introduction to chipcytometry, deep phenotyping and tissue cytometry -chipcytometry case studies

63
!"" # $%&’ ’#

Upload: jan-detmers

Post on 15-Apr-2017

305 views

Category:

Technology


0 download

TRANSCRIPT

���������� �����������������������

������������

���������������������� �!"��" �

�#��$%&��'���������������'��#

���������� �����������������������

���� ���� �

������������ ��

� �������������� �������������� ��!������"

� #��$%��� %"���&'%������(����)�*+

� ,������"�%���$%�-��"�.���/���$����0 %"��������/�"�1����1���

� .��� �%�/��0 "�����*�23���������%�$%/����/%��/�$�%���"

&��%"���3��"�����"�%����4����%����� ��$%�-��"+

� 5�"���$���"� �%�/��&.6�����(�����7/%������8�+

�����(���� �����������������������

���� ���� �

�����)���� �����������������������

���� ���� �

9 %����"%�������%�!��$

���##*����������� ��+����,,���������������,����,,����������

�����!���� �����������������������

�����-���� �����������������������

.���������##���

��������/ ��,,��������$��0

��*�1��2��3���0

����,�����*���������/ �4���5�$1$�0

����,�������##���

����,,�������,���������,�22��3�" �.

�'���.�767��:

�����6���� �����������������������

�7�:;��;��.�7758#

�����7���� �����������������������

�7�:;��;��.�7758#

.��� 7�"���"���"� �1��

� 8��,� 2,��'

� 2��� �����8

� ��

� 2�������,+��,�� ,�+��� 91�:

� ��,, ,���#

� #����' ��,,#

� '���#��' ��##*�# 9,*��;��*�;����#�,;�#�,���;�,�+��:

��""��"�/����" < ����"��"� ,*��

� �*�

� ������ 2���#��#

� #3��

� 2��� #������#

� #�,��� <����#�,#

�����=���� �����������������������

��5���858#

������ ���� �����������������������

� 7��;��>���' ��,,#<��##*� ������� ?��+��� ��,, ���@# ����������� ��'�+�'*�, �''��##

� 7��;��>��'' &�%����� 2*&&���A�#�������2*&&�� ?�#��� '����'����� �&�2�����3��#

� 7��;��>����,����� &�� 2�����3�� ���#��+��� ,��� ���� #������ B�-������

� ��,,��&������#�8����2*�,�"���2��2��3

����������� �����������������������

����7%!�=�%����% �C C ���,,#

����7%!�=7��*��.���������! C ���,,#

����7%!�=��""���%����#������ D�- 2���#��#

����������� �����������������������

������(���� �����������������������

����,�#�'��&���������������

���,�E�'�� ������#�,����

�.��� �.�= �.�6�.)�.)!��<�.�)

������)���� �����������������������

���7.�88����8�

������!���� �����������������������

��'��������,������,,��&� ����

��'�������������,,�������

�����

�������

�8������&&<1,����

���"�����#������

.���������##���

� �'+����'��������+�������������������

������-���� �����������������������

�� �*��&,*���#����� '�������� ��'�2,������� ���#���,� ��,, ,�+�,

� ���� #��#���+���F#����&�����

� ��% !"��,��#�9&�,���#�� 8��� ��<,�8 #��,,�+�� /��<,�8

������#�����:

� ����+��� �&�'�������� ������,#

� #����, #�������

1GH(=! 1H)�� ����� ������ �����

1GH(=! 1H)�� ����� ������ �����

1GH(=! 1H)�� ����� ������ �����

1GH(=! 1H)�� ����� ������ �����

1GH(=! 1H)�� ����� ������ �����

!

�!

�!

� 8��3# 8��� �,,�#���'��' ��������2�'��#

� (�2�� 4.�"������� " I� ���%�, ��&��������<��,,

� ���� #��#���+���;������,�����������

� � ��,,# <�#����

� $*��*�>���8�����#< ��<��H

J*�,�����' �*�2�� �&����3��#

� �����&�������#

������6���� �����������������������

������7���� �����������������������

������=���� �����������������������

������ ���� �����������������������

����������� �����������������������

����������� �����������������������

������(���� �����������������������

��'��.6�����

������)���� �����������������������

�1*�,' ��*� '�#��#�"#����&�� #���,� 2��2��3���K�/ ��* '��� ���' ������,�#� ��8�

��������� ��'�

K"�,�% #���,� ��,�� #�������� ����,

�$����G������

��' ������,�����, 8����� ��8��3

#���,� �# ��� ,�#�

��� 2��*�� �&�&��� �������

����*���*� ��'��*,���,��!"�,�%�F�1,�����

4��������*���*� ��'��*,���,�%F�8���� ����2�'��#�

������!���� �����������������������

�,����;��.�7758#

������-���� �����������������������

4������#�,*����4.���������

��������� '���

��,,�������������/ +�,*����,�*,������ �*������'������������##���

������6���� �����������������������

�*#���� �#���@#�'�#�����������������

� �*������'�L*�,����������,��&�#����#

������7���� �����������������������

�*#�����"2�#�'�#��+���#

� �*������'�'���������##������'�+�E

������=���� �����������������������

�����( ���� �����������������������

���.���85.������

�����(����� �����������������������

�:���,��������>������7����'�����������,���=

�����(����� �����������������������

���� ���� �

5������/��������4����$����,�"/��������%�*�%*�

�����((���� �����������������������

'�%���? �'�������9G�.;�����:;�����������9G�.;�����:;�'���+�'�&����94��������:

7��/�!�/�;��������"

:������'�"����

�1���

��/%�"��%����� @�/�"���!����/�"

� M�����,�#��*��*����&��.��2N���#

�����()���� �����������������������

�����(!���� �����������������������

'�%���? �'�������9G�.;�����:;�'���+�'�&����94��������:;�#���*#��&����������'

7��/�!�/�;��������"

5����� @�/�"(�������� @�/�"

��/%�"��%����:�����"

� @�/��.����/���"

�4�/����

�������$���%��;%�%$����"

7�%���%���,��%����

� M�����,�#��*��*����&��.������'#

�����(-���� �����������������������

BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

.���H�#*�,�#�����

.����<�����,�����������

.��������##���

4��'8���������,

� �����."'��+���2��32�����&��������������

�����(6���� �����������������������

�� �.��%���,�>��1�������

�����(7���� �����������������������

�����(=���� �����������������������

.���������##���

��������/ ��,,��������$��0

��*�1��2��3���0

����,�����*���������/ �4���5�$1$�0

����,�������##���

����,,�������,���������,�22��3�" �.

�'���.�767��:

�����) ���� �����������������������

���� ���� �

������!!������!�%����"��!�.���/���$����

�����)����� �����������������������

���� ���� �

���##*����������� ��+����,,���������������,����,,����������

�����)����� �����������������������

�����)(���� �����������������������

�����))���� �����������������������

� .�������? �� "��,,#

� ,�"�%"�? �*,���,����,���#�#

� ;%�����"? �� +#C�������,#

� 7%$���">� �

� ;�%"�? �,�����,

� �,�����,�1�����3��#

�����)!���� �����������������������

�� ����+������������#��&��*����1"��,,#

�����)-���� �����������������������

��'����&������� ��'�O*����&������� �&�1�#����,# ������ ���8��#��&��#�������# &�,,�8��� ��������,��,,���������,,����C���������� ��� �)C�.�N3#��� ����,C�

�����)6���� �����������������������

���*��2��,��� � ��

�����)7���� �����������������������

�� 4*������'*��'�#�*�*����,,#

�����)=���� �����������������������

�� 1�����3�� ���,�E����������*������,,#

� .�������? ��,,��*,�*��

� ,�"�%"�? $���,���

� �����/%����? O*����&���������&��*�,����

�M � ������������,,#

�����! ���� �����������������������

� �=�7/������*?�,���/���*�/���"��!�������"�

� ���� �#�,��'�'�8�����; ; ���,,#

� 8��,� �������#�!� ���#�����#

� �,, ��#�����#�����#�����'�8����*�����!

����������� ���3��#��������,,�,

� �=���%��"�"?�:�������4��%���/���"�%�%��"�"

� #�,������ ��#����#����,,����,�+�����*�2����&�

P��#�����#��&�������#�Q

� ����"�*,���,�% ���,�#�#

� �������,,�'�����������'����,�#�#

�����!����� �����������������������

��

��

���

��

� ����

� �� �

��

��

���

��

� ����

� �� �

� ����'�������������>�; ;

�����!����� �����������������������

�.�� �����'�.�� ��"#����&�������,,#�'�#�,��������;����6;���'����<���6���������� ��������� '��������#�D����#��� ����,C�R�.�� �!

�����!(���� �����������������������

���� ���� �

���##*����������� ��+����,,���������������,����,,����������

�����!)���� �����������������������

.�����,������,���

��##*����������

������� ���������

O*��������+��#���,� ��,, '���

��������� �����,���

�����!!���� �����������������������

8��,� #,�'� #����9�%����#������:

� �*��&,*���#������'��������

�����!-���� �����������������������

�� ��##*��#�����������

�����!6���� �����������������������

�� �C���,*����>�G#� 1�����3��#�&�� ��##*� #�����������

� �C���,*����>����*�,�#����������� 2�#�' ���4��9�����,���#�:

�����!7���� �����������������������

�*��� #������ 98��,� #,�'� #�����%���:

� ��##*��#������������*#�����.)!

�����!=���� �����������������������

���

���� �>����,� #,�'� #��� SF<" #����������� 2�����3��#T�D�4���>��.�=�������3 1"��,, ����#

���� �>���,������ �&�����# �&�������# S2�����3��"2�#�' �� �����,���#�"2�#�'T�D

� U�

�����- ���� �����������������������

�.�=;���M;��.��2;���.;��.7-;��.(;��.�6;��.���;��.7�;��.!;��.);��.(�J

� G�,�����'�1�����3������������

�����-����� �����������������������

�.���F�.�=F �.���F�.�=" �.���"�.�=F ����,���.>��7� 6=����#������ D��*�������#�,

� H�#*�,�#������2����,��"�+��,��#

�����-����� �����������������������

��� -�-�S#���,��)�=�- T;���#������7�

�.(

���

�����

�����-(���� �����������������������

;AB? M������, ������ 1"��,,#>��.�=9F:;��.7-F;��.� F;��.(7F;��.���F<"�.�)9F:

,.? .��'����� ��,,#>��.�=";��.7-";��.� ";��.(7";��.���F

�B? �.)F��"��,,# ������ �����&��� �������, �����������,E����M����>��.(����#���+������# 9+�##�,#:���'��.(�F�.(7�������,,#

�K).�

:�? �������,�E��� 1"��,,#>��.�=FF;��.7-";��.� F;��.(7";��.���";��.F

.�

�K)

��

�)

� ���������'�������,�#��&�4*�������#�,#