microbiologie - deel i - les 1jswings/micro_1/micro1-les1ed10.pdf · 2004. 3. 3. · 1...
TRANSCRIPT
1
MICROBIOLOGIE
- DEEL I -
Prof. Dr. ir. J. Swings
« Biology of Microorganisms », 9de ed. (2000)
LES 1
LES 1
1. INLEIDING
2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie
1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)
1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)
1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)
1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)
1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)
1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)
1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)
2
http://lmg.ugent.be
Volg links: research, education
log in om de dias te bekomen
LES 1
1. INLEIDING
2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie
1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)
1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)
1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)
1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)
1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)
1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)
1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)
3
Faculty of SciencesLaboratory of Microbiology
Prof. Dr. ir. J. Swings Prof. Dr. M. Gillis Prof. Dr. P. De Vos Prof. Dr. P. Vandamme
Wetenschappelijk personeel: 24Administratief en technisch personeel: 25
GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCESLABORATORY OF MICROBIOLOGY
TEACHING
TEACHINGUNIVERSITY STUDENTS IN BIOLOGY, BIOTECHNOLOGY, BIOCHEMISTRYMaster of Science in Applied Microbial Systematics
4
GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCESLABORATORY OF MICROBIOLOGY
RESEARCH GROUPS
RESEARCH on CLASSIFICATION, PHYLOGENY, IDENTIFICATION AND TYPING OF BACTERIA, related to ECOLOGY, BIODIVERSITY, BIOTECHNOLOGY
Rhizosphere bacteria (N2-fixers), plant pathogenic bacteria Bacillus and allied groups Lactic acid bacteria (probiotics) Drinking waters Antarctic mats, fresh waters, tropical soils Biodegradation of bioplastics, xenobiotics Antibiotic resistance genes in the environment and the food chain Bacteria from clinical, veterinary and industrial environments
GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCESLABORATORY OF MICROBIOLOGY
BCCM™/LMG BACTERIA COLLECTION
PRESERVATION and DISTRIBUTION of BACTERIAL CULTURES
SERVICES
RESEARCH
Phylogeny, classification, identification and typing of acetic acid bacteria,
Vibrio, lactic acid bacteria, streptomycetes Taxonomy of bacteria from clinical, veterinary and industrial environments
Optimising fine strain typing
Automation/robotisation
5
GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCESLABORATORY OF MICROBIOLOGY
TECHNIQUESGENOMIC TECHNIQUES
DNA sequencing % GC determination DNA:DNA hybridisations DNA fingerprinting (DGGE, ARDRA, t-RNA, REP, RAPD, PFGE, AFLP)
PHENOTYPIC TECHNIQUES
gaschromatographic analysis of cellular fatty acids (FAMEs) gelelectrophoresis of cellular proteins (SDS-PAGE) metabolic fingerprinting (breathprints, conventional characterization)
BIOINFORMATICS and BIONUMERICAL techniques for
database construction data mining data analysis
INTRODUCE NEW MOLECULAR TECHNIQUES
American Society for Microbiology (ASM)
6
LES 1
1. INLEIDING
2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie
1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)
1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)
1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)
1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)
1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)
1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)
1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)
Algen 1µm – 10cm
Protozoa 2 – 200µm EUKARYOTEN
Fungi (gisten en schimmels) 2 – 10µm
Bacteriën 0.3 – 2µm PROKARYOTEN
soms tot 100µm
Virussen 0.015 – 0.2µm
MICRO-ORGANISMEN
Afmetingen:
7
Life is first and foremost a microbiological phenomenon
Oudste fossielen
Zijn aanwezig in de biosfeer sinds
3/4 van het ontstaan van het leven
Leeuwenaandeel van het globaal
metabolisme, biomassa en diversiteit
A definition of life
Living organisms are autopoietic
systems capable of evolution by
natural selection
8
The mystery of life
Fig. 1.3
De kenmerken van het cellulair leven
9
Fig. 1.3
Fig. 1.4
Metaforen over de cel Chemische fabriekInformatie opslagplaats
Groei
10
LES 1
1. INLEIDING
2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie
1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)
1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)
1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)
1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)
1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)
1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)
1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)
Fig. 1.5
11
Virussen
Virussen
12
Bacteriofagen zijn virussen van bacteriën
LES 1
1. INLEIDING
2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie
1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)
1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)
1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)
1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)
1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)
1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)
1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)
13
Fig. 1.8
Fig. 1.9
Bacterie Archaea Eukaryoot
14
LES 1
1. INLEIDING
2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie
1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)
1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)
1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)
1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)
1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)
1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)
1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)
Fig. 1.13
Uitzuiveringsent = uitstrijk
15
Fig. 1.12
Steriele overenting
LES 1
1. INLEIDING
2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie
1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)
1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)
1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)
1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)
1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)
1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)
1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)
16
Micro-organisms are part of your life
They are your ancestors
You carry them with you
Fig. 1.14
De impact van micro-organismen op de mens
17
Fig. 1.15
LES 1
1. INLEIDING
2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie
1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)
1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)
1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)
1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)
1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)
1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)
1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)
18
Antonie van Leeuwenhoek (1632 – 1723)
De microscoop van A. van Leeuwenhoek
19
Louis Pasteur (1822 – 1895)
Fig. 1.18a
Pasteur’s experiment
20
Fig. 1.18b
Fig. 1.18c
21
Robert Koch (1843 – 1910)
Koch de ontdekker
Anthrax Bacillus anthracis (1877)
Reinculturen (1881)
Tuberculose Mycobacterium tuberculosis (1882)
Cholera Vibrio cholera (1883)
Kochse postulaten (1884)
22
Koch’s tekeningen van Mycobacterium tuberculosis
Fig. 1.20
Fig. 1.19a
Postulaten van Koch
23
Fig. 1.19b
Fig. 1.19c
24
Fig. 1.19d
Fig. 1.21
Martinus Beijerinck
25
Fig. 1.22
Sergei Winogradsky
1600 1700 1800 1900 2000
1684 Van Leeuwenhoek
1860 Pasteur
1881 Koch’s reinculturen
1929 Penicilline
1983 HIV
Tabel 1.1
300 jaar Microbiologie
1995 Eerste complete bacteriële genoomsequentie