de datos del haploti-po del sistema de amplificacioacuten AmpLFSTR Y Filer en wwwappliedbiosystemscomyfilerdatabase [16] Posteriormente se determinoacute la frecuencia de tal haplotipo de acuerdo a la foacuter-mula anteriormente mencionada
Resultados
Tabla de resultados mostrando diecisiete loci STR encontra-dos en el cromosoma Y al ser analizadas las fracciones mas-culinas obtenidas de la lisis diferencial durante la extraccioacuten de ADN Teniendo como muestra de referencia el hisopado de la cavidad oral
Resultados obtenidos al introducir los datos en la base de datos de la compantildeiacutea AppliedBiosystems
bull 7 loci haplotype (DYS19 DYS389I DYS389II DYS390 DYS391 DYS392 DYS393) 89237 haplotypes
bull 9 loci haplotype (+ DYS385ab) 87440 haplotypesbull 11 loci haplotype (+ DYS438 DYS439) 59735 haplotypesbull 12 loci haplotype (+ DYS437) 39348 haplotypesbull 17 loci haplotype (+ DYS448 DYS456 DYS458 DYS635
YGATAH4) 27531 haplotypes
Resultados obtenidos al comparar el haplotipo en la base de datos YHRD
bull Aacutefrica Se han encontrado 0 haplotipos de 1243 en 19 poblaciones
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bull Oceaniacutea Australia Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 poblaciones
bull Europa Se han encontrado 0 haplotipos de 6007 en 40 poblaciones
bull Aacutertico Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 pobla-ciones
bull Asia Se han encontrado 0 haplotipos de 13041 en 79 po-blaciones
bull America Latina Se han encontrado 0 haplotipos de 3984 en 40 poblaciones
bull Norte America Se han encontrado 0 haplotipos de 3256 en 4 poblaciones
Frecuencia del haplotipo observado El haplotipo no fue observado en las bases de datos utilizadas sin embargo la frecuencia para este caso en particular es de 019 oacute 1 en 500
Interpretacioacuten forense de los resultados
Los polimorfismos del cromosoma Y (STRs) aplicados al anaacute-lisis criminaliacutestico presentan la ventaja de proporcionar in-formacioacuten adicional sobre la presencia de ADN de varoacuten en manchas forenses particularmente en casos de violacioacuten y
asalto sexual en los que este anaacutelisis ofrece una nueva aproxi-macioacuten La principal utilidad de estos sistemas se encuentra en los casos de muestras con mezclas de ceacutelulas masculinas y femeninas Contrariamente a lo que sucede en los siste-mas autosoacutemicos una elevada cantidad de ADN femenino no inhibe la amplificacioacuten de los alelos del cromosoma Y per-mitiendo obtener un perfil especiacutefico de ADN del asaltante
Para interpretar el significado de una correspondencia entre muestras tipificadas geneacuteticamente es necesario conocer la distribucioacuten de la poblacioacuten de los alelos de cada locus en cuestioacuten Si el genotipo de la muestra de evidencia relevante es diferente del genotipo de la muestra de referencia del sospechoso entonces el sospechoso es ldquoexcluidordquo como el donador de la muestra bioloacutegica estudiada Una exclusioacuten es independiente de la frecuencia de los dos genotipos en la poblacioacuten
Si las muestras del sospechoso y la evidencia tienen el mismo genotipo entonces el sospechoso es ldquoincluidordquo como la po-sible fuente de la muestra de evidencia La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la muestra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese genotipo en la poblacioacuten relevante
Tabla 8 Perfil geneacutetico obtenido en las diferentes muestras analizadas
Muestras
MarcadoresGeneacuteticos
Hisopado introito vaginal (liq seminal)
Hisopo exudado introito anal (liq
seminal)
Liacutequido hemaacutetico (acusado)
Ceacutelulas epiteliales cavidad oral (acusado)
BDY456 16 16 16 16
BDYS389I 12 12 12 12
DYS390 24 24 24 24
DYS389II 31 31 31 31
DYS458 18 18 18 18
DYS19 13 13 13 13
DYS385ab 1416 1416 1416 1416
DYS393 13 13 13 13
DYS391 10 10 10 10
DYS439 12 12 12 12
DYS635 24 24 24 24
DYS392 16 16 16 16
Y GATA H4 11 11 11 11
DYS437 14 14 14 14
DYS438 11 11 11 11
DYS448 ND ND ND ND
Nd no determinado
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Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
14 1 15 12 24 29 17 13 1416 13 10 11 22 15 13 14 11 19 000769
15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
20 1 17 13 25 30 15 14 1416 13 10 12 22 16 12 14 12 19 000769
21 1 16 13 24 29 17 14 1318 14 10 11 22 14 11 15 11 21 000769
22 1 16 13 23 29 15 16 1516 14 10 11 21 13 11 15 8 19 000769
23 1 13 12 24 28 16 15 1319 12 11 13 21 11 11 16 9 20 000769
24 1 15 13 25 29 17 14 1113 12 10 11 24 13 12 15 12 19 000769
25 1 15 14 23 30 18 14 1214 12 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
26 1 15 14 23 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 15 12 18 000769
27 1 16 13 24 31 18 13 1317 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
28 1 17 13 24 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 12 15 12 19 000769
29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
30 1 16 13 23 30 16 13 1718 13 10 11 22 11 12 13 10 20 000769
31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
34 1 16 13 24 29 16 14 1115 13 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
35 1 15 12 23 28 17 13 1418 14 10 12 22 13 12 14 11 19 000769
36 1 15 12 21 28 15 15 1516 8 16 10 22 12 11 16 10 20 000769
37 1 16 13 23 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 11 15 12 19 000769
38 1 15 13 24 29 17 14 16 13 10 12 23 14 11 14 11 20 000769
39 1 15 12 24 28 16 14 1114 13 11 10 24 13 12 15 12 19 000769
40 1 15 14 24 32 17 14 1214 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
41 1 16 13 24 29 15 17 1116 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
42 1 13 24 29 14 1114 14 10 12 13 15 12 000769
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43 1 14 24 31 14 1114 13 10 12 13 14 12 000769
44 1 14 23 30 14 1214 13 10 12 13 16 12 000769
45 1 13 23 29 13 1617 13 10 13 15 14 11 000769
46 1 14 24 30 14 1617 13 11 12 14 14 10 000769
47 1 13 23 30 14 1315 12 10 12 11 14 10 000769
48 1 14 20 31 14 1719 14 10 12 11 14 10 000769
49 1 12 22 29 15 1415 14 10 11 11 15 10 000769
50 1 13 24 31 13 1318 13 10 11 14 14 12 000769
51 y 54 2 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 14 12 001538
52 1 14 25 30 14 1115 13 11 12 13 14 12 000769
53 y 107 2 13 24 29 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
55 1 13 24 29 14 1114 13 11 10 13 15 12 000769
56 1 13 24 29 13 1314 13 9 11 11 14 10 000769
57 1 13 24 30 15 13 12 10 13 11 15 9 000769
58 1 13 24 30 13 1619 12 10 12 13 14 11 000769
59 1 14 23 30 14 11 13 12 13 13 15 12 000769
60 1 12 24 26 15 1214 13 11 10 13 15 12 000769
61 1 13 24 29 14 1113 12 11 13 13 15 12 000769
62 1 14 24 30 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
63 1 14 24 30 16 15 14 11 12 12 15 8 000769
64 1 14 24 30 14 1114 13 11 13 13 15 12 000769
65 1 12 24 29 15 1216 13 10 12 13 15 10 000769
66 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 13 15 12 000769
67 1 13 24 29 14 1114 13 10 13 13 15 12 000769
68 1 15 24 31 13 1516 13 11 11 14 14 11 000769
69 1 13 24 28 13 1418 12 10 11 12 14 10 000769
70 1 13 25 30 16 1116 13 10 11 11 14 11 000769
71 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 14 15 12 000769
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77 1 12 23 28 14 1114 13 11 11 14 14 12 000769
78 1 13 23 31 13 1417 13 12 11 15 14 11 000769
79 1 13 24 28 14 1114 12 10 13 14 14 12 000769
80 1 14 24 30 14 1115 13 10 11 13 14 12 000769
81 1 13 23 30 13 16 13 10 12 11 15 10 000769
82 1 14 24 29 15 1114 12 11 11 13 15 12 000769
83 1 13 24 29 14 1115 13 11 13 13 16 12 000769
84 1 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
85 1 13 23 28 17 1213 13 10 11 11 15 10 000769
86 1 13 25 31 13 1419 13 10 12 15 14 11 000769
87 1 13 24 29 13 1518 13 10 12 14 14 12 000769
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90 1 13 24 31 13 1419 12 11 13 16 14 11 000769
91 1 13 23 29 14 1417 13 10 11 14 14 11 000769
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95 1 13 22 30 14 1215 13 10 11 11 14 9 000769
96 1 13 22 31 13 1317 13 10 12 14 14 11 000769
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103 1 13 25 30 13 1420 13 10 13 14 14 11 000769
104 1 14 24 30 13 1617 14 10 12 16 14 11 000769
105 1 12 24 28 15 1617 13 10 13 11 16 9 000769
106 1 13 23 29 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
108 1 14 23 31 13 1415 13 10 11 16 14 11 000769
109 1 13 24 30 13 1416 13 10 12 14 14 11 000769
110 1 14 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 10 000769
111 1 12 22 28 14 1314 13 10 11 11 16 10 000769
112 1 14 24 32 14 11132 13 11 11 13 15 12 000769
114 1 12 23 28 13 1418 14 10 13 13 14 11 000769115 1 14 24 30 13 1214 13 11 11 13 15 12 000769116 1 14 24 31 16 1416 13 10 11 13 14 9 000769
117 1 13 24 29 14 1114 13 12 12 13 15 12 000769
118 1 13 26 29 14 1214 13 11 12 13 14 12 000769
119 1 13 23 32 13 1617 13 10 12 11 14 10 000769
120 1 14 25 31 13 1417 14 10 11 14 14 11 000769
121 1 13 25 32 14 1617 14 10 12 11 13 10 000769
122 1 13 24 30 13 1418 13 10 12 14 14 11 000769
123 1 13 25 29 14 14 14 12 12 13 14 12 000769
124 1 12 23 27 16 12 13 10 12 11 15 10 000769
125 1 13 23 31 13 1617 13 10 11 14 14 11 000769
126 1 13 23 29 15 1517 14 10 12 12 15 10 000769
127 1 12 23 28 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
128 1 13 24 30 11 1519 11 10 13 13 14 10 000769
129 1 13 24 30 13 1423 13 10 12 14 14 11 000769
130 1 13 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 12 000769
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Introduccioacuten
A lo largo de la historia siempre ha existido un gran intereacutes por conocer la identidad de los individuos Identificar a una persona establecer su individualidad es determinar aquellos rasgos o conjunto de cualidades que la distinguen de todas las demaacutes y que hacen que sea ella misma Todos los indi-viduos de la especie humana son ideacutenticos entre siacute en un 995 de su ADN y soacutelo en el 05 restante (~10 millones de nucleoacutetidos) residen las diferencias entre unos y otros y que nos hacen seres uacutenicos (salvo en el caso de gemelos univitelinos que son geneacuteticamente ideacutenticos) Dentro de esta pequentildea proporcioacuten de ADN distintivo existen regiones hi-pervariables o polimoacuterficas que son las que nos permiten usar la informacioacuten geneacutetica con fines de identificacioacuten [1 2 3 4]
La tipificacioacuten de STR del cromosoma Y ha sido una herra-mienta de gran importancia en anaacutelisis forenses [5] Recien-temente la comisioacuten de ADN de la Internacional Society for Forensic Genetics (ISFG) ha publicado guiacuteas con recomenda-ciones sobre el uso de polimorfismos de Y-STRs en identifica-cioacuten humana y anaacutelisis de parentescos [6] De igual manera en Meacutexico [7] se ha iniciado con la elaboracioacuten de bases de datos que den soporte a los anaacutelisis forenses que se han estado llevando a cabo a nivel Judicial y Federal Nuestro anaacutelisis es un esfuerzo para colaborar en la creacioacuten de bases de datos que apoyen los resultados emitidos de geneacutetica forense en nuestro estado
La geneacutetica forense ha revolucionado en los uacuteltimos antildeos gracias a las teacutecnicas de biologiacutea molecular en especial por el descubrimiento de las regiones hipervariables la introduccioacuten de la reaccioacuten en cadena de la polimerasa (PCR) y la elec-troforesis capilar Esto ha permitido el estudio y la medicioacuten de la variabilidad geneacutetica a nivel molecular y han supuesto una de las mayores innovaciones especialmente en aspectos relacionados con la investigacioacuten de personas o restos ca-daveacutericos anaacutelisis de vestigios bioloacutegicos en criminaliacutestica e investigacioacuten bioloacutegica de paternidad [8 9]
Los microsateacutelites poseen una herencia mendeliana simple lo que significa que un individuo hereda uno de los alelos de cada progenitor En el caso de los STRs del cromosoma Y estos son heredados de padre a hijo (varoacuten) mas no a la hija Los marcadores utilizados en anaacutelisis patrilineal en regiones de no recombinacioacuten son transmitidos en bloque a los des-cendientes varones [10 11]
Material y meacutetodos
Muestras
La recoleccioacuten de muestras se realizo mediante hisopado bucal y sangre utilizando tarjetas FTA reg [Whatman] Las muestras eran secadas a temperatura ambiente se guardaron y etique-taron para ser llevadas al laboratorio de geneacutetica donde se guardaron en refrigeracioacuten a -20degC hasta su extraccioacuten donde se utilizoacute una resina quelante llamada Chelex reg [BIO-RAD]
Anaacutelisis del ADN
Se amplificaron de manera simultaacutenea 11 locis del kit co-mercial PowerPlex (DYS389I DYS390 DYS389II DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS392 DYS437 DYS438) en 89 muestras en las 41 muestras restantes de utilizoacute el kit Y-filer de AppliedBiosystems amplificando 5 loci maacutes (DYS456 DYS458 DYS635 Y GATA H4 DYS448) En la PCR para el kit Y-filer se utilizaron los siguientes reacti-vos 3 microl de ADN 475 microl de Buffer 10X 25 microl de primer 025 microl de Taq Polimerasa y como diluyente 15 microl de agua desionizada Para el kit PowerPlex la concentracioacuten de los reactivos fue 15 microl de ADN 12 microl de primer 12 microl de Buffer 02 microl de Taq Polimerasa y como diluyente 94 microl de agua desionizada esteacuteril Las etapas en el amplificacioacuten en el termociclador consistieron de la incubacioacuten inicial (95degC-11min) desnaturalizacioacuten (94degC-1min) alineacioacuten (61degC-1min) extensioacuten (72degC-1min) extensioacuten final (60degC-80min) Despueacutes de que las muestras fueron amplificadas se procede a separar el ADN utilizando un secuenciador automaacutetico ABIPrims3130 de Applied Biosystems que funciona a traveacutes de la electro-foresis capilar La muestra a analizar es preparada con 97 microl formamida 03 microl LIZ (marcador interno) y 1 microl de muestra amplificada
Anaacutelisis de datos
Las frecuencias aleacutelicas y haplotiacutepicas fueron obtenidas por conteo de alelos La diversidad haplotiacutepica fue calculada con la ecuacioacuten de Nei h = n (1-SPi) n-1 donde laquonraquo es el total de haplotipos y laquoPiraquo es la frecuencia aleacutelica Tambieacuten deter-minamos la diversidad geacutenica de cada marcador utilizando la foacutermula 1-SPi y el poder de discriminacioacuten para determinar la precisioacuten de nuestros resultados y lo obtuvimos dividiendo el total de haplotipos diferentes entre el total de haplotipos [12 13]
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Resultados
En primer lugar se determinoacute las frecuencias aleacutelicas de cada marcador y la diversidad geacutenica en cada uno de ellos y pos-teriormente las frecuencias haplotiacutepicas asiacute como su diversi-dad geneacutetica que pueden ser observadas en las tablas 1 y 2 Los haplotipos de la poblacioacuten son enlistados de manera completa en la tabla 9 al final de este artiacuteculo
Se enlista en la tabla 3 las frecuencias aleacutelicas del marcador DYS385ab el cual es el que contiene una mayor diversidad geacutenica
De las 130 muestras analizadas se obtuvieron 127 haploti-pos diferentes El valor de diversidad geacutenica fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) y en cuanto a frecuencia aleacutelica el alelo maacutes frecuente fue el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) La diversi-dad haplotiacutepica fue de 9994 El poder de discriminacioacuten fue 9769 El estudio comparativo con algunos paiacuteses es-pantildeoles nos muestra que no hay grandes diferencias entre las frecuencias de nuestra poblacioacuten con las de poblaciones espantildeolas
Tabla 1 Frecuencias aleacutelicas de 16 loci Y-STR (n = 130)
Alelo DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS393 DYS391
7 0
8 00076 0
9 0 00384
10 0 0 0 05692
11 0 00076 00230 03538
12 01384 0 01153 00307
13 002439 06076 03307 07384 0
14 007317 02461 00243 04538 01153
15 04390 00076 00975 01384 0
16 03414 02682 00384 0
17 01219 03685 00307
18 0 0 01951 0
19 0 00487 0
20 00076 0
21 00076
22 00461
23 02230
24 06153 0
25 00846 0
26 00153 00076
27 0 00076
28 01384
29 03615
30 03153
31 01230
32 00461
33 0
DG 06699 05510 05620 07333 07437 06630 04275 05484
DG=Diversidad geacutenica
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Tabla 2 Frecuencias aleacutelicas de 16 loci Y-STR (n = 130)
Alelo DYS439 DYS635 DYS392 Y GATA H4 DYS437 DYS448 DYS438
7 0
8 0 0 0 00230
9 0 0 0 00538
10 00615 0 00243 02076
11 03923 02076 03170 02692
12 04153 00461 01923 04230
13 01307 04384 00153 00230 00230
14 0 01923 05384
15 0 00615 03923
16 00538 00461
17 0 0 00243
18 0 01219
19 04390
20 00487 02926
21 00307 00975
22 03170 00243
23 03902 0
24 01463 0
25 0
26 0
DG 06527 07225 07189 08617 05535 06961 07015
DG=Diversidad geacutenica
Tabla 3 Frecuencias aleacutelicas para el marcador DYS385ab
Alelos Contados Frecuencia Alelos Contados Frecuencia
10-15 1 00076 14-16 6 00461
11-13 3 00230 14-17 4 00307
11-132 1 00076 14-18 6 00461
11-14 33 02538 14-19 2 00153
11-15 6 00461 14-20 2 00153
11-16 2 00153 14-23 1 00076
12-13 2 00153 15-16 5 00384
12-14 6 00461 15-17 3 00230
12-15 2 00153 15-18 2 00153
12-16 1 00076 15-19 2 00153
13-14 4 00307 15-20 3 00230
13-15 1 00076 15-21 1 00076
13-16 1 00076 16-17 7 00538
13-17 3 00230 16-19 1 00076
13-18 2 00153 17-18 1 00076
13-19 1 00076 17-19 1 00076
14-15 2 00153
Diversidad geacutenica 09172
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Estudio comparativo con otras poblaciones
Los resultados obtenidos en nuestra poblacioacuten fueron com-paradas utilizando 4 marcadores (DYS19 DYS389II DYS390 DYS393) con los datos publicados de algunas poblaciones espantildeolas (catalana vasca y gallega) [14]
Hemos detectado un mayor nuacutemero de alelos en nuestra poblacioacuten siendo el maacutes comuacuten el alelo 14 al igual que para gallegos catalanos y vascos Los alelos menos representados son el 10 18 y 19 ya que no aparecieron en ninguna de las poblaciones Asiacute como el alelo 11 y 17 que soacutelo aparecen una vez Posiblemente la diferente distribucioacuten de alelos en nuestra poblacioacuten respecto a las citadas se deba al tamantildeo de la muestra
Tabla 4 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 en las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 93 25 52
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00076 0 0 0
Alelo 12 0 0 0 0
Alelo 13 03307 01613 00400 00770
Alelo 14 04538 06236 08000 07890
Alelo 15 01384 01398 01600 00960
Alelo 16 00384 00645 0 00380
Alelo 17 00307 00107 0 0
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Tabla 5 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 31 56
Alelo 24 0 00176 0 00180
Alelo 25 0 01380 00650 01980
Alelo 26 00076 05259 05800 03930
Alelo 27 00076 01983 02260 03390
Alelo 28 01384 01034 01290 00180
Alelo 29 03615 00086 0 00360
Alelo 30 03153 00086 0 0
Alelo 31 01230 0 0 0
Alelo 32 00461 0 0 0
Alelo 33 0 0 0 0
Alelo 34 0 0 0 0
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Graacutefico 1 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Graacutefico 2 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 6 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 29 53
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Alelo 20 00076 0 0 0
Alelo 21 00076 00259 0 0
Alelo 22 00461 00345 00690 0
Alelo 23 02230 02672 01720 01700
Alelo 24 06153 05345 06900 07730
Alelo 25 00846 01379 00690 00570
Alelo 26 00153 0 0 0
Alelo 27 0 0 0 0
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Graacutefico 3 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 7 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 32 42
Alelo 8 00076 0 0 0
Alelo 9 0 0 0 0
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00230 00086 0 0
Alelo 12 01153 01380 00630 00710
Alelo 13 07354 07327 08120 08340
Alelo 14 01153 01035 01250 00950
Alelo 15 0 00172 0 0
Alelo 16 0 0 0 0
Graacutefico 4 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
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Hemos encontrado 7 alelos en nuestra poblacioacuten El alelo maacutes comuacuten es el 29 mientras que en las demaacutes poblaciones estudiadas el alelo maacutes comuacuten es el 26
En este marcador hemos hallado 7 alelos en nuestra pobla-cioacuten nuacutemero que se reduce para gallegos vascos y catala-nes El maacutes frecuente es el alelo 24 dato compartido con las demaacutes poblaciones
No hemos encontrado diferencias significativas para este sis-tema al compararlo con la poblacioacuten zacatecana
Para este marcador en nuestra poblacioacuten hemos observado 5 alelos siendo maacutes comuacuten el alelo 13 en las cuatro pobla-ciones estudiadas
Discusioacuten
Los marcadores ubicados en el cromosoma masculino resul-tan de gran utilidad en el establecimiento de viacutenculos bioloacutegi-cos de parentesco y en la investigacioacuten de criacutemenes sexuales con una obvia limitacioacuten todos los individuos de la misma liacutenea paterna compartiraacuten ideacutentica informacioacuten en estos ha-plotipos por lo cual no seraacute posible desvincular individuos re-lacionados por viacutea paterna de la posible existencia de viacutenculo de parentesco o filiacioacuten si soacutelo analizamos marcadores pre-sentes en este cromosoma En consecuencia las evidencias deberaacuten ser en todos los casos evaluadas tambieacuten mediante marcadores autosoacutemicos Cuando en criminaliacutestica por ejem-plo se analiza el ADN de una mancha de sangre encontrada en el lugar del delito y se requiere compararla con el ADN de un sospechoso es necesario conocer cual es la frecuencia en la poblacioacuten de los haplotipos encontrados para que en caso de que coincidan pueda darse un valor de probabilidad de que esa mancha de sangre procede de dicho sospechoso
Obviamente estudiar todos los haplotipos de una poblacioacuten es imposible por lo que se toma una muestra representativa (ngt100) y se analiza en ella las frecuencias de los alelos de los diferentes marcadores que seraacuten utilizados para la iden-tificacioacuten geneacutetica Por tanto las frecuencias geacutenicas obte-nidas en un estudio poblacional no son valores exactos sino estimaciones con un margen de error
Aplicacioacuten estadiacutestica en un caso forense a propoacutesito de un caso
Estadiacutestica con haplotipos de Y-STR
En el caso de los marcadores Y-STR la regla del producto basado en la multiplicacioacuten de las frecuencias aleacutelicas a traveacutes
de los marcadores no puede ser aplicada La frecuencia del haplotipo Y-STR es comuacutenmente determinada por el meacutetodo de conteo Suponiendo que hay una base de datos poblacio-nal de tamantildeo n con la cuenta de la base de datos x para un haplotipo particular La frecuencia del haplotipo puede ser es-timada por la proporcioacuten de la muestra cuando xgt 0 p=xn
Un intervalo de confidencia de liacutemite superior puede ser co-locado en una frecuencia de perfiles usando
En casos donde el perfil no ha sido observado en una base de datos el liacutemite superior sobre el intervalo de confianza es 1-α 1N Donde α es el coeficiente de coincidencia (005 para 95 de intervalo de confidencia) y N es el nuacutemero de individuos en la base de datos
El haplotipo obtenido de las muestras problema obtenidas de la menor y el obtenido del C fueron verificados contra la base de datos de referencia de haplotipos del cromosoma Y en wwwYHRDorg [15] y en la base de datos del haploti-po del sistema de amplificacioacuten AmpLFSTR Y Filer en wwwappliedbiosystemscomyfilerdatabase [16] Posteriormente se determinoacute la frecuencia de tal haplotipo de acuerdo a la foacuter-mula anteriormente mencionada
Resultados
Tabla de resultados mostrando diecisiete loci STR encontra-dos en el cromosoma Y al ser analizadas las fracciones mas-culinas obtenidas de la lisis diferencial durante la extraccioacuten de ADN Teniendo como muestra de referencia el hisopado de la cavidad oral
Resultados obtenidos al introducir los datos en la base de datos de la compantildeiacutea AppliedBiosystems
bull 7 loci haplotype (DYS19 DYS389I DYS389II DYS390 DYS391 DYS392 DYS393) 89237 haplotypes
bull 9 loci haplotype (+ DYS385ab) 87440 haplotypesbull 11 loci haplotype (+ DYS438 DYS439) 59735 haplotypesbull 12 loci haplotype (+ DYS437) 39348 haplotypesbull 17 loci haplotype (+ DYS448 DYS456 DYS458 DYS635
YGATAH4) 27531 haplotypes
Resultados obtenidos al comparar el haplotipo en la base de datos YHRD
bull Aacutefrica Se han encontrado 0 haplotipos de 1243 en 19 poblaciones
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bull Oceaniacutea Australia Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 poblaciones
bull Europa Se han encontrado 0 haplotipos de 6007 en 40 poblaciones
bull Aacutertico Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 pobla-ciones
bull Asia Se han encontrado 0 haplotipos de 13041 en 79 po-blaciones
bull America Latina Se han encontrado 0 haplotipos de 3984 en 40 poblaciones
bull Norte America Se han encontrado 0 haplotipos de 3256 en 4 poblaciones
Frecuencia del haplotipo observado El haplotipo no fue observado en las bases de datos utilizadas sin embargo la frecuencia para este caso en particular es de 019 oacute 1 en 500
Interpretacioacuten forense de los resultados
Los polimorfismos del cromosoma Y (STRs) aplicados al anaacute-lisis criminaliacutestico presentan la ventaja de proporcionar in-formacioacuten adicional sobre la presencia de ADN de varoacuten en manchas forenses particularmente en casos de violacioacuten y
asalto sexual en los que este anaacutelisis ofrece una nueva aproxi-macioacuten La principal utilidad de estos sistemas se encuentra en los casos de muestras con mezclas de ceacutelulas masculinas y femeninas Contrariamente a lo que sucede en los siste-mas autosoacutemicos una elevada cantidad de ADN femenino no inhibe la amplificacioacuten de los alelos del cromosoma Y per-mitiendo obtener un perfil especiacutefico de ADN del asaltante
Para interpretar el significado de una correspondencia entre muestras tipificadas geneacuteticamente es necesario conocer la distribucioacuten de la poblacioacuten de los alelos de cada locus en cuestioacuten Si el genotipo de la muestra de evidencia relevante es diferente del genotipo de la muestra de referencia del sospechoso entonces el sospechoso es ldquoexcluidordquo como el donador de la muestra bioloacutegica estudiada Una exclusioacuten es independiente de la frecuencia de los dos genotipos en la poblacioacuten
Si las muestras del sospechoso y la evidencia tienen el mismo genotipo entonces el sospechoso es ldquoincluidordquo como la po-sible fuente de la muestra de evidencia La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la muestra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese genotipo en la poblacioacuten relevante
Tabla 8 Perfil geneacutetico obtenido en las diferentes muestras analizadas
Muestras
MarcadoresGeneacuteticos
Hisopado introito vaginal (liq seminal)
Hisopo exudado introito anal (liq
seminal)
Liacutequido hemaacutetico (acusado)
Ceacutelulas epiteliales cavidad oral (acusado)
BDY456 16 16 16 16
BDYS389I 12 12 12 12
DYS390 24 24 24 24
DYS389II 31 31 31 31
DYS458 18 18 18 18
DYS19 13 13 13 13
DYS385ab 1416 1416 1416 1416
DYS393 13 13 13 13
DYS391 10 10 10 10
DYS439 12 12 12 12
DYS635 24 24 24 24
DYS392 16 16 16 16
Y GATA H4 11 11 11 11
DYS437 14 14 14 14
DYS438 11 11 11 11
DYS448 ND ND ND ND
Nd no determinado
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2012Vol 8 No 32
doi 103823090
Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
14 1 15 12 24 29 17 13 1416 13 10 11 22 15 13 14 11 19 000769
15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
20 1 17 13 25 30 15 14 1416 13 10 12 22 16 12 14 12 19 000769
21 1 16 13 24 29 17 14 1318 14 10 11 22 14 11 15 11 21 000769
22 1 16 13 23 29 15 16 1516 14 10 11 21 13 11 15 8 19 000769
23 1 13 12 24 28 16 15 1319 12 11 13 21 11 11 16 9 20 000769
24 1 15 13 25 29 17 14 1113 12 10 11 24 13 12 15 12 19 000769
25 1 15 14 23 30 18 14 1214 12 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
26 1 15 14 23 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 15 12 18 000769
27 1 16 13 24 31 18 13 1317 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
28 1 17 13 24 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 12 15 12 19 000769
29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
30 1 16 13 23 30 16 13 1718 13 10 11 22 11 12 13 10 20 000769
31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
34 1 16 13 24 29 16 14 1115 13 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
35 1 15 12 23 28 17 13 1418 14 10 12 22 13 12 14 11 19 000769
36 1 15 12 21 28 15 15 1516 8 16 10 22 12 11 16 10 20 000769
37 1 16 13 23 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 11 15 12 19 000769
38 1 15 13 24 29 17 14 16 13 10 12 23 14 11 14 11 20 000769
39 1 15 12 24 28 16 14 1114 13 11 10 24 13 12 15 12 19 000769
40 1 15 14 24 32 17 14 1214 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
41 1 16 13 24 29 15 17 1116 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
42 1 13 24 29 14 1114 14 10 12 13 15 12 000769
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43 1 14 24 31 14 1114 13 10 12 13 14 12 000769
44 1 14 23 30 14 1214 13 10 12 13 16 12 000769
45 1 13 23 29 13 1617 13 10 13 15 14 11 000769
46 1 14 24 30 14 1617 13 11 12 14 14 10 000769
47 1 13 23 30 14 1315 12 10 12 11 14 10 000769
48 1 14 20 31 14 1719 14 10 12 11 14 10 000769
49 1 12 22 29 15 1415 14 10 11 11 15 10 000769
50 1 13 24 31 13 1318 13 10 11 14 14 12 000769
51 y 54 2 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 14 12 001538
52 1 14 25 30 14 1115 13 11 12 13 14 12 000769
53 y 107 2 13 24 29 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
55 1 13 24 29 14 1114 13 11 10 13 15 12 000769
56 1 13 24 29 13 1314 13 9 11 11 14 10 000769
57 1 13 24 30 15 13 12 10 13 11 15 9 000769
58 1 13 24 30 13 1619 12 10 12 13 14 11 000769
59 1 14 23 30 14 11 13 12 13 13 15 12 000769
60 1 12 24 26 15 1214 13 11 10 13 15 12 000769
61 1 13 24 29 14 1113 12 11 13 13 15 12 000769
62 1 14 24 30 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
63 1 14 24 30 16 15 14 11 12 12 15 8 000769
64 1 14 24 30 14 1114 13 11 13 13 15 12 000769
65 1 12 24 29 15 1216 13 10 12 13 15 10 000769
66 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 13 15 12 000769
67 1 13 24 29 14 1114 13 10 13 13 15 12 000769
68 1 15 24 31 13 1516 13 11 11 14 14 11 000769
69 1 13 24 28 13 1418 12 10 11 12 14 10 000769
70 1 13 25 30 16 1116 13 10 11 11 14 11 000769
71 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 14 15 12 000769
72 1 12 24 28 13 1518 13 9 11 13 15 11 00076973 1 13 24 30 13 1520 13 11 12 14 14 11 00076974 1 13 24 29 13 1520 13 10 13 14 14 11 000769
75 1 14 23 30 14 1517 13 10 12 14 14 8 000769
76 1 14 24 30 15 1114 13 10 12 13 14 12 000769
77 1 12 23 28 14 1114 13 11 11 14 14 12 000769
78 1 13 23 31 13 1417 13 12 11 15 14 11 000769
79 1 13 24 28 14 1114 12 10 13 14 14 12 000769
80 1 14 24 30 14 1115 13 10 11 13 14 12 000769
81 1 13 23 30 13 16 13 10 12 11 15 10 000769
82 1 14 24 29 15 1114 12 11 11 13 15 12 000769
83 1 13 24 29 14 1115 13 11 13 13 16 12 000769
84 1 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
85 1 13 23 28 17 1213 13 10 11 11 15 10 000769
86 1 13 25 31 13 1419 13 10 12 15 14 11 000769
87 1 13 24 29 13 1518 13 10 12 14 14 12 000769
88 y 113 2 14 24 30 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
89 1 13 24 30 13 1517 13 10 12 16 14 12 000769
90 1 13 24 31 13 1419 12 11 13 16 14 11 000769
91 1 13 23 29 14 1417 13 10 11 14 14 11 000769
92 1 13 24 29 13 1516 13 10 11 15 14 11 00076993 1 14 23 30 14 1114 13 10 11 13 15 11 00076994 1 14 24 30 13 1314 13 9 10 11 14 10 000769
95 1 13 22 30 14 1215 13 10 11 11 14 9 000769
96 1 13 22 31 13 1317 13 10 12 14 14 11 000769
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97 1 13 24 30 13 1416 13 11 13 16 14 12 000769
98 1 13 24 29 14 1516 13 10 12 14 14 11 000769
99 1 13 24 30 13 1521 13 11 12 14 14 11 000769
100 1 14 24 31 13 1418 13 11 11 15 14 11 000769
101 1 13 24 30 13 16 13 10 11 11 14 10 000769
102 1 14 26 32 13 1420 13 10 12 15 14 11 000769
103 1 13 25 30 13 1420 13 10 13 14 14 11 000769
104 1 14 24 30 13 1617 14 10 12 16 14 11 000769
105 1 12 24 28 15 1617 13 10 13 11 16 9 000769
106 1 13 23 29 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
108 1 14 23 31 13 1415 13 10 11 16 14 11 000769
109 1 13 24 30 13 1416 13 10 12 14 14 11 000769
110 1 14 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 10 000769
111 1 12 22 28 14 1314 13 10 11 11 16 10 000769
112 1 14 24 32 14 11132 13 11 11 13 15 12 000769
114 1 12 23 28 13 1418 14 10 13 13 14 11 000769115 1 14 24 30 13 1214 13 11 11 13 15 12 000769116 1 14 24 31 16 1416 13 10 11 13 14 9 000769
117 1 13 24 29 14 1114 13 12 12 13 15 12 000769
118 1 13 26 29 14 1214 13 11 12 13 14 12 000769
119 1 13 23 32 13 1617 13 10 12 11 14 10 000769
120 1 14 25 31 13 1417 14 10 11 14 14 11 000769
121 1 13 25 32 14 1617 14 10 12 11 13 10 000769
122 1 13 24 30 13 1418 13 10 12 14 14 11 000769
123 1 13 25 29 14 14 14 12 12 13 14 12 000769
124 1 12 23 27 16 12 13 10 12 11 15 10 000769
125 1 13 23 31 13 1617 13 10 11 14 14 11 000769
126 1 13 23 29 15 1517 14 10 12 12 15 10 000769
127 1 12 23 28 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
128 1 13 24 30 11 1519 11 10 13 13 14 10 000769
129 1 13 24 30 13 1423 13 10 12 14 14 11 000769
130 1 13 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 12 000769
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Resultados
En primer lugar se determinoacute las frecuencias aleacutelicas de cada marcador y la diversidad geacutenica en cada uno de ellos y pos-teriormente las frecuencias haplotiacutepicas asiacute como su diversi-dad geneacutetica que pueden ser observadas en las tablas 1 y 2 Los haplotipos de la poblacioacuten son enlistados de manera completa en la tabla 9 al final de este artiacuteculo
Se enlista en la tabla 3 las frecuencias aleacutelicas del marcador DYS385ab el cual es el que contiene una mayor diversidad geacutenica
De las 130 muestras analizadas se obtuvieron 127 haploti-pos diferentes El valor de diversidad geacutenica fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) y en cuanto a frecuencia aleacutelica el alelo maacutes frecuente fue el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) La diversi-dad haplotiacutepica fue de 9994 El poder de discriminacioacuten fue 9769 El estudio comparativo con algunos paiacuteses es-pantildeoles nos muestra que no hay grandes diferencias entre las frecuencias de nuestra poblacioacuten con las de poblaciones espantildeolas
Tabla 1 Frecuencias aleacutelicas de 16 loci Y-STR (n = 130)
Alelo DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS393 DYS391
7 0
8 00076 0
9 0 00384
10 0 0 0 05692
11 0 00076 00230 03538
12 01384 0 01153 00307
13 002439 06076 03307 07384 0
14 007317 02461 00243 04538 01153
15 04390 00076 00975 01384 0
16 03414 02682 00384 0
17 01219 03685 00307
18 0 0 01951 0
19 0 00487 0
20 00076 0
21 00076
22 00461
23 02230
24 06153 0
25 00846 0
26 00153 00076
27 0 00076
28 01384
29 03615
30 03153
31 01230
32 00461
33 0
DG 06699 05510 05620 07333 07437 06630 04275 05484
DG=Diversidad geacutenica
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Tabla 2 Frecuencias aleacutelicas de 16 loci Y-STR (n = 130)
Alelo DYS439 DYS635 DYS392 Y GATA H4 DYS437 DYS448 DYS438
7 0
8 0 0 0 00230
9 0 0 0 00538
10 00615 0 00243 02076
11 03923 02076 03170 02692
12 04153 00461 01923 04230
13 01307 04384 00153 00230 00230
14 0 01923 05384
15 0 00615 03923
16 00538 00461
17 0 0 00243
18 0 01219
19 04390
20 00487 02926
21 00307 00975
22 03170 00243
23 03902 0
24 01463 0
25 0
26 0
DG 06527 07225 07189 08617 05535 06961 07015
DG=Diversidad geacutenica
Tabla 3 Frecuencias aleacutelicas para el marcador DYS385ab
Alelos Contados Frecuencia Alelos Contados Frecuencia
10-15 1 00076 14-16 6 00461
11-13 3 00230 14-17 4 00307
11-132 1 00076 14-18 6 00461
11-14 33 02538 14-19 2 00153
11-15 6 00461 14-20 2 00153
11-16 2 00153 14-23 1 00076
12-13 2 00153 15-16 5 00384
12-14 6 00461 15-17 3 00230
12-15 2 00153 15-18 2 00153
12-16 1 00076 15-19 2 00153
13-14 4 00307 15-20 3 00230
13-15 1 00076 15-21 1 00076
13-16 1 00076 16-17 7 00538
13-17 3 00230 16-19 1 00076
13-18 2 00153 17-18 1 00076
13-19 1 00076 17-19 1 00076
14-15 2 00153
Diversidad geacutenica 09172
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Estudio comparativo con otras poblaciones
Los resultados obtenidos en nuestra poblacioacuten fueron com-paradas utilizando 4 marcadores (DYS19 DYS389II DYS390 DYS393) con los datos publicados de algunas poblaciones espantildeolas (catalana vasca y gallega) [14]
Hemos detectado un mayor nuacutemero de alelos en nuestra poblacioacuten siendo el maacutes comuacuten el alelo 14 al igual que para gallegos catalanos y vascos Los alelos menos representados son el 10 18 y 19 ya que no aparecieron en ninguna de las poblaciones Asiacute como el alelo 11 y 17 que soacutelo aparecen una vez Posiblemente la diferente distribucioacuten de alelos en nuestra poblacioacuten respecto a las citadas se deba al tamantildeo de la muestra
Tabla 4 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 en las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 93 25 52
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00076 0 0 0
Alelo 12 0 0 0 0
Alelo 13 03307 01613 00400 00770
Alelo 14 04538 06236 08000 07890
Alelo 15 01384 01398 01600 00960
Alelo 16 00384 00645 0 00380
Alelo 17 00307 00107 0 0
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Tabla 5 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 31 56
Alelo 24 0 00176 0 00180
Alelo 25 0 01380 00650 01980
Alelo 26 00076 05259 05800 03930
Alelo 27 00076 01983 02260 03390
Alelo 28 01384 01034 01290 00180
Alelo 29 03615 00086 0 00360
Alelo 30 03153 00086 0 0
Alelo 31 01230 0 0 0
Alelo 32 00461 0 0 0
Alelo 33 0 0 0 0
Alelo 34 0 0 0 0
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Graacutefico 1 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Graacutefico 2 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 6 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 29 53
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Alelo 20 00076 0 0 0
Alelo 21 00076 00259 0 0
Alelo 22 00461 00345 00690 0
Alelo 23 02230 02672 01720 01700
Alelo 24 06153 05345 06900 07730
Alelo 25 00846 01379 00690 00570
Alelo 26 00153 0 0 0
Alelo 27 0 0 0 0
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Graacutefico 3 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 7 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 32 42
Alelo 8 00076 0 0 0
Alelo 9 0 0 0 0
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00230 00086 0 0
Alelo 12 01153 01380 00630 00710
Alelo 13 07354 07327 08120 08340
Alelo 14 01153 01035 01250 00950
Alelo 15 0 00172 0 0
Alelo 16 0 0 0 0
Graacutefico 4 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
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Hemos encontrado 7 alelos en nuestra poblacioacuten El alelo maacutes comuacuten es el 29 mientras que en las demaacutes poblaciones estudiadas el alelo maacutes comuacuten es el 26
En este marcador hemos hallado 7 alelos en nuestra pobla-cioacuten nuacutemero que se reduce para gallegos vascos y catala-nes El maacutes frecuente es el alelo 24 dato compartido con las demaacutes poblaciones
No hemos encontrado diferencias significativas para este sis-tema al compararlo con la poblacioacuten zacatecana
Para este marcador en nuestra poblacioacuten hemos observado 5 alelos siendo maacutes comuacuten el alelo 13 en las cuatro pobla-ciones estudiadas
Discusioacuten
Los marcadores ubicados en el cromosoma masculino resul-tan de gran utilidad en el establecimiento de viacutenculos bioloacutegi-cos de parentesco y en la investigacioacuten de criacutemenes sexuales con una obvia limitacioacuten todos los individuos de la misma liacutenea paterna compartiraacuten ideacutentica informacioacuten en estos ha-plotipos por lo cual no seraacute posible desvincular individuos re-lacionados por viacutea paterna de la posible existencia de viacutenculo de parentesco o filiacioacuten si soacutelo analizamos marcadores pre-sentes en este cromosoma En consecuencia las evidencias deberaacuten ser en todos los casos evaluadas tambieacuten mediante marcadores autosoacutemicos Cuando en criminaliacutestica por ejem-plo se analiza el ADN de una mancha de sangre encontrada en el lugar del delito y se requiere compararla con el ADN de un sospechoso es necesario conocer cual es la frecuencia en la poblacioacuten de los haplotipos encontrados para que en caso de que coincidan pueda darse un valor de probabilidad de que esa mancha de sangre procede de dicho sospechoso
Obviamente estudiar todos los haplotipos de una poblacioacuten es imposible por lo que se toma una muestra representativa (ngt100) y se analiza en ella las frecuencias de los alelos de los diferentes marcadores que seraacuten utilizados para la iden-tificacioacuten geneacutetica Por tanto las frecuencias geacutenicas obte-nidas en un estudio poblacional no son valores exactos sino estimaciones con un margen de error
Aplicacioacuten estadiacutestica en un caso forense a propoacutesito de un caso
Estadiacutestica con haplotipos de Y-STR
En el caso de los marcadores Y-STR la regla del producto basado en la multiplicacioacuten de las frecuencias aleacutelicas a traveacutes
de los marcadores no puede ser aplicada La frecuencia del haplotipo Y-STR es comuacutenmente determinada por el meacutetodo de conteo Suponiendo que hay una base de datos poblacio-nal de tamantildeo n con la cuenta de la base de datos x para un haplotipo particular La frecuencia del haplotipo puede ser es-timada por la proporcioacuten de la muestra cuando xgt 0 p=xn
Un intervalo de confidencia de liacutemite superior puede ser co-locado en una frecuencia de perfiles usando
En casos donde el perfil no ha sido observado en una base de datos el liacutemite superior sobre el intervalo de confianza es 1-α 1N Donde α es el coeficiente de coincidencia (005 para 95 de intervalo de confidencia) y N es el nuacutemero de individuos en la base de datos
El haplotipo obtenido de las muestras problema obtenidas de la menor y el obtenido del C fueron verificados contra la base de datos de referencia de haplotipos del cromosoma Y en wwwYHRDorg [15] y en la base de datos del haploti-po del sistema de amplificacioacuten AmpLFSTR Y Filer en wwwappliedbiosystemscomyfilerdatabase [16] Posteriormente se determinoacute la frecuencia de tal haplotipo de acuerdo a la foacuter-mula anteriormente mencionada
Resultados
Tabla de resultados mostrando diecisiete loci STR encontra-dos en el cromosoma Y al ser analizadas las fracciones mas-culinas obtenidas de la lisis diferencial durante la extraccioacuten de ADN Teniendo como muestra de referencia el hisopado de la cavidad oral
Resultados obtenidos al introducir los datos en la base de datos de la compantildeiacutea AppliedBiosystems
bull 7 loci haplotype (DYS19 DYS389I DYS389II DYS390 DYS391 DYS392 DYS393) 89237 haplotypes
bull 9 loci haplotype (+ DYS385ab) 87440 haplotypesbull 11 loci haplotype (+ DYS438 DYS439) 59735 haplotypesbull 12 loci haplotype (+ DYS437) 39348 haplotypesbull 17 loci haplotype (+ DYS448 DYS456 DYS458 DYS635
YGATAH4) 27531 haplotypes
Resultados obtenidos al comparar el haplotipo en la base de datos YHRD
bull Aacutefrica Se han encontrado 0 haplotipos de 1243 en 19 poblaciones
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bull Oceaniacutea Australia Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 poblaciones
bull Europa Se han encontrado 0 haplotipos de 6007 en 40 poblaciones
bull Aacutertico Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 pobla-ciones
bull Asia Se han encontrado 0 haplotipos de 13041 en 79 po-blaciones
bull America Latina Se han encontrado 0 haplotipos de 3984 en 40 poblaciones
bull Norte America Se han encontrado 0 haplotipos de 3256 en 4 poblaciones
Frecuencia del haplotipo observado El haplotipo no fue observado en las bases de datos utilizadas sin embargo la frecuencia para este caso en particular es de 019 oacute 1 en 500
Interpretacioacuten forense de los resultados
Los polimorfismos del cromosoma Y (STRs) aplicados al anaacute-lisis criminaliacutestico presentan la ventaja de proporcionar in-formacioacuten adicional sobre la presencia de ADN de varoacuten en manchas forenses particularmente en casos de violacioacuten y
asalto sexual en los que este anaacutelisis ofrece una nueva aproxi-macioacuten La principal utilidad de estos sistemas se encuentra en los casos de muestras con mezclas de ceacutelulas masculinas y femeninas Contrariamente a lo que sucede en los siste-mas autosoacutemicos una elevada cantidad de ADN femenino no inhibe la amplificacioacuten de los alelos del cromosoma Y per-mitiendo obtener un perfil especiacutefico de ADN del asaltante
Para interpretar el significado de una correspondencia entre muestras tipificadas geneacuteticamente es necesario conocer la distribucioacuten de la poblacioacuten de los alelos de cada locus en cuestioacuten Si el genotipo de la muestra de evidencia relevante es diferente del genotipo de la muestra de referencia del sospechoso entonces el sospechoso es ldquoexcluidordquo como el donador de la muestra bioloacutegica estudiada Una exclusioacuten es independiente de la frecuencia de los dos genotipos en la poblacioacuten
Si las muestras del sospechoso y la evidencia tienen el mismo genotipo entonces el sospechoso es ldquoincluidordquo como la po-sible fuente de la muestra de evidencia La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la muestra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese genotipo en la poblacioacuten relevante
Tabla 8 Perfil geneacutetico obtenido en las diferentes muestras analizadas
Muestras
MarcadoresGeneacuteticos
Hisopado introito vaginal (liq seminal)
Hisopo exudado introito anal (liq
seminal)
Liacutequido hemaacutetico (acusado)
Ceacutelulas epiteliales cavidad oral (acusado)
BDY456 16 16 16 16
BDYS389I 12 12 12 12
DYS390 24 24 24 24
DYS389II 31 31 31 31
DYS458 18 18 18 18
DYS19 13 13 13 13
DYS385ab 1416 1416 1416 1416
DYS393 13 13 13 13
DYS391 10 10 10 10
DYS439 12 12 12 12
DYS635 24 24 24 24
DYS392 16 16 16 16
Y GATA H4 11 11 11 11
DYS437 14 14 14 14
DYS438 11 11 11 11
DYS448 ND ND ND ND
Nd no determinado
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Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
14 1 15 12 24 29 17 13 1416 13 10 11 22 15 13 14 11 19 000769
15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
20 1 17 13 25 30 15 14 1416 13 10 12 22 16 12 14 12 19 000769
21 1 16 13 24 29 17 14 1318 14 10 11 22 14 11 15 11 21 000769
22 1 16 13 23 29 15 16 1516 14 10 11 21 13 11 15 8 19 000769
23 1 13 12 24 28 16 15 1319 12 11 13 21 11 11 16 9 20 000769
24 1 15 13 25 29 17 14 1113 12 10 11 24 13 12 15 12 19 000769
25 1 15 14 23 30 18 14 1214 12 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
26 1 15 14 23 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 15 12 18 000769
27 1 16 13 24 31 18 13 1317 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
28 1 17 13 24 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 12 15 12 19 000769
29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
30 1 16 13 23 30 16 13 1718 13 10 11 22 11 12 13 10 20 000769
31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
34 1 16 13 24 29 16 14 1115 13 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
35 1 15 12 23 28 17 13 1418 14 10 12 22 13 12 14 11 19 000769
36 1 15 12 21 28 15 15 1516 8 16 10 22 12 11 16 10 20 000769
37 1 16 13 23 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 11 15 12 19 000769
38 1 15 13 24 29 17 14 16 13 10 12 23 14 11 14 11 20 000769
39 1 15 12 24 28 16 14 1114 13 11 10 24 13 12 15 12 19 000769
40 1 15 14 24 32 17 14 1214 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
41 1 16 13 24 29 15 17 1116 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
42 1 13 24 29 14 1114 14 10 12 13 15 12 000769
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43 1 14 24 31 14 1114 13 10 12 13 14 12 000769
44 1 14 23 30 14 1214 13 10 12 13 16 12 000769
45 1 13 23 29 13 1617 13 10 13 15 14 11 000769
46 1 14 24 30 14 1617 13 11 12 14 14 10 000769
47 1 13 23 30 14 1315 12 10 12 11 14 10 000769
48 1 14 20 31 14 1719 14 10 12 11 14 10 000769
49 1 12 22 29 15 1415 14 10 11 11 15 10 000769
50 1 13 24 31 13 1318 13 10 11 14 14 12 000769
51 y 54 2 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 14 12 001538
52 1 14 25 30 14 1115 13 11 12 13 14 12 000769
53 y 107 2 13 24 29 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
55 1 13 24 29 14 1114 13 11 10 13 15 12 000769
56 1 13 24 29 13 1314 13 9 11 11 14 10 000769
57 1 13 24 30 15 13 12 10 13 11 15 9 000769
58 1 13 24 30 13 1619 12 10 12 13 14 11 000769
59 1 14 23 30 14 11 13 12 13 13 15 12 000769
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111 1 12 22 28 14 1314 13 10 11 11 16 10 000769
112 1 14 24 32 14 11132 13 11 11 13 15 12 000769
114 1 12 23 28 13 1418 14 10 13 13 14 11 000769115 1 14 24 30 13 1214 13 11 11 13 15 12 000769116 1 14 24 31 16 1416 13 10 11 13 14 9 000769
117 1 13 24 29 14 1114 13 12 12 13 15 12 000769
118 1 13 26 29 14 1214 13 11 12 13 14 12 000769
119 1 13 23 32 13 1617 13 10 12 11 14 10 000769
120 1 14 25 31 13 1417 14 10 11 14 14 11 000769
121 1 13 25 32 14 1617 14 10 12 11 13 10 000769
122 1 13 24 30 13 1418 13 10 12 14 14 11 000769
123 1 13 25 29 14 14 14 12 12 13 14 12 000769
124 1 12 23 27 16 12 13 10 12 11 15 10 000769
125 1 13 23 31 13 1617 13 10 11 14 14 11 000769
126 1 13 23 29 15 1517 14 10 12 12 15 10 000769
127 1 12 23 28 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
128 1 13 24 30 11 1519 11 10 13 13 14 10 000769
129 1 13 24 30 13 1423 13 10 12 14 14 11 000769
130 1 13 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 12 000769
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Tabla 2 Frecuencias aleacutelicas de 16 loci Y-STR (n = 130)
Alelo DYS439 DYS635 DYS392 Y GATA H4 DYS437 DYS448 DYS438
7 0
8 0 0 0 00230
9 0 0 0 00538
10 00615 0 00243 02076
11 03923 02076 03170 02692
12 04153 00461 01923 04230
13 01307 04384 00153 00230 00230
14 0 01923 05384
15 0 00615 03923
16 00538 00461
17 0 0 00243
18 0 01219
19 04390
20 00487 02926
21 00307 00975
22 03170 00243
23 03902 0
24 01463 0
25 0
26 0
DG 06527 07225 07189 08617 05535 06961 07015
DG=Diversidad geacutenica
Tabla 3 Frecuencias aleacutelicas para el marcador DYS385ab
Alelos Contados Frecuencia Alelos Contados Frecuencia
10-15 1 00076 14-16 6 00461
11-13 3 00230 14-17 4 00307
11-132 1 00076 14-18 6 00461
11-14 33 02538 14-19 2 00153
11-15 6 00461 14-20 2 00153
11-16 2 00153 14-23 1 00076
12-13 2 00153 15-16 5 00384
12-14 6 00461 15-17 3 00230
12-15 2 00153 15-18 2 00153
12-16 1 00076 15-19 2 00153
13-14 4 00307 15-20 3 00230
13-15 1 00076 15-21 1 00076
13-16 1 00076 16-17 7 00538
13-17 3 00230 16-19 1 00076
13-18 2 00153 17-18 1 00076
13-19 1 00076 17-19 1 00076
14-15 2 00153
Diversidad geacutenica 09172
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Estudio comparativo con otras poblaciones
Los resultados obtenidos en nuestra poblacioacuten fueron com-paradas utilizando 4 marcadores (DYS19 DYS389II DYS390 DYS393) con los datos publicados de algunas poblaciones espantildeolas (catalana vasca y gallega) [14]
Hemos detectado un mayor nuacutemero de alelos en nuestra poblacioacuten siendo el maacutes comuacuten el alelo 14 al igual que para gallegos catalanos y vascos Los alelos menos representados son el 10 18 y 19 ya que no aparecieron en ninguna de las poblaciones Asiacute como el alelo 11 y 17 que soacutelo aparecen una vez Posiblemente la diferente distribucioacuten de alelos en nuestra poblacioacuten respecto a las citadas se deba al tamantildeo de la muestra
Tabla 4 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 en las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 93 25 52
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00076 0 0 0
Alelo 12 0 0 0 0
Alelo 13 03307 01613 00400 00770
Alelo 14 04538 06236 08000 07890
Alelo 15 01384 01398 01600 00960
Alelo 16 00384 00645 0 00380
Alelo 17 00307 00107 0 0
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Tabla 5 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 31 56
Alelo 24 0 00176 0 00180
Alelo 25 0 01380 00650 01980
Alelo 26 00076 05259 05800 03930
Alelo 27 00076 01983 02260 03390
Alelo 28 01384 01034 01290 00180
Alelo 29 03615 00086 0 00360
Alelo 30 03153 00086 0 0
Alelo 31 01230 0 0 0
Alelo 32 00461 0 0 0
Alelo 33 0 0 0 0
Alelo 34 0 0 0 0
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Graacutefico 1 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Graacutefico 2 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 6 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 29 53
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Alelo 20 00076 0 0 0
Alelo 21 00076 00259 0 0
Alelo 22 00461 00345 00690 0
Alelo 23 02230 02672 01720 01700
Alelo 24 06153 05345 06900 07730
Alelo 25 00846 01379 00690 00570
Alelo 26 00153 0 0 0
Alelo 27 0 0 0 0
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Graacutefico 3 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 7 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 32 42
Alelo 8 00076 0 0 0
Alelo 9 0 0 0 0
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00230 00086 0 0
Alelo 12 01153 01380 00630 00710
Alelo 13 07354 07327 08120 08340
Alelo 14 01153 01035 01250 00950
Alelo 15 0 00172 0 0
Alelo 16 0 0 0 0
Graacutefico 4 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
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Hemos encontrado 7 alelos en nuestra poblacioacuten El alelo maacutes comuacuten es el 29 mientras que en las demaacutes poblaciones estudiadas el alelo maacutes comuacuten es el 26
En este marcador hemos hallado 7 alelos en nuestra pobla-cioacuten nuacutemero que se reduce para gallegos vascos y catala-nes El maacutes frecuente es el alelo 24 dato compartido con las demaacutes poblaciones
No hemos encontrado diferencias significativas para este sis-tema al compararlo con la poblacioacuten zacatecana
Para este marcador en nuestra poblacioacuten hemos observado 5 alelos siendo maacutes comuacuten el alelo 13 en las cuatro pobla-ciones estudiadas
Discusioacuten
Los marcadores ubicados en el cromosoma masculino resul-tan de gran utilidad en el establecimiento de viacutenculos bioloacutegi-cos de parentesco y en la investigacioacuten de criacutemenes sexuales con una obvia limitacioacuten todos los individuos de la misma liacutenea paterna compartiraacuten ideacutentica informacioacuten en estos ha-plotipos por lo cual no seraacute posible desvincular individuos re-lacionados por viacutea paterna de la posible existencia de viacutenculo de parentesco o filiacioacuten si soacutelo analizamos marcadores pre-sentes en este cromosoma En consecuencia las evidencias deberaacuten ser en todos los casos evaluadas tambieacuten mediante marcadores autosoacutemicos Cuando en criminaliacutestica por ejem-plo se analiza el ADN de una mancha de sangre encontrada en el lugar del delito y se requiere compararla con el ADN de un sospechoso es necesario conocer cual es la frecuencia en la poblacioacuten de los haplotipos encontrados para que en caso de que coincidan pueda darse un valor de probabilidad de que esa mancha de sangre procede de dicho sospechoso
Obviamente estudiar todos los haplotipos de una poblacioacuten es imposible por lo que se toma una muestra representativa (ngt100) y se analiza en ella las frecuencias de los alelos de los diferentes marcadores que seraacuten utilizados para la iden-tificacioacuten geneacutetica Por tanto las frecuencias geacutenicas obte-nidas en un estudio poblacional no son valores exactos sino estimaciones con un margen de error
Aplicacioacuten estadiacutestica en un caso forense a propoacutesito de un caso
Estadiacutestica con haplotipos de Y-STR
En el caso de los marcadores Y-STR la regla del producto basado en la multiplicacioacuten de las frecuencias aleacutelicas a traveacutes
de los marcadores no puede ser aplicada La frecuencia del haplotipo Y-STR es comuacutenmente determinada por el meacutetodo de conteo Suponiendo que hay una base de datos poblacio-nal de tamantildeo n con la cuenta de la base de datos x para un haplotipo particular La frecuencia del haplotipo puede ser es-timada por la proporcioacuten de la muestra cuando xgt 0 p=xn
Un intervalo de confidencia de liacutemite superior puede ser co-locado en una frecuencia de perfiles usando
En casos donde el perfil no ha sido observado en una base de datos el liacutemite superior sobre el intervalo de confianza es 1-α 1N Donde α es el coeficiente de coincidencia (005 para 95 de intervalo de confidencia) y N es el nuacutemero de individuos en la base de datos
El haplotipo obtenido de las muestras problema obtenidas de la menor y el obtenido del C fueron verificados contra la base de datos de referencia de haplotipos del cromosoma Y en wwwYHRDorg [15] y en la base de datos del haploti-po del sistema de amplificacioacuten AmpLFSTR Y Filer en wwwappliedbiosystemscomyfilerdatabase [16] Posteriormente se determinoacute la frecuencia de tal haplotipo de acuerdo a la foacuter-mula anteriormente mencionada
Resultados
Tabla de resultados mostrando diecisiete loci STR encontra-dos en el cromosoma Y al ser analizadas las fracciones mas-culinas obtenidas de la lisis diferencial durante la extraccioacuten de ADN Teniendo como muestra de referencia el hisopado de la cavidad oral
Resultados obtenidos al introducir los datos en la base de datos de la compantildeiacutea AppliedBiosystems
bull 7 loci haplotype (DYS19 DYS389I DYS389II DYS390 DYS391 DYS392 DYS393) 89237 haplotypes
bull 9 loci haplotype (+ DYS385ab) 87440 haplotypesbull 11 loci haplotype (+ DYS438 DYS439) 59735 haplotypesbull 12 loci haplotype (+ DYS437) 39348 haplotypesbull 17 loci haplotype (+ DYS448 DYS456 DYS458 DYS635
YGATAH4) 27531 haplotypes
Resultados obtenidos al comparar el haplotipo en la base de datos YHRD
bull Aacutefrica Se han encontrado 0 haplotipos de 1243 en 19 poblaciones
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bull Oceaniacutea Australia Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 poblaciones
bull Europa Se han encontrado 0 haplotipos de 6007 en 40 poblaciones
bull Aacutertico Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 pobla-ciones
bull Asia Se han encontrado 0 haplotipos de 13041 en 79 po-blaciones
bull America Latina Se han encontrado 0 haplotipos de 3984 en 40 poblaciones
bull Norte America Se han encontrado 0 haplotipos de 3256 en 4 poblaciones
Frecuencia del haplotipo observado El haplotipo no fue observado en las bases de datos utilizadas sin embargo la frecuencia para este caso en particular es de 019 oacute 1 en 500
Interpretacioacuten forense de los resultados
Los polimorfismos del cromosoma Y (STRs) aplicados al anaacute-lisis criminaliacutestico presentan la ventaja de proporcionar in-formacioacuten adicional sobre la presencia de ADN de varoacuten en manchas forenses particularmente en casos de violacioacuten y
asalto sexual en los que este anaacutelisis ofrece una nueva aproxi-macioacuten La principal utilidad de estos sistemas se encuentra en los casos de muestras con mezclas de ceacutelulas masculinas y femeninas Contrariamente a lo que sucede en los siste-mas autosoacutemicos una elevada cantidad de ADN femenino no inhibe la amplificacioacuten de los alelos del cromosoma Y per-mitiendo obtener un perfil especiacutefico de ADN del asaltante
Para interpretar el significado de una correspondencia entre muestras tipificadas geneacuteticamente es necesario conocer la distribucioacuten de la poblacioacuten de los alelos de cada locus en cuestioacuten Si el genotipo de la muestra de evidencia relevante es diferente del genotipo de la muestra de referencia del sospechoso entonces el sospechoso es ldquoexcluidordquo como el donador de la muestra bioloacutegica estudiada Una exclusioacuten es independiente de la frecuencia de los dos genotipos en la poblacioacuten
Si las muestras del sospechoso y la evidencia tienen el mismo genotipo entonces el sospechoso es ldquoincluidordquo como la po-sible fuente de la muestra de evidencia La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la muestra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese genotipo en la poblacioacuten relevante
Tabla 8 Perfil geneacutetico obtenido en las diferentes muestras analizadas
Muestras
MarcadoresGeneacuteticos
Hisopado introito vaginal (liq seminal)
Hisopo exudado introito anal (liq
seminal)
Liacutequido hemaacutetico (acusado)
Ceacutelulas epiteliales cavidad oral (acusado)
BDY456 16 16 16 16
BDYS389I 12 12 12 12
DYS390 24 24 24 24
DYS389II 31 31 31 31
DYS458 18 18 18 18
DYS19 13 13 13 13
DYS385ab 1416 1416 1416 1416
DYS393 13 13 13 13
DYS391 10 10 10 10
DYS439 12 12 12 12
DYS635 24 24 24 24
DYS392 16 16 16 16
Y GATA H4 11 11 11 11
DYS437 14 14 14 14
DYS438 11 11 11 11
DYS448 ND ND ND ND
Nd no determinado
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Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
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15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
20 1 17 13 25 30 15 14 1416 13 10 12 22 16 12 14 12 19 000769
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22 1 16 13 23 29 15 16 1516 14 10 11 21 13 11 15 8 19 000769
23 1 13 12 24 28 16 15 1319 12 11 13 21 11 11 16 9 20 000769
24 1 15 13 25 29 17 14 1113 12 10 11 24 13 12 15 12 19 000769
25 1 15 14 23 30 18 14 1214 12 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
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27 1 16 13 24 31 18 13 1317 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
28 1 17 13 24 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 12 15 12 19 000769
29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
30 1 16 13 23 30 16 13 1718 13 10 11 22 11 12 13 10 20 000769
31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
34 1 16 13 24 29 16 14 1115 13 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
35 1 15 12 23 28 17 13 1418 14 10 12 22 13 12 14 11 19 000769
36 1 15 12 21 28 15 15 1516 8 16 10 22 12 11 16 10 20 000769
37 1 16 13 23 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 11 15 12 19 000769
38 1 15 13 24 29 17 14 16 13 10 12 23 14 11 14 11 20 000769
39 1 15 12 24 28 16 14 1114 13 11 10 24 13 12 15 12 19 000769
40 1 15 14 24 32 17 14 1214 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
41 1 16 13 24 29 15 17 1116 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
42 1 13 24 29 14 1114 14 10 12 13 15 12 000769
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43 1 14 24 31 14 1114 13 10 12 13 14 12 000769
44 1 14 23 30 14 1214 13 10 12 13 16 12 000769
45 1 13 23 29 13 1617 13 10 13 15 14 11 000769
46 1 14 24 30 14 1617 13 11 12 14 14 10 000769
47 1 13 23 30 14 1315 12 10 12 11 14 10 000769
48 1 14 20 31 14 1719 14 10 12 11 14 10 000769
49 1 12 22 29 15 1415 14 10 11 11 15 10 000769
50 1 13 24 31 13 1318 13 10 11 14 14 12 000769
51 y 54 2 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 14 12 001538
52 1 14 25 30 14 1115 13 11 12 13 14 12 000769
53 y 107 2 13 24 29 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
55 1 13 24 29 14 1114 13 11 10 13 15 12 000769
56 1 13 24 29 13 1314 13 9 11 11 14 10 000769
57 1 13 24 30 15 13 12 10 13 11 15 9 000769
58 1 13 24 30 13 1619 12 10 12 13 14 11 000769
59 1 14 23 30 14 11 13 12 13 13 15 12 000769
60 1 12 24 26 15 1214 13 11 10 13 15 12 000769
61 1 13 24 29 14 1113 12 11 13 13 15 12 000769
62 1 14 24 30 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
63 1 14 24 30 16 15 14 11 12 12 15 8 000769
64 1 14 24 30 14 1114 13 11 13 13 15 12 000769
65 1 12 24 29 15 1216 13 10 12 13 15 10 000769
66 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 13 15 12 000769
67 1 13 24 29 14 1114 13 10 13 13 15 12 000769
68 1 15 24 31 13 1516 13 11 11 14 14 11 000769
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70 1 13 25 30 16 1116 13 10 11 11 14 11 000769
71 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 14 15 12 000769
72 1 12 24 28 13 1518 13 9 11 13 15 11 00076973 1 13 24 30 13 1520 13 11 12 14 14 11 00076974 1 13 24 29 13 1520 13 10 13 14 14 11 000769
75 1 14 23 30 14 1517 13 10 12 14 14 8 000769
76 1 14 24 30 15 1114 13 10 12 13 14 12 000769
77 1 12 23 28 14 1114 13 11 11 14 14 12 000769
78 1 13 23 31 13 1417 13 12 11 15 14 11 000769
79 1 13 24 28 14 1114 12 10 13 14 14 12 000769
80 1 14 24 30 14 1115 13 10 11 13 14 12 000769
81 1 13 23 30 13 16 13 10 12 11 15 10 000769
82 1 14 24 29 15 1114 12 11 11 13 15 12 000769
83 1 13 24 29 14 1115 13 11 13 13 16 12 000769
84 1 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
85 1 13 23 28 17 1213 13 10 11 11 15 10 000769
86 1 13 25 31 13 1419 13 10 12 15 14 11 000769
87 1 13 24 29 13 1518 13 10 12 14 14 12 000769
88 y 113 2 14 24 30 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
89 1 13 24 30 13 1517 13 10 12 16 14 12 000769
90 1 13 24 31 13 1419 12 11 13 16 14 11 000769
91 1 13 23 29 14 1417 13 10 11 14 14 11 000769
92 1 13 24 29 13 1516 13 10 11 15 14 11 00076993 1 14 23 30 14 1114 13 10 11 13 15 11 00076994 1 14 24 30 13 1314 13 9 10 11 14 10 000769
95 1 13 22 30 14 1215 13 10 11 11 14 9 000769
96 1 13 22 31 13 1317 13 10 12 14 14 11 000769
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97 1 13 24 30 13 1416 13 11 13 16 14 12 000769
98 1 13 24 29 14 1516 13 10 12 14 14 11 000769
99 1 13 24 30 13 1521 13 11 12 14 14 11 000769
100 1 14 24 31 13 1418 13 11 11 15 14 11 000769
101 1 13 24 30 13 16 13 10 11 11 14 10 000769
102 1 14 26 32 13 1420 13 10 12 15 14 11 000769
103 1 13 25 30 13 1420 13 10 13 14 14 11 000769
104 1 14 24 30 13 1617 14 10 12 16 14 11 000769
105 1 12 24 28 15 1617 13 10 13 11 16 9 000769
106 1 13 23 29 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
108 1 14 23 31 13 1415 13 10 11 16 14 11 000769
109 1 13 24 30 13 1416 13 10 12 14 14 11 000769
110 1 14 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 10 000769
111 1 12 22 28 14 1314 13 10 11 11 16 10 000769
112 1 14 24 32 14 11132 13 11 11 13 15 12 000769
114 1 12 23 28 13 1418 14 10 13 13 14 11 000769115 1 14 24 30 13 1214 13 11 11 13 15 12 000769116 1 14 24 31 16 1416 13 10 11 13 14 9 000769
117 1 13 24 29 14 1114 13 12 12 13 15 12 000769
118 1 13 26 29 14 1214 13 11 12 13 14 12 000769
119 1 13 23 32 13 1617 13 10 12 11 14 10 000769
120 1 14 25 31 13 1417 14 10 11 14 14 11 000769
121 1 13 25 32 14 1617 14 10 12 11 13 10 000769
122 1 13 24 30 13 1418 13 10 12 14 14 11 000769
123 1 13 25 29 14 14 14 12 12 13 14 12 000769
124 1 12 23 27 16 12 13 10 12 11 15 10 000769
125 1 13 23 31 13 1617 13 10 11 14 14 11 000769
126 1 13 23 29 15 1517 14 10 12 12 15 10 000769
127 1 12 23 28 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
128 1 13 24 30 11 1519 11 10 13 13 14 10 000769
129 1 13 24 30 13 1423 13 10 12 14 14 11 000769
130 1 13 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 12 000769
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Estudio comparativo con otras poblaciones
Los resultados obtenidos en nuestra poblacioacuten fueron com-paradas utilizando 4 marcadores (DYS19 DYS389II DYS390 DYS393) con los datos publicados de algunas poblaciones espantildeolas (catalana vasca y gallega) [14]
Hemos detectado un mayor nuacutemero de alelos en nuestra poblacioacuten siendo el maacutes comuacuten el alelo 14 al igual que para gallegos catalanos y vascos Los alelos menos representados son el 10 18 y 19 ya que no aparecieron en ninguna de las poblaciones Asiacute como el alelo 11 y 17 que soacutelo aparecen una vez Posiblemente la diferente distribucioacuten de alelos en nuestra poblacioacuten respecto a las citadas se deba al tamantildeo de la muestra
Tabla 4 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 en las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 93 25 52
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00076 0 0 0
Alelo 12 0 0 0 0
Alelo 13 03307 01613 00400 00770
Alelo 14 04538 06236 08000 07890
Alelo 15 01384 01398 01600 00960
Alelo 16 00384 00645 0 00380
Alelo 17 00307 00107 0 0
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Tabla 5 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 31 56
Alelo 24 0 00176 0 00180
Alelo 25 0 01380 00650 01980
Alelo 26 00076 05259 05800 03930
Alelo 27 00076 01983 02260 03390
Alelo 28 01384 01034 01290 00180
Alelo 29 03615 00086 0 00360
Alelo 30 03153 00086 0 0
Alelo 31 01230 0 0 0
Alelo 32 00461 0 0 0
Alelo 33 0 0 0 0
Alelo 34 0 0 0 0
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Graacutefico 1 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Graacutefico 2 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 6 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 29 53
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Alelo 20 00076 0 0 0
Alelo 21 00076 00259 0 0
Alelo 22 00461 00345 00690 0
Alelo 23 02230 02672 01720 01700
Alelo 24 06153 05345 06900 07730
Alelo 25 00846 01379 00690 00570
Alelo 26 00153 0 0 0
Alelo 27 0 0 0 0
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Graacutefico 3 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 7 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 32 42
Alelo 8 00076 0 0 0
Alelo 9 0 0 0 0
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00230 00086 0 0
Alelo 12 01153 01380 00630 00710
Alelo 13 07354 07327 08120 08340
Alelo 14 01153 01035 01250 00950
Alelo 15 0 00172 0 0
Alelo 16 0 0 0 0
Graacutefico 4 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
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Hemos encontrado 7 alelos en nuestra poblacioacuten El alelo maacutes comuacuten es el 29 mientras que en las demaacutes poblaciones estudiadas el alelo maacutes comuacuten es el 26
En este marcador hemos hallado 7 alelos en nuestra pobla-cioacuten nuacutemero que se reduce para gallegos vascos y catala-nes El maacutes frecuente es el alelo 24 dato compartido con las demaacutes poblaciones
No hemos encontrado diferencias significativas para este sis-tema al compararlo con la poblacioacuten zacatecana
Para este marcador en nuestra poblacioacuten hemos observado 5 alelos siendo maacutes comuacuten el alelo 13 en las cuatro pobla-ciones estudiadas
Discusioacuten
Los marcadores ubicados en el cromosoma masculino resul-tan de gran utilidad en el establecimiento de viacutenculos bioloacutegi-cos de parentesco y en la investigacioacuten de criacutemenes sexuales con una obvia limitacioacuten todos los individuos de la misma liacutenea paterna compartiraacuten ideacutentica informacioacuten en estos ha-plotipos por lo cual no seraacute posible desvincular individuos re-lacionados por viacutea paterna de la posible existencia de viacutenculo de parentesco o filiacioacuten si soacutelo analizamos marcadores pre-sentes en este cromosoma En consecuencia las evidencias deberaacuten ser en todos los casos evaluadas tambieacuten mediante marcadores autosoacutemicos Cuando en criminaliacutestica por ejem-plo se analiza el ADN de una mancha de sangre encontrada en el lugar del delito y se requiere compararla con el ADN de un sospechoso es necesario conocer cual es la frecuencia en la poblacioacuten de los haplotipos encontrados para que en caso de que coincidan pueda darse un valor de probabilidad de que esa mancha de sangre procede de dicho sospechoso
Obviamente estudiar todos los haplotipos de una poblacioacuten es imposible por lo que se toma una muestra representativa (ngt100) y se analiza en ella las frecuencias de los alelos de los diferentes marcadores que seraacuten utilizados para la iden-tificacioacuten geneacutetica Por tanto las frecuencias geacutenicas obte-nidas en un estudio poblacional no son valores exactos sino estimaciones con un margen de error
Aplicacioacuten estadiacutestica en un caso forense a propoacutesito de un caso
Estadiacutestica con haplotipos de Y-STR
En el caso de los marcadores Y-STR la regla del producto basado en la multiplicacioacuten de las frecuencias aleacutelicas a traveacutes
de los marcadores no puede ser aplicada La frecuencia del haplotipo Y-STR es comuacutenmente determinada por el meacutetodo de conteo Suponiendo que hay una base de datos poblacio-nal de tamantildeo n con la cuenta de la base de datos x para un haplotipo particular La frecuencia del haplotipo puede ser es-timada por la proporcioacuten de la muestra cuando xgt 0 p=xn
Un intervalo de confidencia de liacutemite superior puede ser co-locado en una frecuencia de perfiles usando
En casos donde el perfil no ha sido observado en una base de datos el liacutemite superior sobre el intervalo de confianza es 1-α 1N Donde α es el coeficiente de coincidencia (005 para 95 de intervalo de confidencia) y N es el nuacutemero de individuos en la base de datos
El haplotipo obtenido de las muestras problema obtenidas de la menor y el obtenido del C fueron verificados contra la base de datos de referencia de haplotipos del cromosoma Y en wwwYHRDorg [15] y en la base de datos del haploti-po del sistema de amplificacioacuten AmpLFSTR Y Filer en wwwappliedbiosystemscomyfilerdatabase [16] Posteriormente se determinoacute la frecuencia de tal haplotipo de acuerdo a la foacuter-mula anteriormente mencionada
Resultados
Tabla de resultados mostrando diecisiete loci STR encontra-dos en el cromosoma Y al ser analizadas las fracciones mas-culinas obtenidas de la lisis diferencial durante la extraccioacuten de ADN Teniendo como muestra de referencia el hisopado de la cavidad oral
Resultados obtenidos al introducir los datos en la base de datos de la compantildeiacutea AppliedBiosystems
bull 7 loci haplotype (DYS19 DYS389I DYS389II DYS390 DYS391 DYS392 DYS393) 89237 haplotypes
bull 9 loci haplotype (+ DYS385ab) 87440 haplotypesbull 11 loci haplotype (+ DYS438 DYS439) 59735 haplotypesbull 12 loci haplotype (+ DYS437) 39348 haplotypesbull 17 loci haplotype (+ DYS448 DYS456 DYS458 DYS635
YGATAH4) 27531 haplotypes
Resultados obtenidos al comparar el haplotipo en la base de datos YHRD
bull Aacutefrica Se han encontrado 0 haplotipos de 1243 en 19 poblaciones
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bull Oceaniacutea Australia Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 poblaciones
bull Europa Se han encontrado 0 haplotipos de 6007 en 40 poblaciones
bull Aacutertico Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 pobla-ciones
bull Asia Se han encontrado 0 haplotipos de 13041 en 79 po-blaciones
bull America Latina Se han encontrado 0 haplotipos de 3984 en 40 poblaciones
bull Norte America Se han encontrado 0 haplotipos de 3256 en 4 poblaciones
Frecuencia del haplotipo observado El haplotipo no fue observado en las bases de datos utilizadas sin embargo la frecuencia para este caso en particular es de 019 oacute 1 en 500
Interpretacioacuten forense de los resultados
Los polimorfismos del cromosoma Y (STRs) aplicados al anaacute-lisis criminaliacutestico presentan la ventaja de proporcionar in-formacioacuten adicional sobre la presencia de ADN de varoacuten en manchas forenses particularmente en casos de violacioacuten y
asalto sexual en los que este anaacutelisis ofrece una nueva aproxi-macioacuten La principal utilidad de estos sistemas se encuentra en los casos de muestras con mezclas de ceacutelulas masculinas y femeninas Contrariamente a lo que sucede en los siste-mas autosoacutemicos una elevada cantidad de ADN femenino no inhibe la amplificacioacuten de los alelos del cromosoma Y per-mitiendo obtener un perfil especiacutefico de ADN del asaltante
Para interpretar el significado de una correspondencia entre muestras tipificadas geneacuteticamente es necesario conocer la distribucioacuten de la poblacioacuten de los alelos de cada locus en cuestioacuten Si el genotipo de la muestra de evidencia relevante es diferente del genotipo de la muestra de referencia del sospechoso entonces el sospechoso es ldquoexcluidordquo como el donador de la muestra bioloacutegica estudiada Una exclusioacuten es independiente de la frecuencia de los dos genotipos en la poblacioacuten
Si las muestras del sospechoso y la evidencia tienen el mismo genotipo entonces el sospechoso es ldquoincluidordquo como la po-sible fuente de la muestra de evidencia La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la muestra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese genotipo en la poblacioacuten relevante
Tabla 8 Perfil geneacutetico obtenido en las diferentes muestras analizadas
Muestras
MarcadoresGeneacuteticos
Hisopado introito vaginal (liq seminal)
Hisopo exudado introito anal (liq
seminal)
Liacutequido hemaacutetico (acusado)
Ceacutelulas epiteliales cavidad oral (acusado)
BDY456 16 16 16 16
BDYS389I 12 12 12 12
DYS390 24 24 24 24
DYS389II 31 31 31 31
DYS458 18 18 18 18
DYS19 13 13 13 13
DYS385ab 1416 1416 1416 1416
DYS393 13 13 13 13
DYS391 10 10 10 10
DYS439 12 12 12 12
DYS635 24 24 24 24
DYS392 16 16 16 16
Y GATA H4 11 11 11 11
DYS437 14 14 14 14
DYS438 11 11 11 11
DYS448 ND ND ND ND
Nd no determinado
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Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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15 Y Chromosome Haplotype Reference Database (YHRD) [base de datos de Internet] Actualizado 28 mar 2012 Dsiponible en httpwwwyhrdorg
16 Applied Biosystems YFiler Haplotype Database [Base de datos de Internet] Dsiponible en httpwww6appliedbiosystemscomyfilerdatabase
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
14 1 15 12 24 29 17 13 1416 13 10 11 22 15 13 14 11 19 000769
15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
20 1 17 13 25 30 15 14 1416 13 10 12 22 16 12 14 12 19 000769
21 1 16 13 24 29 17 14 1318 14 10 11 22 14 11 15 11 21 000769
22 1 16 13 23 29 15 16 1516 14 10 11 21 13 11 15 8 19 000769
23 1 13 12 24 28 16 15 1319 12 11 13 21 11 11 16 9 20 000769
24 1 15 13 25 29 17 14 1113 12 10 11 24 13 12 15 12 19 000769
25 1 15 14 23 30 18 14 1214 12 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
26 1 15 14 23 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 15 12 18 000769
27 1 16 13 24 31 18 13 1317 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
28 1 17 13 24 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 12 15 12 19 000769
29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
30 1 16 13 23 30 16 13 1718 13 10 11 22 11 12 13 10 20 000769
31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
34 1 16 13 24 29 16 14 1115 13 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
35 1 15 12 23 28 17 13 1418 14 10 12 22 13 12 14 11 19 000769
36 1 15 12 21 28 15 15 1516 8 16 10 22 12 11 16 10 20 000769
37 1 16 13 23 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 11 15 12 19 000769
38 1 15 13 24 29 17 14 16 13 10 12 23 14 11 14 11 20 000769
39 1 15 12 24 28 16 14 1114 13 11 10 24 13 12 15 12 19 000769
40 1 15 14 24 32 17 14 1214 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
41 1 16 13 24 29 15 17 1116 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
42 1 13 24 29 14 1114 14 10 12 13 15 12 000769
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43 1 14 24 31 14 1114 13 10 12 13 14 12 000769
44 1 14 23 30 14 1214 13 10 12 13 16 12 000769
45 1 13 23 29 13 1617 13 10 13 15 14 11 000769
46 1 14 24 30 14 1617 13 11 12 14 14 10 000769
47 1 13 23 30 14 1315 12 10 12 11 14 10 000769
48 1 14 20 31 14 1719 14 10 12 11 14 10 000769
49 1 12 22 29 15 1415 14 10 11 11 15 10 000769
50 1 13 24 31 13 1318 13 10 11 14 14 12 000769
51 y 54 2 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 14 12 001538
52 1 14 25 30 14 1115 13 11 12 13 14 12 000769
53 y 107 2 13 24 29 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
55 1 13 24 29 14 1114 13 11 10 13 15 12 000769
56 1 13 24 29 13 1314 13 9 11 11 14 10 000769
57 1 13 24 30 15 13 12 10 13 11 15 9 000769
58 1 13 24 30 13 1619 12 10 12 13 14 11 000769
59 1 14 23 30 14 11 13 12 13 13 15 12 000769
60 1 12 24 26 15 1214 13 11 10 13 15 12 000769
61 1 13 24 29 14 1113 12 11 13 13 15 12 000769
62 1 14 24 30 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
63 1 14 24 30 16 15 14 11 12 12 15 8 000769
64 1 14 24 30 14 1114 13 11 13 13 15 12 000769
65 1 12 24 29 15 1216 13 10 12 13 15 10 000769
66 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 13 15 12 000769
67 1 13 24 29 14 1114 13 10 13 13 15 12 000769
68 1 15 24 31 13 1516 13 11 11 14 14 11 000769
69 1 13 24 28 13 1418 12 10 11 12 14 10 000769
70 1 13 25 30 16 1116 13 10 11 11 14 11 000769
71 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 14 15 12 000769
72 1 12 24 28 13 1518 13 9 11 13 15 11 00076973 1 13 24 30 13 1520 13 11 12 14 14 11 00076974 1 13 24 29 13 1520 13 10 13 14 14 11 000769
75 1 14 23 30 14 1517 13 10 12 14 14 8 000769
76 1 14 24 30 15 1114 13 10 12 13 14 12 000769
77 1 12 23 28 14 1114 13 11 11 14 14 12 000769
78 1 13 23 31 13 1417 13 12 11 15 14 11 000769
79 1 13 24 28 14 1114 12 10 13 14 14 12 000769
80 1 14 24 30 14 1115 13 10 11 13 14 12 000769
81 1 13 23 30 13 16 13 10 12 11 15 10 000769
82 1 14 24 29 15 1114 12 11 11 13 15 12 000769
83 1 13 24 29 14 1115 13 11 13 13 16 12 000769
84 1 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
85 1 13 23 28 17 1213 13 10 11 11 15 10 000769
86 1 13 25 31 13 1419 13 10 12 15 14 11 000769
87 1 13 24 29 13 1518 13 10 12 14 14 12 000769
88 y 113 2 14 24 30 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
89 1 13 24 30 13 1517 13 10 12 16 14 12 000769
90 1 13 24 31 13 1419 12 11 13 16 14 11 000769
91 1 13 23 29 14 1417 13 10 11 14 14 11 000769
92 1 13 24 29 13 1516 13 10 11 15 14 11 00076993 1 14 23 30 14 1114 13 10 11 13 15 11 00076994 1 14 24 30 13 1314 13 9 10 11 14 10 000769
95 1 13 22 30 14 1215 13 10 11 11 14 9 000769
96 1 13 22 31 13 1317 13 10 12 14 14 11 000769
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97 1 13 24 30 13 1416 13 11 13 16 14 12 000769
98 1 13 24 29 14 1516 13 10 12 14 14 11 000769
99 1 13 24 30 13 1521 13 11 12 14 14 11 000769
100 1 14 24 31 13 1418 13 11 11 15 14 11 000769
101 1 13 24 30 13 16 13 10 11 11 14 10 000769
102 1 14 26 32 13 1420 13 10 12 15 14 11 000769
103 1 13 25 30 13 1420 13 10 13 14 14 11 000769
104 1 14 24 30 13 1617 14 10 12 16 14 11 000769
105 1 12 24 28 15 1617 13 10 13 11 16 9 000769
106 1 13 23 29 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
108 1 14 23 31 13 1415 13 10 11 16 14 11 000769
109 1 13 24 30 13 1416 13 10 12 14 14 11 000769
110 1 14 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 10 000769
111 1 12 22 28 14 1314 13 10 11 11 16 10 000769
112 1 14 24 32 14 11132 13 11 11 13 15 12 000769
114 1 12 23 28 13 1418 14 10 13 13 14 11 000769115 1 14 24 30 13 1214 13 11 11 13 15 12 000769116 1 14 24 31 16 1416 13 10 11 13 14 9 000769
117 1 13 24 29 14 1114 13 12 12 13 15 12 000769
118 1 13 26 29 14 1214 13 11 12 13 14 12 000769
119 1 13 23 32 13 1617 13 10 12 11 14 10 000769
120 1 14 25 31 13 1417 14 10 11 14 14 11 000769
121 1 13 25 32 14 1617 14 10 12 11 13 10 000769
122 1 13 24 30 13 1418 13 10 12 14 14 11 000769
123 1 13 25 29 14 14 14 12 12 13 14 12 000769
124 1 12 23 27 16 12 13 10 12 11 15 10 000769
125 1 13 23 31 13 1617 13 10 11 14 14 11 000769
126 1 13 23 29 15 1517 14 10 12 12 15 10 000769
127 1 12 23 28 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
128 1 13 24 30 11 1519 11 10 13 13 14 10 000769
129 1 13 24 30 13 1423 13 10 12 14 14 11 000769
130 1 13 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 12 000769
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Graacutefico 1 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS19 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Graacutefico 2 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS389II entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 6 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 29 53
Alelo 18 0 0 0 0
Alelo 19 0 0 0 0
Alelo 20 00076 0 0 0
Alelo 21 00076 00259 0 0
Alelo 22 00461 00345 00690 0
Alelo 23 02230 02672 01720 01700
Alelo 24 06153 05345 06900 07730
Alelo 25 00846 01379 00690 00570
Alelo 26 00153 0 0 0
Alelo 27 0 0 0 0
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Graacutefico 3 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 7 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 32 42
Alelo 8 00076 0 0 0
Alelo 9 0 0 0 0
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00230 00086 0 0
Alelo 12 01153 01380 00630 00710
Alelo 13 07354 07327 08120 08340
Alelo 14 01153 01035 01250 00950
Alelo 15 0 00172 0 0
Alelo 16 0 0 0 0
Graacutefico 4 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
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Hemos encontrado 7 alelos en nuestra poblacioacuten El alelo maacutes comuacuten es el 29 mientras que en las demaacutes poblaciones estudiadas el alelo maacutes comuacuten es el 26
En este marcador hemos hallado 7 alelos en nuestra pobla-cioacuten nuacutemero que se reduce para gallegos vascos y catala-nes El maacutes frecuente es el alelo 24 dato compartido con las demaacutes poblaciones
No hemos encontrado diferencias significativas para este sis-tema al compararlo con la poblacioacuten zacatecana
Para este marcador en nuestra poblacioacuten hemos observado 5 alelos siendo maacutes comuacuten el alelo 13 en las cuatro pobla-ciones estudiadas
Discusioacuten
Los marcadores ubicados en el cromosoma masculino resul-tan de gran utilidad en el establecimiento de viacutenculos bioloacutegi-cos de parentesco y en la investigacioacuten de criacutemenes sexuales con una obvia limitacioacuten todos los individuos de la misma liacutenea paterna compartiraacuten ideacutentica informacioacuten en estos ha-plotipos por lo cual no seraacute posible desvincular individuos re-lacionados por viacutea paterna de la posible existencia de viacutenculo de parentesco o filiacioacuten si soacutelo analizamos marcadores pre-sentes en este cromosoma En consecuencia las evidencias deberaacuten ser en todos los casos evaluadas tambieacuten mediante marcadores autosoacutemicos Cuando en criminaliacutestica por ejem-plo se analiza el ADN de una mancha de sangre encontrada en el lugar del delito y se requiere compararla con el ADN de un sospechoso es necesario conocer cual es la frecuencia en la poblacioacuten de los haplotipos encontrados para que en caso de que coincidan pueda darse un valor de probabilidad de que esa mancha de sangre procede de dicho sospechoso
Obviamente estudiar todos los haplotipos de una poblacioacuten es imposible por lo que se toma una muestra representativa (ngt100) y se analiza en ella las frecuencias de los alelos de los diferentes marcadores que seraacuten utilizados para la iden-tificacioacuten geneacutetica Por tanto las frecuencias geacutenicas obte-nidas en un estudio poblacional no son valores exactos sino estimaciones con un margen de error
Aplicacioacuten estadiacutestica en un caso forense a propoacutesito de un caso
Estadiacutestica con haplotipos de Y-STR
En el caso de los marcadores Y-STR la regla del producto basado en la multiplicacioacuten de las frecuencias aleacutelicas a traveacutes
de los marcadores no puede ser aplicada La frecuencia del haplotipo Y-STR es comuacutenmente determinada por el meacutetodo de conteo Suponiendo que hay una base de datos poblacio-nal de tamantildeo n con la cuenta de la base de datos x para un haplotipo particular La frecuencia del haplotipo puede ser es-timada por la proporcioacuten de la muestra cuando xgt 0 p=xn
Un intervalo de confidencia de liacutemite superior puede ser co-locado en una frecuencia de perfiles usando
En casos donde el perfil no ha sido observado en una base de datos el liacutemite superior sobre el intervalo de confianza es 1-α 1N Donde α es el coeficiente de coincidencia (005 para 95 de intervalo de confidencia) y N es el nuacutemero de individuos en la base de datos
El haplotipo obtenido de las muestras problema obtenidas de la menor y el obtenido del C fueron verificados contra la base de datos de referencia de haplotipos del cromosoma Y en wwwYHRDorg [15] y en la base de datos del haploti-po del sistema de amplificacioacuten AmpLFSTR Y Filer en wwwappliedbiosystemscomyfilerdatabase [16] Posteriormente se determinoacute la frecuencia de tal haplotipo de acuerdo a la foacuter-mula anteriormente mencionada
Resultados
Tabla de resultados mostrando diecisiete loci STR encontra-dos en el cromosoma Y al ser analizadas las fracciones mas-culinas obtenidas de la lisis diferencial durante la extraccioacuten de ADN Teniendo como muestra de referencia el hisopado de la cavidad oral
Resultados obtenidos al introducir los datos en la base de datos de la compantildeiacutea AppliedBiosystems
bull 7 loci haplotype (DYS19 DYS389I DYS389II DYS390 DYS391 DYS392 DYS393) 89237 haplotypes
bull 9 loci haplotype (+ DYS385ab) 87440 haplotypesbull 11 loci haplotype (+ DYS438 DYS439) 59735 haplotypesbull 12 loci haplotype (+ DYS437) 39348 haplotypesbull 17 loci haplotype (+ DYS448 DYS456 DYS458 DYS635
YGATAH4) 27531 haplotypes
Resultados obtenidos al comparar el haplotipo en la base de datos YHRD
bull Aacutefrica Se han encontrado 0 haplotipos de 1243 en 19 poblaciones
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bull Oceaniacutea Australia Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 poblaciones
bull Europa Se han encontrado 0 haplotipos de 6007 en 40 poblaciones
bull Aacutertico Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 pobla-ciones
bull Asia Se han encontrado 0 haplotipos de 13041 en 79 po-blaciones
bull America Latina Se han encontrado 0 haplotipos de 3984 en 40 poblaciones
bull Norte America Se han encontrado 0 haplotipos de 3256 en 4 poblaciones
Frecuencia del haplotipo observado El haplotipo no fue observado en las bases de datos utilizadas sin embargo la frecuencia para este caso en particular es de 019 oacute 1 en 500
Interpretacioacuten forense de los resultados
Los polimorfismos del cromosoma Y (STRs) aplicados al anaacute-lisis criminaliacutestico presentan la ventaja de proporcionar in-formacioacuten adicional sobre la presencia de ADN de varoacuten en manchas forenses particularmente en casos de violacioacuten y
asalto sexual en los que este anaacutelisis ofrece una nueva aproxi-macioacuten La principal utilidad de estos sistemas se encuentra en los casos de muestras con mezclas de ceacutelulas masculinas y femeninas Contrariamente a lo que sucede en los siste-mas autosoacutemicos una elevada cantidad de ADN femenino no inhibe la amplificacioacuten de los alelos del cromosoma Y per-mitiendo obtener un perfil especiacutefico de ADN del asaltante
Para interpretar el significado de una correspondencia entre muestras tipificadas geneacuteticamente es necesario conocer la distribucioacuten de la poblacioacuten de los alelos de cada locus en cuestioacuten Si el genotipo de la muestra de evidencia relevante es diferente del genotipo de la muestra de referencia del sospechoso entonces el sospechoso es ldquoexcluidordquo como el donador de la muestra bioloacutegica estudiada Una exclusioacuten es independiente de la frecuencia de los dos genotipos en la poblacioacuten
Si las muestras del sospechoso y la evidencia tienen el mismo genotipo entonces el sospechoso es ldquoincluidordquo como la po-sible fuente de la muestra de evidencia La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la muestra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese genotipo en la poblacioacuten relevante
Tabla 8 Perfil geneacutetico obtenido en las diferentes muestras analizadas
Muestras
MarcadoresGeneacuteticos
Hisopado introito vaginal (liq seminal)
Hisopo exudado introito anal (liq
seminal)
Liacutequido hemaacutetico (acusado)
Ceacutelulas epiteliales cavidad oral (acusado)
BDY456 16 16 16 16
BDYS389I 12 12 12 12
DYS390 24 24 24 24
DYS389II 31 31 31 31
DYS458 18 18 18 18
DYS19 13 13 13 13
DYS385ab 1416 1416 1416 1416
DYS393 13 13 13 13
DYS391 10 10 10 10
DYS439 12 12 12 12
DYS635 24 24 24 24
DYS392 16 16 16 16
Y GATA H4 11 11 11 11
DYS437 14 14 14 14
DYS438 11 11 11 11
DYS448 ND ND ND ND
Nd no determinado
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Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
14 1 15 12 24 29 17 13 1416 13 10 11 22 15 13 14 11 19 000769
15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
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23 1 13 12 24 28 16 15 1319 12 11 13 21 11 11 16 9 20 000769
24 1 15 13 25 29 17 14 1113 12 10 11 24 13 12 15 12 19 000769
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27 1 16 13 24 31 18 13 1317 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
28 1 17 13 24 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 12 15 12 19 000769
29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
30 1 16 13 23 30 16 13 1718 13 10 11 22 11 12 13 10 20 000769
31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
34 1 16 13 24 29 16 14 1115 13 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
35 1 15 12 23 28 17 13 1418 14 10 12 22 13 12 14 11 19 000769
36 1 15 12 21 28 15 15 1516 8 16 10 22 12 11 16 10 20 000769
37 1 16 13 23 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 11 15 12 19 000769
38 1 15 13 24 29 17 14 16 13 10 12 23 14 11 14 11 20 000769
39 1 15 12 24 28 16 14 1114 13 11 10 24 13 12 15 12 19 000769
40 1 15 14 24 32 17 14 1214 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
41 1 16 13 24 29 15 17 1116 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
42 1 13 24 29 14 1114 14 10 12 13 15 12 000769
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43 1 14 24 31 14 1114 13 10 12 13 14 12 000769
44 1 14 23 30 14 1214 13 10 12 13 16 12 000769
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50 1 13 24 31 13 1318 13 10 11 14 14 12 000769
51 y 54 2 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 14 12 001538
52 1 14 25 30 14 1115 13 11 12 13 14 12 000769
53 y 107 2 13 24 29 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
55 1 13 24 29 14 1114 13 11 10 13 15 12 000769
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57 1 13 24 30 15 13 12 10 13 11 15 9 000769
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114 1 12 23 28 13 1418 14 10 13 13 14 11 000769115 1 14 24 30 13 1214 13 11 11 13 15 12 000769116 1 14 24 31 16 1416 13 10 11 13 14 9 000769
117 1 13 24 29 14 1114 13 12 12 13 15 12 000769
118 1 13 26 29 14 1214 13 11 12 13 14 12 000769
119 1 13 23 32 13 1617 13 10 12 11 14 10 000769
120 1 14 25 31 13 1417 14 10 11 14 14 11 000769
121 1 13 25 32 14 1617 14 10 12 11 13 10 000769
122 1 13 24 30 13 1418 13 10 12 14 14 11 000769
123 1 13 25 29 14 14 14 12 12 13 14 12 000769
124 1 12 23 27 16 12 13 10 12 11 15 10 000769
125 1 13 23 31 13 1617 13 10 11 14 14 11 000769
126 1 13 23 29 15 1517 14 10 12 12 15 10 000769
127 1 12 23 28 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
128 1 13 24 30 11 1519 11 10 13 13 14 10 000769
129 1 13 24 30 13 1423 13 10 12 14 14 11 000769
130 1 13 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 12 000769
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Graacutefico 3 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS390 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
Tabla 7 Frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 de las diferentes poblaciones estudiadas
Zacatecas Galicia Cataluntildea P Vasco
n 130 116 32 42
Alelo 8 00076 0 0 0
Alelo 9 0 0 0 0
Alelo 10 0 0 0 0
Alelo 11 00230 00086 0 0
Alelo 12 01153 01380 00630 00710
Alelo 13 07354 07327 08120 08340
Alelo 14 01153 01035 01250 00950
Alelo 15 0 00172 0 0
Alelo 16 0 0 0 0
Graacutefico 4 Comparacioacuten de frecuencias aleacutelicas del marcador DYS393 entre poblacioacuten zacatecana y poblaciones espantildeolas
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Hemos encontrado 7 alelos en nuestra poblacioacuten El alelo maacutes comuacuten es el 29 mientras que en las demaacutes poblaciones estudiadas el alelo maacutes comuacuten es el 26
En este marcador hemos hallado 7 alelos en nuestra pobla-cioacuten nuacutemero que se reduce para gallegos vascos y catala-nes El maacutes frecuente es el alelo 24 dato compartido con las demaacutes poblaciones
No hemos encontrado diferencias significativas para este sis-tema al compararlo con la poblacioacuten zacatecana
Para este marcador en nuestra poblacioacuten hemos observado 5 alelos siendo maacutes comuacuten el alelo 13 en las cuatro pobla-ciones estudiadas
Discusioacuten
Los marcadores ubicados en el cromosoma masculino resul-tan de gran utilidad en el establecimiento de viacutenculos bioloacutegi-cos de parentesco y en la investigacioacuten de criacutemenes sexuales con una obvia limitacioacuten todos los individuos de la misma liacutenea paterna compartiraacuten ideacutentica informacioacuten en estos ha-plotipos por lo cual no seraacute posible desvincular individuos re-lacionados por viacutea paterna de la posible existencia de viacutenculo de parentesco o filiacioacuten si soacutelo analizamos marcadores pre-sentes en este cromosoma En consecuencia las evidencias deberaacuten ser en todos los casos evaluadas tambieacuten mediante marcadores autosoacutemicos Cuando en criminaliacutestica por ejem-plo se analiza el ADN de una mancha de sangre encontrada en el lugar del delito y se requiere compararla con el ADN de un sospechoso es necesario conocer cual es la frecuencia en la poblacioacuten de los haplotipos encontrados para que en caso de que coincidan pueda darse un valor de probabilidad de que esa mancha de sangre procede de dicho sospechoso
Obviamente estudiar todos los haplotipos de una poblacioacuten es imposible por lo que se toma una muestra representativa (ngt100) y se analiza en ella las frecuencias de los alelos de los diferentes marcadores que seraacuten utilizados para la iden-tificacioacuten geneacutetica Por tanto las frecuencias geacutenicas obte-nidas en un estudio poblacional no son valores exactos sino estimaciones con un margen de error
Aplicacioacuten estadiacutestica en un caso forense a propoacutesito de un caso
Estadiacutestica con haplotipos de Y-STR
En el caso de los marcadores Y-STR la regla del producto basado en la multiplicacioacuten de las frecuencias aleacutelicas a traveacutes
de los marcadores no puede ser aplicada La frecuencia del haplotipo Y-STR es comuacutenmente determinada por el meacutetodo de conteo Suponiendo que hay una base de datos poblacio-nal de tamantildeo n con la cuenta de la base de datos x para un haplotipo particular La frecuencia del haplotipo puede ser es-timada por la proporcioacuten de la muestra cuando xgt 0 p=xn
Un intervalo de confidencia de liacutemite superior puede ser co-locado en una frecuencia de perfiles usando
En casos donde el perfil no ha sido observado en una base de datos el liacutemite superior sobre el intervalo de confianza es 1-α 1N Donde α es el coeficiente de coincidencia (005 para 95 de intervalo de confidencia) y N es el nuacutemero de individuos en la base de datos
El haplotipo obtenido de las muestras problema obtenidas de la menor y el obtenido del C fueron verificados contra la base de datos de referencia de haplotipos del cromosoma Y en wwwYHRDorg [15] y en la base de datos del haploti-po del sistema de amplificacioacuten AmpLFSTR Y Filer en wwwappliedbiosystemscomyfilerdatabase [16] Posteriormente se determinoacute la frecuencia de tal haplotipo de acuerdo a la foacuter-mula anteriormente mencionada
Resultados
Tabla de resultados mostrando diecisiete loci STR encontra-dos en el cromosoma Y al ser analizadas las fracciones mas-culinas obtenidas de la lisis diferencial durante la extraccioacuten de ADN Teniendo como muestra de referencia el hisopado de la cavidad oral
Resultados obtenidos al introducir los datos en la base de datos de la compantildeiacutea AppliedBiosystems
bull 7 loci haplotype (DYS19 DYS389I DYS389II DYS390 DYS391 DYS392 DYS393) 89237 haplotypes
bull 9 loci haplotype (+ DYS385ab) 87440 haplotypesbull 11 loci haplotype (+ DYS438 DYS439) 59735 haplotypesbull 12 loci haplotype (+ DYS437) 39348 haplotypesbull 17 loci haplotype (+ DYS448 DYS456 DYS458 DYS635
YGATAH4) 27531 haplotypes
Resultados obtenidos al comparar el haplotipo en la base de datos YHRD
bull Aacutefrica Se han encontrado 0 haplotipos de 1243 en 19 poblaciones
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bull Oceaniacutea Australia Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 poblaciones
bull Europa Se han encontrado 0 haplotipos de 6007 en 40 poblaciones
bull Aacutertico Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 pobla-ciones
bull Asia Se han encontrado 0 haplotipos de 13041 en 79 po-blaciones
bull America Latina Se han encontrado 0 haplotipos de 3984 en 40 poblaciones
bull Norte America Se han encontrado 0 haplotipos de 3256 en 4 poblaciones
Frecuencia del haplotipo observado El haplotipo no fue observado en las bases de datos utilizadas sin embargo la frecuencia para este caso en particular es de 019 oacute 1 en 500
Interpretacioacuten forense de los resultados
Los polimorfismos del cromosoma Y (STRs) aplicados al anaacute-lisis criminaliacutestico presentan la ventaja de proporcionar in-formacioacuten adicional sobre la presencia de ADN de varoacuten en manchas forenses particularmente en casos de violacioacuten y
asalto sexual en los que este anaacutelisis ofrece una nueva aproxi-macioacuten La principal utilidad de estos sistemas se encuentra en los casos de muestras con mezclas de ceacutelulas masculinas y femeninas Contrariamente a lo que sucede en los siste-mas autosoacutemicos una elevada cantidad de ADN femenino no inhibe la amplificacioacuten de los alelos del cromosoma Y per-mitiendo obtener un perfil especiacutefico de ADN del asaltante
Para interpretar el significado de una correspondencia entre muestras tipificadas geneacuteticamente es necesario conocer la distribucioacuten de la poblacioacuten de los alelos de cada locus en cuestioacuten Si el genotipo de la muestra de evidencia relevante es diferente del genotipo de la muestra de referencia del sospechoso entonces el sospechoso es ldquoexcluidordquo como el donador de la muestra bioloacutegica estudiada Una exclusioacuten es independiente de la frecuencia de los dos genotipos en la poblacioacuten
Si las muestras del sospechoso y la evidencia tienen el mismo genotipo entonces el sospechoso es ldquoincluidordquo como la po-sible fuente de la muestra de evidencia La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la muestra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese genotipo en la poblacioacuten relevante
Tabla 8 Perfil geneacutetico obtenido en las diferentes muestras analizadas
Muestras
MarcadoresGeneacuteticos
Hisopado introito vaginal (liq seminal)
Hisopo exudado introito anal (liq
seminal)
Liacutequido hemaacutetico (acusado)
Ceacutelulas epiteliales cavidad oral (acusado)
BDY456 16 16 16 16
BDYS389I 12 12 12 12
DYS390 24 24 24 24
DYS389II 31 31 31 31
DYS458 18 18 18 18
DYS19 13 13 13 13
DYS385ab 1416 1416 1416 1416
DYS393 13 13 13 13
DYS391 10 10 10 10
DYS439 12 12 12 12
DYS635 24 24 24 24
DYS392 16 16 16 16
Y GATA H4 11 11 11 11
DYS437 14 14 14 14
DYS438 11 11 11 11
DYS448 ND ND ND ND
Nd no determinado
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Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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15 Y Chromosome Haplotype Reference Database (YHRD) [base de datos de Internet] Actualizado 28 mar 2012 Dsiponible en httpwwwyhrdorg
16 Applied Biosystems YFiler Haplotype Database [Base de datos de Internet] Dsiponible en httpwww6appliedbiosystemscomyfilerdatabase
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
14 1 15 12 24 29 17 13 1416 13 10 11 22 15 13 14 11 19 000769
15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
20 1 17 13 25 30 15 14 1416 13 10 12 22 16 12 14 12 19 000769
21 1 16 13 24 29 17 14 1318 14 10 11 22 14 11 15 11 21 000769
22 1 16 13 23 29 15 16 1516 14 10 11 21 13 11 15 8 19 000769
23 1 13 12 24 28 16 15 1319 12 11 13 21 11 11 16 9 20 000769
24 1 15 13 25 29 17 14 1113 12 10 11 24 13 12 15 12 19 000769
25 1 15 14 23 30 18 14 1214 12 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
26 1 15 14 23 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 15 12 18 000769
27 1 16 13 24 31 18 13 1317 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
28 1 17 13 24 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 12 15 12 19 000769
29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
30 1 16 13 23 30 16 13 1718 13 10 11 22 11 12 13 10 20 000769
31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
34 1 16 13 24 29 16 14 1115 13 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
35 1 15 12 23 28 17 13 1418 14 10 12 22 13 12 14 11 19 000769
36 1 15 12 21 28 15 15 1516 8 16 10 22 12 11 16 10 20 000769
37 1 16 13 23 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 11 15 12 19 000769
38 1 15 13 24 29 17 14 16 13 10 12 23 14 11 14 11 20 000769
39 1 15 12 24 28 16 14 1114 13 11 10 24 13 12 15 12 19 000769
40 1 15 14 24 32 17 14 1214 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
41 1 16 13 24 29 15 17 1116 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
42 1 13 24 29 14 1114 14 10 12 13 15 12 000769
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43 1 14 24 31 14 1114 13 10 12 13 14 12 000769
44 1 14 23 30 14 1214 13 10 12 13 16 12 000769
45 1 13 23 29 13 1617 13 10 13 15 14 11 000769
46 1 14 24 30 14 1617 13 11 12 14 14 10 000769
47 1 13 23 30 14 1315 12 10 12 11 14 10 000769
48 1 14 20 31 14 1719 14 10 12 11 14 10 000769
49 1 12 22 29 15 1415 14 10 11 11 15 10 000769
50 1 13 24 31 13 1318 13 10 11 14 14 12 000769
51 y 54 2 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 14 12 001538
52 1 14 25 30 14 1115 13 11 12 13 14 12 000769
53 y 107 2 13 24 29 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
55 1 13 24 29 14 1114 13 11 10 13 15 12 000769
56 1 13 24 29 13 1314 13 9 11 11 14 10 000769
57 1 13 24 30 15 13 12 10 13 11 15 9 000769
58 1 13 24 30 13 1619 12 10 12 13 14 11 000769
59 1 14 23 30 14 11 13 12 13 13 15 12 000769
60 1 12 24 26 15 1214 13 11 10 13 15 12 000769
61 1 13 24 29 14 1113 12 11 13 13 15 12 000769
62 1 14 24 30 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
63 1 14 24 30 16 15 14 11 12 12 15 8 000769
64 1 14 24 30 14 1114 13 11 13 13 15 12 000769
65 1 12 24 29 15 1216 13 10 12 13 15 10 000769
66 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 13 15 12 000769
67 1 13 24 29 14 1114 13 10 13 13 15 12 000769
68 1 15 24 31 13 1516 13 11 11 14 14 11 000769
69 1 13 24 28 13 1418 12 10 11 12 14 10 000769
70 1 13 25 30 16 1116 13 10 11 11 14 11 000769
71 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 14 15 12 000769
72 1 12 24 28 13 1518 13 9 11 13 15 11 00076973 1 13 24 30 13 1520 13 11 12 14 14 11 00076974 1 13 24 29 13 1520 13 10 13 14 14 11 000769
75 1 14 23 30 14 1517 13 10 12 14 14 8 000769
76 1 14 24 30 15 1114 13 10 12 13 14 12 000769
77 1 12 23 28 14 1114 13 11 11 14 14 12 000769
78 1 13 23 31 13 1417 13 12 11 15 14 11 000769
79 1 13 24 28 14 1114 12 10 13 14 14 12 000769
80 1 14 24 30 14 1115 13 10 11 13 14 12 000769
81 1 13 23 30 13 16 13 10 12 11 15 10 000769
82 1 14 24 29 15 1114 12 11 11 13 15 12 000769
83 1 13 24 29 14 1115 13 11 13 13 16 12 000769
84 1 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
85 1 13 23 28 17 1213 13 10 11 11 15 10 000769
86 1 13 25 31 13 1419 13 10 12 15 14 11 000769
87 1 13 24 29 13 1518 13 10 12 14 14 12 000769
88 y 113 2 14 24 30 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
89 1 13 24 30 13 1517 13 10 12 16 14 12 000769
90 1 13 24 31 13 1419 12 11 13 16 14 11 000769
91 1 13 23 29 14 1417 13 10 11 14 14 11 000769
92 1 13 24 29 13 1516 13 10 11 15 14 11 00076993 1 14 23 30 14 1114 13 10 11 13 15 11 00076994 1 14 24 30 13 1314 13 9 10 11 14 10 000769
95 1 13 22 30 14 1215 13 10 11 11 14 9 000769
96 1 13 22 31 13 1317 13 10 12 14 14 11 000769
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97 1 13 24 30 13 1416 13 11 13 16 14 12 000769
98 1 13 24 29 14 1516 13 10 12 14 14 11 000769
99 1 13 24 30 13 1521 13 11 12 14 14 11 000769
100 1 14 24 31 13 1418 13 11 11 15 14 11 000769
101 1 13 24 30 13 16 13 10 11 11 14 10 000769
102 1 14 26 32 13 1420 13 10 12 15 14 11 000769
103 1 13 25 30 13 1420 13 10 13 14 14 11 000769
104 1 14 24 30 13 1617 14 10 12 16 14 11 000769
105 1 12 24 28 15 1617 13 10 13 11 16 9 000769
106 1 13 23 29 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
108 1 14 23 31 13 1415 13 10 11 16 14 11 000769
109 1 13 24 30 13 1416 13 10 12 14 14 11 000769
110 1 14 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 10 000769
111 1 12 22 28 14 1314 13 10 11 11 16 10 000769
112 1 14 24 32 14 11132 13 11 11 13 15 12 000769
114 1 12 23 28 13 1418 14 10 13 13 14 11 000769115 1 14 24 30 13 1214 13 11 11 13 15 12 000769116 1 14 24 31 16 1416 13 10 11 13 14 9 000769
117 1 13 24 29 14 1114 13 12 12 13 15 12 000769
118 1 13 26 29 14 1214 13 11 12 13 14 12 000769
119 1 13 23 32 13 1617 13 10 12 11 14 10 000769
120 1 14 25 31 13 1417 14 10 11 14 14 11 000769
121 1 13 25 32 14 1617 14 10 12 11 13 10 000769
122 1 13 24 30 13 1418 13 10 12 14 14 11 000769
123 1 13 25 29 14 14 14 12 12 13 14 12 000769
124 1 12 23 27 16 12 13 10 12 11 15 10 000769
125 1 13 23 31 13 1617 13 10 11 14 14 11 000769
126 1 13 23 29 15 1517 14 10 12 12 15 10 000769
127 1 12 23 28 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
128 1 13 24 30 11 1519 11 10 13 13 14 10 000769
129 1 13 24 30 13 1423 13 10 12 14 14 11 000769
130 1 13 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 12 000769
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Hemos encontrado 7 alelos en nuestra poblacioacuten El alelo maacutes comuacuten es el 29 mientras que en las demaacutes poblaciones estudiadas el alelo maacutes comuacuten es el 26
En este marcador hemos hallado 7 alelos en nuestra pobla-cioacuten nuacutemero que se reduce para gallegos vascos y catala-nes El maacutes frecuente es el alelo 24 dato compartido con las demaacutes poblaciones
No hemos encontrado diferencias significativas para este sis-tema al compararlo con la poblacioacuten zacatecana
Para este marcador en nuestra poblacioacuten hemos observado 5 alelos siendo maacutes comuacuten el alelo 13 en las cuatro pobla-ciones estudiadas
Discusioacuten
Los marcadores ubicados en el cromosoma masculino resul-tan de gran utilidad en el establecimiento de viacutenculos bioloacutegi-cos de parentesco y en la investigacioacuten de criacutemenes sexuales con una obvia limitacioacuten todos los individuos de la misma liacutenea paterna compartiraacuten ideacutentica informacioacuten en estos ha-plotipos por lo cual no seraacute posible desvincular individuos re-lacionados por viacutea paterna de la posible existencia de viacutenculo de parentesco o filiacioacuten si soacutelo analizamos marcadores pre-sentes en este cromosoma En consecuencia las evidencias deberaacuten ser en todos los casos evaluadas tambieacuten mediante marcadores autosoacutemicos Cuando en criminaliacutestica por ejem-plo se analiza el ADN de una mancha de sangre encontrada en el lugar del delito y se requiere compararla con el ADN de un sospechoso es necesario conocer cual es la frecuencia en la poblacioacuten de los haplotipos encontrados para que en caso de que coincidan pueda darse un valor de probabilidad de que esa mancha de sangre procede de dicho sospechoso
Obviamente estudiar todos los haplotipos de una poblacioacuten es imposible por lo que se toma una muestra representativa (ngt100) y se analiza en ella las frecuencias de los alelos de los diferentes marcadores que seraacuten utilizados para la iden-tificacioacuten geneacutetica Por tanto las frecuencias geacutenicas obte-nidas en un estudio poblacional no son valores exactos sino estimaciones con un margen de error
Aplicacioacuten estadiacutestica en un caso forense a propoacutesito de un caso
Estadiacutestica con haplotipos de Y-STR
En el caso de los marcadores Y-STR la regla del producto basado en la multiplicacioacuten de las frecuencias aleacutelicas a traveacutes
de los marcadores no puede ser aplicada La frecuencia del haplotipo Y-STR es comuacutenmente determinada por el meacutetodo de conteo Suponiendo que hay una base de datos poblacio-nal de tamantildeo n con la cuenta de la base de datos x para un haplotipo particular La frecuencia del haplotipo puede ser es-timada por la proporcioacuten de la muestra cuando xgt 0 p=xn
Un intervalo de confidencia de liacutemite superior puede ser co-locado en una frecuencia de perfiles usando
En casos donde el perfil no ha sido observado en una base de datos el liacutemite superior sobre el intervalo de confianza es 1-α 1N Donde α es el coeficiente de coincidencia (005 para 95 de intervalo de confidencia) y N es el nuacutemero de individuos en la base de datos
El haplotipo obtenido de las muestras problema obtenidas de la menor y el obtenido del C fueron verificados contra la base de datos de referencia de haplotipos del cromosoma Y en wwwYHRDorg [15] y en la base de datos del haploti-po del sistema de amplificacioacuten AmpLFSTR Y Filer en wwwappliedbiosystemscomyfilerdatabase [16] Posteriormente se determinoacute la frecuencia de tal haplotipo de acuerdo a la foacuter-mula anteriormente mencionada
Resultados
Tabla de resultados mostrando diecisiete loci STR encontra-dos en el cromosoma Y al ser analizadas las fracciones mas-culinas obtenidas de la lisis diferencial durante la extraccioacuten de ADN Teniendo como muestra de referencia el hisopado de la cavidad oral
Resultados obtenidos al introducir los datos en la base de datos de la compantildeiacutea AppliedBiosystems
bull 7 loci haplotype (DYS19 DYS389I DYS389II DYS390 DYS391 DYS392 DYS393) 89237 haplotypes
bull 9 loci haplotype (+ DYS385ab) 87440 haplotypesbull 11 loci haplotype (+ DYS438 DYS439) 59735 haplotypesbull 12 loci haplotype (+ DYS437) 39348 haplotypesbull 17 loci haplotype (+ DYS448 DYS456 DYS458 DYS635
YGATAH4) 27531 haplotypes
Resultados obtenidos al comparar el haplotipo en la base de datos YHRD
bull Aacutefrica Se han encontrado 0 haplotipos de 1243 en 19 poblaciones
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bull Oceaniacutea Australia Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 poblaciones
bull Europa Se han encontrado 0 haplotipos de 6007 en 40 poblaciones
bull Aacutertico Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 pobla-ciones
bull Asia Se han encontrado 0 haplotipos de 13041 en 79 po-blaciones
bull America Latina Se han encontrado 0 haplotipos de 3984 en 40 poblaciones
bull Norte America Se han encontrado 0 haplotipos de 3256 en 4 poblaciones
Frecuencia del haplotipo observado El haplotipo no fue observado en las bases de datos utilizadas sin embargo la frecuencia para este caso en particular es de 019 oacute 1 en 500
Interpretacioacuten forense de los resultados
Los polimorfismos del cromosoma Y (STRs) aplicados al anaacute-lisis criminaliacutestico presentan la ventaja de proporcionar in-formacioacuten adicional sobre la presencia de ADN de varoacuten en manchas forenses particularmente en casos de violacioacuten y
asalto sexual en los que este anaacutelisis ofrece una nueva aproxi-macioacuten La principal utilidad de estos sistemas se encuentra en los casos de muestras con mezclas de ceacutelulas masculinas y femeninas Contrariamente a lo que sucede en los siste-mas autosoacutemicos una elevada cantidad de ADN femenino no inhibe la amplificacioacuten de los alelos del cromosoma Y per-mitiendo obtener un perfil especiacutefico de ADN del asaltante
Para interpretar el significado de una correspondencia entre muestras tipificadas geneacuteticamente es necesario conocer la distribucioacuten de la poblacioacuten de los alelos de cada locus en cuestioacuten Si el genotipo de la muestra de evidencia relevante es diferente del genotipo de la muestra de referencia del sospechoso entonces el sospechoso es ldquoexcluidordquo como el donador de la muestra bioloacutegica estudiada Una exclusioacuten es independiente de la frecuencia de los dos genotipos en la poblacioacuten
Si las muestras del sospechoso y la evidencia tienen el mismo genotipo entonces el sospechoso es ldquoincluidordquo como la po-sible fuente de la muestra de evidencia La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la muestra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese genotipo en la poblacioacuten relevante
Tabla 8 Perfil geneacutetico obtenido en las diferentes muestras analizadas
Muestras
MarcadoresGeneacuteticos
Hisopado introito vaginal (liq seminal)
Hisopo exudado introito anal (liq
seminal)
Liacutequido hemaacutetico (acusado)
Ceacutelulas epiteliales cavidad oral (acusado)
BDY456 16 16 16 16
BDYS389I 12 12 12 12
DYS390 24 24 24 24
DYS389II 31 31 31 31
DYS458 18 18 18 18
DYS19 13 13 13 13
DYS385ab 1416 1416 1416 1416
DYS393 13 13 13 13
DYS391 10 10 10 10
DYS439 12 12 12 12
DYS635 24 24 24 24
DYS392 16 16 16 16
Y GATA H4 11 11 11 11
DYS437 14 14 14 14
DYS438 11 11 11 11
DYS448 ND ND ND ND
Nd no determinado
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Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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2012Vol 8 No 32
doi 103823090
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
14 1 15 12 24 29 17 13 1416 13 10 11 22 15 13 14 11 19 000769
15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
20 1 17 13 25 30 15 14 1416 13 10 12 22 16 12 14 12 19 000769
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29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
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31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
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42 1 13 24 29 14 1114 14 10 12 13 15 12 000769
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124 1 12 23 27 16 12 13 10 12 11 15 10 000769
125 1 13 23 31 13 1617 13 10 11 14 14 11 000769
126 1 13 23 29 15 1517 14 10 12 12 15 10 000769
127 1 12 23 28 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
128 1 13 24 30 11 1519 11 10 13 13 14 10 000769
129 1 13 24 30 13 1423 13 10 12 14 14 11 000769
130 1 13 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 12 000769
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bull Oceaniacutea Australia Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 poblaciones
bull Europa Se han encontrado 0 haplotipos de 6007 en 40 poblaciones
bull Aacutertico Se han encontrado 0 haplotipos de 0 en 0 pobla-ciones
bull Asia Se han encontrado 0 haplotipos de 13041 en 79 po-blaciones
bull America Latina Se han encontrado 0 haplotipos de 3984 en 40 poblaciones
bull Norte America Se han encontrado 0 haplotipos de 3256 en 4 poblaciones
Frecuencia del haplotipo observado El haplotipo no fue observado en las bases de datos utilizadas sin embargo la frecuencia para este caso en particular es de 019 oacute 1 en 500
Interpretacioacuten forense de los resultados
Los polimorfismos del cromosoma Y (STRs) aplicados al anaacute-lisis criminaliacutestico presentan la ventaja de proporcionar in-formacioacuten adicional sobre la presencia de ADN de varoacuten en manchas forenses particularmente en casos de violacioacuten y
asalto sexual en los que este anaacutelisis ofrece una nueva aproxi-macioacuten La principal utilidad de estos sistemas se encuentra en los casos de muestras con mezclas de ceacutelulas masculinas y femeninas Contrariamente a lo que sucede en los siste-mas autosoacutemicos una elevada cantidad de ADN femenino no inhibe la amplificacioacuten de los alelos del cromosoma Y per-mitiendo obtener un perfil especiacutefico de ADN del asaltante
Para interpretar el significado de una correspondencia entre muestras tipificadas geneacuteticamente es necesario conocer la distribucioacuten de la poblacioacuten de los alelos de cada locus en cuestioacuten Si el genotipo de la muestra de evidencia relevante es diferente del genotipo de la muestra de referencia del sospechoso entonces el sospechoso es ldquoexcluidordquo como el donador de la muestra bioloacutegica estudiada Una exclusioacuten es independiente de la frecuencia de los dos genotipos en la poblacioacuten
Si las muestras del sospechoso y la evidencia tienen el mismo genotipo entonces el sospechoso es ldquoincluidordquo como la po-sible fuente de la muestra de evidencia La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la muestra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese genotipo en la poblacioacuten relevante
Tabla 8 Perfil geneacutetico obtenido en las diferentes muestras analizadas
Muestras
MarcadoresGeneacuteticos
Hisopado introito vaginal (liq seminal)
Hisopo exudado introito anal (liq
seminal)
Liacutequido hemaacutetico (acusado)
Ceacutelulas epiteliales cavidad oral (acusado)
BDY456 16 16 16 16
BDYS389I 12 12 12 12
DYS390 24 24 24 24
DYS389II 31 31 31 31
DYS458 18 18 18 18
DYS19 13 13 13 13
DYS385ab 1416 1416 1416 1416
DYS393 13 13 13 13
DYS391 10 10 10 10
DYS439 12 12 12 12
DYS635 24 24 24 24
DYS392 16 16 16 16
Y GATA H4 11 11 11 11
DYS437 14 14 14 14
DYS438 11 11 11 11
DYS448 ND ND ND ND
Nd no determinado
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Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
14 1 15 12 24 29 17 13 1416 13 10 11 22 15 13 14 11 19 000769
15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
20 1 17 13 25 30 15 14 1416 13 10 12 22 16 12 14 12 19 000769
21 1 16 13 24 29 17 14 1318 14 10 11 22 14 11 15 11 21 000769
22 1 16 13 23 29 15 16 1516 14 10 11 21 13 11 15 8 19 000769
23 1 13 12 24 28 16 15 1319 12 11 13 21 11 11 16 9 20 000769
24 1 15 13 25 29 17 14 1113 12 10 11 24 13 12 15 12 19 000769
25 1 15 14 23 30 18 14 1214 12 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
26 1 15 14 23 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 15 12 18 000769
27 1 16 13 24 31 18 13 1317 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
28 1 17 13 24 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 12 15 12 19 000769
29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
30 1 16 13 23 30 16 13 1718 13 10 11 22 11 12 13 10 20 000769
31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
34 1 16 13 24 29 16 14 1115 13 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
35 1 15 12 23 28 17 13 1418 14 10 12 22 13 12 14 11 19 000769
36 1 15 12 21 28 15 15 1516 8 16 10 22 12 11 16 10 20 000769
37 1 16 13 23 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 11 15 12 19 000769
38 1 15 13 24 29 17 14 16 13 10 12 23 14 11 14 11 20 000769
39 1 15 12 24 28 16 14 1114 13 11 10 24 13 12 15 12 19 000769
40 1 15 14 24 32 17 14 1214 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
41 1 16 13 24 29 15 17 1116 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
42 1 13 24 29 14 1114 14 10 12 13 15 12 000769
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43 1 14 24 31 14 1114 13 10 12 13 14 12 000769
44 1 14 23 30 14 1214 13 10 12 13 16 12 000769
45 1 13 23 29 13 1617 13 10 13 15 14 11 000769
46 1 14 24 30 14 1617 13 11 12 14 14 10 000769
47 1 13 23 30 14 1315 12 10 12 11 14 10 000769
48 1 14 20 31 14 1719 14 10 12 11 14 10 000769
49 1 12 22 29 15 1415 14 10 11 11 15 10 000769
50 1 13 24 31 13 1318 13 10 11 14 14 12 000769
51 y 54 2 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 14 12 001538
52 1 14 25 30 14 1115 13 11 12 13 14 12 000769
53 y 107 2 13 24 29 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
55 1 13 24 29 14 1114 13 11 10 13 15 12 000769
56 1 13 24 29 13 1314 13 9 11 11 14 10 000769
57 1 13 24 30 15 13 12 10 13 11 15 9 000769
58 1 13 24 30 13 1619 12 10 12 13 14 11 000769
59 1 14 23 30 14 11 13 12 13 13 15 12 000769
60 1 12 24 26 15 1214 13 11 10 13 15 12 000769
61 1 13 24 29 14 1113 12 11 13 13 15 12 000769
62 1 14 24 30 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
63 1 14 24 30 16 15 14 11 12 12 15 8 000769
64 1 14 24 30 14 1114 13 11 13 13 15 12 000769
65 1 12 24 29 15 1216 13 10 12 13 15 10 000769
66 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 13 15 12 000769
67 1 13 24 29 14 1114 13 10 13 13 15 12 000769
68 1 15 24 31 13 1516 13 11 11 14 14 11 000769
69 1 13 24 28 13 1418 12 10 11 12 14 10 000769
70 1 13 25 30 16 1116 13 10 11 11 14 11 000769
71 1 13 24 29 14 1114 13 10 11 14 15 12 000769
72 1 12 24 28 13 1518 13 9 11 13 15 11 00076973 1 13 24 30 13 1520 13 11 12 14 14 11 00076974 1 13 24 29 13 1520 13 10 13 14 14 11 000769
75 1 14 23 30 14 1517 13 10 12 14 14 8 000769
76 1 14 24 30 15 1114 13 10 12 13 14 12 000769
77 1 12 23 28 14 1114 13 11 11 14 14 12 000769
78 1 13 23 31 13 1417 13 12 11 15 14 11 000769
79 1 13 24 28 14 1114 12 10 13 14 14 12 000769
80 1 14 24 30 14 1115 13 10 11 13 14 12 000769
81 1 13 23 30 13 16 13 10 12 11 15 10 000769
82 1 14 24 29 15 1114 12 11 11 13 15 12 000769
83 1 13 24 29 14 1115 13 11 13 13 16 12 000769
84 1 13 24 29 14 1114 13 11 11 13 15 12 000769
85 1 13 23 28 17 1213 13 10 11 11 15 10 000769
86 1 13 25 31 13 1419 13 10 12 15 14 11 000769
87 1 13 24 29 13 1518 13 10 12 14 14 12 000769
88 y 113 2 14 24 30 14 1114 13 11 12 13 14 12 001538
89 1 13 24 30 13 1517 13 10 12 16 14 12 000769
90 1 13 24 31 13 1419 12 11 13 16 14 11 000769
91 1 13 23 29 14 1417 13 10 11 14 14 11 000769
92 1 13 24 29 13 1516 13 10 11 15 14 11 00076993 1 14 23 30 14 1114 13 10 11 13 15 11 00076994 1 14 24 30 13 1314 13 9 10 11 14 10 000769
95 1 13 22 30 14 1215 13 10 11 11 14 9 000769
96 1 13 22 31 13 1317 13 10 12 14 14 11 000769
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97 1 13 24 30 13 1416 13 11 13 16 14 12 000769
98 1 13 24 29 14 1516 13 10 12 14 14 11 000769
99 1 13 24 30 13 1521 13 11 12 14 14 11 000769
100 1 14 24 31 13 1418 13 11 11 15 14 11 000769
101 1 13 24 30 13 16 13 10 11 11 14 10 000769
102 1 14 26 32 13 1420 13 10 12 15 14 11 000769
103 1 13 25 30 13 1420 13 10 13 14 14 11 000769
104 1 14 24 30 13 1617 14 10 12 16 14 11 000769
105 1 12 24 28 15 1617 13 10 13 11 16 9 000769
106 1 13 23 29 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
108 1 14 23 31 13 1415 13 10 11 16 14 11 000769
109 1 13 24 30 13 1416 13 10 12 14 14 11 000769
110 1 14 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 10 000769
111 1 12 22 28 14 1314 13 10 11 11 16 10 000769
112 1 14 24 32 14 11132 13 11 11 13 15 12 000769
114 1 12 23 28 13 1418 14 10 13 13 14 11 000769115 1 14 24 30 13 1214 13 11 11 13 15 12 000769116 1 14 24 31 16 1416 13 10 11 13 14 9 000769
117 1 13 24 29 14 1114 13 12 12 13 15 12 000769
118 1 13 26 29 14 1214 13 11 12 13 14 12 000769
119 1 13 23 32 13 1617 13 10 12 11 14 10 000769
120 1 14 25 31 13 1417 14 10 11 14 14 11 000769
121 1 13 25 32 14 1617 14 10 12 11 13 10 000769
122 1 13 24 30 13 1418 13 10 12 14 14 11 000769
123 1 13 25 29 14 14 14 12 12 13 14 12 000769
124 1 12 23 27 16 12 13 10 12 11 15 10 000769
125 1 13 23 31 13 1617 13 10 11 14 14 11 000769
126 1 13 23 29 15 1517 14 10 12 12 15 10 000769
127 1 12 23 28 14 1114 13 11 12 13 15 12 000769
128 1 13 24 30 11 1519 11 10 13 13 14 10 000769
129 1 13 24 30 13 1423 13 10 12 14 14 11 000769
130 1 13 24 30 14 1115 13 11 11 13 15 12 000769
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Anaacutelisis de resultados
Se realizoacute la comparacioacuten de las muestras en cuestioacuten encon-trando que las muestras obtenidas de la menor y las muestras de referencia del C tienen el mismo genotipo por lo tanto el perfil del C estaacute INCLUIDO como posible fuente de las muestras problema obtenidas de la menor La probabilidad de que otro individuo no relacionado corresponda a la mues-tra de la evidencia es estimada por la frecuencia de ese ge-notipo en la poblacioacuten relevante encontrando que esta es de 019 es decir la probabilidad de que otro individuo tengo el mismo haplotipo es de 1 en 500
Se realizo el anaacutelisis estadiacutestico de esta muestra comparaacutendo-la con los datos obtenidos en nuestro estudio y se obtuvieron los siguientes resultados
Haplotipo
DYS456-------16 DYS389I------12 DYS390--------24DYS389II------31 DYS458-------18 DYS19--------13
DYS385ab----1416DYS393-------13DYS391------10DYS439------12DYS635-----24DYS392-----16Y GATA H4---11DYS437-----14DYS438-----11DYS448----ND
Coincidencias en nuestra base de datos
bull PowerPlexY (12 loci) - 0 coincidencias en 88bull YFiler (17 loci) - 0 coincidencias en 42 Hubo 0 coincidencias en un total de 130 individuos de los 58 municipios del estado de Zacatecas
Caacutelculos de Frecuencia
En casos donde el perfil no ha sido observado en la base de datos y el intervalo de confidencia es
α1N 0 coincidencias en 130
1-α1N = 1 ndash (005) [1130] = 000227 = 0227
La principal caracteriacutestica que se observo al analizar todas las muestras no se amplifica el marcador DYS448 debido a que el individuo presenta una mutacioacuten en el cromosoma Y que pudo ser heredada u ocasionada por alguno de los factores mutageacutenicos presentados anteriormente y esto hace que ten-ga una mayor probabilidad de discriminacioacuten en comparacioacuten con otras muestras
Conclusiones
PRIMERA Se analizaron 130 muestras de las cuales se obtu-vieron 127 haplotipos diferentes y se repitieron 3 haplotipos lo que indica que en la poblacioacuten zacatecana siacute existe diver-sidad de haplotipos ya que solo el 2 de las muestras se repiten y pudiera deberse a alguacuten parentesco desconocido entre los individuos
SEGUNDA Los marcadores utilizados en el estudio fueron DYS456 DYS389I DYS390 DYS389II DYS458 DYS19 DYS385ab DYS393 DYS391 DYS439 DYS635 DYS392 Y-GATA-H4 DYS437 DYS438 DYS448 y los valores que obtuvimos son la diversidad geacutenica que fue mayor en el marcador DYS385 ab con un 09172 (91722) Los ale-los maacutes frencuentes fueron el 13 del marcador DYS393 con un 07384 (7384) el 24 del marcador DYS390 con un 06153 (6153) y el 13 del marcador DYS389I con un 06076 (6076)
TERCERA El estudio comparativo con algunas regiones es-pantildeolas nos muestra que no hay grandes diferencias con nuestra poblacioacuten y esto puede deberse a que los mexica-nos somos descendientes de los espantildeoles y que a lo largo de los antildeos no han habido cambios significativos en el ADN del cromosoma Y
CUARTA Dada la importancia que en geneacutetica forense su-pone la buacutesqueda de nuevos polimorfismos de ADN con un alto poder de discriminacioacuten y cuyo anaacutelisis sea raacutepido y sen-cillo podemos afirmar que los loci analizados en este trabajo cumplen todos los requisitos necesarios para su aplicacioacuten en identificacioacuten humana y que son una poderosa herramienta para su en identificacioacuten humana
Agradecimientos
Este trabajo fue particularmente apoyado por el Laboratorio de Geneacutetica Forense de la Procuraduriacutea General de Justicia del Estado de Zacatecas y al apoyo de la Procuraduriacutea Ge-neral de la Repuacuteblica
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
1 1 16 13 24 29 16 14 11 13 11 11 24 13 12 15 12 19 000769
2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
3 1 17 13 24 31 16 13 1417 13 10 11 22 14 11 13 13 20 000769
4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
7 1 17 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
8 1 15 13 24 29 18 15 1314 13 11 11 23 15 12 15 13 19 000769
9 1 14 13 23 28 17 17 1213 13 10 11 22 11 12 15 10 22 000769
10 1 16 13 24 29 14 15 1316 12 9 11 21 11 12 14 9 21 000769
11 1 16 13 24 29 16 14 1114 13 11 11 23 14 13 15 12 19 000769
12 1 14 13 23 28 17 17 12 13 10 12 22 11 11 14 10 21 000769
13 1 17 13 24 32 18 13 13 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
14 1 15 12 24 29 17 13 1416 13 10 11 22 15 13 14 11 19 000769
15 1 15 12 22 29 16 13 1416 13 10 10 22 16 11 14 11 20 000769
16 1 15 13 24 31 17 15 1114 14 11 12 24 13 12 15 12 17 000769
17 1 15 14 24 30 17 14 1114 13 11 13 23 13 12 15 12 19 000769
18 1 15 13 24 29 16 15 1114 11 10 11 23 13 12 15 12 18 000769
19 1 15 13 25 28 17 14 1113 12 10 12 24 13 12 15 12 19 000769
20 1 17 13 25 30 15 14 1416 13 10 12 22 16 12 14 12 19 000769
21 1 16 13 24 29 17 14 1318 14 10 11 22 14 11 15 11 21 000769
22 1 16 13 23 29 15 16 1516 14 10 11 21 13 11 15 8 19 000769
23 1 13 12 24 28 16 15 1319 12 11 13 21 11 11 16 9 20 000769
24 1 15 13 25 29 17 14 1113 12 10 11 24 13 12 15 12 19 000769
25 1 15 14 23 30 18 14 1214 12 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
26 1 15 14 23 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 15 12 18 000769
27 1 16 13 24 31 18 13 1317 13 10 12 22 12 12 14 10 19 000769
28 1 17 13 24 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 12 15 12 19 000769
29 1 15 13 23 29 19 15 1519 12 10 12 24 11 11 14 9 20 000769
30 1 16 13 23 30 16 13 1718 13 10 11 22 11 12 13 10 20 000769
31 1 16 13 24 30 18 13 1520 13 11 12 22 14 12 14 11 19 000769
32 1 15 13 25 29 17 14 1015 13 11 11 23 13 12 14 12 18 000769
33 1 16 12 24 29 19 13 1418 13 10 12 23 13 11 14 13 20 000769
34 1 16 13 24 29 16 14 1115 13 11 12 23 13 12 15 12 19 000769
35 1 15 12 23 28 17 13 1418 14 10 12 22 13 12 14 11 19 000769
36 1 15 12 21 28 15 15 1516 8 16 10 22 12 11 16 10 20 000769
37 1 16 13 23 29 18 14 1114 13 11 11 23 13 11 15 12 19 000769
38 1 15 13 24 29 17 14 16 13 10 12 23 14 11 14 11 20 000769
39 1 15 12 24 28 16 14 1114 13 11 10 24 13 12 15 12 19 000769
40 1 15 14 24 32 17 14 1214 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
41 1 16 13 24 29 15 17 1116 13 10 10 23 11 12 15 11 20 000769
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47 1 13 23 30 14 1315 12 10 12 11 14 10 000769
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Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
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2 1 14 13 23 28 18 15 12 13 10 12 20 11 12 15 10 20 000769
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4 1 15 14 24 29 16 14 1317 12 9 11 20 11 10 14 10 20 000769
5 1 16 14 24 30 17 14 1114 13 11 12 23 13 11 14 12 18 000769
6 1 16 12 22 28 17 15 1215 14 10 11 21 11 12 15 10 21 000769
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2012Vol 8 No 32
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2012Vol 8 No 32
doi 103823090
Material complementario
Tabla 9 Haplotipos completos de cada una de las muestras estudiadas
No
Co
nta
do
s
Haplotipo
Frecuencia
DY
S456
DY
S389
I
DY
S390
DY
S389
II
DY
S458
DY
S19
DY
S385
ab
DY
S393
DY
S391
DY
S439
DY
S635
DY
S392
Y G
ATA
H4
DY
S437
DY
S438
DY
S44
8
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