gt for the biomed industry כנס מידע ברפואה 2010 healthcare

מציגהמפתחת פתרון , אדית אוריGT data mining,MSc מהנדסת תעשייה וניהול ,

מתמחה אשר ( Datalert startup –עדכון ] Procedureware' בעלים של חב

. 2002-בנושא מ

פרויקטים עםGT בתחומים, ב וסינגפור"ארה, בישראל:

ביוטק

מחקר

Fraud Detection

ייצור איכות ואספקה

סקרים

פ בנושאי טכנולוגיות עזר לקשישים ומידע בתי חולים"שת.

ומנהלת שניים מהם, חברה בפורומים של כריית נתונים.

20-Dec-2010 כנס מידע ברפואה השני– GT data mining for the Biomed Industry

© All Rights Reserved, Edith Ohri 2010

Slide 0

GT data mining

לתעשיית הביומד

ה א ו פ ר ב ע ד י מ ס נ 2כ מ 0 צ 2' ד 0 1 0

ב ש ו ת – 9מ ו י א ו פ ר ע ד י מ ת ו כ ר ע מ

רי או אדית

Procedureware חברת

972-3-5232164+: 'טל

[email protected]: דואל


הפקת ידע רפואי

?מה לא בסדר בנתונים

לא ברורים

מסובכים

מרובי גורמים

דינאמיים

פרטים חסרי ...חשובים

כמושהםלהשתמש בנתונים צריך , אין ברירה:... 'ת



2

GT data miningפתרון

GT הוא מנוע החיפוש היחיד שמסוגל לזהות בעצמו

בתוך נתוני שטח , דפוסי התנהגות וגורמים משפיעים

מסובכים

: GT-תחומים שבהם יש ערך מוסף ל

שירותים רפואיים -

מעקב מטופלים -

פיתוח תרופות -

טיפול במחלות -

התפשטות מגפות -

. מחקרים אמפיריים-



3

GTמודל שירות



5שקף

GT

:קלט

מעקב

מערכות מידע

מערכות ציוד

מחקר

אינטרנט

פ"שת

:פלט

איתור דפוסים חריגים

אינדיקטורים

מעקב

גילוי מוקדם

נוסחאות חיזוי



6שקף

דוגמאות

Osteoarthritisלמחקר מחלת GTיישום

:מטרות

, למצוא את קצב התקדמות המחלה(1)

. ס'להגדיר ביומרקר(2)

. ניצול מידע חופשי באינטרנטבמקרה הנדון מוצגת אפשרות של



7

שימוש בנתוני אינטרנט למחקר –המשך



8

-אתר הרשות האמריקאית לדיווח על תופעות לואי בחיסונים – מקור הנתונים

Vaccine Adverse Event Reporting System (VAERS)

. עקב חיסון OAדיווחים על מקרי 1160כולל הקלט

.והיקף המקרים מכל סוג, תסמינים, על החיסון, שדות בלבד 8בכל רשומה

VAERS-קלט מ

Osteoarthritis, קצב התקדמות מחלה –המשך

את הדרישה הראשונה למציאת

ניתן , "קצב התקדמות המחלה"

, פשוט לסכם מתוך טבלת הקלט

והנה תרשים התוצאות

המחלה מתקדמת בשלב אחד

.שנים 3כל



10

Osteoarthritis, ס'ביומרקר –המשך

, GTהשלב הבא הוא כריית נתונים עם

להגדרת דפוסי ההתנהגות והגורמים המשפיעים

(ס יהיו חלק מהגדרות אלה'הביומרקר)



11

ס'לעזרת גילוי ביומרקר GT data mining –המשך

:דפוסים יציבים 2נמצאו

חיסונים נגד שפעת ואנתראקס .

חיסונים נגד צהבת מסוגB ,

.רובלה+אדמת+ואבעבועות



12

Osteoarthritisס 'ביומרקר –המשך



13

:ניתוח הדפוסים מציף את הסמנים הבאים להידרדרות המחלה

.בחיסון אנתראקס ביותראקס, מבוגרים גבריםאצל חוט השדרהבעיות ב1.

.או החיסון המשולש נגד אבעבועות Bבחיסון נגד צהבת מסוג צעירות נשים2.

: אחרי החיסונים הבאים OAכל תסמין של 3.

צהבת מסוגB (Hep-B)

רובלה +אדמת+אבעבועות(MEASLES + MUMPS + RUBELLA)

אנתראקס ביותראקס(Anthrax Biothrax).

אפקט מגדרי Osteoarthritis –המשך

:ממצאים נוספים

רגישות נשים, כללית

לסיכוני , פחות מגברים

OA עקב חיסון



14

גורם הגיל, Osteoarthritis –המשך

:ממצאים נוספים

OAהפגיע ביותר לסיכוני הגיל

~45בחיסון הוא



15

קבוצות מסוכנות-תת, Osteoarthritis –המשך

GT קבוצות -מאבחן תת

מקרים ו סיכון גבוהב, חריגות

רבים

האבחון הזה לא אפשרי

בסטטיסטיקה



16

ניצול נתוני מעקב מטופלים –דוגמא

GT-מוקדי סיכון חדשים שהתגלו ב

ישראלים ערבים צרכני חשיש : דפוס1)

.ואלכהול

יהודים מבוגרים : "גורם כללי2)

.שאינם בסיכון ידוע" אלמנים



17

:נתון

. מרכזים רפואיים 2-ב, מטופלים במעקב 250-כ

.והרגלי שימוש בסמים ואלכהול, פרטים אישיים, על הסטוריה בריאותית, שדות 50-כ

השוואת חיזוי המחלה בשתי שיטות –המשך דוגמא



18

השוואה לחיזוי בשיטה הנהוגה

GT נותן תוצאות מדויקות יותר

בפיתוח תרופה GT –דוגמא



19

התרופה נבדקה בתנאים שטח קשים .

לא ניתן להגיע מהנתונים למסקנות

.סטטיסטיות

GT דפוסים ברורים 3, מגלה בכל זאת

המסקנות< --

במסקנות לגבי תרופה חדשה GT –המשך דוגמא



20

מסקנות

(a הוא ( נשוא המחקר)' טיפול ארק

אפקטיבי

(b עם מחזור חדשהנחשפה תופעה

שמסבירה את , של שבועיים

...הנתונים" פיזור"

GT מוסיף ידע חדש

HPVדוגמת מחקר

:נתונים

רשומות מעבדה 200-פחות מ

(. לא מלאים)שדות 10-ו

GT:

מוצא את דפוסי ההתנהגות

מסקנות< --



21

HPVדוגמת מחקר המשך

מסקנות

פחות מסוכן ממה 16-וירוס1.

שחושבים

חסרים חיסונים HPVבערכת 2.

רואים התפרצות הסרטן במפתיע )

(בשלב הסופי

GT זמן לשוק"מקצר את ה"



22

דם-אבחון דיכאון לפי סמני –דוגמא



23

:נתון

, מקור מידע חופשי באינטרנט

.מישתנים 50-רשומות וכ 5000

GT :

יש הבדל ברור בין דפוסי ההתנהגות

.בגברים ובנשים

גורמים משפיעים< --

דם-אבחון דיכאון לפי סמני –המשך דוגמא



24

:גורמי מחלת דכאון

ערך נמוך של של"Total Iron Binding"

המחלה חזקה יותר נשיםאצל ,

.והגיל גבוה במספר שנים

גורמים משפיעים ייחודיים לנשים :

Triglyceridesרמה גבוהה של

... Eמחסור בויטמין

GT חושף מידע סמוי ב-databases

אקולוגיה של מאגרי מיים -דוגמא

דרוש למצוא מה גורם לירידת איכות במאגר

.מיים

GT קבוצות -תת, חושף בנתוני התפעול

שמסבירות את הירידה באיכות, חריגות

וגם

.סמנים מוקדמים

←אחד מהם מוצג כאן

הם" חריגים"ולפיו ה

למעשה חלק סביר

.מתופעה כללית

GT מפענח חריגים



25שקף

בעולם , יישומי כריית נתונים ברפואה

◙Clinigene &Strand Life Sciences - הדבר . של סיכון לסכרתמרקרים -ביו

.ב והודו"הביא נתח שוק חדש בארה

, לבתי חולים ושירותי רפואה, דם-של לחץאבחון רפואי - Omronחברת ◙

.ולמטופלים בביתם

, CardioBeeperעם המכשיר Meridian Medical Technologiesחברת ◙

. של מחלותאבחון מוקדם כולל , דיאגנוסטיקה מרחוק

: בארץ◙

לדלקת ריאותאינדיקטורים -מרכז רפואי סורוקה

איתור סיכונים-ח הילל יפה "בי

שפור שרות –מרכז סוראסקי , ח איכילוב"בי

חב 'Perlis – ועוד, אבחון מוקדם וטיפול מונע לקשישים.



26

!שטפון הנתונים הוא הזדמנות עסקית

GT באיכות , לא מפוקחיםליצר ידע מנתונים מסוגל

. ארגון נתוניםללא צורך בפרויקט , מעורבת

של יעילהניהול לניצול היחיד שפותח על בסיס מדעי

.משאבי מידע



27

תודה

Edith Ohri

דכן דואל מעו : edith@datalert .co. i l

-המקור הופיע ב

http://www.ilsi.org.il/companies_life_science_company.asp?ID=827



28

~ Thanks for your time ~

mailto:[email protected]

gt for the biomed industry כנס מידע ברפואה 2010 healthcare

Healthcare