molekuláris interakciós ujjlenyomat
DESCRIPTION
Molekuláris interakciós ujjlenyomat. Málnási-Csizmadia András, Bikádi Zsolt, Hazai Eszter, Jelinek Balázs, Hári Péter, Simon Zoltán, Zhenhui Yang, Zahoránszky Gergely. A projekt áttekintése. Gyógyszerfejlesztés Nagyrészt szemiempirikus Ismert/természetes hatóanyag továbbfejlesztése - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
![Page 1: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/1.jpg)
Molekuláris interakciós ujjlenyomat
Málnási-Csizmadia András, Bikádi Zsolt, Hazai Eszter, Jelinek Balázs, Hári Péter, Simon Zoltán,
Zhenhui Yang, Zahoránszky Gergely
![Page 2: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/2.jpg)
A projekt áttekintése
•Gyógyszerfejlesztés
– Nagyrészt szemiempirikus• Ismert/természetes hatóanyag továbbfejlesztése• High Throughput Screening
– Pontos hatásmechanizmus nem ismert, és nem is kell az engedélyezéshez
– Mellékhatások• Több fehérjepartner• A gyógyszerjelölt molekula elvetését okozhatja• Költséges (egy gyógyszer fejlesztése több 100 millió USD)
![Page 3: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/3.jpg)
A projekt áttekintése
•Komplex szolgáltatás
A. Direct Similarity
B. ZMOL Similarity
C. Molecular Interaction Fingerprint
– Alkalmas gyógyszerjelölt molekulák többszintű szűrésére
• Szerkezetvizsgálat• Mellékhatás-vizsgálat
Straight et al, Science
![Page 4: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/4.jpg)
Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék
• Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán
Virtua Drug Kft.• Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter
DELTA Elektronik Kft.• Hári Péter, Akli Péter
eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont
• Dr. Szathmáry Eörs
Résztvevők, partnerek
![Page 5: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/5.jpg)
A projekt áttekintése
•Cél
Mellékhatás-predikció a bioinformatika eszközeivel
•Eszköz
Molekuláris dokkolás
Art Olson, TSRI
Dokkolási probléma: Két különálló molekula atomi koordinátáiból kiindulva hogyan adható meg kettejük komplexének szerkezete?
![Page 6: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/6.jpg)
A projekt áttekintése
![Page 7: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/7.jpg)
I. Adatgyűjtés, szelekció
![Page 8: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/8.jpg)
II - III. Előkészítés és dokkolás
![Page 9: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/9.jpg)
kcal/mol
8,5
2,5
0
-2,5
-4,5
Fehérjék
Ligandu
mo
k
Hasonló MIF
Hasonlókölcsönhatási partnerek
Hasonló hatások,Hasonló mellékhatások
IV. Az eredmények értékelése
MOLEKULÁRIS INTERAKCIÓS
UJJLENYOMAT (MIF)
Egyedileg jellemzi a kismolekulátKölcsönhatási partnerek előrejelzéseA fehérjekészlet diszkriminátor-felületként működik
![Page 10: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/10.jpg)
V. A szolgáltatás beindítása
![Page 11: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/11.jpg)
Összkép
![Page 12: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/12.jpg)
• Adatgyűjtés– Gyógyszermolekulák és fehérjék 100%– Mellékhatások 50%
• Előkészítés 100%
• Dokkolás 100%
• Értékelés 2007. március
• Szolgáltatás indítása 2007. december
Állapot, ütemterv
![Page 13: Molekuláris interakciós ujjlenyomat](https://reader035.vdocuments.pub/reader035/viewer/2022062217/56814f83550346895dbd38d3/html5/thumbnails/13.jpg)
Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék
• Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán
Virtua Drug Kft.• Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter
DELTA Elektronik Kft.• Hári Péter, Akli Péter
eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont
• Dr. Szathmáry Eörs
Résztvevők, partnerek