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1
Modèles structuraux et fonctionnels du site actif des hydrogénases [NiFe]:
de nouveaux catalyseursbio-inspirés pour la production d’hydrogène
Laboratoire de Chimie et Biochimie des Centres Redox BiologiquesCEA Grenoble
Yohan Oudart
Directeur de thèse: Pr. Marc FontecaveResponsable de thèse: Dr. Vincent Artero
28 septembre 2006
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2
Le pétrole comme source énergétique
� Réserves limitées
� Mauvaise répartition des ressources: tensions géopolitiques
� Hydrocarbures responsables de 75 % des émissions de CO2
� Effet de serre: + 0,5° C en 50 ans
�Recherche d’une altenative: gaz naturel, biocarburants, hydrogène
� 36 % de la consommation mondiale d’énergie
� Quasi monopole dans les transports
IntroductionI.a. Contexte
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3
L’économie de l’hydrogène comme vecteur énergétique
IntroductionI.a. Contexte
Application dans les transports
Applications mobiles
Applications stationnaires
ÉlectricitéP.A.C.Transport et stockage
Énergie (renouvelable ou nucléaire)
H2O
Biomasse H2
Hydrocarbures CO2
CO2
Énergie solaire
Application dans les transports
Applications mobiles
Applications stationnaires
ÉlectricitéP.A.C.Transport et stockage
Énergie (renouvelable ou nucléaire)
H2O
Biomasse H2
Hydrocarbures CO2
CO2
Énergie solaire
Application dans les transports
Applications mobiles
Applications stationnaires
Électricité
Application dans les transports
Applications mobiles
Applications stationnaires
ÉlectricitéP.A.C.Transport et stockage
Énergie (renouvelable ou nucléaire)
H2O
Biomasse H2
Hydrocarbures CO2
CO2
Énergie solaire
Transport et stockage
Transport et stockage
Énergie (renouvelable ou nucléaire)
H2O
Biomasse H2
Hydrocarbures CO2
CO2
Énergie solaire
Biomasse H2
Hydrocarbures CO2
CO2CO2
Énergie solaire
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4
Les piles à combustibles
� Principe:∆rG°= + 285 kJ/mol
� Fonctionnement:
IntroductionI.a. Contexte
H2OH2 + 1/2 O2
Polymer Electrolyte Membrane Fuel Cell (PEMFC)
� Problèmes de la production, du transport et du stockage de H2
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5
� Principe:∆rG°= - 285 kJ/mol
A la cathode, en milieu acide:
� Problème: coût du platine ou dépense énergétique importante:Au moins 3 x plus cher que le vaporéformage
Introduction
� Platine:
Réaction réversible à Eher = -420mV/ENH (H2O, 30°C, pH=7, 1 bar H2)
2H+ +2e- H2
I.b. La production d’hydrogène par électrolyse
H2O H2 + 1/2 O2
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6
2H+ + 2e- H2
� Réaction moins courante en catalyse homogène
-Paramètres importants pour l’activité inconnus
Introduction
� Solution : les hydrogénases ?
� Réaction d’her très connue en catalyse hétérogène
I.b. La production d’hydrogène par électrolyseD
ensi
téde
cou
rant
d’é
chan
ge /
A m
-2
Force de la liaison M-H / kJ.mol-1
her pour hydrogen evolution reaction
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7
� Catalyse d’une réaction simple mais difficile:
E= -400mV/ENH (30°C, pH=7, 0,1 bar H2)
Site actif supposé des hydrogénases à fer, forme oxydée
Site actif des hydrogénases [NiFe],forme réduite
Deux grandes classes d’hydrogénases:1� Des sites actifs originaux:
IntroductionI.c. Les hydrogénases
Volbeda et al., Dalton Trans. 2003
ω2
[NiFe]-H2ase de Allochromatum vinosum
adsorbé sur PGE
Jones et al., Chem. Commun. 2002
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8
X= H–, HOO–, HO–, …
� Différent états d’oxydation:
- Fer (+II)
- Nickel (+I), (+II) et/ou (+III)
� Cystéines du nickel: environnementtétraédrique distordu
Les hydrogénases [NiFe]
IntroductionI.c. Les hydrogénases
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9�Pas de modèles fonctionnels au début de ces travaux
Verhagen et al., Eur.J.Inorg.Chem. 2003Chalbot et al., Eur. J. Inorg. Chem. 2003
Li et al., J.Am.Chem.Soc. 2005 Sellmann et al., Angew.Chem.Int.Ed. 2004
IntroductionI.d. Les modèles structuraux du site actif
des hydrogénases [NiFe]
NiCys-S
S
S
Cys-SFe
CN
CNCO
Cys
CysSite actif des H2ases [NiFe]
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10
Introduction
Conception de catalyseurs en 3 étapes :
1. Synthèse de nouveaux complexes bio-inspirés
2. Caractérisations
3. Activité catalytique: la réduction des protons
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11
NiCys-S
S
S
Cys-SFe
CN
CNCO
Cys
CysSite actif des H2ases [NiFe]
Motif inspiré du site actif
Inspiré de la chimie deshydrures/catalyse d’hydrogénation
Motif {Ni(µ-SR)2M}
1. Synthèse de nouveaux complexes
1.a. Approche bio-inspirée
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12
NiCys-S
S
S
Cys-SFe
CN
CNCO
Cys
CysSite actif des H2ases [NiFe]
- Ligands soufrés du ruthénium:
- Complexes de ruthénium (II) utilisés en catalyse d’hydrogénation
[Ni(emi)]2- [Ni(xbsms)]
1. Synthèse de nouveaux complexes
1.a. Approche bio-inspirée
Ni(II)
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13
NiCys-S
S
S
Cys-SFe
CN
CNCO
Cys
CysSite actif des H2ases [NiFe]
� Rôle de la binucléarité: motif {M(µ-SR)2M}
� Rôle d’un site basique adjacent
� Synthèse et caractérisation de complexes inspirés du site actif des hydrogénases
Structure supposée du site actif des hydrogénases à fer
1. Synthèse de nouveaux complexes
Fe
S
Fe
S
OC CO
S
N
Fe
S
S
Fe
Fe
S
Fe
S
S
S
S
CN
C
O
NC
H
H
H
+
Fe
S
Fe
S
OC CO
S
NH
Fe
S
S
Fe
Fe
S
Fe
S
S
S
S
CN
C
O
NC
L
1.a. Approche bio-inspirée
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14
NiCys-S
S
S
Cys-SFe
CN
CNCO
Cys
CysSite actif des H2ases [NiFe]
Dérivés du [Ni(xbsms)]:
1. Synthèse de nouveaux complexes
1.b. Synthèses
S
S
S
SNi
RuCl Cl 2
Ru
Cl
S
S
S
SNi
S
S
S
SNi Ru
Cl
Cl
CO
CO
Ru(CO)2Cl2n
+
Oudart et al., Inorg. Chem., 2006
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15
NiCys-S
S
S
Cys-SFe
CN
CNCO
Cys
CysSite actif des H2ases [NiFe]
Rigidité en solution
x
x
JAB=12Hz
1. Synthèse de nouveaux complexes
1.b. Synthèses
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16
NiCys-S
S
S
Cys-SFe
CN
CNCO
Cys
CysSite actif des H2ases [NiFe]
Rigidité en solution
x
x
JAB=12Hz
1. Synthèse de nouveaux complexes
1.b. Synthèses
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17
NiCys-S
S
S
Cys-SFe
CN
CNCO
Cys
CysSite actif des H2ases [NiFe]
Dérivés du [Ni(emi)]2-:
1. Synthèse de nouveaux complexes
1.b. Synthèses
19001950200020502100
Longueur d’onde en cm-1
N
N S
SNi
O
O
RuCl Cl
2
RuCl
N
N S
S
Ni
O
O
N
N S
Ni
O
O
S
RuCO
Cl
Cl
CORu(CO)2Cl2
n
2-
-
2-
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18
NiCys-S
S
S
Cys-SFe
CN
CNCO
Cys
CysSite actif des H2ases [NiFe]
� Sonde Infrarouge
> > =
> > =
� Sonde RMN 1H
2. Caractérisations2.a. Caractérisations RMN et IR
Richesse en électrons des centres métalliques
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19
-2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5
RuI RuII
-2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5
� {Ru(CO)2Cl2} plus riche en électrons que {RuCl(p-cyméne)}+
2. Caractérisations2.b. Caractérisation électrochimique
E (en V)
E (en V)
RuI RuII
E (en V)
-2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5
RuI RuII
{Ni(SR)2}- {Ni(SR)2}
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20
-2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5
RuII � RuIII
ou {Ni(µ-S)2Ru} � {Ni(µ-S)2Ru} +
+0.8 V
2. Caractérisations2.c. Caractérisation électronique
E (en V)
1,81,922,12,22,32,4
1,972,022,07
RuI RuII
{Ni(SR)2}- {Ni(SR)2}
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21
3. La catalyse de réduction des protons3.a. Généralités
A + e- B A + e- BB + C D
Mécanisme EC électrocatalytiqueMécanisme E Mécanisme EC
A + e- BB + C D + A
E
i
E
i
E
i
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22
-2 -1 ,5 -1 -0 ,5 0 0 ,5 1
2H+ +2e- H2
-2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1� L’ her:
Platine
Carbone vitreux
3.La réduction des protons3.a.Généralités
E (en V)
DMF, Et3NHCl
2H+ +2e- H2
Surtension d’activation
-0,93 V
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23
-2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5-2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5-2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5-2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5
3,8 TON. s-1
2 e-
7,6 e-
R2 = 0,992
0
0,5
1
1,5
2
2,5
3
3,5
4
4,5
0 5 10 15Nombres d'équivalents d'acides
Fréqu
ence de cycle (s
-1)
3. La réduction des protons3.b. La voltampérométrie cyclique
�A 20 mv.s-1 et 10 équivalent d’Et3NHCl: Eher = -1,66 V
E (en V)
Et3NH+
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24-2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1
-2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1
-2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1
Effet de la binucléarité
� Synergie entre les complexes de nickel et de ruthénium: � Gain de 260 mV
3. La réduction des protons3.b. La voltampérométrie cyclique
E (en V)
Et3NH+
Et3NH+
Et3NH+
Eher= -1,83 V
Eher= -1,57V
Eher= -1,94 V
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25
Effet d’un site de protonation
� Diminution de la surtension d’activation
-2 -1,8 -1,6 -1,4 -1,2 -1 -0,8 -0,6 -0,4 -0,2 0
3. La réduction des protons3.b. La voltampérométrie cyclique
E (en V)
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26
0
20
40
60
80
100
120
140
160
180
0 2 4 6 8 10 12 14 16
Q (en C)
t (en h)
t2
t3
� Étude de la stabilité sur plusieurs heures
� Rendement faradique
� Détection de dihydrogène
50,5 TON
3.La réduction des protons3.c. L’électrolyse
Electrolyses à – 1,6 V dans le DMF
13, 5 TON
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27
0
5
10
15
20
25
30
35
40
0 1 2 3 4 5
0
5
10
15
20
25
30
35
40
0 1 2 3 4 5t (en h)
Nombre de TON
Electrolyses standardisées: -1,6 V dans DMF
Limite du transport de matière
NiCl2
Blanc
[Ni(xbsms)], [Ni(emi)]2-, [Ni(emi)Ru(CO)2Cl2]]
2-
3.La réduction des protons3.c. L’électrolyse
Limite du transport de matière
NiCl2
Blanc
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28
0
5
10
15
20
25
30
35
40
0 1 2 3 4 5t (en h)
�Effet coopératif entre les deux métaux: cinétique x 5: jusqu’à 6,4 TON /h
�{Ru(p-cymène)Cl}+ important pour la cinétique
3.La réduction des protons3.c. L’électrolyse
[Ni(xbsms)Ru(p-cymène)Cl]+,[Ni(emi) Ru(p-cymène)Cl]-
[Ni(xbsms)Ru(CO)2Cl2]]
[Ni(xbsms)], [Ni(emi)]2-, [Ni(emi)Ru(CO)2Cl2]]
2-
Limite du transport de matière
NiCl2
Blanc
Nombre de TON
Electrolyses standardisées: -1,6 V dans DMF
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29
0
1
2
3
4
5
6
7
-1,9-1,8-1,7-1,6-1,5-1,4-1,3
a)[Ni(emi)Ru(CO)2Cl2]2-
b)[Ni(emi)Ru(p-cymène)Cl]-
c) [Ni(xbsms)] d) [Ni(xbsms)Ru(CO)2Cl2] e)[Ni(xbsms)Ru(p-cymène)Cl]+
f) [Ni(emi)]2-
g) NiCl2
Eher (en V) vs. Ag/AgCl/KCl(3 éq et 100 mv/s)
TOF (en h-1)
b)
a)c)
e)
d)
f)
g)
3.La réduction des protons3.c.L’électrolyse
� Pas de corrélation entre Eher et vitesse catalytique
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30
-2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5
0 100 200 300 400 500 600 7000 100 200 300 400 500 600 7000 100 200 300 400 500 600 700
3. La réduction des protons3.d. Stabilité
E (en mV)
E (en V)
Après électrolyse
Avant électrolyse
Après 27 TON
80% du signal initial après 27 TON
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31
-2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1
- Mécanisme ECCE
[NiRu] [NiRu]-
[NiRu]+ [NiRuH]
+e-
+ H+
+e-
+ H+H2
3. La réduction des protons3.d. Mécanismes
E (en V)
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32
- Mécanisme CECE avec induction EC
3. La réduction des protons
E (en V) -2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5
3.e. Mécanismes
[NiRuL] [NiRuL]2-
[NiRuH]-
[NiRuH]+2e-
E°=-0,85V
[NiRu]-+ H+
+e-
+ H+
[NiRu] + H2
+e-
-L-
E°=-1,45VE°=-1,45V
k=7.108 mol-1.L.s-1
k=600 mol-1.L.s-1
[NiRuL] [NiRuL]2-
[NiRuH]-
[NiRuH]+2e-
[NiRu]-+ H+
+e-
+ H+
[NiRu] + H2
+e-
- L-
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33
Hydrogénase [NiFe] D.gigas Ni-SU
[Ni(emi)Ru(CO)2Cl2]2–
[Ni(xbsms)Ru(CO)2Cl2]
["C3S2"Ru(CO)2Cl2]
Eher (en V) vs. Ag/AgCl/KCl(3 éq et 100 mv/s)
Constante de force de la liaison CO (mdynes/Å)
� Richesse en électrons croissantes et surtension décroissante
Richesse en électron et Eher
3. La réduction des protons
15,2
15,4
15,6
15,8
16
16,2
16,4
16,6
16,8
17
-2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0
3.e. Mécanismes
![Page 34: Modèles structuraux et fonctionnels du site actif des … · 2014. 10. 4. · Ni Cys-S S S Cys-S Fe CN CN CO Cys Cys Site actif des H2ases [NiFe] Dérivés du [Ni(xbsms)]: 1. Synthèse](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022063011/5fc526ed9695db7c55538df1/html5/thumbnails/34.jpg)
34
-2,1
-2
-1,9
-1,8
-1,7
-1,6
-1,5
-1,4
-2,5 -2 -1,5 -1 -0,5 0 0,5 1 1,5
Surtension importante et complexes pauvres en
électrons
Surtension moyenne et complexes riches en
électrons
Charge du complexe
Eher (en V)
g)
h)
c)
a)
d)
f)
e)
b)a)[Ni(emi)Ru(CO)2Cl2]
2-
b)[Ni(emi)Ru(p-cymène)Cl]-
c) [Ni(xbsms)]
d) [Ni(xbsms)Ru(CO)2Cl2] e)[Ni(xbsms)Ru(p-cymène)Cl]+
f) ["C3S2"Ru(CO)2Cl2] g) ["C3S2"Ru(p-cymène)Cl]+
h) [Ni(emi)]2-
3. La réduction des protons
Richesse en électron et Eher
� Richesse en électrons croissantes et surtension décroissante
3.e. Mécanismes
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35
La protonation comme étape limitante
� Eher indépendant de la charge du complexe
� Linéarité entre TOF max et nombres d’équivalents d’acide c
� Simulation des voltampérogrammes de [Ni(xbsms)Ru(CO)2Cl2]
� Site basique proche du métal pouvant améliorer l’activité
3. La réduction des protons3.e. Mécanismes
R2 = 0,992
0
0,5
1
1,5
2
2,5
3
3,5
4
4,5
0 5 10 15Nombres d'équivalents d'acides
Fréqu
ence de cycle (s
-1)
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36
Comparaison avec d’autres composés:
3. La réduction des protons3.e. Discussion
Modèles H2ases à fer
Modèles [NiRu]
Eher vs Ag/AgCl
Platine
-0,4 V
-0,43 V
-0,5 V
-1,07 V
-1,95 V
-0,91 V-0,55 V
6 TON en 1h
25 TON en 0,2h
10,6 TON en 3h
100 TON en 2,5h
353 TON en 14 h
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37
Conclusion:
� Quatre nouveaux complexes nickel-ruthénium
� Quatre nouveaux complexes mononucléaires de ruthénium
� Premiers modèles fonctionnels catalytiques des hydrogénases [NiFe]
� Approche originale:
� Mise en évidence de paramètres importants pour l’her :
� Importance de la proximité de deux métaux: effet synergique
� Importance de la richesse électronique pour la diminutionde la surtension
� Importance du motif {Ru(p-cymène)Cl}+ pour la cinétique
� Mécanismes: la protonation comme étape limitante
� Importance de la proximité d’un site basique
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38
� Diversifier les ligands du ruthénium:
� Faciliter la protonation:
Perspectives
� Autres métaux:
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39
Remerciements:
Marc FontecaveVincent Artero
Tout le CB
Jacques Pécaut, Colette Lebrun
Dominique Marion
La montagne, Estelle et les amis