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Document de démonstration Document de démonstration seulement quelques liens sont seulement quelques liens sont actifs et consultablesactifs et consultables……
(lorsque le pointeur de la souris prend la forme d’une main)(lorsque le pointeur de la souris prend la forme d’une main)
20062006
Module de GénétiqueModule de Génétique
Responsables P. Maury & R. BabiléResponsables P. Maury & R. Babilé
Génétique des populationsGénétique des populationsPLAN du COURSPLAN du COURS
Introduction générale
Chapitre I : Variabilité génétique au sein des populations
Chapitre III : Evolution de la variabilité génétique
Chapitre II : Modèles d’analyse de la variabilité génétique
Conclusion générale
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3
La variabilité génétique au sein des populationsLa variabilité génétique au sein des populations
CHAPITRE ICHAPITRE I
Introduction du chapitre IIntroduction du chapitre I
Variations morphologique et chromosomiqueVariations morphologique et chromosomique
Polymorphisme protéiquePolymorphisme protéique
Polymorphisme de l ’ADNPolymorphisme de l ’ADN
Conclusion du chapitre IConclusion du chapitre I
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4
PrincipePrincipe
Caractériser des segments d ’ADN, c ’est à dire obtenir des ‘marqueurs ’ moléculaires. Deux types de marqueurs : Dominants et codominants
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5
Principe (2)Principe (2)
CODOMIMANTCODOMIMANT DOMIMANTDOMIMANT
3 Génotypes3 Génotypes
AA11
AA11
AA11
AA22
AA22
AA22
Phénotypes donnés par le Phénotypes donnés par le marqueurmarqueur
AA11AA11
AA11AA22
AA22AA22
11
11
00
RETOUR SUITE
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6
MéthodesMéthodes
RFLP : Restriction Fragment length Polymorphism (1980)
RAPD : Random Amplified Polymorphic DNA (1990)
Microsatellites : Séquences répétées en tandem (1992) AFLP : Amplification Fragment length Polymorphism (1995)
SEQUENCAGE : caractérisation des différentes paires de bases
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7
Exemple de profil RAPDExemple de profil RAPDT0 T PM PMGénotypes
Marqueur
2027
1584
947
564
kpb
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8
Quelques remarques…..Quelques remarques…..
Par rapport au polymorphisme protéique : Par rapport au polymorphisme protéique : mise en évidence d ’un polymorphisme dans mise en évidence d ’un polymorphisme dans les régions non codantes de l ’ADN et moins les régions non codantes de l ’ADN et moins soumis à la sélection naturelle.soumis à la sélection naturelle.
Le polymorphisme de l ’ADN n ’entraîne pas Le polymorphisme de l ’ADN n ’entraîne pas nécessairement des effets décelables sur le nécessairement des effets décelables sur le développementdéveloppement
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9
I-5. ConclusionI-5. Conclusion
Une importante variabilité - ou polymorphisme -génétique (présence de multiples allèles pour de nombreux gènes) existe au sein des espèces
Comment apprécier cette variabilité? À plusieurs échelles…..en résumé
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10
En résumé,En résumé,
CaractèreCaractèresimplesimple
CaractèreCaractèrecomplexecomplexe
VariationsVariationsMORPHOLOGIQUESMORPHOLOGIQUES
VariationsVariationsCHROMOSOMIQUESCHROMOSOMIQUES
PolymorphismePolymorphismePROTEIQUEPROTEIQUE
PolymorphismePolymorphismeADNADN
GENOTYPEGENOTYPE
PHENOTYPEPHENOTYPE
Pour décrire un génotypePour décrire un génotype => plus de ‘ marqueurs phénotypiques ’ => plus de ‘ marqueurs phénotypiques ’
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11
Génotype :Génotype :
Description des allèles aux différents loci…..
Phénotype :Phénotype :
Expression physique d ’un génotype…..
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12
Modèles d ’analyse de la variabilité génétiqueModèles d ’analyse de la variabilité génétique
CHAPITRE IICHAPITRE II
Introduction du chapitre IIIntroduction du chapitre II
Le modèle de HARDY - WEINBERG
Application du modèle
Test de conformité du modèle
Conclusion du chapitre IIConclusion du chapitre II
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13
Evolution de la variabilité génétique dans diverses populationsEvolution de la variabilité génétique dans diverses populations
CHAPITRE IIICHAPITRE III
Introduction du chapitre IIIIntroduction du chapitre III
Croisements entre individus apparentésCroisements entre individus apparentés
Effets de la migration et de la mutationEffets de la migration et de la mutation
Effets de la sélectionEffets de la sélection
Conclusion du chapitre IIIConclusion du chapitre III
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14
Coefficient de parenté1Coefficient de parenté1
BB
II
DD
JJ
Individu A Individu A
Les individus I et J sont Les individus I et J sont apparentésapparentés
RETOUR SUITE
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15
Coefficient de parenté2Coefficient de parenté2
BB
II
DD
JJ
AA aa
Individu A Individu A
Les individus I et J sont Les individus I et J sont apparentésapparentés
RETOUR
Ils peuvent partager des Ils peuvent partager des exemplaires identiques de exemplaires identiques de certains gènes, copies issues certains gènes, copies issues d ’un exemplaire ancestral d ’un exemplaire ancestral (présent chez A) …(présent chez A) …
AAAA aa aaRéplicationRéplication
SUITE
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16
Coefficient de parenté3Coefficient de parenté3
BB
II
DD
JJ
AA aa
Individu A Individu A
Les individus I et J sont Les individus I et J sont apparentésapparentés
RETOUR
Ils peuvent partager des Ils peuvent partager des exemplaires identiques de exemplaires identiques de certains gènes, copies issues certains gènes, copies issues d ’un exemplaire ancestral d ’un exemplaire ancestral (présent chez A) …(présent chez A) …
AAAA aa aaRéplicationRéplication
Coefficient de parenté entre I et J : RCoefficient de parenté entre I et J : R IJIJ
‘ Probabilité à 1 locus donné, pris sur I et sur J, d ’avoir deux allèles identiques par ascendance ’‘ Probabilité à 1 locus donné, pris sur I et sur J, d ’avoir deux allèles identiques par ascendance ’
SUITE
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17
Coefficient de parenté4Coefficient de parenté4
BB
II
DD
JJ
AA aa
Individu A Individu A
AA AABB DD
Les individus I et J sont Les individus I et J sont apparentésapparentés
RETOUR
Ils peuvent partager des Ils peuvent partager des exemplaires identiques de exemplaires identiques de certains gènes, copies issues certains gènes, copies issues d ’un exemplaire ancestral d ’un exemplaire ancestral (présent chez A) …(présent chez A) …
AAAA aa aaRéplicationRéplication
Coefficient de parenté entre I et J : RCoefficient de parenté entre I et J : R IJIJ
‘ Probabilité à 1 locus donné, pris sur I et sur J, d ’avoir deux allèles identiques par ascendance ’‘ Probabilité à 1 locus donné, pris sur I et sur J, d ’avoir deux allèles identiques par ascendance ’
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18
Coefficient de parenté5Coefficient de parenté5
BB
II
DD
JJ
AA aa
Individu A Individu A
AA AABB DD
Les individus I et J sont Les individus I et J sont apparentésapparentés
RETOUR
Ils peuvent partager des Ils peuvent partager des exemplaires identiques de exemplaires identiques de certains gènes, copies issues certains gènes, copies issues d ’un exemplaire ancestral d ’un exemplaire ancestral (présent chez A) …(présent chez A) …
Parenté augmente avec le nombre d ’ancêtres communs et si nombre de générations (ancêtre Parenté augmente avec le nombre d ’ancêtres communs et si nombre de générations (ancêtre commun et individus IJ) sont faibles commun et individus IJ) sont faibles
AAAA aa aaRéplicationRéplication
Coefficient de parenté entre I et J : RCoefficient de parenté entre I et J : R IJIJ
‘ Probabilité à 1 locus donné, pris sur I et sur J, d ’avoir deux allèles identiques par ascendance ’‘ Probabilité à 1 locus donné, pris sur I et sur J, d ’avoir deux allèles identiques par ascendance ’
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Chaîne de parenté