pengantar bioinformatika
TRANSCRIPT
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
1/22
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
2/22
WHAT IS BIOINFORMATICS?
TI: The use of computer technology to collect, analyze, and interpretbiological information at the molecular level/ Molecular Biology /
Biotechnology BIOLOGI: The mathematical, statistical and computing methods that aim to
solve biological problems using DNA and amino acid sequences andrelated information."
A set of software tools for molecular sequence analysis
Ilmu yang mengaplikasikan teknologi informatika yaitu teknologi komputasidan komunikasi terutama internet pada ilmu biologi
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
3/22
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
4/22
BIOINFORMATIKA vs BIOLOGI
KOMPUTASI
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
5/22
HISTORY
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
6/22
DAYHOFF
Dr. Margaret Oakley Dayhoff (1925-1983)pionir
dalam penggunaan komputasi di bidang kimia dan
biologi
Dianggap sebagai salah satu penemu
Bioinformatics 1961Membuat alat untuk membantu
menentukan sekuen asam amino dengan
overlapping sekuen asam amino (Point Accepted
Mutation).
Inisiator "Atlas of Protein Sequence and Structure"
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
7/22
NEEDLEMAN WUNSCH
NeedlemanWunsch melakukan Global
Alignment terhadap 2 sekuen
Algoritma ini diusulkan oleh Saul Needleman
and Christian Wunsch yang dipublikasikan pada
artikelA general method applicable to the
search for similarities in the amino acid
sequence of two proteins, J Mol Biol. 48(3):443-53.
Untuk sekuen protein dan nukleotida
Dynamic programming, aplikasi pertama
perbandingan (comparing) sekuen biologi
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
8/22
STADEN
Dikembangkan oleh Rodger Staden di Cambridge, Inggris
Sequence Data Handling by Computer
Metode komputerisasi untuk penyimpanan (storage), editing dan analisis sekuenDNA dan asam amino
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
9/22
GENBANK OLEH NIH
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
10/22
NCBINATIONAL CENTER BIOTECHNOLOGY INFORMATION
Computerized information processing methods for the conduct of biomedicalresearch
www.ncbi.nlm.nih.gov
Division of the National Library of Medicine (NLM) at the National Institutes of Health(NIH).
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
11/22
EMBNET NETWORK
Since its creation in 1988, EMBnet has evolved from an informalnetwork of individuals in charge of maintaining biological
databases into the only organization world-wide bringing
bioinformatics professionals to work together to serve the
expanding fields of genetics and molecular biology.
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
12/22
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
13/22
EMBL-EBI
European Molecular Biology Laboratory EBI (European Bioinformatic Institute)
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
14/22
FIRST BACTERIAL GENOME
Haemophilus influenzae: 1380 kb
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
15/22
HUMAN GENOME PROJECT (HGP)
3 milyar pasang basa =
2.0 1013meters
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
16/22
LI
STOFURL
S
FORS
EQ
UENCE
DATABASE
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
17/22
Pemanfaatan Bioinformatika
mengungkap bagaimana kode genetikditerjemahkan untuk membentuk komponenmakhluk hidup (manusia, hewan, tumbuhan,mikrobia, virus) ?
memprediksi fungsi gen
melacak letak kerusakan gen yangmengakibatkan penyakit genetik
menelusuri evolusi biologi dari organisme mencari kesamaan genetik di antara
berbagai macam organisme
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
18/22
Pemanfaatan Bioinformatika
membantu identifikasi DNA dalam forensik menyempurnakan diagnosa penyakit dan
terapi gen
membantu perancangan obat baru
memperlancar proyek pemetaan fungsionalgenome manusia (Human Genome Project)sehingga selesai 2 tahun lebih awal
memudahkan kegiatan rekayasa genetika
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
19/22
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
20/22
MOLECULAR AND MEDICAL RESEARCH
LIPI
BIOTEKNOLOGI
http://www.lipi.go.id
BIOFARMAhttp://www.biofarma.co.id
EIJKMAN
http://www.eijkman.go.id
BIOTROPhttp://www.biotrop.org
RSHS - Patologi
http://www.rshs.or.id
BPPThttp://www.bppt.go.id
BB BIOGEN
biogen.litbang.deptan.go.id
UNIVERSITASSANBEFARMA
SCI (Stem Cell & Cancer
Institute)
KALBEFARMA
MOCHTAR RIYADI RESEARCH
CENTER - SINGAPORE
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
21/22
INDUSTRI
(Charon Pokhpan- CPB) Udang
(Astra Agro Lestari) Kelapa sawit
(Bisi International) Jagung
(EWINDO) Bibit Sayur Mayur
(LONSUM) Kelapa Sawit
POLICE DEPARTEMENT
Fingerprintmolecular identification
-
8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA
22/22