introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e pubmed
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Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed. MATERIALE DIDATTICO A CURA DI: G. GRILLO Biblioteca “A. Rosmini” dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie . Didattica Integrativa Corso di Laurea triennale in DIETISTICA Torino, 26 novembre 2012. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
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Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse,
fonti e Pubmed
MATERIALE DIDATTICO A CURA DI:
G. GRILLOBiblioteca “A. Rosmini” dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie
Didattica Integrativa Corso di Laurea triennale in DIETISTICA
Torino, 26 novembre 2012
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http://www.lsmolinette.unito.it/biblioteca/biblioteca.htm
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Banche dati
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I database: definizione
La gestione dell’informazione è lo scopo principale di un database:è un insieme di descrizioni standard, strutturate e organizzate, accessibile all'utenza attraverso interfacce che ne permettano l'interrogazione e il recupero di dati
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Una tabella di database
• Sono visibili i campi (colonne) in verticale e i record (righe) in orizzontale
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Relazione tra tabelle
• Esempio di database relazionale, in cui le tabelle sono collegate tra loro
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2 tipi principali di DB
• Bibliografici (METADATI)
• Fattuali o full text (DATI)
• …ma: occhio all’integrazione!!
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Ricercare in un database bibliografico
• Vanno distinti:
– la struttura del database
– il software di IR (= information retrieval, recupero dell’informazione)
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Cosa sono i database bibliografici?
• In un database bibliografico i dati sono divisi in campi e record
• I record rappresentano le citazioni bibliografiche che derivano dallo spoglio di articoli di riviste prese in considerazione dal database
• Per ogni articolo viene prodotta una citazione bibliografica che comprende una serie di elementi (metadati). Questi riferimenti bibliografici sono relativi alla letteratura biomedica (prevalentemente periodici)
Le singole citazioni bibliografiche sono organizzate in campi (Autore, titolo, rivista …)
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CINAHL : Cumulative Index to Nursing & Allied Health
Caratteristiche della banca dati:
Prodotto dall’American Nurses Association e dalla National League for Nursing
E’ la principale banca dati per le scienze infermieristiche ed affini
Parte dal 1981
Indicizza non solo riviste (quasi 3.000), ma anche libri, materiale audiovisivo,
tesi, atti di convegni...
Ha un proprio tesauro
(Il 70% del CINAHL subject headings (12,414 ) corrisponde ai MeSH del MEDLINE; gli altri termini sono specifici per l’infermieristica e le scienze alleate)
Dal 1 gennaio 2009 è accessibile tramite la piattaforma EBSCOhost
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CINAHL : Cumulative Index to Nursing & Allied Health
Le varie specialità dell’infermieristica:
ChirurgiaChirurgia plasticaFisioterapia e riabilitazioneGastroenterologiaGinecologiaNutrizione e dieteticaOncologia
Discipline collaterali:
Assistenza medicaOptometriaPediatria Pronto soccorsoServizio socialenella cura della saluteTecnica radiologicaTerapia occupazionaleTecnica chirurgica
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LA RICERCA BIBLIOGRAFICA IN DUE PASSAGGI
PROGETTAZIONE
quesito scomposizione
parole chiave PICO
operatori booleani concatenazione delle parole
STRATEGIA
database quale utilizzare?
i tesauri il MESH e non solo
la ricerca per voce di tesauro /termine libero
i sottodescrittori da quale punto di vista affrontare l’argomento cercato
Focus/explode le voci di soggetto principali, l’inclusione delle diramazioni secondarie di un soggettoi limiti e tipi di pubblicazione
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fase preliminare Focalizzare il problemaScomporlo in termini essenzialiTradurre i termini in inglese
esecuzioneCercare i termini MESH che rappresentano i concetti e i subheading relativi ad ogni termine
Combinare i termini scegliendo gli operatori booleani adeguati
LA PROGETTAZIONEquesito scomposizione
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Il modello PICO : Patient group(s)
Intervention treatment
Comparison
Outcome
In EBM viene richiesta la capacità di trasformare lo scenario o caso clinico in domande (quesiti clinici) correttamente formulate. Saranno caratterizzate dalla peculiarità di:•Essere centrate sul paziente•Generare risposte appropriate e preciseI quesiti clinici dovrebbero contenere 4 elementi:
LA PROGETTAZIONEParole chiavePICO
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“TRADURRE” il PICO
Patient and Problem Come descriveresti un gruppo di pazienti simili a colui che stai trattando? Quali sono le principali caratteristiche del paziente? Considera il problema primario, ma anche condizioni correlate: età, sesso, talvolta il gruppo sociale o etnico a cui appartiene, la sua storia personale. (es: è un fumatore? è stato esposto a sostanze tossiche? etc.) Intervention Quale intervento fondamentale stai per prendere in considerazione? Prescrizione di un farmaco? di un test diagnostico? di un intervento chirurgico? Quali altri fattori possono influenzare la prognosi del paziente (vedi sopra)?
Outcome Che cosa vuoi ottenere, misurare, migliorare o modificare? Cosa stai cercando di fare per il tuo paziente? Ridurre il numero di eventi avversi? Migliorare i risultati funzionali?
Comparison Quali sono le alternative prinicipali all’intervento preso in esame? Stai per scegliere tra due farmaci, un farmaco ed un placebo, due test diagnostici?Non sempre è presente un paragone specifico
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MEDLINE
Caratteristiche della banca dati:
Parte dal 1950, prodotto dalla National Library of Medicine
Indicizza solo articoli di riviste (5.197 riviste biomediche internazionali, 80% del contenuto in lingua inglese)
Settori: Medicine, Biology,Environmental science, Marine biology, Plant and animal, science, Biophysics, Chemistry, Nursing, Dentistry, Veterinary medicine, Allied health, Pre-clinical sciences
Thesaurus:MESH (Medical Subject Headings della NLM)
LA STRATEGIA
databasequale utilizzare
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Le pubblicazioni specifiche di una disciplina vengono recensite o indicizzate e successivamente raccolte in un repertorio bibliografico (cartaceo: soggetti-autore; elettronico: database) che ne agevola il ritrovamento.
Il metodo più efficace per interrogare un repertorio bibliografico è l’utilizzo di
parole chiave (o termini di soggetto) che formano un tesauro (o soggettario):
vocabolario controllato con l’abolizione dei sinonimi in cui le varie voci sono
strutturate tra loro in una rete di relazioni gerarchiche: “struttura ad albero”
Nell’ambito delle scienze mediche ed infermieristiche il repertorio principale è:
MEDLINE (due versioni: Pubmed gratuito http://www.pubmed.gov Ovid a
pagamento)
N.B. Per l’accesso al testo pieno, al catalogo e ad altri serviziricordarsi l’integrazione con
LA STRATEGIA
I tesauri il MeSH e non solo
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Thesaurus livello ottimale di controllo, consente univocità nei termini di ricerca
Ricerca libera sconsigliabile in genere poiché riduce il controllo. Implica una ricerca in tutti i campi[Tag] (TIAB, Text
Word, MeSH Terms, etc.)
IMPORTANTE!La ricerca può anche essere effettuata tramite parole troncate,
in questo caso il sistema ricerca tutti i termini che iniziano con la stringa data, es.: inserendo: bacter*
il sistema ritrova bacteria, bacterium, bacterophage etc…
LA STRATEGIA
La ricerca per voce di tesauro e/o termine libero
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Gli indicizzatori possono anche assegnare un ulteriore elemento descrittivo ad un termine MeSH: i subheadings o sottodescrittori.
La loro funzione è di dettagliare ulteriormente un aspetto specifico di un termine MeSH.
Es.:DiagnosisSurgery
MetabolismPathology
LA STRATEGIA
I sottodescrittorida quale punto di vista affrontare l’argomento cercato
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•Età •Specifici sottoinsiemi (subsets: systematic reviews…)•Tipo di pubblicazione•Lingua•Data•Altro…
LA STRATEGIA
i filtri o limiti
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Tra i vari generi di pubblicazioni utilizzati dalla National Library of Medicine per la recensione del materiale bibliografico (e utilizzabili come limiti nella ricerca) , ricordo i principali:
Clinical Trial rapporto di uno studio clinico pre-organizzato sulla sicurezza, efficacia o dosaggio ottimale di uno o più farmaci, dispositivi o tecniche diagnostiche terapeutiche o profilattiche in esseri umani selezionati in base a criteri predeterminati di idoneità e osservati per verificare l’evidenza di effetti favorevoli o sfavorevoli.
Controlled Clinical Trial lavoro che consiste in un esperimento clinico che implica uno o più trattamenti di prova, almeno un trattamento di controllo, misure specifiche dei risultati per valutare l’intervento e una metodologia priva di pregiudizi finalizzata ad assegnare i pazienti al trattamento.
Meta-Analysis lavoro che consiste in studi che utilizzano un’analisi quantitativa per combinare i risultati di studi indipendenti e riassunti e conclusioni che possono essere usati per valutare l’efficacia terapeutica.
Practice Guideline lavoro che consiste in un insieme di direttive o principi per indirizzare il personale medico in decisioni sanitarie circa le procedure diagnostiche, terapeutiche o cliniche da adottare in specifiche circostanze cliniche. Possono essere sviluppate da agenzie governative a qualunque livello, istituzioni quali società professionali o comitati governativi.
Randomized Controlled Trial lavoro che consiste in un esperimento clinico che include fasi specifiche e preordinate di gestione dello stesso.
Revisione sistematica differiscono dalle revisioni tradizionali della letteratura in quanto riuniscono risultati di tutti gli studi clinici condotti su un determinato argomento, ottenendo una stima basata su un numero maggiore di soggetti, quindi statisticamente più stabile e clinicamente più affidabile.
LA STRATEGIA
tipi di pubblicazione
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Banche dati
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RISORSE A PAGAMENTOACCESSO DA CASA
http://proxy-medicina.unito.it
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TROVA@UNITO E PUBMED
Come posso accedere ai servizi di trova@unito ?Collegarsi a Pubmed da link presenti su pc universitarioppure da casa tramite proxy http://proxy-medicina.unito.it inserendo le proprie credenziali SCU:
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Banche dati
![Page 42: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/42.jpg)
MEDLINE IN PUBMED
tutorial e FAQ Strumenti
risorse utili
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La ricerca per parole “libere”
inserendo le parole della ricerca, Pubmed procede con la funzione di completamento automatico, suggerendo i termini
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gli esiti della ricerca:
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Aprendo la finestra potrò selezionare i diversi formati di presentazione delle citazioni, il loro numero, e ordinarli per anno, autore, titolo e rivista
![Page 46: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/46.jpg)
Selezionando gli articoli, posso gestirli in vario modo (cliccando su Send to posso): • mandare le citazioni in un file;
• mandarle in una “collection” virtuale all’interno di MY NCBI;
• inviarle ad un “management software” esterno;
• mandarle nel “clipboard” = parcheggio temporaneo (max 8 ore) di citazioni;
• inviarle via mail;
• inviarle nella mia personale bibliografia all’interno di MY NCBI
![Page 47: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/47.jpg)
Sulla destra della schermata trovo:La possibilità di gestire i risultati e di filtrarli
La possibilità di capire come il sistema hainterpretato la mia ricerca
La possibilità di visualizzarele ultime ricerche effettuate
![Page 48: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/48.jpg)
Come Pubmed ha interpretato la ricerca – tramite parole libere - di
hospital infections:
"cross infection"[MeSH Terms] OR ("cross"[All Fields] AND
"infection"[All Fields]) OR "cross infection"[All Fields] OR ("hospital"[All
Fields] AND "infections"[All Fields]) OR "hospital infections"[All Fields]
![Page 49: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/49.jpg)
La chiave per accedere: a. all’eventuale full-text b. al catalogo d’Ateneo
Questa citazione era stata selezionata per l’invio in clipboard, resta segnalato anche nel corso di ulteriori ricerche
![Page 50: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/50.jpg)
Fornisce informazioni importanti per l’articolo:a. Tipo di disegno di studiob. Termini MeSH correlatic. Sostanze correlate
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In Advanced Search trovo:la “search history”
cliccando sul numero progressivo di ogni ricerca, posso:
combinare le ricerche con gli operatori, cancellarle, rilanciarle, vedere come il sistema ha interpretato la ricerca, salvarla in MY NCBI
cliccando sui numero di esitidi ogni ricerca, ritorno all’elenco complessivo
![Page 52: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/52.jpg)
Un recente aggiornamento ha eliminato la pagina dei “limiti” e inserito i “filtri” di ricerca (a sinistra dell’elenco) che posso essere aggiunti o tolti dall’utente rispetto ai risultati ottenuti.
![Page 53: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/53.jpg)
La ricerca per termini MeSH
Opzione di ricerca tramite termini MeSH
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Inserimento termine “libero”
Il sistema “interpreta” le parole inserite, suggerendo il MeShH semanticamente più vicino al termine di partenza
Sottodescrittori (Subheadings): essenziali per capire da quale punto di vista ci interessa l’argomento cercato
![Page 55: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/55.jpg)
Nella parte sottostante della schermata, trovo:
a. Tutti i termini che, inseriti, avrebbero portato a quel termine MeSH, utili (correlandoli con OR) per ricerche per parole libere in database o altri sistemi non provvisti di tesauro
b. La ramificazione del MeSH all’interno della quale si trova il termine cercato, utile per sapere se ci interessa anche il termine “figlio” nella funzione Explode
“figlio” di “cross infection”
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Si aggiunge alla finestra di composizione della stringa di ricerca
2 funzioni importanti:a. Restringere la ricerca ai soli articoli aventi questo
soggetto come argomento PRINCIPALEb. Non esplodere: non includere nella ricerca gli
articoli soggettati con le diramazioni “figlie” di questo termine
![Page 57: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/57.jpg)
Invio della ricerca (dopo aver selezionato le opzioni dei subheadings desiderate) nel box di composizione della stringa di ricerca con gli operatori più opportuni
N.B. Qualora non si selezioni alcun sottoscrittore verranno tenuti in considerazione tutti i subheadings
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La ricerca è ora impostata all’interno del box, possibilità di verificarla ed eventualmente modificarla, poi invio cliccando su
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Stringa di ricerca lanciata e relativi risultati
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La “carta d’identità” di un articolo
Dati bibliografici
Meshattribuiti
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Non utilizzare i MeSH per:
Argomenti recenti
Argomenti poco studiati o poco consueti
Articoli inseriti nel database nel corso
delle ultime settimane
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Registrazione per apertura account in Pubmed, che consente di:
Salvare le ricerche (anche in modalità alert = con avviso automatico di ulteriori pubblicazioni
inerenti la ricerca salvata)
Salvare collezioni di citazioni bibliografiche
Salvare la propria bibliografia, anche di altra letteratura non indicizzata in Pubmed
Visionare le ricerche svolte negli ultimi 6 mesi (solo se collegati nel corso di sessioni in My NCBI)
Personalizzare i filtri di ricerca
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La registrazione è semplice e ti permette di avere un tuo spazio personale per gestire i risultati della ricerca.
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Ricerche salvate
Collezioni salvate
Bibliografia salvata
Attività recente (ultimi 6 mesi)
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Da qui posso salvare la ricerca in My NCBI
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Da qui, dopo averli selezionati, invio gli articoli nelle “Collections” oIn “My Bibliography”
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Banche dati
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http://www.cochrane.org/
LA COCHRANE COLLABORATION
La Cochrane Collaboration è una iniziativa internazionale no-profit nata con lo scopo di raccogliere, valutare criticamente e diffondere le informazioni relative alla efficacia degli interventi sanitari. Produce - utilizzando una metodologia scientifica comune - sintesi (revisioni sistematiche) sulla efficacia e sicurezza degli interventi sanitari di tipo preventivo, terapeutico e riabilitativo. Questi rapporti vengono diffusi attraverso un database elettronico denominato "Cochrane Library“. (Da Centro Cochrane Italiano http://www.cochrane.it/it/)
L’Università di Torino offre il database elettronico della Cochrane all’interno della piattaforma Wiley
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Banche dati di studi secondari:Cochrane Library
Da novembre 2009 accessibile da:http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/mrwhome/106568753/HOME
La Cochrane Library è un insieme di database
all’interno dei quali è reperibile letteratura
indipendente e di qualità elevata creata per
migliorare l’assistenza e fornire prove sulle quali
basare le scelte in ambito clinico e sanitario.
![Page 70: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/70.jpg)
Cochrane Database of Systematic Reviews (CDSR; Cochrane Reviews)
Database of Abstracts of Reviews of Effects (DARE; Other Reviews)
Cochrane Central Register of ControlledTrials (CENTRAL; Clinical Trials)
Cochrane Methodology Register (CMR; Methods Studies)
Health Technology Assessment Database (HTA; Technology Assessments)
NHS Economic Evaluation Database (NHSEED; Economic Evaluations)
I DATABASE
Il principale database Cochrane: contiene le revisioni sistematiche
Contiene abstract di revisioni sistematiche validate qualitativamente. Ogni abstact contiene un riassunto e un commento critico sulla qualità complessiva.
Include dettagli di articoli (trialcontrollati) pubblicati ricavati dalle principali BD bibliografiche e da altre fonti altre pubblicate e non
E’ una bibliografia di pubblicazioni che dettagliano i metodi utilizzati nella conduzione di trial controllati
Raccoglie studi (completati e in corso) di valutazioni (mediche,sociali, etiche, economiche) in ambito sanitario
Contiene abstract di valutazioni economiche basate su criteri di qualità, evidenziandone i punti di forza e di debolezza
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Gli Archivi della Cochrane Library
![Page 72: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/72.jpg)
LE LINEE GUIDA
Sono raccomandazioni di comportamento clinico, elaborate mediante un processo di revisione sistematica della letteratura,
con lo scopo di aiutare i medici e i pazienti a decidere le modalità assistenziali più appropriate in specifiche situazioni
cliniche1
1Field MJ, Lohr KN eds (1992). Guidelines for Clinical Practice: From Development to Use, Washington, DC: National Academy Press.
![Page 73: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/73.jpg)
CHI REALIZZA LE LINEE GUIDA?
Agenzie internazionali e nazionali
Agenzie governative
Agenzie regionali
Aziende sanitarie
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Dove reperire le LG?
• In Medline o altro DB bibliografico, se pubblicate su riviste censite
limitazione applicata alla stringa di ricerca: Publication Types [Practice Guideline]
• Su risorse specifiche liberamente accessibili in rete.
DATABASE DI LG
Es. NGC o NHS EVIDENCE
SITI DI AGENZIE PRODUTTRICI DI LGEs. NICE o SIGN
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Altri siti su cui reperire LG• ANAES - www.has-sante.fr/ - Agence Nationale d’Accréditation et d’Evaluation en Santé –
Francia• CDC - Centers for Disease Control and Prevention – Atlanta (USA)
http://www.cdc.gov/hiv/resources/guidelines/
• CMA Infobase - Clinical Practice Guidelines - http://mdm.ca/cpgsnew/cpgs/index.asp - Canada
• CPO - http://www.cpo.it/lineeguida - Centro di riferimento regionale per l’Epidemiologia e la Prevenzione Oncologica - ASO S. Giovanni Battista Torino
• MJA - http://www.mja.com.au/public/guides/guides.html - Clinical Guidelines - Australia
• New Zeland Guidelines Group - http://www.nzgg.org.nz/ - Nuova Zelanda
• PRODIGY - http://www.prodigy.nhs.uk/guidance/list.htm - NHS Dept of Health – Inghilterra
• ICSI - http://www.icsi.org/guidelines_and_more/ - Institute for Clinical Systems Improvement – USA
• SNLG - http://www.pnlg.it/ - Sistema Nazionale Linee Guida– Isituto Superiore di Sanità - Italia
![Page 76: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/76.jpg)
Un paziente adulto viene ricoverato d’urgenza in ospedale per essere operato di appendicite. La sera prima dell’operazione, il paziente vi esprime le sue ansie e le sue preoccupazioni e vi chiede cosa ne pensate dell’utilizzo della musica per superare queste paure. Cosa rispondereste al paziente?
P Paziente adulto ansioso ricoverato in ospedale per essere sottoposto ad intervento chirurgico di appendicectomia
I musicoterapia
C nessun intervento o altri tipi di intervento
O verificare l’efficacia della musica per controllare l’ansia
![Page 77: Introduzione alla ricerca bibliografia: risorse, fonti e Pubmed](https://reader031.vdocuments.pub/reader031/viewer/2022012916/56814e53550346895dbbe4fc/html5/thumbnails/77.jpg)
Un infermiere che assiste i pazienti oncologici ha sentito parlare dell’esercizio fisico che potrebbe aiutare i suoi pazienti ad affrontare la fatigue (l'insieme di sintomi fisici e psichici tra i più debilitanti e meno trattati nei malati di cancro). Si pone quindi la domanda se l’esercizio fisico è consigliabile o no per le persone malate di tumore che presentano fatigue ovvero se un programma di esercizi fisici è efficace nel diminuire la fatigue correlata al cancro?
P Paziente oncologici con fatigue = Tumore
I programma di esercizi fisici = programma di esercizi fisici
C nessun esercizio fisico / riposo, sonno
O Effetto sulla fatigue: riduzione della fatigue = Fatigue