医用画像処理学(1)...

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医用画像処理学(1) 総論と基本概念(1) (教科書pp.1-14) 有村秀孝

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医用画像処理学(1)

総論と基本概念(1)

(教科書pp.1-14)

有村秀孝

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●画像を見やすくするため

=> 人間の視覚機能の拡大

例:画質改善(ノイズ除去、エッジ強調処理、対象物強調)

●画像の中から有益な情報を引き出すため

=> 視覚機能の代行

例:パターン認識技術などを用いて、専門家(医師)の診断支援を行う。

●分かり易く見せるため

=>視覚機能に訴える

例:診断しやすい3次元表示。ボリュームレンダリング。MIP処理。

医用画像処理の目的

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放射線治療における医用画像処理の目的

3

患者体内の情報の可視化

形態と機能,線量分布,患者セットアップ,腫瘍

有効な情報の抽出

DVH(dose volume histogram),腫瘍位置

分かり易くみせるためのアプローチ

治療計画,Beam’s eye view,3次元サーフィスレンダリング

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医用画像処理学体系と放射線治療

イメージング技術

医用画像

(治療計画CT, kV-CT,

MV-CT, MR, PET, SPECT, EPIDなど)

画像変換

位置合わせのレジストレー

ション,治療計画フュージョ

ン,ポータル線量画像

【等方ボクセル化,レジスト

レーション,フュージョン,ピ

クセル値線量変換】

領域抽出

GTV,CTV,OAR抽出,治療

計画正常組織領域抽出,解

剖学的な部位決め

【対象物強調, ニ値化処理,

領域抽出】

パターン認識

腫瘍位置決め,動画像解析,

解剖学的な部位決め

【ヒストグラム解析,テンプ

レートマッチング,レジスト

レーション,オプティカルフ

ロー】

コンピュータグラフィックス

治療計画,シミュレーション,

線量分布表示 【レンダリング,

モデリング】

4D-CT,CBCT,MV-X

線,kV-X線撮像,

PET/CT, MR/CT

4

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画像石 (不老不死の神 西王母、中国、東京国立博物館)

どちらが見やすい画像か?

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なに?

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ん?

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おおお! (でも,なぜ?言えることは?)

例:見方を変えると見たいものが見えてくる(画像処理の効果)

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階調変換

明るさとコントラスト(明るさの差)を変えることができます

ディジタル値

明るい

暗い

輝度

C1

D

明るい

暗い

ディジタル値

輝度

C2

D

暗い、低コントラスト 明るい、高コントラスト

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画像のパターン認識

「見たもの(画像)」を「記憶」の中にある「意味のあるパターン」

に対応づけをし、見たものを認識する処理

良性 悪性

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Original image

Dot-enhanced image

Enhanced

aneurysm

Effect of Dot-Enhancement Filter

Aneurysm

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動脈瘤

3次元MR画像における脳動脈瘤の検出

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医療では、、、

X線写真フィルム健在というのは,今は昔。

しかし、CR (computed radiography), フラットパネルディテクター(flat panel detector;

FPD)などのディジタル画像検出器に移行しつつある。フィルムレス化。

画像処理の利点

現在は、○

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画像の種類

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画像処理技術

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ディジタル化 (サンプリングと量子化)

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

(サンプリングを行う方向)

音階

または

濃淡

アナログ値

ディジタル値

0

1

2

3

4

5 (量子化を行う方向)

時間 または 距離

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あるアナログ信号(ある物理量)をサンプリング(標本化)し,量子化することに

よってディジタル化が行われる.

サンプリング

あるアナログ信号(例:脳波,X線エネルギー分布)を一定間隔(時間または空間)で測定

すること。一定時間または空間間隔をサンプリング間隔という。サンプリング間隔はサン

プリング定理に従って決める。

量子化

各サンプリング点のアナログ値(測定値)を,一定間隔で分割された有限個のレベル(例

:8ビットなら0から255までの256段階のレベル)の何処かに割り当てること.analog-

to-digital (A/D)変換に相当する.

ディジタル化

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ビット (bit) :ほとんどのデジタルコンピュータが扱うデータの最小単位.binary

digit (2進数字)の略.2進数の1桁で,2通りの状態を,“0”と“1”で表記される.

問題:10進数の0から15までを16進数と2進数で表しなさい.

コンピュータで扱う情報量の単位

10進数 16進数 2進数(4 bits)

0 0 0000

1 1 0001

2 2 0010

3 3 0011

4 4 0100

5 5 0101

6 6 0110

7 7 0111

8 8 1000

9 9 1001

10 A 1010

11 B 1011

12 C 1100

13 D 1101

14 E 1110

15 F 1111

8ビット=1バイト(Byte)

1024バイト=1 KB

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アナログ値

アナログ信号

x1 x2 x3 x4 x5 x6 x7

10進 2進

(3) 11 (2) 10 (1) 01 (0) 00

0 1 2 3

Δx=xi-xi-1:サンプリング間隔

量子化テーブル

ディジタル値

アナログ値

時間または距離

次のアナログ信号を量子化テーブルを使って量子化しなさい

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アナログ値

アナログ信号

x1 x2 x3 x4 x5 x6 x7

10進 2進

(3) 11 (2) 10 (1) 01 (0) 00

0 1 2 3

Δx=xi-xi-1:サンプリング間隔

量子化テーブル

ディジタル値

アナログ値

時間または距離

答え

ディジタル

アナログ信号

x1 x2 x3 x4 x5 x6 x7

11

10

01

00

ディジタル信号

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連続関数f( x) (x線写真、心電図 ) が持つ最高周波数がUであるとき、またはU以下に

帯域制限されているとき,Δx<1/(2U)となる△xでf(x)をサンプリングするとf(x)に含ま

れる全ての情報は保存される。

サンプリング周波数:1/(Δx)=fs

ナイキスト周波数:1/(2Δx)=fs/2

サンプリング間隔,サンプリング周期:Δx

サンプリング定理

f x fm

2U

sinc x

m

2U

m

sinc x sin( x)

xシンク関数

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22

)1(}sin(cos({2

)(

1

0

    

tnbtnaa

tf n

n

n

a0, an, bnを求め、上記式を使って、連続信号f(t)を単純な波で表現することをフーリエ級数展開と言います。偶関数と奇関数のフーリエ級数はそれぞれcos波(余弦波)またはsin波(正弦波)だけで表現される。不連続点を持つ関数のフーリエ級数では、Gibbs現象が生じる。

フーリエ係数(Fourier coefficients) の求め方

T

dttfT

a0

0 )(1

T

n dttntfT

a0

)cos()(2

T

n dttntfT

b0

)sin()(2

連続信号の周期をTとすると、フーリエ係数を次式を使って求めることができる。

(2)

(3)

(4)

anとbnは、nで決まる 周波数のcosとsinの 振幅です。cos波とsin波の直交性(orthogonality)を利用したテンプレートマッチング。

a0は、波の平均値です。

フーリエ級数展開(Fourier series expansion)の概念 周期的な連続信号(周期関数)は、基本(角)周波数(最低周波数)をω として、その整数倍

(integral multiple)の周波数の多くの単純な波(sin波, cos波)を足し合わさることによって、表現

できる。

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フーリエ級数展開の概念

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24

フーリエ変換(Fourier transform)

dxxixfF e )((

dxiFxf e)(

2

1(

フーリエ変換:絶対可積分 (absolutely integrable) の任意の関数(非周期でもOK)に対して、それぞれの(連続)周波数に対する振幅を求めることができる。実空間の関数から周波数空間の関数に変換。

フーリエ逆変換(Fourier inverse transform):フーリエ級数展開の拡張(Extended Fourier

series expansion)。任意の関数(arbitrary function)は、単純な波

exp(iωx)=cos(ωx)+isin(ωx)で表現できる。周波数空間の関数を実空間の関数に逆変換

できる。

DFT(discrete Fourier transform; 離散フーリエ変換):実際にフーリエ変換をコンピュータで計算するときに用いる。サンプリングしたディジタル信号に適用する。周期関数を仮定。したがって、フーリエ変換後も周期関数となる。DFTの高速な計算アルゴリズムはFFT(fast Fourier

transform)。

1

0

2N

n

knN

i

nk efF

1

0

21 N

k

knN

i

kn eFN

f

フーリエ変換

フーリエ逆変換

DTF

逆DFT

フーリエ変換 任意の関数 周波数ごとに分解される

A prism splits

visible light into

the colors of

the spectrum.

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25

フーリエ変換の例

||( xaexf 22

2)(

a

aF

)|(|2

1( dx

dxf    )(sin

)sin()( dc

d

dF

)(( xxf 1)( F

d -d

f(x)

1/(2d)

x

f(x) F(ω)

ω

-2π/d -π/d

π/d

2π/d

ω

FT

FT

FT

δ(x)

ω

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26

画像のフーリエ変換

● ガウス関数のフーリエ変換はガウス関数となる。

フーリエ変換の例(つづき)

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27

フーリエ変換の応用

dxxfxf

T)()(

1)(

自己相関関数(autocorrelation function) パワースペクトル

2|(|1

)( FT

P

dFdxxf 2

2

12 |(||)(|

パーシバルの定理

実空間でのエネルギーと周波数空間でのエネルギーは等しい。

ウイナーヒンチンの定理

自己相関関数φ(τ)とパワースペクトルP(ω)はフーリエ変換対の関係にある。

diP e)((

dieP()(

FT

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28

畳込み積分と線形システム

dxhfxhxf )()()()(

関数f(x)とh(x)との畳込み積分(convolution)

τ:x方向の移動量

線形システム

PSF

h(x)

f(x) g(x)

線形システムの条件 )]([)( xfLxg

)()()]()([ 22112211 xgaxgaxfaxfaL 加法性:

)()]([ xgxfL定常性:

)()()( HFG )()()( xhxfxg

線形システム応答を畳込み積分で表現

ここで、f(x)としてインパルス(δ関数)を入力すると、出力はG(ω)=H(ω)となり、システム伝達関数(周波数応答関数) H(ω)が求められる。画像の分野では、

H(ωはMTF(modulation transfer function)と呼ばれ、h(x)は点広がり関数(point spread function)と呼ばれる。

FT

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畳みこみ積分の例

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MTFの概念

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31

画像処理におけるフィルタ処理(畳込み積分)

h1 h2 h3

h4 h5 h6

h7 h8 h9

f1 f2 f3

f4 f5 f6

f7 f8 f9

ghfhfi

i i

9

1

10

フィルタh

入力画像f

g

出力画像g

Laplacianフィルタ(二階微分;second order differential) Sobelフィルタ(x方向)

Prewittフィルタ(x方向) 平均化フィルタ

1/9 1/9 1/9

1/9 1/9 1/9

1/9 1/9 1/9

-1 0 1

-1 0 1

-1 0 1

-1 0 1

-2 0 2

-1 0 1

1 1 1

1 -8 1

1 1 1

0 1 0

1 -4 1

0 1 0

8近傍 4近傍

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エリアシングエラー

Δxでサンプリングすると,サンプリング周波

数は1/Δx=fs.

ナイキスト周波数:fsでサンプリングしたとき

の再現される最高周波数

1/(2Δx)=fs/2

信号の最高周波数U < 1/(2Δx)ならば

エリアシングエラーは起こらない.

実空間 周波数空間

標本化関数

重なったところでエリアシングエラーが起こる

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(問1)下の信号をサンプリングする場合、サンプリング間隔を幾らより小さくするべきか?

0 20 40 60 80 (msec)

(問2)信号の周波数域20Hz~80kHz → サンプリング間隔は? (問3)2進数11111111をD / A変換したところ2.55Vになった。 このD / A変換器で00000010を変換すると何Vが出力されるか? (問4)人間の耳は20kHzの音が可聴域の上限(最高周波数)だと言われています。 ここで、ある歌手(アーティスト?)の4分間 の曲を適切にサンプリングし、それぞれのサンプリング点を16ビットで量子化したディジタルの曲をCDに記録することを考えます。この曲には最低何キロバイト必要でしょうか?

練習問題

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U =T

1 =

40

1 △x<

2・40

1 = 20(ms)

△x<2u

1

解答

(問1)

6.3×10-6より小さい

より (問2)

28―1=255(10)

255

2.55 = 0.01  0.01×2=0.02(v)

(問3)

6

53103.6

106.1

1

10802

1

x

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310*20*2

1

310*20*2

1

60*4

kB192002*

10*20*2

1

60*4

3

(問4)人間の耳は20kHzまでしか聞こえないので、曲の最高周波数を20kHzとします。したがって、サンプリング間隔は、

1個のサンプリング点のデータ量は16ビットなので、2バイト。したがって、全体のデータ量は

解答

4分の曲をこのサンプリング間隔でサンプリングすると、サンプリング点数は

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x4 x3 x2 x1

y1

y2

y3

y4

z1 z2 z3

z4

求めたい点:

(x0,y0,z0)

サンプリング定理の応用

ーSinc関数近似による補間法を用いた等方ボクセル変換

(isovoxel transformation)ー

)(sinc)(sinc)(sinc,,,, 000000 zzyyxxzyxfzyxfx y z

(H20年度卒研生中村君作成)

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Sinc関数

3次近似(third order approximation)

Sinc補間による等方ボクセル化

Ux

Uxx

2

2sin)sinc(

x

xxxx

xxx

x

20

21584

1021

)sinc(32

32

(H20年度卒研生中村君作成)

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Sinc補間と線形補間の結果

(a) Original (b) Cubic - Linear

(c) Cubic Interpolation (d) Linear Interpolation

(H20年度卒研生中村君作成)

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ディジタル化 (サンプリングと量子化)

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ディジタル化

ディジタルとは、状態を示す量を数値化して処理(取得、蓄積、加工、伝送など)を行う方式

アナログが「坂道」で、ディジタルが「階段」。

つまり、アナログはなめらかで、ディジタルはガタガタです。

アナログ写真の濃淡の種類は無限、しかし、ディジカメでは、たったの256種類!

だから、CMで「ディジタルだから、画像がきれい」というのはおかしい。

ただし、劣化に強い。

ディジタル画像だと,思い出は色あせない...色あせた方が良い思い出もある?

ディジタルデータは、基本的には、0と1を使って表現されます。

たとえば、音楽CDなら、「穴が有る」なら「1」で、「穴が無い」なら「0」という感じです。

ディジタル人間は白黒はっきりを好む。合理的、論理的。

アナログ人間はグレーなところ、曖昧さを好む。感覚的、感情的。

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X線エネルギー分布

FPD

X線光子->電子・正孔対->ディジタル化

ディジタル画像

ディジタル画像

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画像の標本化と画素

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X線画像作成(撮影)

骨 血管 肺 空気

白 白っぽい 灰色 黒

筋肉

X線

X

線検出器

被写体

X線

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Flat Panel Detector (医療用ディジタル画像検出器)

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Flat Panel Detector (医療用ディジタル画像検出器)

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Flat Panel Detector (医療用ディジタル画像検出器)

間接変換方式と直接変換

方式とで、どちらがぼけの

少ない画像になるか?

間接変換方式

直接変換方式

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ボケが有る

低画質な画像 FT

δ(x)

F T 高画質な画像 1

高周波数成分が少ない

高周波数成分が多い

ボケが無い

間接変換方式

直接変換方式

X線->光

X線->電子

距離 周波数

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サンプリングの効果

画像の場合、一定距離間隔をピクセルと言います。

どの程度まで細かいところが見えるか(空間の解像度)が決まります。

例えば、肋骨(1.6cmくらい)が見えるかどうか。ピクセルサイズ8mmではぎりぎり見えるが、32mmでは見えなくなる。

256 x 256

細かい間隔

256 ピクセル x 2 mm

16 x 16

粗い間隔

16ピクセル x 32 mm

64 x 64

64 ピクセル x 8 mm

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ディジタル画像 (量子化)

量子化ビット数が多いほど、多くの階調数を表現できる

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濃淡の種類の数=

256 (8ビット)

細かい濃淡

濃淡の種類の数=

16 (4ビット)

濃淡の種類の数=

4 (2ビット)

粗い濃淡

量子化の効果

量子化によって、濃淡の種類の数が決まります

例えば、低いコントラストの肋骨が見えるかどうか。2ビット画像では濃淡の種類が4つしかないので、ほとんど見えなくなる。