guía de uso avanzado de pubmed
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Spanish guide for PubMed usersTRANSCRIPT
Guía de uso avanzadoGuía de uso avanzado
Duración del tutorial: 30’22/11/2010
¿Qué es?PUBMEDPUBMED permite el acceso gratuito a bases de dades bibliográficas de ciencias de la salud como MEDLINEMEDLINE, de la National Library of Medicine de los Estados Unidos.MEDLINEMEDLINE está formado por unos 17 17 millones de referenciasmillones de referencias de artículos de revistas publicadas desde 1948desde 1948 hasta la actualidad, el 92% en inglés.el 92% en inglés.My NCBIMy NCBI Permite personalizar el uso de PUBMED grabando perfiles de interés y agregar alertasalertas a nuestro correo-e para seguir temas actuales.
Búsqueda simpleBúsqueda simple
Autocompletado
Cuando escribimos en el cuadro de búsqueda el sistema nos sugiere múltiples propostas de autoescritura. autoescritura. Elegimos la que más se ajusta con el puntero.
Búsqueda simple de un tema / 1
Introducimos el térrmino o la frase en el cuadro de búsqueda y presionamos SEARCHSEARCH
Búsqueda simple de un tema / 2
PubMed traducirá de forma automáticatraducirá de forma automática nuestro planteamiento en los descriptores por los cuales se indizaría formalmente el artículo y en otras etiquetas, en todos los sinónimos asociados (Entry term mappings), los autores, los títulos de las revistas, etc.
Búsqueda simple de un tema / 3
El botón URL nos permite generar un localizadorlocalizador de internet para poder guardarlo y reproducir una búsqueda idéntica en el futuro:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%28%22silicosis%22[MeSH%20Terms]%20OR%20%22silicosis%22[All%20Fields]%29%20AND%20%28%22lung%20neoplasms%22[MeSH%20Terms]%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND%20%22neoplasms%22[All%20Fields]%29%20OR%20%22lung%20neoplasms%22[All%20Fields]%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND%20%22cancer%22[All%20Fields]%29%20OR%20%22lung%20cancer%22[All%20Fields]%29&cmd=DetailsSearch
Búsqueda simple de un tema / 4
Podemos usar operadores lógicos (AND, OR, NOT), operadores lógicos (AND, OR, NOT), en mayúscules siempre, para orientar la búsqueda:percutaneous transluminal angioplasty AND (renal OR kidney)
Búsqueda con límites / 1
PubMed prevé la búsqueda de artículos usando límiteslímites que son muy habituales.habituales.
Búsqueda con límites / 2
La búsqueda de artículos puede limitarselimitarse a un género, una lengua, una franja de edat, un sector de publicaciones, una especie, etc.En esta búsqueda con límites buscamos el término gonarthrosis en las revistas Core Core (son 120 revistas del total, unas 5.500)
Búsqueda avanzadaBúsqueda avanzada
Campos de Pubmed
Campos característicos de PubMed
Los registros de Pubmed están Los registros de Pubmed están formados por unos formados por unos campos característicos que son directamente que son directamente interrogables.interrogables.
Búsqueda avanzada
• Búsqueda por autores, revistas, etc. (campos campos concretosconcretos)• Búsqueda a través de los descriptores MeSH MeSH (MeMedical SSubject HHeadings)
Search Builder / 1
En la ventana de Search Search builderbuilder podemos obtener con el desplegable todos los nombres de los campos y consultar el Index Index de cada campo.
Search Builder / 2
El IndexIndex se abre por la palabra o frase más aproximada a la frase que escribimos en el Search Search BuilderBuilder
Search Builder / 3
Tal y como vamos encontrando etiquetas con el Search Builder y el índice las podemos ir incorporando con el botón en la ventana de búsqueda (Search Box), donde se combinan:
Resultados
MeMedical SSubject HHeadings (MeSHMeSH) / 1
Una búsqueda a través de los descriptores descriptores MeSHMeSH nos permite capturar información de manera:
a) más consistente,
b) más metódica; y,
c) más rigurosa.
MeMedical SSubject HHeadings (MeSHMeSH) / 2
1) Introducimos el término pathologic fracture en el cuadro de interrogación,
2) MeSH traduce automáticamente pathologic fracture al descriptor Fractures, spontaneous,
3) Nos permite limitar la búsqueda p.e. a los artícules enfocados en la rehabilitación, i
4) Ambos elementos se combinan en el menú desplegable por la opción “Search Box with AND”
Resultados
VisualizaciónVisualizaciónde resultadosde resultados
Visualización de resultados / 1
Artículos del dominio públic (2)
Visualización de resultats / 2
El Hospital está subscrito
Se obtiene el texto completo clicando el logo del Hospital
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?holding=ieshvadhlib
Este enlace Este enlace para acceder a Pubmed nos identifica como usuarios de la usuarios de la BibliotecaBiblioteca. Cuando vemos un registro de Pubmed nos indica si tenemos acceso mostrando el logo logo del Hospital.del Hospital.
Visualización de resultados / 3
Vista “Abstract”
Texto complet
Captura de registros
My NCBIMy NCBI
¿Qué es My NCBIMy NCBI?
El instrumento El instrumento My NCBIMy NCBI en en PubMed permite PubMed permite registrarse y así registrarse y así retenerretener la la información recogida por información recogida por un usuario y sus un usuario y sus preferencias.preferencias.
Registro en My NCBIRegistro en My NCBI
Podemos abrir gratuitamente una cuenta en My NCBIMy NCBI o bien usar p.e. la de Google o Gmail
Función Función Collections Collections / / 11
Cuando queremos guardar un conjunto de guardar un conjunto de registrosregistros bibliográficos en PubMed podemos hacerlo con la función Clipboard,función Clipboard, que solo nos deja retener hasta 500 registros i solo se conservan si no estamos inactivos 8 horas seguidas.
La función Collectionsfunción Collections es por el contrario para usuarios que se han registrado a My NCBI y permite conservar hasta 5000 registros indefinidamente, y además compartirlos.
Función Función Collections Collections / 2/ 2
Podemos compartir una coleccióncompartir una colección de registros configurándola como “pública” y proporcionando la URLla URL o enlace directo a colaboradores nuestros.
Función Función Save Save search / 1search / 1
Tener una cuenta en My NCBIMy NCBI también nos permite grabar una búsqueda (su estrategia) para poderla ejecutar en el futuro.
Función Función Save search / Save search / 22
La función Save SearchSave Search genera un formulario donde podemos inscribir nuestras preferencias para recibir continuadamente los resultados que se vayan incorporando a PubMed sobre nuestro tema en un correu-e correu-e personal.personal.
Función Función My My Bibliography /1Bibliography /1
Por último, otra función de My NCBIMy NCBI útil es My BibliographyMy Bibliography, diseñada específicamente para guardar registros de un autor y editarlos en listas
Función Función My My Bibliography /2Bibliography /2
Botones de edición de My My BibliographyBibliography
Captura Captura de registrosde registros
Podemos capturar los resultados de la búsqueda, sea a partir de la lista total, sea haciendo una selección de la lista marcando los botones de selección
Cuando enviamos registros a una dirección de correu-e no podemos enviar más de 200 registros por mensaje, pero se pueden enviar fraccionados.
Importar registrosImportar registrosaa
Podemos importar un archivo extraído de
Pubmed
Con el registro o registros seleccionados desplegamos SEND TOSEND TO, escogemos la opción FILEFILE
y el formato MEDLINEMEDLINE
Desde el submenú IMPORT REFERENCESIMPORT REFERENCES de EndNoteWeb podemos subir el archivo generado por la búsqueda anterior (pubmed_result.txt) aplicando el filtre PUBMED (NLM)filtre PUBMED (NLM)
Registro en detalle
Registro en la lista
Importar registrosImportar registrosaa
El icono de documento en la barra de las direcciones nos indica que ZoteroZotero ha detectado los “metadatos” de un
artículo en PubmedPubmed
1) Abrimos Zotero activando su botón en la barra. 2) En la columna izquierda activamos la carpeta donde queremos grabar un registro.3) Clicamos el icono que aparece en la barra de direcciones para incorporarlo. 1
2
3
Otras funcionesOtras funciones
Enlace permanente a un Enlace permanente a un artículoartículo
Una forma de crear un enlace permanente a un registro es con un URL que contenga la expresión http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ y el número PMID. P.e.:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19010894
Función Función ImagesImages
En octubre de 2010 PubMed ha incorporado imágenes en los artículos que pertenecen a las publicaciones de Pubmed Central, de libre acceso
Agregadores RSSAgregadores RSS
PubMed ofrece diversos canales RSS para obtener fácilmente informació continuada sobre un tema, etc.
Más información en la Guía de uso de RSS
Elaborado por: Marta-R. Domínguez Senra ([email protected])