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KEGG: Enciclopédia de
Genes e Genomas de Kyoto
Talles Eduardo Ferreira
Maciel
Orientadora: Juliana Lopes R. Fietto
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Propósito do KEGGPropósito do KEGGÉ a representação computacional completa da célula, do organismo, e da
biosfera, o que permitirá a predição (dos altos níveis de complexidade) dos processos celulares e dos comportamentos dos organismos a partir de informações moleculares e genômicas.
...como parte dos projetos de pesquisa dos laboratórios Kanehisa no Centro de Bioinformática da Universidade de Kyoto e do Centro do Genoma Humano da Universidade de Tóquio.
Quando e como surgiu?
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Interface inicial do KEGGInterface inicial do KEGG
1º Categoria
2º Categoria
3º Categoria
4º Categoria
5º Categoria
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Composição do KEGG
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PESQUISA POR ORGANISMOS
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T
TE
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Leishmania vs. Canis familaris
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624 genes ortólogos
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Para este exemplo foi encontrado 491 ortólogos.
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KEGG pode ser utilizado para as seguintes finalidades:
• Inferir funções de genes.• Inferir funções de proteínas.• Classificar genes com base na rota metabólica. • Inferir funções de sistemas altamente complexos.• Pesquisa de genes ortólogos.• Integração de bancos de dados.• Elucidar vias metabólicas de genes.• Estudar enzimas.• Estudar drogas.• Estudar as estruturas químicas, assim como as
propriedades físico-química dos compostos.
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ConclusãoConclusão Kegg tem a função de armazenar conhecimentos atuais sobre
sistemas biológicos no que se refere a vias de interações moleculares ou genes.
Mantêm um catálogo de genes para os genomas seqüenciados e providencia anotações consistentes e padronizadas.
Kegg é um banco de dados bastante completo que integra áreas como química, biológia, bioquímica, farmacologia, dentre outras.
Possui boa integração com inúmeros outros bancos de dados de interesse biológico (como o NCBI por exemplo).
A interface é amigável, mas pode ser melhorada principalmente com padronização das páginas e adição de informações de ajuda ao usuário.
Providencia novas informações biotecnológicas que pode ser usadas para predição de sistemas biológicos e projeto de novos experimentos.
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