İmmunolojİk tani yÖntemlerİ - anadoluissagligi.comanadoluissagligi.com/img/file_1923.pdflepra,...
TRANSCRIPT
İMMUNOLOJİK TANI YÖNTEMLERİ
Prof. Dr. Bekir KOCAZEYBEK
I- GENEL BAKIŞ;
• KLİNİK İMMUNOLOJİDE HASTALIĞIN TANISI İÇİN
a) Çok iyi bir ÖYKÜ alınması
b) FİZİKİ İNCELEME yapılması
c) Uygun TANI TESTİNİN yapılması
ZORUNLUDUR
a)ÖYKÜ:
KLİNİK İMMUNOLOJİ UZMANINA BAŞVURU NEDENLERİ(sıklık sırasıyla);
• ENFEKSİYONLAR (en sık) Yineleyen enfeksiyon
Çocuklarda bulaşıcı ÜSYE çok sıktır
Bu çocuklarda sekonder olarak
♣ Otit, sinüzit, bronşit gelişebilir
Bu hastalıklar diğer çocuklara görülmesine göre daha sıksa
♣ Antibiyotik almayı gerektiriyorsa
Ig G alt sınıf yetersizliği vardır
Deri ve ÜSYE’nin;
♣ 6-12 aydan sonra başlaması
♣ Sık ve birincil olması
Ig yetersizliğini gösterir
Çok ağır enfeksiyonlar
Ağır viral enfeksiyonlar
T hücre yetersizliği
Ağır bakteri enfeksiyonlar
B hücre yetersizliğini gösterir
Fırsatçı mikroorganizmalarla enfeksiyon
Hastane enfeksiyon etkenleri
KİT’ de CMV enfeksiyonu
Doğal ve özgül immunitede
♣ Özellikle T hücre bozukluğu
Kendine özgü mikroorganizmlarla enfeksiyon
Aspleniklerde
Pnömokok enfeksiyonu
Enflamasyonsuz enfeksiyon
Aplastik anemi, nötropenik ve disfonksiyonel nötrofiliklerde
Pyojenik bakterilere dirençsizlik
Kronik enfeksiyon
Kronik ishal yada büyüme bozukluğu olanlarda
sIgA yada T hücre yetersizliği
♣ Rotavirus, G. lamblia enfeksiyonu
• İMMUN YETERSİZLİĞE BAĞLI;
HASTALIK BELİRTİLERİ
Allerjik
Artrit
Deri değişiklikleri
MALİGN HASTALIKLARLA İLGİLİ BELİRTİLER
b)FİZİKİ İNCELEME:
• Hastada enfeksiyon bulunup bulunmadığı; VARSA;
Hastanın genel yanıtı, sağlık durumunun gözlenmesi
• Hastalarda; Solgunluk
Kanama odakları
Deride kolay morarma
Döküntü
• Hastanın; Lenf bezleri ve bademcikleri var olup olmadığı
Büyüklüğü saptanmalıdır Ağır T hücre yetmezliğinde lenf bezi ele gelmez
Bademcikler görünmez
• Normal bebeklerde dalağın alt ucu ele gelir Ancak dalak yokluğu (aspleni ile) Bakteriyel (kapsüllü) enfeksiyonlar sıktır
• Ağızda pamukçukların olması
T hücre yetersizliği
Candida sp
• Bazı özel sendromlara spesifik; Hastalık ve/veya bulguların olması Di George sendromunda
Neonatal tetanoz ve KKH
Wiskott-Aldrich sendromu
Egzama
Kolay kanama eğilimi
Peteşi
c)TANI TESTLERİ:
• UYGUN TANI TESTİ NE DEMEK?
Hastanın kliniğine paralel doğru seçilmiş
Laboratuvar da özenle yapılmış
Sonucu titizlikle açıklanmış testtir
• UYGUN TANI TESTİ İSTEMENİN NEDENLERİ
İmmun sistem çevre ile dinamik bir dengede olduğu için;
Çoğu testin spektrumu geniştir
İmmunolojik testlerin BAZILARI;
BİOASSAY (yaşam sürecinde inceleme) olduğundan
Test sırasında kontrol edilemeyen değişken faktörlerden etkilenirler
Bundan dolayı testler
♣ Aynı yaş ve zamanda
Hasta ve kontrol gruplarında yapılmalıdır
Bazı testler ilgili laboratuvarda az yapılır Bundan dolayı
Bu birim sürekli nitelik kontrolü yapması gerekir
Test sonuçları Klinik durumla paralel açıklanması gerekir
ÇÜNKÜ;
Başka ikincil hastalıklar
Veya metabolik bozukluklar sonuçları etkiler
İmmunolojik testler Özel araç- gereç ve uzman ekipmanlı laboratuvarlar
gerektirdiğinden pahalıdır
IMMUNOLOJİK TESTLERDE KLİNİK ÖRNEKLER
• Venöz damardan kan alınabilir • Mikrobiyal antijen tayini ile ilgili Serum, dışkı, balgam, idrar, Boğaz salgısı, BOS, PMNL Diğer enfekte doku, salgı ve sekresyonlar
• Humoral immuniteyle (antikor tayini) ilgili Serum (antikoagulansız kan)
• Hücresel immuniteyle ilgili Heparinlenmiş taze kan ve eriyik maddeler İnvivo uygulamalar (cilt testleri)
• İmmuno genetik çalışmalarla ilgili Kan örnekleri Taze veya fikse edilmiş dokular
ENFEKSİYON HASTALIKLARININ TANISINDA
• İmmunolojik (Serolojik) Testler ♦ Enfeksiyon hastalığının tanısına sıklıkla indirekt,
(bazende direkt) yardımcı olurlar
♦ Çeşitli klinik örneklerde mikroorganizmalara özgül antijen (Ag) veya antikorları (Ab) arama testleridir
♦ Ag araştıran testlerde duyarlılık erken ve tedavi edilmeyen durumlarda yüksektir
♦ Ab araştıran testlerde primer immun yanıt 7-21 gün içinde geliştiğinden çok erken evrede yalancı negatif olabilir
♦ Erken tedavi edilen ve bağışıklık yetmezliği olan olgularda antikor yanıtı gelişmemektedir
♦ Bu testler Ag-Ab birleşme temelli testlerdir ♦ Bu testler duyarlılığı ve özgüllüğü farklı YÖNTEMLERLE invitro olarak yapılmaktadır ♦ Bu yöntemlerin ANALİTİK duyarlılığı farklıdır
– Hücresel İmmun Yanıt (Fakültatif yada zorunlu H.İ.B) gelişir
• İnvivo deri testleri • İnvitro sentezlenen Quanteferon miktarı ya da Quanteferon
sentezleyen hücre miktarı ölçülür.
İmmunolojik yöntemlerin analitik duyarlılıkları (µg/ml- ng/ml)
Yöntemler Analitik duyarlılıklar
Protein elektroforezi 100 mg/dl
Immun elektroforez 5-10 mg/dl
Tek Yönlü Immundiffüzyon <1-2 mg/dl
Çift Yönlü Immundiffüzyon <1 mg/dl
Elektroimmundiffüzyon <0,5 mg/dl
Nefakometre? 0.1 mg/dl
Aglütinasyon/KBD 1 mikrog/dl
RIA-EIA-FIA- Kemilüminesans-IA <5pg/ml
Presipitasyon
MİKROBİYAL ENFEKSİYONLARDA SEROLOJİK(İMMUNOLOJİK) YÖNTEMLERİN AMACI(I)
1- TANIDA;
• ÖRNEĞĠN; VĠRUSLARIN TANIMLANMASINDA;
♦ Kültürle izolasyonu;
• Olanaksız, güç veya uzun zaman aldığından
• örneğin HIV enf uygun hayvan yok
• Tam donanımlı laboratuvarlar ve deneyimli elemanlar gerektirdiğinden
• Virus izolasyonu için uygun örnek almak, transport etmek, saklamak hususlarındaki sorunlardan dolayı
• RUTĠN TANIDA PRATĠK DEĞĠLDĠR
VİRUS ENFEKSİYONLARINDA SEROLOJİK(İMMUNOLOJİK) YÖNTEMLERİN AMACI(I)
*Viruslerin mikroskobisinde;
-EM ve inklüzyon cisimciği aranmasının
pratikte kullanımı sınırlı, zahmetli ve pahalı olması
-Subjektif değerlendirmelere (deneyimli eleman) açık olması, yalancı pozitiflik ve negatiflikler olabilir
VİRUS ENFEKSİYONLARINDA SEROLOJİK(İMMUNOLOJİK) YÖNTEMLERİN AMACI(I)
♦Viral nükleik asidin saptanmasında;
-Moleküler Yöntemlerin
*Her sağlık merkezinde uygulanamaması
* Uygulandığı laboratuvarlara teknik donanım yetersizliği ve deneyimli ekipman azlığı
* Her virus için deneysel olarak optimize edilememesi
-Yalancı pozitif ve negatiflik sorunu
* Her virus için uygulamasının olmaması
- Özgül primer sorunu
• Mikrobiyal Enfeksiyonlarda İmmunolojik (serolojik) Test Yöntemlerinin amacı; ÖRNEĞİN; BAKTERİYAL ETKENİN TANIMLANMASINDA
İzolasyonun olanaksız, güç veya zaman gerektirdiği durumlar;
Lepra, Sifiliz, Brucelloz, Tularemi
Derin yerleşimli bir enfeksiyonda örneği elde etmek veya üretmede zorluk;
Coxiella endokarditinde endokard örneği almak veya kanda üretme zorluğu
Legionella, Chlamydophila, atipik pnömosinde BAL yada NFS almak veya üretme zorluğu
Geçirilmiş bir enfeksiyon veya taşıyıcılık durum belirlemede:
ARA veya AGN’ de ASO düzeyi
Tifo’da Anti-Vi varlığı
MİKROBİYAL ENFEKSİYONLARDA ETKENİ TANIMLAMADA SEROLOJİK (İMMUNOLOJİK) DEĞERLENDİRME KRİTERLERİ (I)
Antikor tayin temelli dört kriter vardır
a) Tek bir serum örneğinde; Yüksek titrede spesifik IgM yanıtı -Rubella IgM, M.pneumoniae IgM Veya IgM negatif IgG pozitif ise; Akut-konvelasan dönem (2-3 hafta sonra) serumda
4 kat titre artışı -EBV IgG, C. pneumophila IgG ≥512
b) Akut ve konvelasan dönem (2-3 hafta) serumda 4 kat titre artışı Total antikor yanıtında
Paul Bunnel testi (EBV)
Bruselloz tanısında Wright Testi
1/20den > 1/160 c) Nadir görülen enfeksiyonlarda; Tek serum örneğinde Özgül IgM antikor yanıtı
Kuduz, Botulismus
d) IgG AVİDİTE TESTLERİ
AFİNİTE: Multivalan bir antikorun monovalan bir antijenle bağlanma kuvveti
AVİDİTE: Multivalan bir antikorun multivalan bir antijenle bağlanma kuvveti
Olası Serolojik Profiller
IgG (-) IgG (+) IgG (+) IgM (+) IgM (-) IgM (+) Yeni Önceden Kazanılmış Geçirilmiş ve enfeksiyon Kazanılmış Bağışıklık
Primer ve sekonder enfeksiyon
ayırımında kullanılır
BU DURUM;
Re-enfeksiyonlarda
Toplumda yaygın dolaşan viruslar;
CMV, HSV gibi
Re-aktivasyonlarda
CMV, HSV, EBV, VZV gibi latent viruslar
Akut ve Subklinik Enfeksiyon Sonrası Uzamış
Serokonversiyonda GÖRÜLEBİLİR
Toksoplazmoz
IgG AVİDİTE TESTLERİNDE PRENSİP (I)
• Primer enfeksiyonlarda viruse özgül IgG aviditesi düşük; Sekonder enfeksiyonlarda Yüksek
Re-enfeksiyon/aktivasyon
Primer enfeksiyonlarda oluşan antikorlar zaman ilerledikçe(>4 ay), olgunlaşır ve antijenlere bağlanma gücü artar Bunun nedeni;
Yüksek aviditeli B lenfositlerin seçilmesindendir
• İMMUNOKOMPETAN KİŞİLERDE AVİDİTE OLGUNLAŞMA SÜRELERİ
CMV 4 ay
RUBELLA 2 ay
TOXOPLASMA 6 ay
EBV 2.5 ay
HIV 6 – 12 ay
IgG AVİDİTE TESTLERİNDE PRENSİP (II)
• Hamile kadınların;
CMV, Rubella konjenital enfeksiyonlarında;
Primer ve sekonder enfeksiyon ayrımında önemlidir
Enfeksiyon primerse konjenital geçiş yüksektir
Sekonder ise virusun geçişi düşüktür
• Immunsuprese Olgularda
CMV, EBV ve HHV-6 enfeksiyonların primer yada sekonder ayrımında kullanılır
• ETKENİ TANIMLAMADA ANTİJEN TAYİNİ: Duyarlılığı ve özgüllüğü yüksek tanı yöntemleriyle
• Doğru yerden ve uygun şekilde alınan örneklerde Ag tayini PMNH / pp65’in IF ile CMV tanısı
Serum örneklerinde HBsAg’nin EIA ile HBV tanısı
C.trachomatis Ag tayini ancak epitel hücre içeren üretral yada endoservikal sürüntü yada akıntı
H.pylori HpsA tayininde fazla sulu yada katı olmayan dışkı
Ag Tayininin Yapıldığı Durumlar;
• İzolasyonda(Kültür) sorunlar
– Kültürde zor üreyen bakterilerin tanısında;
» Örn: - C. trachomatis
- L. pneumophila
– Kültürü geciken yada uzun süren mikroorganizmaların tanısında;
» Bakteriler
- H.pylori
» Viruslar
- CMV/pp65
» Parazitler
- E. granulosus
» Mantarlar
-C. neoformans
• Kısa sürede, hızlı tanı konulması gereken ACİL-CİDDİ durumlarda;
– Özellikle mikrobiyal menenjit tablosunda
» Örn: S.agalactia yenidoğan menenjiti
– Tonsillofarenjit
» S.pyogenes
• Toksijenik Ag’lerin tayini ile Bakteriyolojik Tanısında – C. difficile
• Karışık ortamlardaki bakterilerin hızlı tanısında – Campylobacter
• İndirekt bakteriyal tür tanısında – Shigella spp
Immunolojik(Serolojik) tanı neleri amaçlar?(II)
2. Enfeksiyon hastalığını doğrulama Direkt Aglutinasyon Testi
-Kültürde üreyen bakterinin antijenine karşı hasta serumundaki antikor yanıtının saptanması
M.tuberculosis enfeksiyonunda Quanteferon testi HIV’ de EIA ile Anti- HIV’ in WB ile doğrulanması
3. Bir kişinin ya da toplumun bağışıklığını saptama
Anti-HAV IgG, Anti-HBs
4. Etkenlerin serogrup, serotip veya immuno tiplendirilmesi E. coli’de ETEC, EPEC gibi
5. Hastalığın prognozu HAV IgM yanıtı,
HBV’de hepatit belirteçleri
Serolojik(İmmunolojik) Tanıda Klinik Örnek Uygunluğu
• Serum, plazma, plevra-periton-eklem sıvısı, BOS ve doku kesitleri • Ab Arama amaçlı serumun eldesi aseptik koşullarda olmalı ve
Hemolizli, lipemik, fibrinli olmamalı
• Ag Arama temelli klinik örnekler; CMV/ pp 65 PMNH bakılabilir RSV/Ag Nazofarengiyal yıkama suyu veya aspirat
• Serolojik testler test kuralına göre çalışılmalı Örneğin: Soğuk aglütinasyon • Taze serumla çalışılmalı,
Çalışılamıyorsa; Testlerin özelliğine göre 40C, -22, -40, -700C’
de saklanmalı
• Serumlarda dondurma ve çözme işlemi bir kez yapılmalı • Bazı hastalıklarda kan alım aralığı önemli Örneğin: HIV’de ortalama 1.5 ay sonra
Serolojik Tanıda İnvitro Test Prensipleri
IgG’nin moleküler yapısı
Antijen (Ag)- Antikor (Ab) birleşmesinin özellikleri
• Antijen-antikor birleşmesi kimyasal bir reaksiyondur – Çünkü ısı açığa çıkar
• Özgül bir reaksiyondur – S. flexneri‘ye karşı hazırlanan Ab
– S. dysenteria ile birleşmez
• Geriye dönüşür bir reaksiyondur
– Ag+AbAgAb
– Ag ile Ab arasında meydana gelen denge K ile gösterilen denge sabiti ile açıklanır
• K=(AgAb) / (Ag) (Ab)
• K ne kadar yüksek olursa birleşme o kadar özgüldür.
• Antijen ve antikor uygun oranlarda bir araya
getirildiğinde maksimum reaksiyon oluşur
• İki safhalı reaksiyondur: 1. safha;
-Çok kısadır, Gözle görülmez
-Elektrolitlere gereksinim yoktur
2. safha;
- Uzundur, gözle görülür.
- Elektrolitlere gereksinim vardır.
- Isı ve nötral pH reaksiyonu hızlandırır
Antijen-antikor birleşmesinde rol oynayan kuvvetler
1- Elektrostatik kuvvetler - Ag ve Ab moleküllerinin yüzeyinde birbirine zıt yüklü
yapıların birbirini çekmesidir - Bu hücrelerdeki çekme gücü 2 molekül arasındaki uzaklığın
karesi ile ters orantılıdır. F=(1/d2) -Bu kuvvetler Ag ve Ab birbirine yaklaştıkça artar - Örneğin NH+ grubu ise iyonize COO- grupları birbirine çeker.
2- Hidrojen bağları -Hidrofilik gruplar arasında meydana gelen bağlardır
-Zayıf ve geriye dönüşümlü bağlardır -Bu bağların oluşmasında iki molekülün birbirine yaklaşması
gerekmektedir.
3- Hidrofobik bağlar
- Bu bağlar 2 molekülün birbirine yaklaşması
sırasında su moleküllerini iterek birleşmesinde etkendir
4- Van der Walls kuvvetleri
- Bu kuvvetler Ag ve Ab molekülünü saran elektron
bulutları ile ilgili kuvvetlerdir.
- Bu kuvvetlerin etkinliği için Ag ve Ab moleküllerinin birbirine çok yaklaşmaları gerekir.
- Bu kuvvetlerin etkinliği Ag ve Ab arasındaki uzaklığı 7 ile ters orantılıdır
F=1/d7
SEROLOJİK TEST YÖNTEMLERİ 1)PRESİPİTASYON;
• Çözünür haldeki antijen ve özgül antikorların Optimum konsantrasyonda karıştırılması ve Birleşmesine bağlı gelişen reaksiyona denir Reaksiyon sonucu
Kompleks (presipitat)gözle görülür Birkaç dakikadan,1-2 güne kadar
uzayabilir • Reaksiyonda Optimum Ag ve Ab miktarı önemlidir AYRICA;
PH, elektrolit ve ısı da önemlidir
Presipitasyon reaksiyonları;
• Pasif difüzyon şeklinde Sıvı ortamda difüzyon
Halka ve kapiller tüp
N. menengitidis, S. pneumoniae, H.influenzae Ag
Jel (agar)ortamda difüzyon
Tek yönlü difüzyon
Quidin tüp dif.
Çeşitli virus ve bakteri Ag belirlenmesinde kullanılır
Radyal, Mancini plak dif.
CRP, serum Ig ve kompleman düzeyleri
♣ Türbidimetrik ve nefolometrik cihazlar geliştirilmiştir
♣ Çok sayıda kan değerlendirilmesi için
Çift yönlü (quchterlonoy plak) difüzyon
Aspergilloz, histoplasmoz, blastomikoz Ag’lerin belirlenmesinde
Immuno-double diffusion
■ ELEKTRO- İMMUN DİFÜZYON Elektrikli ortamda;
Antijenler elektriksel alanda ayrılırlar (elektroforez)
Elektroforez için değişik matriksler;
Kağıt
Sellüloz asetat
Agar
Poliakrilamid kullanılır
İmmun difüzyon ve elektroforezin birleştirilmiş tekniğine
İMMUNELEKTROFOREZ denir
Serum proteinlerinin tanımlanmasında
Ig sınıfları ve ağır, hafif zincirlerdeki anormalliklerin saptanmasında
Basit, tek yönlü (laurell)(roket elektroforezi)
♣ Titresi bilinmeyen bir antijenin titresini belirler
Karşıt( zıt yönlü) IEF
♣ HBV Ag ve Ab saptanmasında
♣ Septik menenjit, pnömoni, septik artrit vb etken Antijen saptanmasında
2) AGLUTİNASYON: • Doğal olarak antijen taşıyan
Bakteriler, Eritrositler, Lökositler
• Yüzeylerinde yapay olarak antijen bulunan Eritrosit, Latex, Bentonit
Polistren gibi sentetik parçacıkların
Elektrolitli bir ortamda
Taşıdıkları antijenlerle,
Spesifik antikorların
♣ Kümeleşme yaparak çökmesine denir
• Lamda, tüpte mikroplaklarda yapılırlar
• İkiye ayrılır Aktif aglutinasyon
Pasif aglutinasyon
• AKTİF AGLUTİNASYON;
DİREKT
Aglutinasyonda rol alan antijen partikülün kendisidir Bakterilerin antijenleri
Gruber- Widal, Wright, WF
Kan grubu antijenleri
Aktif hemaglutinasyon
♣ ABO, Rh, Vd
Forward
Reverse
♣ Cross-Matching
Major
Minor
♣ Soğuk aglutinasyon
M.pneumoniae ♣ Paul- Bunnel
EBV
• AKTİF AGLUTİNASYON; İNDİREKT Antijen ve antikorun bağlanmasında
ikincil bir antikorun kullanılması
Antiglobulin Ab (tavşan kaynaklı - ticari)
Direk Coombs ♣ Eritroblostasis fetalisli
çocukların eritrosit yüzeyindeki Ab saptanır
İndirekt Coombs ♣ Rh (-) annenin serumdaki
Anti-Rh Ab’ler saptanır
PASİF AGLUTİNASYON
• ANTİKOR (Ab) ARANIYORSA
Aglutinasyonda rol alan antijenler
Polisakkarit veya
Proteinler (tannik asitle)
Eritrosite bağlanırsa
♣ HEMAGLUTİNASYON
VZV, Rubella, CMV, T.gondii
Latex partikülleri, bentonit, kömür vb
PASİF AGLUTİNASYON • ANTİJEN (Ag) (TERS PASİF) ARANIYORSA;
Eritrosit, latex, bentonit, kömür
S.aureus covan 1
Antikorun Fc’sine bağlanır
Latex Agg (LA)
Ko Agg (CoA)
♣ Serum, BOS, idrarda
Bakteriyal polisakkarit Ag’leri
N.menengitidis
Hib
S.pneumoniae
C.neoformans
Streptokok gruplandırılması,
S.aureus koagulaz deneyi
Çeşitli bakteri ve virusta ag tayinleri
• Hemaglutinasyon- inhibisyon (HI) testi Hemaglutinasyonu engelleyici antikorların
saptandığı testtir
Hastanın serumu seri dilusyon edilir
Üzerine standardize sabit virus antijeni konulur
Eritrositler eklenir
Serumda Ab’ler varsa
Hemaglutinasyonun görülmediği son titre pozitif sonuçtur
İnfluenzae, Kabakulak, Rubella enfeksiyonlarında
3)KOMPLEMAN BAĞLAMA TESTİ
• Antijen ve antikor birleşmesinin komplemanı uyarmasına dayanarak geliştirilen iki basamaklı testtir
• Antikor (sıklıkla) ve antijen saptayabilen yarı kantitatif bir yöntemdir
• Test birbirinden farklı üç komponent içerir Test sistemi Hasta serumu (inaktif/aranan Ab)
Antijen (bilinen)
KOMPLEMAN(kobay veya tavşan serum)
İndikatör sistemi (hemolitik sistem) Koyun eritrositleri
Koyun eritrositlerine karşı Ab
DEĞERLENDİRME; • Hasta serumunda Ab varsa
Ag ve Ab birleşecek (klasik yol)
C, Ag ve Ab’ye bağlanacak
Ortamda C kalmayacağı için
Hemolitik sisteme bağlanamayacak
Hemoliz olmayacak
Bazı viral, riketsiyal ve fungal hastalıkların tanısında
1990’lı yıllarda Sifiliz için KOLMER
4)FLOKÜLASYON
– Kardiolipin antijenin sifilitik hasta serumlarındaki reaginlerle birleşerek oluşturdukları,
– VE; Toksin ile anti toksinin uygun miktarda karşılaştıklarında meydana getirdikleri
KÜMECİKLERE denir
– Bu kümecikler gözle yada küçük büyütmelerle görülebilir.
Toksoid aşıların miktar tayininde kullanılır
AYRICA;
Sifilizin tarama testlerinde;
Rapid plazma reagin (RPR) direkt, VDRL kadar ise serum inaktif edilerek çalışılır.
Bunlar tüplerde veya özel lambalarla kalitatif (RPR) ve kantitatif (VDRL) olarak yapılabilirler.
RPR, 4+’dan (-) kadar, VDRL de ise ½ den başlayan ve yukarı titrelere kadar varan titrede sonuç verilir.
5)NÖTRALİZASYON
• Bir virusun enfektivitesini Özgül antikoru ile etkileştikten sonra Kaybetmesine denir. Enfektiviteyi nötrleyen antikorların ortaya çıkarılması testidir.
BİRÇOK VİRAL ENFEKSİYON TANISI Nötrolizan Ab’lerin saptanması Çift serumda Ab titresinin artışıyla sağlanır Poliovirus/Serum Doku Kültürüne
Kabakulak virusu/Serum Embriyonlu Yumurta
Kuduz Aşısı/Serum Fareye
• Nötralizasyon İnvitro ve invivo yapılabilir İN VİVO 3 ŞEKİLDE YAPILABİLİR: Deney Hayvanlarında En sık Fare kullanılır
Doku Kültüründe
En sık bu yöntem kullanılır
Prensip CPE’nin yok edilmesidir.
CP’nin görülmediği titre nötr. titresidir.
Embriyonlu Yumurta İnfluenzae- Kabakulak Allantoik keseye Çiçek-Herpesviruslar Karioallantoik zara
İN VİTRO OLARAK ASO deneyi
AGBHS’ de Streptolysin O’ya karşı Anti- Streptolysin O oluşur
Nötrolizasyon sonucu İndikatör olarak eritrositlerde erime olmaz
METABOLİK İNHİBİSYON TESTİ • Nötralizasyon Testi gibidir
• Virus/Serum karışımı
• Üzerine hücre süspansiyonu konur
• Fenol kırmızısı(İndikatör)
Nötralizasyon varsa renk SARI
Nötralizasyon yoksa renk KIRMIZI
Örneğin; Enteroviruslarda renk kırmızı kalır, Adenoviruslarda renk değişikliği olur.
G)İMMUNOASSAY TESTLER • İşaretli antikorların kullanılmasıyla 1942’de; FA Fluoresan Antikor (Fluorokromlar) 1954’de; IFA (İndirekt Fluoresan Antikor) 1960’da; RIA (Radyoizotopla- iyotla) 1970’de; EIA (enzimle) kullanıma girmiştir Antikor yada antijen saptamak
için kullanılırlar
I- İmmun Fluoresan (IF) testler
• FLUORESANS
Fluorokrom veya florofor boyaların
Ultraviyole ışık altında
Işık enerjisini emerek
Bu enerjiyi farklı dalga boyuna çevirmesine denir
• Antikorlar en sık fluoresin isotiyosiyanat (FITC) ile işaretlenir. BUNA GÖRE; Direk fluoresan antikor (DFA)
Katı fazda klinik örnek (Ag) Üzerine FITC’li Ab Pozitif sonuç (fluoresan-yeşil görüntü)
Bakteri ve viruslerin hızlı tanıda
♣ Kuduzda negri cisimciği
♣ Kolera tanısında
İndirek fluoresan antikor (İFA) Katı fazda hazır Ag Hasta serumu(aranan Ab) FITC’li Anti-Ig Pozitif sonuç (fluoresan görüntü)
Birçok bakteri virus enf ve otoimmun hast.
♣ FTA- Abs (T.pallidum)
♣ ANA, AMA vb
• IF yöntemiyle klinik örneklerden hem Ag hem Ab aranır • Fluoresan mikroskobu olması ve uzman kişi gereklidir
II-Radioimmuno Assay (RIA)
• Yöntem aynı IF ve EIA gibidir
• Antikorda işaretliyici madde olarak
Radyoaktif madde I. 125 ve I. 132 kullanılır
Gamma sayaçlarında değerlendirilir
Radyoaktif madde kullanımından dolayı sınırlıdır
Özellikle hormon testlerinde (TSH, T3, T4) kullanılır
Radyo allergo sorbent (RAST) deneyi
Allerjene spesifik IgE tayininde kullanılır
Radioimmunosorbent (RIST)
Serumda total IgE tayininde
VI. ELISA (Enzyme Linked Immunosorbend Assay)
– Antikoru ENZİMLE İŞARETLEME yöntemidir Peroksidaz, alkalin fosfataz ve beta galaktozidaz gibi enzimler Spesifik substratları renkli ürünlere çevirirler
Peroksidaz/Orthofenilendiamin Alkali fosfataz/Nitrofenil fosfat
Renkli ürünler spektrofotometrede belirli dalga boylarında olurlar
– Yöntemin; Kullanılan reaktifler uzun ömürlü olması Artık maddelerle ilgili radyasyon sorunu olmaması Uygulamasının basit ve otomatize edilebilmesi yönleriyle
Aynı prensipli (işaretleme) RIA ve IF’ye göre avantajlıdır
• Dezavantajları ise;
Antijen saptamada klinik örneğin uygunluğunun değerlendirememesi
Bazı viral enfeksiyonlarda düşük Ag yoğunluğu saptanmaması
IgM saptanmasında RF-IgM ile çatışmanın olması
Bunun için Absorblama işlemi olması
– Antijen veya antikorun çeşitli vücut sıvılarında <5pg düzeyinde saptandığı için yüksek ANALİTİK DUYARLILIKTA olması
– UYGULAMA PRENSİPLERİ
Ag ve Ab (sınıfa özgül) saptayabilir
Katı faz olarak; Plastik tabanlı mikrotitrasyon plakları
Boncuk veya filtre kullanılır
Bazı ELIZA uygulama şekilleri:
1)İNDİREK ELIZA ile Ab Tayini
• Ag kaplı kuyucuk
• Hasta serumu (Aranan Ab)
• Yıkama
• Enzim işaretli ikincil Ab
• Yıkama
• Substrat
• H2SO4 (Reaksiyonu durdurur)
• Spektrofotometre
Yarışmasız İndirekt ELISA ile Ab saptama
2)Sandwich ELIZA ile Ag Tayini
• Katı yüzeyde capture monoklonal yada poliklonal
• Ag içeren hasta serum örneği
• Yıkama
• Enzimle işaretli saptayıcı monoklonal yada poliklonal
• Yıkama
• Substrat
• H2SO4 (Reaksiyonu durdurma)
• Spektrofotometrede okuma
3) İNDİREK SANDWİCH ELIZA ile Ag Tayini
• Katı yüzeyde capture Ab
• Ag içeren hasta serum örneği
• Yıkama
• Spesifik bir saptayıcı antikor ilave edilir antijene bağlanır
• Ag iki antikor arasında kalır
• Enzimle işaretli ikincil Ab saptayıcı antikora Fc bölgesinden bağlanır • HRP ile işaretli
• Yıkama
• Substrat
• H2SO4 (Reaksiyonu durdurma)
• Spektrofotometrede okuma
4) YARIŞMACI (KOMPETATİF)ELISA:
–Serumda Ag Arama (Sıklıkla kullanılır) Katı yüzeyde Ab
Şüpheli serum (Ag aranan klinik örnek) ve enzimli işaretli antijenin beraber konulduğu antijen rekabet (Competetive) yöntemidir.
İşaretli antijen katı yüzeye bağlanırsa, substratla da birleşir RENK OLUŞUR.
Bu sonuç klinik örnekteki Ag’nin olmadığı bir sonuçtur.
Fakat klinik örnekteki antijen katı faza bağlanırsa enzim olmadığından substratla reaksiyon olmaz. RENK OLUŞMAZ.
5) YAKALAMALI (CAPTURE)ELISA:
Sıklıkla;
Enfeksiyoz etkene yönelik,
Spesifik IgM ve IgG saptama testidir
1)Spesifik Ag saptama Katı faza poliklonal veya M.ab’lar konulur Poli Ab’ler,
M Ab’lere göre
Farklı Ag epitoplarını
bağladığı için güvenilirdir
2)Spesifik Ab (IgM) saptama
• Katı faz formu IgM’in Fc bölgesine karşıt anti-IgM Ab katı faza
bağlanır
Üzerine hasta serumu (IgM?) konulur
Üzerine viral antijen
Enzimle işaretli antikor
Substrat…
• Konjugat faz formu Katı fazda viral Ag
Hasta serumu (IgM?)
ENZİMLE İŞARETLİ anti IgM Ab (KONJUGAT)
Substrat…
• UYGULAMA CİHAZ SİSTEMLERİ – MİKROELİSA TEMELLİ AÇIK SİSTEMLER
Klasik Cihazlar
İlk yıllarda kullanılan bağımsız yıkayıcı ve okuma cihazlarından ibaret sistem
Yarı Otomatik veya Tam Otomatik Cihazlar Örnek yükleme, Yıkama ve okuma cihazları entegre
sistemler
• MAKROELİSA TEMELLİ KAPALI SİSTEMLER
– Kan bankası rutin çalışmalarına son yıllarda giren sistemlerdir.
– Çalışma sistemleri ve Prensipleri; Kapalı bir cihaz ve bu cihazda çalışmaya uygun kitler ile
cihaza bağlı bilgisayar ve yazıcı.
– Piyasada en sık bulunan sistemlerde kullanılan kitler; Enzyme-linked flureskent assay (ELFA) Mikro partikül enzim immuno assay (MPEIA) Fluoresan polorizasyon immuno assay (FPIA) Chemiluminescent Assay (CA) yöntemleri ile
çalışmaktadır.
MİNİ VİDAS-ELFA
• Bu sistemlerin; – BAŞLICA AVANTAJLARI
Duyarlılık ve özgüllükleri yüksektir.
Tam otomatik (inkübasyon, yıkama, reaktif pipetleme işlemleri) 24 saat kesintisiz çalışmaktadırlar. Açık sistemlere göre kontaminasyon, teknisyen hataları son derece azalmaktadır.
Random acces(Rastgele erişimli) Çok sayıda farklı testi aynı anda ve aralıklı yapan sistem
İstenilen bir test istenilen bir örnekten istenilen bir durumda(acil)yapabilmeye uygun
STAT girişli (tek örnek ve bir örneklik reaktif kullanımı) olmalarıdır.
Reaktif kompartmanlarının 2-8 0C sahip olmalarıdır ve cihazlarda atık torbalarının olması.
Bunların yanında gerek cihaz donanımı gerek kitlerin hazırlanma tekniklerine ilişkin olarak avantajları vardır.
–DEZAVANTAJLARI Kurumu tek cihaza ve buna bağlı olarak tek kite zorunlu
kılmaları
Açık sistemlere göre pahalı olmaları
IV-WESTERN- BLOT • Viral lizat veya rekombinant antijenler Sodyum dodesilsulfat yardımıyla
(SDS) POLİACRYLAMİD JEL zemininde, molekül ağırlıklarına göre elektroforetik
olarak ayrılır. • Polipeptit antijenler, ikinci bir elektroforez ile NİTROSELÜLOZ MEMRAN
ŞERİTLER ÜZERİNE transfer edilir. • Hasta serumu ile şerit üzerindeki antijenler özel bir testte temas ettirilir
(elektroforetik yöntem) • Hasta serumunda aranılan antikorlar varsa, şerit üzerindeki antijen
bulunan BANDLARDA RENK KOYULUĞU (KOYU-ZAYIF-RENKSİZ) oluşur. • Kitin internal Pozitif ve Negatif kontrollerindeki band renkleri
değerlendirmede önemlidir. • Ve band için, HANGİ ANTİJEN VARSA REAKTİF kabul edilir. • Şeritlerin üzerindeki bandların pozitifliğine göre o hasta için, etkenin
sonuç virulansı patternlerine göre POZİTİF-NEGATİF VEYA SAPTANMAYAN sonuç verilir.
Etkene özgü IgM, IgG, IgA antikorlarına göre test yapılabilir. HIV, H.pylori ve T.pallidum enfeksiyonlarının tanısında
özgüllüğü yüksek olarak kullanılmaktadır.
Western blot (WB)
III-HÜCRESEL İMMUNİTE ÖLÇÜM YÖNTEMLERİ
• HÜCRESEL İMMUNİTEYE YÖNELİK TEST YÖNTEMLERİ
İKİ BAŞLIK ALTINDA İNCELENİR
A) İNVİTRO TEST YÖNTEMLERİ
B) İNVİVO TEST YÖNTEMLERİ
A)İNVİTRO TEST YÖNTEMLERİ 1)LÖKOSİT SAYIM VE FENOTİPLEMESİ
• LÖKOSİT SAYIMI
Mikroskopik yöntemlerle
Hemositometrik hücre sayımı
Işık mikroskobu (40’lık)
Thoma ve Neabaur lamları
%0.4’lük tripan mavisi
♣ Rutinde Pek kullanılmıyor
Gelişmiş immuno hemotolojik cihazlar
En uygun yöntemdir
Piyasada farklı firma cihazları var
• LÖKOSİT FENOTİPLEMESİ Vücudun değişik bölgelerinde
Kemik iliği, kan, dalak ve lenf nodüllerinde
Lökositlerin sayı ve tipleri
♣ Lenfositlerin
B lenfositleri
T lenfositleri
T4 ve T8
♣ Monositlerin
♣ Granülositlerin
Nötrofiller
Bazofiller
Eozinofiller
İmmuno hematolojik cihazlar,
Flowsitometrik cihazlarla
Hücre yüzey moleküllerinin (Marker) fenotiplemesi
CD (cluster of differntiation – farklılaşma kümeleri) antijenleri
Hematopoetik hücrelerin yüzeyinde yer alırlar
250’ye yakın CD tanımlanmıştır
♣ Örneğin CD4 T, CD8 T, CD45 B lenfosit gibi
Lökositlerin yüzeyindeki CD antijenik epitopları
♣ Monoklonal antikorların (MAbs)
Fluoresan boyalar
Enzimlerle konjuge edilerek
Fluoresan mikroskobuyla
Flow sitometri cihazlarıyla( EN SIK)
* Kantitatif analizi ve
* Hücre ayrımı ve tanımlaması yapılır
FLOWSİTOMETRİ
ÇALIŞMA PRENSİBİ;
• Fluoresanlanmış (FITC ile) M Ab ile işaretlenmiş hücreler
• Sıvı bir ortamda sıra halinde uyarıcı ışıktan (Argon lazer) 488nm’de geçirilirler
Uyarıcı ışığı
Hücreler kırarlar veya
Florokromla işaretlenmiş m Ab’lerin bağlandığı hücre tarafından emilir ve yayılır
Bu yayılan ışığın şiddetini ve niteliğini algılayan dedektörler bilgisayara aktarırlar
Buna göre;
♣ Hücrenin tipi ve sayısı belirlenir
1’den 10’a kadar renk eklenebilir – ve bu sayı artmaktadır
• KLİNİK KULLANIMI
Lökosit fenotiplemesi (EN SIK)
Konjenital veya kazanılmış immun yetersizlik tanısı (en sık AIDS)
HIV pozitifliğinde prognoz değerlendirilmesi
İmmun yetersiz hastalarda immuniteyi yada kemoterapi monitörizasyonu
KİT yapılan hastalarda yeni immun durumun takibi
Tümör hücre fenotiplemesi
Lösemi ve lenfoma tanı ve sınıflaması
B lenfositlerinde klonal tayini ve lenfoma ve lösemi ayırımında
Hücre içi antijenlerin (myeloperoksidaz miktarı) tayini
Hematopoetik hücrelerin (CD4)
Hematopoetik olmayan
Tümörler ve hücrelerden ayırt edilmesi
• DNA analizi
Anöploidi tayini
Hücre siklüsu kinetiğinin belirlenmesi
Apoptozis
• Nötrofil fonksiyon analizleri
O2’nin oluşumunun tayini ile;
Granulomatoz hastalık tayini
• Diğer kullanım alanları
Retikülosit sayımı
Transplant hastalarında Cross-Match
Sitogenetik
• ENFEKSİYON HASTALIKLARINDA
Mikroorganizma- hedef hücre ilişkisi;
Apoptozisin incelenmesi
HIV ile enfekte kişilerde
♣ Monunükleer hücrelerinde apoptosis oranları
CD8 T ve
CD19 B hücrelerinde en sıktır
Konak hücreye ait proteinlerdeki değişimler
EBV ile enfekte B lenfositlerinde;
♣ BCR2 ekpresyonu
HIV ile enfekte T lenfositlerinde;
♣ CD4 ekpresyonu
CMV ile fibroblastlarda;
♣ MHC I ekpresyonu
Mikroorganizmanın hücreye bağlanmasının incelenebilmesi
EBV’nin ♣ B lenfositlerine
♣ Epitel hücrelerine
CR2 reseptörüne
Poliovirus ♣ MNH CD14 reseptörlerinde
Kızamık virusu ♣ Hedef hücrelerin CD46 reseptöründe
Hücre içi ve yüzeyi mikroorganizma antijenlerini inceleme VZV ile enfekte hücre yüzeyinde
♣ gp1
HIV ile enfekte CD4 T lenfositlerinde
♣ gp 160/120
İnfluenzae ile enfekte hücrelerde
♣ HA antijenileri
Klinik virolojide kullanılmaktadır Enfekte kişilerin hücrelerinden
Virusle enfekte olanları süratle belirler
♣ CMV ile enfekte MNH’ler kantitatif olarak
♣ HIV seropozitif kişilerde
MNH’ lerde kantitatif Ag tayini Böylelikle;
*Antiviral tedavinin izlemi
Spesifik antikor tayini
CMV, HSV, HIV gibi viruslara
H. pylori gibi bakterilere
T.gondii gibi parazitlere karşı
Gelişen spesifik Ab’ler ölçülebilir
2-LENFOSİT SAYIMI VE AKTİVASYON TESTLERİ a) Lenfosit izolasyonu
• Dansite- Gradient Santrifüj Yöntemi Kan hücre grupları birbirinden farklı dansite özelliğine
sahiptir 3 ml ficol-isopak (Dansite 1077 gr/lt) konur
3 ml heparinli periferik kan konur
1500 devirde, 45 dakika santrifüj edilir
Lenfositler orta tabakada yoğunlaşırlar
En altta eritrosit ve granülositler
♣ Dansiteleri 1077 ‘den fazla
En üstte buff-coat toplanır
♣ Dansiteleri 1077’den düşük
♣ Buff- Coat’dan
Trombositler (santrifüj)
Monositler petri kabında tutularak uzaklaştırılır
b) Lenfosit ayırımı
• T lenfosit ayırımı
Rozet testi
Koyun eritrositlerine karşı CD2 reseptörü vardır
Periferik kanda E-Rozet yapan
%65-70 T lenfosit vardır
B lenfositi E-Rozet yapmaz
• B lenfosit ayırımı Direkt immun fluoresan yöntemi
Fluoresanlanmış (FITC) anti- Ig Ab ile yapılır
Toplam lenfositlerin %20-25’i B lenfositleridir
• Periferik kandaki
T ve B lenfosit oranını saptamak İmmun yetmezlik hastalıklarının tanısında
Lenfosit lösemi ve lenfomadaki lenfosit tipinin tayininde
Otoimmun hastalıklar ve kanserli olgularda hücresel immun yanıtın değerlendirilmesinde kullanılır
• NK sitotoksisite ölçümü Antikora bağımlı hücresel sitotoksisite
ölçümü CR 51 ile işaretlenmiş ve yıkanmış hedef
hücrelere Anti- hedef hücre Ig G ile FcR bulunan effektör hücreler (NK, makrofajlar)
eklenir Hedef hücrelerden CR 51 salınır Gamma sayacında CR 51 ölçülür CR 51 miktarı, ♣ NK hücre sayı ve aktivite düzeyi ile
doğru orantılıdır
c) Lenfosit Aktivasyon testleri(LAT) • Lenfosit uyarımı
Otoimmunite
Kanser patogenezinde
İntraselüler enfeksiyonlarda
Hücresel immun yanıtın ölçümünde uygulanmaktadır
• Genelde T hücre bazen B hücre yanıtı değerlendirilir
• Aktive olan T hücreleri
Morfolojik ve fenotipik değişikliğe uğrarlar
Büyüklüğü değişir
Histolojik boyamada kromatik değişiklik
Dinlenme halinde olmayan
Ancak; aktive olduğunda ortaya çıkan yüzey proteinleri meydana gelir
• LAT;
Hasta lenfositlerinin
Özgül antijenle
Veya özgül olmayan antijenlerle
İnvitro uyarılmasına dayanır
İki tipi vardır
1)Yüzey fenotipi (aktivasyon belirteçleri) değişikliklerini belirlemek
Aktivasyon belirteçleri
Ya enflamasyon bölgesinden direkt hücrelerden
Ya da invitro uyarılan lenfositlerden aranır
♣ FLOWSİTOMETRİ ile belirlenir
2) Uyarı sonrası lenfositin proliferasyon yeteneğini ölçmek
Lenfoblast transformasyon testi (LTT)
96 kuyucuklu plaklarda yapılır
T hücre uyaranları olarak
Fitohemaglutin (PHA)
Konkovalin A (ConA)gibi lektinlerle
Süperantijenler gibi bakteriyel toksinlerle
B hücre uyaranları olarak,
Süperantijenler
LPS kullanılır
LTT TESTİNDE;
Antijen ve lenfositlerin 72 saat kültürü yapılır
H timidin eklenir
H timidin çoğalan DNA yapısına girer
Radyoaktif veya fluoresan boya ile
DNA sentez hızı ve miktarı ölçülür
♣ Hasta ve kontrol karşılaştırmaları ile yorumlanır
Karışık lenfosit kültürü Alıcı ve verici kanından ayrılan lenfositler
İnvitro besiyerinde karıştırılarak
Lenfosit kültürü yapılır
♣ Antijenik farklılık varsa
♣ Biri diğerini aktive eder
♣ Blastik dönüşümle DNA miktarı artar
DNA sentezinin kantitatif ölçümü yapılır
Bazen verici lenfositleri
♣ X ışınları ile işleme sokulur
♣ Blastik dönüşüm olmaz
♣ Alıcının lenfositleri uyarılır
♣ Alıcının verilecek Dokuya karşı reaksiyon ölçülür
Buna tek yönlü karışık lenfosit kültürü denir
Doku transplantasyonunda
* HLA- D (LD antijenleri) antijenleri saptanır
Sitolitik T hücre yanıtının değerlendirilmesinde
Lenfositotoksik test Test prosedürü
HLA antijeni saptanacak total lenfositler veya CD 19 B lenfosit
Hangi HLA’ya ait olduğu bilinen anti-serum
Kompleman
Tripan mavisi veya eozin boyası
♣ Antijen + antikor birleşir
♣ Kompleman bağlanır
♣ Lenfosit zarı zedelenir
♣ Boya lenfosit içine girer
♣ Mikroskopta %50’den fazla boyanan lenfosit miktarı
Denenen lenfositleri, bilinen anti- HLA tipine ait olduğunu gösterir
Doku transplantasyonunda
* HLA A,B,C antijenlerin göstermede kullanılır
• Sitokin sentezini belirleme testleri Aktive T hücreler değişik sitokinler üretirler
Enflamasyon bölgesinden elde edilen T lenfositler
İnvitro kültürü yapılır
Total sitokin sentezini verir
ELISPOT (Enzimle işaretli immunspot) Gama- IFN (Quantiferon) sentezleyen hücre sayısı yüzde
olarak belirlenir
ELISA ile TH1’lerce sentezlenen gama IFN (Quantiferon) miktarı kantitatif olarak saptanır
Flowsitometrik yöntemle
Tüm farklı sitokin sentezleri ölçülebilir
3- MONOSİT/MAKROFAJ TESTLERİ M/M Hücreleri • Doğal bağışıklıkta rol alırlar Ve özgül bağışıklığı sitokinlerle koordine ederler • Spesifik patojenleri yok eden efektör hücrelerdir • Apoptosizde apoptotik hücreleri temizlerler
Bu hücreler doku örnekleri yada hücre süspansiyonlarından MAbs ile saptanırlar
Monositin en iyi belirlenmesi; FLOWSİTOMETRİDE
Anti, CD14 mAbs ile olur
Ayrıca CD11b, CD11c, CD16, CD32, CD64 gibi taşıdıkları reseptörlerle tanımlanmaları yapılır
Histokimyasal boyama olarak
Non spesifik esteraz Boyaması Monositer lösemi tanısında kullanılır
MAKROFAJ GÖÇÜNÜ ÖNLENİM TESTİ
• Duyarlı lenfosit ile antijen teması sonucu
Salgılanan MIF (Makrofaj göçünü önleyen faktör)
Saptama testidir
Kapiller tüpte
Lenfosit
Özgün antijen varsa MIF pozitiftir
MIF TESTİNİN POZİTİFLİĞİ
♣ O antijene karşı hücresel immun yanıtı gösterir
4-NÖTROFİL FONKSİYON TESTLERİ
• Polimorf nüveli nötrofiller (PMN) Doğal immunitenin efektör (fagositik) hücreleridirler
Enflamasyon bölgesine ilk gelen hücrelerdir
PMN yetersizliği Ya PMN sayısal azlığı
Yada PMN fonksiyon bozukluğu şeklinde olabilir
Bakteriyel enfeksiyonlara yatkınlık sağlar
Yetersizlik ölçüm testleri; a) Nötrofil sayısal değerlendirmesi testleri
b) Nötrofil adhezyon değerlendirme testleri
c) Kemotaksi değerlendirme testleri
d) Opsonizasyon değerlendirme testleri
e) Fagositoz yapmayı saptama testleri
f) Oksidatif patlama ve degranülasyon değerlendirmesi
g) Bakteriyel öldürmeyi değerlendirme testleri
olarak sınıflandırılır
a)Nötrofil sayısı
• Nötropeni 500/ml kanda olması
Kemik iliği, malignite, otoimmunite ve kemoterapiye bağlı gelişir
Mikroskobik boyama yöntemleri
Gelişmiş hematoloji ve immuno hemotoloji cihazlarıyla saptanır
FLOWSİTOMETRİ
b) Kemotaksi(KT) testleri
• Nötrofillerin Enflamasyon bölgesine hareketine (migrasyonu) KT denir
Bakteri ürünleri (endotoksin, hücre duvar yapıları, bakteri enzimleri)
Konak faktörleri (C3a ve C5a, LTB4) rol oynar
Bu kemotaktik moleküllere yanıtsızlık;
Defektif migrasyon (göç) yanıtı ile sonuçlanır
Defektif göçü saptamada BOYDEN odacık testi kullanılır
Filtre üzerinde;
♣ Kemotaktik madde
♣ Nötrofillerle yapılır
Petride agaroz jelde;
♣ Kemotaktik maddeler
♣ Nötrofillerle yapılır
Kemotaksi testleri İdyopatik immun yetersizlik hastalıklarının tanısında kullanılır
c) Nötrofil adhezyonu
NÖTROFİLLERİN
• Endotele adhezyonu ve enflamasyon bölgesine göçü
L-selectin ve İntegrinle sağlanır
Bu iki adezindeki yetersizliğe
Lökosit adhezyonu yetersizliği (LAY) denir
Bu durumda;
♣ Nötrofil enflamasyon bölgesine ulaşamaz
♣ Bakteriyel enfeksiyon yayılır
♣ Abse oluşmaz
• LAY hastalarında
CD11a/CD 18a LFA-1 (lenfosit fonksiyon antijen-1) lökosit integrini yoktur
Mabs’lerle FLOWSİTOMETRİ ile belirlenir
d) Opsonizasyon testleri
OPSONİN
• Mikroorganizmaların fagositlere bağlanmasını sağlayarak fagositozu kolaylaştıran moleküllere denir
IgG1,3 ve IgM, C3b ve iC3b’dir
Opsoninler için
Nötrofillerde
FcγR III (IgG ve IgM)
CR1 ve CR3 (C3b ve iC3b)
Makrofajlarda
FcγR I,II,III (IgG ve IgM) reseptörleri bulunur
• OPSONOSİTOFAJİK TEST
Amacı;opsonizasyon-fagositoz sürecini göstermektir. I-tüpe
Norm serum + norm lök + kuşkulu bakteri
II-tüpe İmmun (hasta) serum + norm lök + kuşkulu bakteri
37ºC’de 20 dakika inkübasyon .Her iki tüpden ayrı preparat hazırlanır
May –Grunwald – Giemsa boyama
Lökositlerin içine girmiş bakteri sayılır
Normal serumda ve immun serumda
♣ Ayrı sayılan bakterilerin toplamı sayılan lökosit sayısına bölünür
♣ Bir lökosite düşen bakteri sayısı bulunur
Buna fagositoz endeksi (FE) denir
İS/NS oranı OPSONİK ENDEKSİ’ni verir Oranın büyüklüğü İS’deki Ab titresi ile orantılıdır
• ERİTROSİT –AMBOSEPTÖR-KOMPLEMAN(EAC) TESTİ
Kompleman C3b parçasına karşı
Nötrofillerde bulunan reseptörlerin belirlenme testine denir
Koyun eritrositleri
Özgül antikorları ile birleşir
Kompleman bağlarlar
♣ Hemoliz oluşur
Kompleman C5 parçası eksik olarak deneye sokulursa
♣ E+Ab/C kompleksi
C3b reseptörlü nötrofillerle rozet yaparlar
e) Fagositoz • Mikrobiyal öldürmenin ilk basamağıdır
• Antikor ve komplemanla opsonize mikroorganizmanın PNL ve makrofajlarla temasından sonra
İçeriye alınma işlemidir
• Fagositoz testleri Opsonize partiküller ile
Nötrofillerin inkübasyonu sonucu Mikroskopta partikülleri içine alan
Nötrofiller görülür
Opsonize olmuş Ancak hücre içine alınmamış partiküller
Asit muamelesi ile uzaklaştırılırlar
Fluoresan veya radyoaktif madde ile işaretlenirler
♣ Direkt sayımları yapılır
f) Oksidatif patlama ve degranülasyonun değerlendirilmesi
I- Oksidatif patlamaya yönelik
• Nötrofillerin fonksiyonun değerlendirilmesinde
En sık uygulanan test
Süperoksit sentez yeteneğinin değerlendirilmesidir
• Kronik granülomatöz hastalığın taramasında
Bu değerlendirme kullanılır
ÇÜNKÜ;
Bu hastalık fagositoz defekti sonucu gelişir
♣ Nötrofil içinde NADPH’ı (nikotin amid adenin di nükleotid fosfat de hidro genaz) etkileyen oksidaz enzimdeki bozukluktur
• Dört test yöntemi kullanılır 1)NBT (Nitroblue tetrazolium test)
• Testin prensibi
NBT’ in redüksiyonuna dayanan bir testtir
Redükte olduğunda sarı renkten koyu mora dönüşür
Nötrofiller;
NBT içinde 37 ºC’ de 15 dakika tutulur
NBT, nötrofil içine alınır
Pyridine ile ekstrakte edilir
515 nm dalga boyunda spektrofotometrede okunur
Veya mikroskopta boyanarak görülebilir
• Testin değerlendirilmesi
Nötrofiller içinde süperoksit ve H2O2 oluşur
Bunların redüktan etkisiyle
NBT redükte olur (renk değişir)
Öldürme işlemi olduğunu gösterir
• Lökositlerin mikroorganizmaları öldürme işlemi bozuk olan hastalıklarda Kronik granülamatöz hastalık Chediak- Higashi sendromu Myeloperoksidaz yetmezliği olanlar Glukoz- 6 fosfat dehidrogenaz eksikliği
olanlarda Akut lösemi Down sendromu Akut enfeksiyonu olanlarda
NBT negatiftir
2)Sitokrom b ölçülmesi
■ Fagositlerde bulunan;
Oksidaz enziminin parçası olan sitokrom –b’ nin
İmmunolojik cihazlar
Ve biokimyasal yöntemlerle ölçülmesidir
3) Flowsitometrik , DCF (dichlorofluoresan) yöntemi
■ Bu test H2O2 oluşumunu ölçer
■ Kronik granülomatoz hastalığın tanısında kesin sonuç verir
4)Kemülimunisans’a Dayalı immuno hematolojik cihazlar
■ H2O2, O-, O2 radikallerini ölçmeye dayanır
II- Degranülasyona dayalı testler
• Degranülasyon
Fagozom ve lizozomların füzyonu sonucunda
Fagolizozomun içine lizozom içeriğinin boşalmasıdır
• ELISA yöntemiyle
Lizozom içeriğinin
Asid hidroloz
Lizozim
Laktoferrin
Katyonik proteinlerin ölçümü yapılır
III- Mikrobik öldürme
• Mikrobisidal test
Hasta ve kontrol grubundan nötrofiller alınır
Hastalardan izole edilen bakteri ve mantar ile kültürü yapılır
Bir gece beklenir
Ertesi gün yaşayan bakteri veya mantar yoksa mikrobik öldürme tamdır
B)İNVİVO TEST YÖNTEMLERİ DERİ TESTLERİ;
• Geç aşırı duyarlılık reaksiyonunu ölçerek Hücresel bağışık yanıtın değerlendirmesini
Belirli bir patojeni veya temas antijenini tanıyan bellekli T lenf varlığını saptar
Test pozitifliği ancak klinik öyküyle anlamlıdır
• En sık uygulanan model İntraselüler bakteri enfeksiyonlarında
Tüberkülin deri testi olarak Old tüberkülin(OT)
1890 yılında R.Koch buldu
PPD( purified protein derivide) uygulanır
Saybert ve Glen 1941 yılında tanımladılar
PPD-s olarak standardize edildi
1-TÜ : 0.00002 mgr PPD-s içerir
M.tuberculosis enfeksiyonlarının tanısında kullanılır
• AYRICA;
Blastomisin (blastomikoz)
Histoplazmin (histoplazmoz)
Brucellin (bruselloz)
Frei testi (LGV)
Toksoplazmin (toksoplazmoz)
Ekinokokkin(ekinokokkoz)
Deri testleride kullanılır
• Bunların dışında;
Kontak duyarlılığında ilaç, metal, bitkisel maddelere karşı
Dermatit tanısında panel antijenler kullanılır
Prausnitz-Küstner (PK) reaksiyonu Atopik allerjili bir serum ve spesifik antijenin
Diğer bir kişinin deri içine verilmesiyle
♣ Anafilaksinin pasif transferi gösterilir
TÜBERKÜLİN DERİ TESTİ PPD;
• Montoux deri içi uygulaması ile yapılır 5 T U (0.1ml) ön kol iç yüzeyinin deri içine
48 -72 saat sonra endurasyon değerlendirilir Endurasyonu (Sertliği);
≥10 mm olan,
♣ BCG olmamış çocuk ve yetişkinlerde
♣ Pozitifliği gösterir
≥ 15 mm olan
♣ BCG’li çocuklarda pozitifliği gösterir
5-10 mm arası
♣ BCG aşılanmasına
♣ Atipiklerle çapraz reaksiyona
♣ Anerjiye bağlı olarak görülür
• Pozitif deri testinin anlamlı olması için; Klinik belirtilerden önce negatif daha sonra pozitif olması
gerekir
Tuberculin PPD
2 - 3 gün sonra
Cilt üzerinde şişlik ölçülür.
Deri testinde teknik hatalar ■ Uygunsuz antijen konsantrasyonu ■ Enjeksiyonun cildin derinine yapılması ■ Subjektif değerlendirme ■ Test yerine dışsal müdahaleler ■ Booster olayı gelişebilir
Yaşla BCG aşılaması
M.tuberculosis ve atipiklere karşı oluşan aşırı duyarlılık
Booster’ı artırır
IMMUNOGENETİK TESTLER;
• İMMUN SİSTEMİN Bileşeni ve hücrelerin doğal ya da özgül fazlarındaki
Naif yapılarını Mutasyonel değişikliklerin
Molekülleri genetik yöntemlerle ortaya koyan testlerdir.
• ÖRNEĞİN; Antijen sunan hücrelerde(ASH) MHC I ve II moleküllerinin tayini Ig’lerin Fab kısmında variable(v)bölgesini,Fc kısmındaki CH2 gibi
aktif bölgelerin genetik yapıtaşlarının belirlenmesi Fagositlerin sentezinde enzim ve sitokinlerin genetik
mutasyonlarını ortaya koyan testler Primer veya sekonder immün yetersizliklerin genetik
mutasyonlarının ortaya konulmasında
İMMUNO GENETİK YÖNTEMLER
• Nükleik asit teknolojisine (NAT) dayalı test yöntemleri
Klinik immunoloji laboratuvarında tanısal amaçlı daha yenidirler
Rutin tanı amaçlı konvansiyonel yöntemlerin yerini ne kadar alacakları zamanla görülecektir
ANCAK; Primer ya da seconder immun yetersizliğe bağlı birçok
sendrom ve hastalığın, Örneğin X’e bağlı A-gammaglobulin hastalığı
Artrit ve oto-immun hastalıklarla seyreder B hücre ve Ig izotiplerinde azalmaya nedeni olan B
hücre tirozin kinaz genindeki mutasyonun belirlenmesi gibi
Malign bazı hastalıkların; Örneğin;Hodgkin ve Non-Hodgkin lenfoma etiyolojisinde T
lenfositlerinde moleküler bozulmaların tayini MOLEKÜLER TANISINDA SIKLIKLA KULLANILMAKTADIRLAR
NAT’a dayalı test yöntemleri
1)Hibridizasyon (birleşme)
2)Amplifikasyon (çoğaltma)
başlıkları altında incelenir
1)HİBRİDİZASYON
• Bir DNA molekülü
Kompementerlik (birbirinin tamamlayıcısı) özelliğindedir
Isı ya çeşitli kimyasal maddelerle ayrılabilen
Uygun ısı, tuz konsantrasyonu, PH’da yeniden birleşebilen
İki sarmal zincire sahiptir
• İşte tanı amacıyla nükleik asitlerin araştırılması
Molekülün bu özelliklerine dayanmaktadır
YÖNTEMİN PRENSİBİ
• Klinik örnekte varsayılan etkenin nükleik asidi ısı ve kimyasal maddelerle iki zincire ayrılır
• Bu zincirlerin varlığı PROB adı verilen işaretli DNA ve RNA parçasıyla gösterilmektedir
• PROB adı verilen reaktiflerin işaretlenmesinde Flurokrom
Enzim
Kemülüminesan madde
Radyoizotop kullanılmaktadır
• PROBLAR Hedef nükleik asitlerin belirli bölgelerine komplementerdir
50 bp’den küçüktürler
HİBRİDİZASYON TEKNİKLERİ
a)Sıvı faz hibridizasyonu
• Sıvı ortamda prob ve hedef nükleik asit serbesttir
DNA/DNA
DNA/RNA
b)Katı faz hibridizasyonu
I-MAKROARRAY( makroskobik dizinleme) yöntemi – Nitro selüloz ve Naylon gibi porlu yüzeylerde yapılır
• Southern blot DNA’lar;
Agaroz jel elektroforezle, nitroselluloz ve naylon membran kağıda aktarılır Restriksiyon enzimleri ile klinik örnek temas ettirilir
DNA/DNA (32p-Biotin/Avidin peroksidaz)
Nokta mutasyonları, delesyonlar ve translokasyon sonucu farklılıkların saptanmasıyla hematolojik malignitelerin özelliklerinin belirlenmesinde kullanılır Burkitt lenfoma, Foliküler lenfoma
Kronik myeloid lösemi
Philadelphia kromozomu
AYRICA; B hücre lenfomalarında
♣ B hücre klonizitesinin incelenmesinde
T hücre lenfomasında
♣ T hücre klonizitesinin incelenmesinde
Nükleik asit boyutları konusunda yardımcı olur
• Northern blot RNA’lar, Nitroseluloz kağıtlara aktarılır mRNA /cDNA-cRNA hibridlemesinde 32p-Biotin/AP işaretlemesi kullanılır
• Dot blot DNA’lar,
Nitroselüloz kağıtlarda
DNA/DNA
32 p-Biotin/AP işaretlemesi kullanılır
II-MİKROARRAY • Porsuz yüzeyleriyle plastik, cam ve silikon kullanılır • Klinik örnekten
Nükleik asidin pürifikasyonu Amplifikasyonu Hibridizasyonu Tespiti
25- 75 mm’lik slaytlarda yapılmaktadır
• Uygulama alanları Antimikrobiyal ilaç keşfi ve geliştirilmesi ile aşı çalışmaları
Konak bağışıklık sistemindeki polimorfizmler Gen up ve downregülasyonları Apoptozis mekanizmalarında
Kanserlerin sınıflandırması ve derecelendirmesinde
Microarray
c) İn Situ Hibridizasyon
• Doku yada hücrelerdeki;
Nükleik asitleri saptar
• DNA/DNA hibridlemesinde;
Biotin/AP işaretlemesi kullanılır
• 16S/23S r-RNA’ları hedefleyen
Fluorokrom’la işaretleme olur
FISH (flouresan inn situ hibridizasyon yöntemi)
• FISH yöntemiyle; – Belirli genlerin;
Kromosomal lokalizasyonunu haritalamak
Veya kromozomal bozukluklarının saptanmasında kullanılır
T hücre fonksiyonlarının belirlenmesinde
2)NÜKLEİK ASİT AMPLİFİKASYONU (ÇOĞALTMA)(NAA)
NAA yöntemleri
a) Hedef Amplifikasyon Sistemleri
b) Prob Amplifikasyon Sistemleri
c) Sinyal Amplifikasyon Sistemleri
adı altında incelenmektedir
a) Hedef Amplifikasyon Sistemleri
• İncelenecek örnekteki az sayıda hedef molekülün (DNA, RNA)
İnvitro enzimatik replikasyon yöntemleriyle
Saptanabilecek düzeylere çıkarılmasıdır
Yöntemler • PCR
Klinik örnekte DNA aranıyorsa 4 adet deoksinükleik trifosfat (dATP, dGTP, dCTP, dTTP)
Özgül oligonükleotik primerleri (15-30 bazlık)
Isıya dayanıklı Tag polimeraz enzimi
94 ºC’de (denatürasyon)
54 ºC’de (bağlama)
72 ºC’de (Genişleme)
♣ Bu işlem 25-30 kez yapılır
Southern hibridizasyonla tanımlama yapılır
Klinik örnekte RNA aranıyorsa RNA’nın elde edilmesinden sonra
Revers-Transkriptaz uygulanarak
cDNA’ya çevrilir
Daha sonra cDNA amplifiye edilir
Değişik PCR tipleri Arbitrarily primer PCR(APP)
Multiplex PCR(MP)
Nested PCR(NP)
RT-PCR(RTP)
Kantitatif PCR(KP)
Real time PCR(RTİP)
Real-time PCR
Eş zamanlı
Nükleik asit amplifikasyonu
Amplifikasyon sırasında saptama yapılır
Floresan sinyalin ölçülmesi (Cyber green I)
Kantitatif ve kalitatif sonuç
Kısa sürede (2-3 saat) alınır
REAL TIME PCR
www.biorad.com
özel deteksiyon sistemli PCR cihazı
Real Time PCR
• DNA Bağlayıcı Flouroforlar
– Etidyum Bromid
– Syber Green
– Syber Gold
• Problar
– Lineer Oligo problar
“HybProbes”
– 5’ Nükleaz Oligo problar “Taq
Man” **
– Molecular becon
Transkripsiyon temelli Amplifikasyon teknikleri
Hedef molekülleri RNA’dır
TAS( Transcription based Amp)
TMA(Transcription mediated Amp)
NASBA (Nükleik Asid Sequence based Amp)
Northern blot ile tanımlama yapılır
Klinik immunoloji ve moleküler biyoloji lab.
İnsan immun sistem bileşenleri genomu ve kanser genotipi incelemelerinde
DNA yapısındaki mutasyonlar
Gen tayini ve dizilimi saptaması
Gen ve genetik polimorfizmi saptama
Transkriptlerin özellikleri ve miktarı saptanması
Genetik manipülasyonun saptanması
PCR’ IN İMMUNOGENETİK ÇALIŞMA ALANLARI
B) Prob Hibridizasyon Bazlı (NAA) Yöntemi
–Ligasyon yardımı ile prob çoğaltılmasına dayanır
–Hedef DNA + Prob Hibridizasyon / Ligaz LCR
• C) Sinyal Amplifikasyon Bazlı NAA Yöntemi – Aslında prob hibridizasyon çoğaltma yöntemidir
– İki prob kullanılır
– Birinci prob hedef NA dizisini tanır • Üzerinde ikinci probu bağlama bölgesi vardır
– Çok sayıda sinyal taşıyan 2. prob 1. proba bağlanır • SONUÇTA HEDEF DİZİ +1 Prob/2. Prob hibridi oluşur
• Bağlama bölgesindeki bol miktardaki sinyalle HİBRİD oluşur
– Örnek :
b-DNA (dallanmış DNA)
RCA (Rolling Circle Amp) Tek nükleotid polymorfizm
Allellik ayrımında kullanılır
MAJOR HİSTOCOMPATIBILITY COMPLEX (MHC) GEN BÖLGESİNE YÖNELİK TESTLER
• MHC ve ÜRÜNLERİ
İnsan 6. kromozom kısa kolunda yer alırlar
Üç gen bölgesine sahiptirler
MHC Sınıf I gen bölgesi
HLA-A,B,C,E,F,G antijenleri
MHC Sınıf II gen bölgesi
HLA-DR, HLA-DQ, HLA-DP antijenleri
MHC Sınıf III gen bölgesi
Hsp, TNFα, C4A,C4B, C2
HLA molekülleri Glikoprotein yapısındadırlar
Transmembranöz yapıda bulunurlar
Yüksek polimorfizm (bireyden bireye) gösterirler
HLA-I;
En fazla lenfosit, lökosit olmak üzere
Tüm çekirdekli somatik hücrelerin çoğunda,
Eritrositler hariç
HLA-II ise;
Sınır olup APC (dendritik hücre, makrofaj)
B lenfositleri, Aktive T4 lenfositleri,
Endotel, böbrek glomerül hücrelerde bulunur
HLA Doku tipi tayinindeki amaçlar
• Organ ve doku tipi nakillerinde, HLA uyumu
• Adli tıpta
Babalık tayininde
Kimlik tanımlamasında
• Bazı otoimmun hastalıkların tanısında
HLA-DR4 ile RA
HLA-B 5 ile Behçet hastalığı
HLA Doku Tipi Tayin Yöntemleri
• Üç grup altında yapılmaktadır
1) MOLEKÜLER/DNA TEMELLİ YÖNTEMLER
2) Antikor Temelli Yöntemler
3) Hücre Temelli Yöntemler
Moleküler Yöntemler
Özgün, esnek, yeni alleller yeni reaktiflerin geliştirilmesi,
Canlı hücre gerektirmemesi,
Otomasyona uygun olması(serolojik ve hücresel yöntemlere göre),
Eşzamanlı çok sayıda örnek ile çalışma
HLA genlerindeki tüm çeşitliliklerin gösterilmesi, serolojik olarak tanımlanamayan alllellerin gösterilmesi
DNA temelli yöntemler • MHC gen bölgesinde;
PCR yöntemi ile; Sekansa spesifik Primerleri (SSP) kullanılır
Daha sonra Restriction fragments lenght polymorfizm (RFLP)uygulanarak DNA parçalara ayrılarak spesifik problarla tanımlanır
HLA-I ve II tiplemesi yapılır
AVANTAJ VE DEZAVANTAJLARI; Sadece bir allel veya allel grubuna özgün DNA segmentlerini
çoğaltacak primer seti kullanılır
Serolojik yöntemlerin doğrulanmasında
Dezavantajı çok sayıda PCR yapılması
SSP cihazı
HLA-B27 için PCR-SSP ürünü (agaroz
jelde)
HİBRİDİZASYON YÖNTEMİ İLE; Sekansa spesifik oligonükleotid (SSO) prob
hibridizasyonu ile
HLA-I ve II tayini
AVANTAJLARI;
Sekansa özgü oligonukleotitler kullanılarak yapılır
Tüm lokusu içine alacak şekilde primer seçilir
Strip, tüp, çip (mikroarray), boncuk (luminex teknoloji)
Solid organ transp. da yeterli (böbrek, krc transp)
Çok sayıda örnekle çalışılabilir
Histo spot SSO (full otomatik)
SSO hibridizasyon deneyi
Sekans (dizi analizi) HLA Tiplemesi
PCR ile çoğaltılan HLA gen segmentinin
SEKANS CİHAZINDA, nükleotid dizi analizi yapılmaktadır
KULLANIM ALANLARI; Böbrek alıcısı gibi hızlı sonuç gerektiren
örneklerde
Denk olan vericilerin tespit edilebilmesi, diğer yöntemlerle elde edilen karmaşık sonuçların çözülmesi amacıyla sık kullanılmaktadır.
DNA Dizi Analizi
Aynı hastada Sekans Bazlı Tipleme(SBT)
ile
(HLA-B genotipi)
A lokusu SBT
Diğer Yöntemler
• SSCP (Single stranded conformational polymorphism)(PAGE))
• Pyrosequencing
• Ekzonükleazla released fluorescence gibi
IMMUNOGENETİK YÖNTEMLERİN SON YILLARDA KULLANIM ALANLARI
• Immunolojide son yıllarda önem kazanan Mikro RNA’lar(Mi RNA)
Post transkripsiyon döneminin regülatör proteinleri olarak ortaya çıkan çeşitli kanserlerin ve hastalıkların tanısında kullanılan küçük RNA parçacıklarıdır.
A)Mikro-RNA bazlı çalışmalar Mikro-RNA’nın direkt kantitatif tayinidir Mikro-RNA’nın klonlama tayinidir Mikro-RNA ekspresyon ölçümüdür
B)Immunolojide bioinformatik gelişmeler Immun genomik sistemlerin moleküler genetik bazlı sayısal
veri sunan analiz teknikleriyle bilgisayar ortamında ortaya konmasıdır
MiRNA Bazlı Çalışmalarda Kullanılan yöntemler
• Mikro array ve genom dizilimi
• Deep sequencing
• Quantatif Real Time -PCR
• Mikrodizi veri analizi