introdução aos scratchpads: aproveitando melhor seus dados
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Introdução aos Scratchpads: Aproveitando melhor seus dados. Brazil November, 2012. Laurence Livermore Natural History Museum, London [email protected]. O que é Scratchpads?. Sítios prontos para dados de biodiversidade, com apoio institucional - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
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Introdução aos Scratchpads:Aproveitando melhor seus dados
Laurence LivermoreNatural History Museum, London
BrazilNovember, 2012
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O que é Scratchpads?
• Sítios prontos para dados de
biodiversidade, com apoio institucional
• Plataforma virtual para pesquisa e
publicação
• Acesso livre, fonte livre
• Modular e flexível
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O que Scratchpads não é!
• Um banco de dados unitário de biodiversidade
• Restringido por tema, geografia ou táxon
• Uma ferramenta excluisiva aos taxonomistas
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De onde vêm os recursos financeiros?
2007 2011 2014
ViBRANTVirtual Biodiversity Research
&
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Exemplos de utilização:
Taxa(Classificações, pérfis de táxons, espécimes, literatura, imagens, mapas, conjuntos
de dados do fenótipo, genótipo, de morfometria, chaves, filogenias)
ProjetosConservação Regiões Sociedades
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Quem usa Scratchpads?
• No. total de sítios: 400+
• No. total de usuários: 7,000+
• Usários ativos: 5,500+ (273 w / 759
m)
• Contéudo : 430,000+ (nodos)
Site
s Use
rs
ViBRANT SP 2
• Pesquisadores profissionais
• Naturalistas amadores
• Cientistas cidadão
• Indivídos, grupos e sociedades
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eMonocot Scratchpads
• 15 sítios e crescendo
• 40+ usuários internacionais• Scratchpads / eMonocot Portal
online!
Listagem dos sítios: http://about.e-monocot.org/list-emonocot-scratchpads
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Por que Scratchpads?
A Ciência é global
• Precisa de padronização global
• Workflows globais
• Cooperação de institutos e
organizações de grande porte
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Por que Scratchpads?
Ciência é realizada “locally”
• Por cientistas do local
• Em colaboração com infraestruturas locais
• Com apoio financeiro do local
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Por que Scratchpads?
Isso resulta em :
• Uma paisagem complexa, fragmentada e de navegação
difícil
• Fontes dispersas de dados
• Dificuldades em coletar informações para pesquisa
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Porque precisa mudar?
Problemas com dados publicados pela maneira tradicional:
• Maioria de descrições sob controle de reprodução (~1923)
• Acesso Livre limitado
• Ausência de mecanismo para atualização e correção
• Ausência (quase) de integração de dados (exceto citações)
• Ausência de mecanismos para engajar a comunidade
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Porque precisa mudar?
Resultado:
• Grandes quantidades de “conhecimento” taxonômico não
publicado
• Conhecimento não publicado não pode ser mobilisado para
fins úteis
• Impact científico baixo (mas longa meia-vida)
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O Conceito Scratchpad
Um Scratchpad é sítio que abriga dados para voce e sua comunidade
Seus dados Dados externos e serviços
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O que pode fazer Scratchpads?
• Páginas de taxon (geradas a partir de conteúdo etiquetado)
• Mapas de distribuição (a partir de espécimes e regiões
TDWG - Brummitt, 2001)
• Registros de espécimes
• Matrizes de caracteres
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Example Taxon Page
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Example regional distribution
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O que pode fazer Scratchpads?
• Gerência de bibliografia
• Imagens, video e som (importação em massa)
• Importação de planilhas Excel
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Example Literature
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O que pode fazer Scratchpads?
• Editação de dados em tabela
• Conteúdo específico ao
pedido de usuário
• Gerenciamento dos usuários
• Formulários (planilhas)
específico ao pedido de
usuário
• Medidas analíticas do uso do
sítio.
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Medidas analíticas
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O que pode fazer Scratchpads?
• Exportação de Darwin Core
Archive (links a eMonocot Portal e
EOL)
• Importação de dados de EOL
(taxonomia, informação sobre
espécies)
• Integração de mapas da
GBIF
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Importação e exportação de dados de Scratchpads
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Quais novas funções vêm logo?
• Chaves baseadas em matrizes (usando projeto de
caracteres)
• Ferramenta para publicação- submeter manuscritos pelo seu site
para Phytokeys ou Biodiversity Data Journal (NOVO)
• Checklists, apoio para linguagens múltiplas, outros!
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Amostras do protótipo: ferramenta de publicação
ID Keypreview
Multi-figure plates Plate layout
ID Keybuilder
Manuscript preview
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Apoio• In-site Support- One click help within your site
• Wiki- Training manuals, videos & glossary
• Training Courses (12 in 2012)- UK (6), Sweden, (2) Greece (1),
Bulgaria (1), South Africa (1), Brazil (1)• Ambassadors Programme- Enthusiastic experienced users- Local support
• Embedded Issues Queue- Bug reports- Feature requests
• Sandbox Site- http://sandbox.scratchpad.eu
http://scratchpad.eu/help
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• Scratchpad technical development- Simon Rycroft, Ben Scott, Ed Baker, Alice Heaton & Katherine Boulton
• Scratchpad outreach- Irina Brake & Dimitris Koureas
• E-Monocot - Paul Wilkin & the Kew team, Charles Godfray & the Oxford team
• ViBRANT- Vince Smith, Dave Roberts & Lucy Reeve
• Our 7,000+ users
Agradecimentos