InstItut de GénétIque et de BIoloGIe MoléculaIre et cellulaIre

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OUTILS  :    PARTIE  PRATIQUE  

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PlateForMe Exercice  BLAST  

•  Quel  est  la  localisa4on  génomique  de  BBS1?  –  Séquence  protéique:  

•  Recherche  de  la  séquence  protéique  BBS1  dans  les  archives  du  génome  humain  août  2010.  –  hEp://www-­‐bio3d-­‐igbmc.u-­‐strasbg.fr/~jmuller/enseignement.html  –  hEp://www.ensembl.org/info/website/archives/index.html  

– TBLASTN  sur  le  génome  humain  

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Est-­‐ce  que  le  chromosome  9  est  la  bonne  localisa?on?  

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Localisa?on  sur  le  chromosome  11  

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PlateForMe Alignement  vs  génome  

Plusieurs  HSP  100%  ID  E-­‐value  plus  élevée  car  calculée  sur  le  chromosome  en  en4er  

1  ou  2  HSP  >80%  ID  E-­‐value  plus  faible  car  alignement  en  un  seul  bloc  

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Est-­‐ce  bien  le  gène  BBS1?  

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