isolation and characterization of azospirillum spp. 90134014 吳昇達 90134094 楊承琳...
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Isolation and Characterization of Azospirillum spp.
90134014 吳昇達 90134094 楊承琳指導老師 : 趙維良
Azospirillum 的菌種特性1.G(-) 短桿菌,直徑約 1.0μm ,長度約 2~3μm2. 微量好氧菌3. 有移動性,具有鞭毛4. 能進行固氮作用5. 最適合生長溫度 :35-37 度6. 在含有有機酸鹽類的培養基能長的很好 如 :malate( 蘋果酸 ) 、 succinate( 琥珀酸 ) 、 pyruvate
7.DNA 的 G+C 百分比約 69-71%
8. 常出現於榖類作物 ( 常出現稻米中 ) 的根部和土壤中
9. 在 potato agar 上呈現紅色點狀菌落,有皺摺10. 在 BMS agar 上出現粉紅色、不透明、圓形、
有皺摺的菌落11. 培養在 nitrogen-free malate media ,微量好
氧情況下會進行固氮作用12. 在 Congo red medium 會出現鮮紅色菌落
Oxidase +
Urease +
Starch -
gelatin -
indole -
實驗器材1.Phase-contrast microscopy
2. 稻米田的土壤 ( 包含稻米作物 )
*本次採樣地點為北市中正高中後門稻田3.RC medium 、 BMS medium 、 Nfb tube
4. 各培養基作為生化測試用 (Oxidase 、 Urease 、 Starch 、 gelatin 、 indole)
主要使用培養基成份
1.Nfb medium ( 成份為每公升的需求量 )
a. L-malic acid 5.0g 、 NaCl 0.1g
b. K2HPO4 0.5g 、 MgSO4 . 7H2O 0.2g
c. CaCl2 0.02g
d. Trace element solution : (Na2MoO4 . 2H2O 0.2g 、MnSO4 . H2O 0.235g 、 H3BO3 0.28g 、 CuSO4 .5H2O 0.008g 、 ZnSO4 . 7H2O 0.024g 、 distilled w
ater 1000mL) 2.0mL
e. Bromthymol blue 2.0mL
f. Fe EDTA(1.64% solution) 4.0mL
g. Vitamins solution (biotin 0.01g 、 pyridoxin0.02g 、distilled water 1000ml)1.0ml
h. KOH 4.0g 、 1.75g agar
※ 利用 KOH 調整 pH 值到 6.8
2.RC medium( 成份為每公升的需求量 )
a. K2HPO4 0.5g 、 MgSO4 . 7H2O 0.2g
b. NaCl 0.1g 、 yeast extract 0.5g
c. FeCl3 . 6H2O 0.015g 、 DL-malic acid 5g
d. KOH 4.8g 、 agar 20g
※ 利用 0.1N KOH 調整 pH 值到 7.0
15mL,1:400 aqueous solution (RC)
3.BMS medium( 成份為每公升的需求量 )
a. L-malic acid 2.5g 、 KOH 2.0g
b. raw cane sugar 2.5g 、 Vitamins solution (biotin
0.01g 、 pyridoxin 0.02g 、 distilled water 100
0mL) 1.0mL
c. bromthymol blue 2 drops
d. agar 15.0g
實驗步驟
1. 收集稻米作物樣本,以無菌水沖洗
2. 以無菌水沖洗根部,並切下根部約 5-8mm
3. 將根部磨碎加入含有 5mL 的 Nfb medium 試管中
4. 培養 37℃ 72 小時
5. 挑出培養基液面下 1-4mm 的白色菌環,利用 p
hase-contrast 鏡檢,觀察是否有細菌呈桿狀、細長類似 S 型
6. 將白色菌環菌液連續稀釋到 10 的 4~5 次方,利用 RC medium 推平板 ,培養 37 72℃ 小時
7. 挑選 RC medium 上 紅色、點狀菌落,利用 p
hase-contrast microscopy 鏡檢,挑選出形狀為陰性桿菌的菌落
8. 將菌落進行連續稀釋,四區劃線培養在 RC me
dium 上,確保獲得純菌
9. 對菌落進行各種生化測試
採樣地點• 北市市立中正高級中學後門農田
結果ㄧ、稻米根部樣本置入 Nfb tube 中,培養 72 小
時,在試管液面下 1~4mm 出現白色菌環。如圖一
圖一、稻米根部培養於 Nfb 上出現白色菌環 左為對照組
二、菌液連續稀釋到 105 ,滴入 0.1mL 菌液於 R
C medium 上推平板,得到 5 株菌株,分別再接種到 RC medium 上以確保獲得純菌,進行鏡檢。
三、五株菌株的敘述如下表ㄧ
編號 外觀 Gram’s stain
1 點狀,粉紅色,直徑約 0.5mm ,桿狀 G(-)
2 針狀,粉紅色,直徑約 1mm ,球狀 G(+)
3 針狀,橘色,外圈暈開一圈透明不規則外緣,直徑約 2mm ,球狀
G(+)
4 針狀,橘色,直徑約 1mm ,球狀 G(+)
5 點狀中間不規則凸起,粉紅色,直徑約 0.5~1.5mm ,球狀
G(-)
表一、各菌落的外觀型態及染色結果
四、 1 號菌經鏡檢後觀察為 G (-)短桿菌,在 RC medium 上呈現紅色點狀菌落,應為 Azospirillum.spp ,如圖二。
圖二、 1 號菌株在 RC medium 上之生長情況
圖三 .1 號菌株經 Gram’s stain 後在顯微鏡下的觀察
五、將 1 號菌株接種至 BMS medium 上,呈 現綠色菌落,如圖四。
圖四、 1 號菌株在 BMS medium 上產生綠色菌落
討論1. 在 Nfb tube 上產生的白色菌環表示可行固氮作
用。2.RC medium 裡面含有剛果紅,能用來區分 rhiz
obia 和其他種類微生物。3. 一般而言 Azospirillum spp. 在 BMS medium
上會呈現粉紅色或深紅色。
4. 本次實驗所篩選到的 1 號菌株在外觀,型態以及 RC medium 上之生長狀況均符合 Azospirillum 的特徵;但是,在 BMS medium 上,卻出現綠色菌落與理論不符。
5.針對此實驗結果,可能因素為:
( 1 )在 rhizobia 中,有其他菌種的外觀型態和 Azospirillum相似,導致在判斷上出現錯 誤。 ( 2 )樣本只侷限於稻米,變異性太小,導致在 數次實驗中所得到的菌相並無太大變化而 無法篩選到 Azospirillum 。 ( 3 )在培養過程中,好氧的環境對 Azospirillum 造成傷害,導致無法生長。
感謝1. 本實驗特別感謝北投 賴先生提供稻米作物樣本
References
1.Enrique A. Rodríguez Cáceres . 1982. Improved Medium for Isolation of Azospirillum spp. Appl Environ Microbiol. 44(4): 990–991.
2Klingmuller,W. 1985. Azospirillum III . Springer-Verlag, New York