imprinting :pws-as-bws-rss
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Imprinting :PWS-AS-BWS-RSS. Lezione 8. REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE. meccanismi epigenetici e controllo a distanza dell ’ espressione genica mediante la struttura della cromatina. RNA interference. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
By NA
Imprinting :PWS-AS-BWS-RSS
Lezione 8
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meccanismi epigenetici e controllo a distanza dell’espressione genica mediante la struttura della cromatina
effetto di posizione gene PAX6-SOX9
soppressione dell’espressione mediante i domini della cromatina: Distrofia facioscapolo omerale
imprinting
REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE
RNA interference
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REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE imprinting
EPIGENOTIPO: informazione ereditabile in grado di influire sul fenotipo senza che vi sia cambiamento di sequenza del DNA
Il meccanismo epigenetico meglio conosciuto e’ la metilazione del DNA. La metilazione di una regione genomica viene considerata un indicatore di inattivazione.
Imprinting genomico: espressione differenziata di un gene perfettamente funzionale, legata all’origine parentale, indipendente dal sesso della progenie
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REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE imprinting
E' UNO DEI MECCANISMI ALLA BASE DELL'APPARENTE IRREGOLARITA' DI SEGREGAZIONE
Riparleremo dei cosidetti meccanismi atipici, ma gia' dovreste sapere che la correlazione genotipo-fenotipo intesa in senso classico non e' sempre vera quando si guarda all'espressione
Imprinting genomico: espressione differenziata di un gene perfettamente funzionale, legata all’origine parentale, indipendente dal sesso della progenie
Le leggi di Mendel sono sempre vere quando si parla di locus, di gene molecolare, ma il fenotipo finale e' sempre il risultato di un'interazione fra piu'molecole quindi piu' ci allontaniamo dal locus piu' troviamo problemi e apparenti atipicita': stiamo confrontando le mele con le pere…..
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il carattere viene espresso quando ereditato dal padre
l’allele materno e’ silente
Imprinting materno
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Penetranza elevata quando il locus e’ ereditato dalla madre
allele paterno silente
Imprinting paterno
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Esperimenti di trasferimento dei pronuclei nei topi
Aborti triploidi, mola idatiforme e teratomi nell’uomo
Disomie uniparentali
Differente espressione del DNA nel topo transgenico
Mutazioni che provocano fenotipi differenti a seconda del genitore d’origine o che sembrano essere ereditate con modalita’ diverse a seconda del genitore che trasmette il locus.
Osservazioni che suggeriscono l’esistenza dell’imprinting
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REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE imprinting
L’imprinting e’ una forma di regolazione genica,che si esprime attraverso meccanismi epigenetici che si attuano nel corso dello sviluppo e della vita dell’organismo.
Come e quando i genomi parentali vengono “marcati” per consentire ai meccanismi di regolazione di selezionare i diversi alleli ?
Bisogna ricordare che gli attori di questa azione sono 2:
Il locus su cui l’imprinting agisce
Il locus che ha questa capacita’
Come e quando?
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REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE imprinting
Non e’ un cambiamento permanente del DNA
Deve essere abolito prima di trasmettere il genoma
Deve essere ripristinato coerentemente al sesso dell’individuo che trasmette
Su questa nuova “etichettatura” agiscono i meccanismi di regolazione genica secondo i pattern previsti per cellule, tessuti.....
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REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE:imprinting
MatPatAngelman Prader-Willi
MatPat
MatPat
DELEZIONE
DISOMIAUNIPARENTALE
PatPat
MatMat
MatPat
DELEZIONESUBMICROSCOPICA
MatPat
MUTAZIONE
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1996 La caratterizzazione molecolare delle mutazioni nella regione PWS/AS permette di chiarire l’organizzazione del centro di imprinting (IC) e di proporre un modello.
SRNPNSRNPN
SNRPN: Small Nuclear ribonuclearProtein N: e’ espresso solo dal cromosoma paterno, composto da 10 esoni.
Ricapitoliamo: l’imprinting implica l’acquisizione di segnali specifici della linea germinale, inducendo attivita’ differenziale degli alleli parentali. Errori nella linea germinale impedirebbero l’acquisizione dell’epigenotipo corretto.
Caratterizzazione molecolare
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BD1B BD1B* BD1A BD2 BD3 E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10
BD SNRPN
livello metilazione : Metilati Non metilati
MATPAT
1B’
LTR
PWS-SPWS-O
PWS-U
struttura dei trascritti
struttura genomica
Delezioni
Mutazioni a livello dell’esone1 impedirebbero se ereditate attraverso il padre il passaggio da mat>patMutazioni a livello di BD se ereditate attraverso madre impedirebbero il passaggio da pat>mat
Stuttura della regione
AS-SCHAS-D
AS-CAS-R
AS-J AS-HAS-C2
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Modello IC
BD-imprintatore Esone1 SNRPNTre passaggi sono necessari:
Abolizione : l’esone1 e’ richiesto in entrambe le linee germinali Ripristino: BD attivo e’ richiesto in cis per l’epigenotipo materno Ripristino: BD inattivo e’ richiesto per l’epigenotipo paterno
Abolizione Ripristino Abolizione Ripristino
linea germinale XX normale linea germinale XY normale
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Famiglia Prader-Willi
IC
BD-imprintatore Esone1 SNRPNTre passaggi sono necessari:
Abolizione : l’esone1 e’ richiesto in entrambe le linee germinali Ripristino: BD attivo e’ richiesto in cis per l’epigenotipo materno Ripristino: BD inattivo e’ richiesto per l’epigenotipo paterno
Abolizione Ripristino
XX
XY Mancato ripristino
Le mutazioni dell’ esone1 non cancellano l’imprinting sia in XX che in XY
In XX e’ irrilevante dal momento che comunque hanno epigenotipo mat
In XY saranno incapaci di convertire
PWS
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Famiglia Angelman
IC
BD-imprintatore Esone1 SNRPNTre passaggi sono necessari:
Abolizione : l’esone1 e’ richiesto in entrambe le linee germinali Ripristino: BD attivo e’ richiesto in cis per l’epigenotipo materno Ripristino: BD inattivo e’ richiesto per l’epigenotipo paterno
Abolizione Ripristino
XY
XX Mancato ripristino
L’ esone1 cancella l’imprinting sia in XX che in XY
BD mutato non ripristina, ma in XY e’ irrilevante perche’ l’epigenotipo e’ correttoIn XX saranno incapaci di instaurare l’epigenotipo materno
AS
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Perche’ PWS/AS salta le generazioni
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ALTRI LOCI "IMPRINTED"
CROMOSOMA 6 in 6q24 (diabete mellito
neonatale transitorio)
CROMOSOMA 7 IN 7q (Russell-Silver Syndrome
RSS)
CROMOSOMA 11 IN 11q (Beckwith-Wiedemann
Syndrome BWS)
CROMOSOMA 14 IN 14q23 (sindrome
polimalformativa da disomia uniparentale)
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Sindrome di Beckwith-Wiedemann
By NA
Sindrome di BWS E RSS