metode selekcije v konjereji - genska banka · določitev spola ocena tveganja za bolezni ocena...
TRANSCRIPT
![Page 1: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/1.jpg)
METODE SELEKCIJE V KONJEREJI
Klemen Potočnik
![Page 2: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/2.jpg)
Teme
Rejski program
Selekcija velikih populacij: Ocenjevanje PV
Genomska selekcija
Kloniranje
Selekcija v majhnih populacijah: Strategije ohranjanje maksimalne genetske pestrosti
![Page 3: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/3.jpg)
Rejski programi v konjereji
Različni rejski cilji
Število zmag, visoka uvrstitev, kilometrski čas, zaslužek,…
Telesne lastnosti
Dolgoživost
Plodnost
Delavoljnost
Dirkalni in športni konji
Konji, ki niso namenjeni
tekmovanjem
Pogosto spregledano tudi napačno razumljeno
Preprečevanje parjenja v sorodstvu
![Page 4: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/4.jpg)
SELEKCIJA VELIKIH POPULACIJ
![Page 5: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/5.jpg)
Kriteriji – orodja za odbiro - selekcijoDednostni delež = 0,25
Velikost populacije = 2000
Konji, ki hitro tečejo, visoko skočijo, …
Konji, katerih potomci hitro tečejo, visoko skočijo, …
PRI SELEKCIJI NA IZMERJENO - OPAŽENO
VREDNOST, zato …
Napačno ODBEREMO
NE ODBE-REMO
Plemenska vrednost
Fenotipska vrednost
![Page 6: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/6.jpg)
Kako do plemenske vrednosti?
Meritve
Sorodstvo
Statistični model, ki vključuje različne vplive
Sodobne metode:
Model živali
t.i. Threshold model
t.i. Thurstonian model
Model naključne regresije RR
Praviloma so PV zanesljive,
ko imajo meritve potomci.
Takrat so plemenjaki že stari, v športu pogosto tudi
kastrati!
![Page 7: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/7.jpg)
V konjereji skepsa ali PV res deluje?!?
Razlike v vzreji, vzgoji, negi, treningu, …, zamegljuje realno sliko
Dokaz, da je PV pravo orodje za selekcijo so trije rejci s po 2 do 5 plemenskih kobil
Sundace SWBR: Jan Philipsson
Sanity STR: StefanPhilipsson
Don Index HR: Reinhard Rents
![Page 8: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/8.jpg)
Do PV takoj po rojstvu ali že prej - GS
Osnova Genomske Selekcije: klasični obračun PV in informacije genoma (SNP-čip) za živali z zanesljivimi ocenami PV
ABAABB
![Page 9: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/9.jpg)
Genomski selekcija
Prednosti: Krajši generacijski interval Uporaba žrebca še pred kastracijo Večja učinkovitost selekcije pri lastnostih z manjšim h2
Orodje za preprečevanje parjenja v sorodstvu – funkcionalni inbriding
Omejitve: Veliko število živali v bazni populaciji (PV+SNP) Velika investicija
Hayes in Goddard (2008)http://jas.fass.org/cgi/content/full/86/9/2089
![Page 10: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/10.jpg)
Genomski selekcija – v praksi
Zlasti za zgodnje odkrivanje bolezni ~ dolgoživost
Francozi Genomska selekcija embrija
Določitev spola
Ocena tveganja za bolezni
Ocena genomske PV
Ocena funkcionalnega inbridinga
Vse pred ET
![Page 11: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/11.jpg)
Kloniranje
1996 DOLLY, ovca
2003 prvi kloniran kopitar
2005 prvi kloniran konj
2012 FEI sprejel klone in njihove potomce, kot tekmovalce
Veliko etičnih pomislekov
![Page 12: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/12.jpg)
Kloniranje - tehnika
Donorjeva celica
Ženska spolna celica
Klonirana celica
Klon se razlikuje od ‘originala‘:- epigenetika
- mDNA- vplivov okolja
Klon žrebca proizvaja popolnoma identične spolne celice
Potomcev ni mogoče razlikovati!
![Page 13: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/13.jpg)
Kloniranje v praksi
Kastrati so plemenske živali
Kloni testiranih žrebcev so testirani žrebci Velik ekonomski potencial 200 osemenitev letno× 5 let × 1000 $ = 1 mio $ Med top 15 športnimi konji na svetu je v Endurancu 9 kastratov, v
Steeple chase 15, v dresuri 12, v preskakovanju zaprek 7 in eventingu 13.
2012 še noben klon ali potomec klona ni tekmoval na FEI
Kloniranih vse več vrhunskih žrebcev in kastratov.
![Page 14: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/14.jpg)
SELEKCIJA MAJHNIH POPULACIJ
REJSKI PROGRAM – OHRANJANJE GV
![Page 15: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/15.jpg)
Glavni cilj selekcije majhnih populacij
Ohraniti genetsko pestrost
Dva koraka:
Oceniti trenutno stanje
Na osnovi analize stanje sprejeti strategijo upravljanja
![Page 16: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/16.jpg)
Stanje populacije
Analiza genetske variabilnosti in strukture
Analiza rodovnikov: Koeficient inbridinga in sorodstva
Efektivna velikost populacije
Izvor genov
Molekularna genetika - analiza: Primerjava pričakovanega in določene heterozigotnosti
Raznolikost alelov
![Page 17: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/17.jpg)
Različni pristopi ohranjanja GV
Parjenje živali z minimalnim koeficientom sorodstva
Kompenzacijsko parjene
Izbira plemenske živali na osnovi najmanjše povprečne
povezanosti
Kombinacija minimiranja koeficienta sorodstva in izenačevanja
povezanosti s populacijo
![Page 18: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/18.jpg)
Različni pristopi ohranjanja GV – praksa
Neposredna uporaba teoretičnih pristopov ni vedno najbolj
učinkovita
Zahteva po ‘ kakovostnih‘ podatkih
Veliko modeliranja
Prenos znanja do RO in rejcev
Zato praksa pogosto rešuje s kroženjem plemenjakov
![Page 19: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/19.jpg)
Ohranjanje: Ex situ
Kaže se kot vse bolj uporabna metoda ohranjanja GV
Depozitorij tkiv
Določitev števila donorjev
Vrsta tkiv
Način hranjenja
…
Ali bi – bo to res delovalo?
![Page 20: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/20.jpg)
Individualna in pasemska povezanost med 814 konji in 36 pasmami
Petersen JL, Mickelson JR, Cothran EG, Andersson LS, et al. (2013) Genetic Diversity in the Modern Horse Illustrated from Genome-Wide SNP Data. PLoS ONE 8(1): e54997. doi:10.1371/journal.pone.0054997http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0054997
![Page 21: METODE SELEKCIJE V KONJEREJI - Genska banka · Določitev spola Ocena tveganja za bolezni Ocena genomske PV Ocena funkcionalnega inbridinga Vse pred ET Kloniranje 1996 DOLLY, ovca](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060708/607401c9b1c1ff2cd040fce2/html5/thumbnails/21.jpg)
HVALA ZA POZORNOST!