Inger LindströmProjektledare sjukvårdsintegrerad biobankning, Biobank Sverige

Maria JönssonBiomedicinsk analytiker, Klinisk kemi Lund

Johanna EkströmProcessteamledare Biobanksprocessen AMM Syd och Biobank Region Skåne

Nationell modell för

sjukvårdsintegrerad biobankning

– en resurs för forskning

Workshop SIB - Innehåll

Sjukvårdsintegrerad biobankning inom VR-BiS Inger

Nationell inventering av SIB

Beskrivning av SIB vid region Skåne och BD47 Maria & Johanna

Behov av nationell harmonisering av SIB Inger

Utmaningar för expansion och utveckling av SIB

Frågor och diskussion

Sjukvårdsintegrerad biobanking av vätskebaserade prover för forskning (SIB)

• Beställning och insamling av forskningsprover görs genom sjukvårdens befintliga rutiner

• Stora nationella forskningsstudier har efterfrågat och drivit på införandet av SIB

• Nationellt initiativ till gemensam modell för införande av SIB.

Sjukvårdsintegrerad biobanking av vätskebaserade prover för forskning (SIB)

Bild: Anna Beskow, Uppsala Biobank

.xml

.xml .csv

Fördelar med SIB

• Standardiserad hantering av forskningsprov från provtagning till infrysning medför spårbarhet, känd kvalitet och jämförbara prover oavsett provtagningstillfälle och provtagningsplats

• Införande av SIB över hela landet möjliggör för deltagande i forskningsstudier oavsett bostadsort

• SIB skapar förutsättningar för ett kvalitetssäkrat och kostnadseffektivt sätt att hantera prover för medicinsk forskning.

Uppsala

StockholmÖrebroKarlstad

Gävle

Umeå

Göteborg Linköping

Malmö

Helsingborg

Lund

Växjö

Karlskrona

Kristianstad

Sjukvårdsintegrerad biobankning

innan starten av SIB-Swelife projektet

dec 2015:

Totalt 17 st

2 st8 st7 st

Sjukvårdsintegrerad biobankningmars 2019:

Totalt 26 st10 st14 st2 st

Arbetar med införandet eller planerar att införa

sjukvårdsintegrerad biobanking under 2018/2019.

Sjukvårdsintegrerad biobankning införd

men saknar en eller fler av följande:

-automation (robot), LIMS och elektroniska remisser.

Sjukvårdsintegrerad biobankning införd

och inkluderar samtliga: -automation (robot), LIMS

och elektroniska remisser.

Införande av SIB

Införande av SIB har delfinansierats genom Swelife projekt ”Införande av sjukvårdsintegrerad biobankning” 2015-2020 på ett flertal platser.

Bild från Therese Fagerqvist, RBC Uppsala-Örebro

Insamling via SIB för biobankning

*Studieinformation från Stockholm saknas

< 10 aktiva multicenter studier under 2018, flera i uppstartsfas

0

10000

20000

30000

40000

50000

60000

0

10

20

30

40

50

60

Bio

ban

k No

rr

Up

psala B

iob

ank

Öreb

ro b

iob

ank

Stockh

olm

, SMB

*

BB

F, Linkö

pin

g

Bio

ban

k Väst

BD

47

, Lun

d

Insamling via SIB 2018

Singelcenter studier Multicenter studier Antal primärrör

Införande av SIB i nationellt perspektiv

• Införande av SIB har oftast anpassats till befintliga rutiner vid klinisk verksamhet vid mottagande sjukhus

• Införande av SIB har ofta skett i anslutning till stora multicenter-studier med behov av rutinbaserad provtagning

• För att underlätta start av multicenterstudier erbjuds rådgivning och stöd till forskare via ”Provservicekoordinatorer” med erfarenhet från biobanksområdet.

Provservicekoordinatorer - forskarstöd vid nationell insamling

Provservicekoordinatorer är verksamma vid biobanksfaciliteter i anslutning till universitet med medicinsk fakultet. PSK medfinansieras från respektive universitet.

Uppdraget för PSK

• Ge rådgivning och koordineringshjälp vid insamling av blodoch vätskebaserade prover vid uppstart av multicenterstudier

• Ge råd avseende provtyper och kvalitetsfrågor vid nyinsamling av biobanksprov

• Ge råd och hjälp med uttag av befintliga vätskebaserade prov

• Ge råd och information om tillgängliga analysplattformar.

Besök PSK-poster för mer information!

SIB i nationellt perspektiv (VR-BiS)

Nationell projektledare för sjukvårdsintegrerad biobankning inom VR-BiS projektet med uppdrag att

Inventera SIB nationellt för att identifiera delar i processen som skiljer mellan olika platser

Arbeta tillsammans med PSK gruppen och utförare för nationell harmonisering av processer för SIB

Tillsammans med utförare och användare arbeta fram förslag för expansion och fortsatt utveckling av modellen för SIB.

Inventering av SIB

Inventering av kartläggning av sjukvårdsintegrerad biobankning i Sverige med avseende på

Organisation av egen biobanksfacilitet, tex arbetsgrupp för SIB Rutiner för beställning av prover Rutiner för hantering av prover (insamling, förvaring, utplock) LIMS och IT Prissättning av service / användaravgifter Samarbeten / expansion inom sjukvårdsregionen Utvecklingsplaner för SIB

Inventering av SIB – blod & vätska

Standardprover / rör

Inventering av SIB – blod & vätska

”Udda” provtyper

Inventering av SIB – preanalytiska variabler

Norr/Umeå Uppsala ÖrebroSthlm

SMB/KULVäst/

GöteborgSydöstra/Linköping Syd/BD47

Beställning Papper e-remiss /BoS

e-remiss / E-remiss / Takecare

e-remiss / LabBest

e-remiss /RoS

Papper

Tid från arm till frys

1-2 h 2-4 h <4 h <2h, <10h, <24h, >24h

2-8 h 2-4 h 2 h

Centrifugering,standard

15 min1500g

7 min2400g

7 min2400g

10 min 2000g

10 min 2000g

10 min2000g

10 min2000g

Centrifugering,citratplasma

25 min2500g

20 min 2400g

20 min 2400g

15 min2000g

20 min 2500g

20 min 2500g

20 min2500g

Rör till förvaring FluidX /kryorör från VC

Micronic Micronic REMP REMP REMP / kryorör

REMP /kryorör

Transport av primärrör

Rörpost inom NUS

Rörpost inom sjukhus

<30 min, Inom sjukhus

Kylda. Serum& plasma

Bud från VC & Möndahl

Kylda inom regionen

Provtagning på sjukhus

Transport av alikvoteradeprover

-20C från VC 1g/v (Sofiabox)

-20C med Jumbolans

Nej Alikvoteringpå KUL-mottagning

Nej Nej Frusna plattor (torr-is )med temp.log

Sjukvårdsintegrerad biobankning vid

Region Skåne

Maria Jönsson

Biomedicinsk analytiker, Klinisk kemi och Farmakologi, Lund

Johanna Ekström

Processteamledare Biobanksprocessen AMM Syd och Biobank

Region Skånes biobank

• 35 st biobanksavdelningar utspridda över olika

förvaltningar

• BD47-servicefacilitet

-ca 100 olika forskningsprovsamlingar

-2 st vård- och behandlingsprovsamlingar

Sjukvårdsintegrerad biobankning

För mig:

• Alla prover som tas på sjukhuset och sparas

i en biobank.

• Provhanteringen kan vara manuell eller

automatisk.

Provtagning

Dokumentation är viktig så att prov

alltid kan spåras till provgivare

Biobanksremiss och prover- LUCAS

• Remiss med etiketter

att märka

ursprungsrör

• Serum

• EDTA

• STRECK

Lager av plattor

• 22 olika

provsamlingar

Prov till BD47

• 22 provsamlingar på REMP-plattor

- varav 7 är RCC syd ansvariga för

• 3 provsamlingar i kryorör.

Provsamlingar: Cancer

Regionalt Cancer Centrum Syd

• BioMel – melanom

• GUNNEL- gyn

• LUCAS- lung

• SARA- sarcom

• SCAN-B - bröst

• Uro-SCAN – urinblås

• VIOLA- lymfom

Provsamlingar till BD47

14 olika provsamlingar på REMP

plattor

Lokala provsamlingsansvariga inom

• Hjärt/lung

• Psykiatri

• Neurologi

Lokala Biobanker på sjukhuset

Infektion

• Sepsis

Onkologi

• Bröstcancer

Neurologi

• Minnessjukdomar

Multicenter

BD47

SweVAD- hjärtpump

KETECT

Andra biobanksavdelningar

MINSS – stora bukoperationer

TTM-2- hjärtstopp

ScanCLAD - lungtransplantationer

IMPACT – gravida preeklampsi

Infysning av rör

• EDTA

• PAX-Gene

• TEMPUS

• Urin

• Faces

Hantering- manuellt

• REMP

• Kryorör

Plasma/serum

Buffycoat

STRECKplasma

Liqvor

Ett set med plattor

• En ursrungsplatta

• En målplatta

• En serum

• En EDTAplasma

• Remiss

• Plattmall

• Serumplatta

-Käll och målplatta

• Plasmaplatta

• En etikett tas från

remissen för märkning av

plattmall.

CSP 8

Överföring mellan källplatta och

målplatta

Källplatta Målplatta frys

Före

Källplatta MålplattaEfter

Full platta

Excelfil med provdata som skickas till

BD47

LUCAS SC1954 217 1 1954002376B 2019-02-18 13:30 2019-02-18 14:20

LUCAS SC1954 217 2 1954001758B 2019-02-19 08:20 2019-02-19 09:20

LUCAS SC1954 217 3 1954001754B 2019-02-19 11:20 2019-02-19 12:55

LUCAS SC1954 217 4 1954001186B 2019-02-20 07:50 2019-02-20 09:15

LUCAS SC1954 217 5 1954002182A 2019-02-20 10:15 2019-02-20 11:50

LUCAS SC1954 217 6 1954002730A 2019-02-20 12:05 2019-02-20 13:30

LUCAS SC1954 217 7 1954001755B 2019-02-20 13:30 2019-02-20 15:00

LUCAS SC1954 217 8 1954002692A 2019-02-20 12:00 2019-02-20 15:25

LUCAS SC1954 217 9 1954002354B 2019-02-22 09:00 2019-02-22 10:05

LUCAS SC1954 217 10 1954002183A 2019-02-22 10:45 2019-02-22 11:50

LUCAS SC1954 217 11 1954002734A 2019-02-22 12:10 2019-02-22 13:35

LUCAS SC1954 217 12 1954002367B 2019-02-22 15:05 2019-02-22 15:40

LUCAS SC1954 218 1 1954002303A 2019-02-25 09:55 2019-02-25 10:10

LUCAS SC1954 218 2 1954002706A 2019-02-25 14:30 2019-02-25 16:00

LUCAS SC1954 218 3 1954002184A 2019-02-25 15:30 2019-02-25 16:55

LUCAS SC1954 218 4 1954002375B 2019-02-26 14:00 2019-02-26 15:30

LUCAS SC1954 218 5 1954002185A 2019-02-26 14:35 2019-02-26 15:40

LUCAS SC1954 218 6 1954002209B 2019-02-27 09:50 2019-02-27 10:45

LUCAS SC1954 218 7 1954002186A 2019-02-27 10:50 2019-02-27 12:20

LUCAS SC1954 218 8 1954002707A 2019-02-27 12:00 2019-02-27 13:10

LUCAS SC1954 218 9 1954002382B 2019-03-01 10:00 2019-03-01 10:50

LUCAS SC1954 218 10 1954002212B 2019-03-01 10:20 2019-03-01 11:30

LUCAS SC1954 218 11 1954002211B 2019-03-01 10:10 2019-03-01 11:30

LUCAS SC1954 218 12 1954002378B 2019-03-01 12:00 2019-03-01 13:15

Platta Pos. Ident. Provtagning Infrysning

Proven fryses i -80° på Klinisk kemi i väntan på

transport till biobanken

Temperaturen i transportlådan

monitoreras under hela transporten

Transport till biobanken på torris

Antal provsamlingar och prover

• Ca 50 olika provsamlingar

• 450 – 600 prover/månad

• 1-70 prov / provsamling och månad

• 1-9 ursprungsrör

• 1-40 alikvoter / provsamling

BD47-servicefacilitet

Södra Sverige Sjukhus som skickar prov till

förvaring på BD47

• Lund

• Malmö

• Kristianstad

• Helsingborg

• Halmstad

BD47

Medicon Village, Lund

• Ljungby

• Växjö

• Karlskrona

Regionservice transporterar

proven till Biobank

Biobank tar emot

och packar upp proven

Tidigare registrering av alla provsamlingar-nu endast ett fåtal

Accessdatabas

excelfiler

Registrering i webapplikation-för övriga studier i väntan på LIMS

Registrering i LIMS-LabVantage (SoftWarePoint)

Insamling av prov

Hantering av prov

Frysposition

endast MOS och SCAPIS 1-årsuppföljning

Uttagsfunktion i LIMSet

Inskanning av remp plattor-innan utskick till klinisk kemi

för alikvotering

Inskanning av REMP i webapplikationen

Koppling av provID med rörID

Majoriteten av forskningsprov förvaras i

temperaturövervakade -80°C frysar, eller i

-20°C frysrum

Vid BD47 förvaras ca 100 olika

provsamlingar varav insamling

pågår för ca 45 st

0

500000

1000000

1500000

2000000

2500000

3000000

3500000

4000000

4500000

5000000

2012 2013 2014 2015 2016 2017 2018

Antal prov tillhörande forskningsprovsamlingar

1211913265

26297

0

5000

10000

15000

20000

25000

30000

2016 2017 2018

Uttag från forskningsprovsamlingar

2018 inkom ca 300 000

alikvoter från ca 50 000

primärrör insamlade via

SIB

Prov från vård och behandlingsprovsamling

Klinisk mikrobiologi förvaras i frysrum (-20˚C)

Totalt > 3 miljonerUttag till VoB under 2018: 198 stUttag till forskning under 2018: 244 st

Vävnadsprov från vård och behandlings-

provsamling från klinisk patologi förvaras i

rumstemperatur

Totalt >13 miljoner klossarUttag till VoB under 2018: 861 stUttag till forskning under 2018: 5077 st

Vid BD47 utförs DNA extraktioner,…

Manuell extraktion

Robotiserad extraktion

…normeringar och urplock från

DNA-prov

Pipetteringsrobot

Olikheter mellan SIB noder

Provhantering Typer och volymer på primärrör Tid från provtagning till alikvotering och infrysning Tid och g-tal vid centrifugering av plasma och serum Rutiner för transport av prover Rör/plattor för infrysning av alikvoter Tining och omfrysning av alikvoter

LIMS och IT Registrering och hantering av information om prov Möjlighet att kommunicera via LIMS inom och mellan sjukvårdsregioner LIMS saknas vid mindre provtagningsenheter

Prissättning Uppstartskostnad Kostnad för insamling Kostnad för förvaring och utplock

Nationell harmonisering av SIB inom VR-BiS

• Nationell tjänstekatalog för SIB / blod och vätskebaserade proverArbete med nationell tjänstekatalog pågår inom PSK-gruppen

• Utvärdera om olikheter i preanalytisk provhantering påverkar analysresultat

Kvalitetsprojekt med Gunnel Tybring (f.d KI biobank) för att sammanställa manual ”Riktlinjer för preanalytisk hantering av blod och vätskebaserade prover inom sjukvårdsintegrerad biobankning”

• LIMS och IT system Kartlägga möjligheter till sjukvårdsregionala LIMS som stöd för SIB samt

utreda behov av kommunikation om prover mellan regionala LIMS

• Uttag och utplock vid multicenterstudierTa fram en nationell gemensam blankett för utplock från

olika noder

Utveckling och expansion av modellen för SIB

Förslag från befintliga verksamheter

SIB i nuläge infört på universitetssjukhus och några större sjukhus. Ej behov av automation för SIB vid mindre sjukhus och vårdcentraler

Introducera ”mobila SIB-kit” för att erbjuda möjlighet till provtagning vid mindre sjukhus och vårdcentraler vid enstaka studier

Möjlighet till provtagning via mobila enheter, t.ex. blodbussar

Flera förslag?

Utmaningar för expansion och utveckling av SIB- varierar över landet

Låg prioritet från huvudmän för investeringar av utrustning och tilldelning av resurser för införande och utveckling av SIB

Geografi – långa avstånd och få patienter i delar av Sverige

Önskemål om nya och udda prov/rörtyper från forskare för insamling via SIB

Låg efterfrågan från forskare

Andra faktorer ………

Tack

till alla som varit med och bidragit till SIB inventeringen och till alla Provservicekoordinatorer

Frågor?

Besök SIB poster!

http://etc.ch/pPLA

Några SIB frågor