FACULTAD DE CIENCIAS AGRARIASESCUELA DE INGENIERÍA AGRONÓMICA

GENÉTICA

NOMBRE:

XAVIER MOLINA LÓPEZ

PROFESOR:

ING. GONZALO ALMAGRO

TEMA:

MARCADORES GENÉTICOS

MARCADORES GENÉTICOS

Es un locus polimórfico que indica:

El genotipo de los organismos que presentan el marcador. Aplicación en estudios de genética de poblaciones El genotipo de uno o varios loci ligados al marcador. Aplicación en clonación posicional y en selección asistida por

marcadores

Si un marcador sigue las leyes de Mendel Þ MARCADOR GENÉTICO

Debe ser: Polimórfico Multi-alélico Codominante – No interacción intraalélica No epistático – No interacción interalélica Neutro – No efecto fenotípico o selectivo por sustitución alélica Insensible al ambiente Abundante y distribuido en el genoma

Tipos de Marcadores Morfológicos – genes que controlan características morfológicas Bioquímicos – isoenzimas y proteínas Moleculares – ADN

Marcadores Morfológicos

Genes que determinan fenotipos de fácil identificación visual: Enanismo Deficiencia de clorofila – albinismo Color de pétalos Morfología foliar Pubescencia Primeros mapas genéticos

Limitaciones de Marcadores Morfológicos Insuficientemente polimórficos Generalmente dominantes Interfieren con otras características Influenciables por el ambiente Poco abundantes Se los identifica a nivel de planta completa o adulta (tiempo)

Marcadores Moleculares

Develan: Polimorfismos detectados en el DNA del núcleo y organelos

Ventajas:

No sujetos a la influencia del medio ambiente Potencialmente de número ilimitado Objective: medir la variación La mayor desventaja es la necesidad de equipo técnicamente

más complejo

Tipos de marcadores moleculares

Basados en corte de DNA con enzimas RFLP (Restriction Fragment Length polymorphism)

Basados en PCR RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) AFLP (Amplified Fragment Lenght Polymorphism) Microsatélites o SSR (Simple Sequence Repeat) Región amplificada caracterizada por una secuencia (SCAR))

Región amplificada caracterizada por una secuencia (SCAR))

Los SCAR aprovechan una banda que ha sido generada en un experimento de RAPD, san cebadores de16 a 24 pb, diseñados a partir de los extremos de marcadores RAPD clonados.Esta técnica transforma una banda —propensa a dificultades de interpretación o de reproducibilidad— en un marcador muy confiable.

Ventajas: Patrones más sencillos que los RAPD Ensayo sólido gracias al uso de cebadores largos específicos Herencia mendeliana. A veces convertibles a marcadores

codominantes Desventajas: Requieren un conocimiento mínimo de las secuencias Requieren esfuerzo y gastos para diseñar cebadores específicos

de cada locus

AFLP (Amplified Fragment lenght polymorphism)

Combina el corte del DNA con enzimas de restricción (RFLP); y Amplificación de fragmentos de DNA mediante PCR con “primers” arbitrarios (RAPD).Ventajas:

Rápido scan del genoma por polimorfismos debido al gran úmero de bandas generadas por cada par de primers

Produce un fingerprint altamente informativo Son también altamente reproducibles No requiere información previa sobre la secuencia o sonda Extremedamnte útil para crear mapas genéticos “Transcript

profiling”

Desventajas: Generan grandes cantidades de información, que pueden

requerir análisis automatizados y por tanto tecnología computacional.

Son marcadores dominantes En mapeo genético, se agrupan en los centrómeros y telómeros Son técnicamente demandantes en el laboratorio y,

especialmente, en el análisis de datos.

Aplicaciones: Determinación de la variabilidad Análisis de distancias genéticas Fingerprinting Analisis de colecciones Mapeo genómico Monitoreo de marcadores de diagnóstico

Instrumentos utilizados en estos procesos

Electroforesis vertical

Electroforesis horizontal

Gel de Agarosa

Termociclador

Secuenciación de ADN