post source decay : psd とは?
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Post Source Decay : PSD とは?. ポストソース分解( Post Source Decay; PSD )は、 MALDI-TOF-MS で、レーザー照射後に生成したイオンが、 イオン源の加速電場を出た後 の Drift Space (無電場領域)で、 イオン自身 の過剰な内部エネルギーまたは残留ガスとの衝突によって 励起分解 する現象である。. イオン源. +. +. +. +. +. +. +. +. +. PSD イオン. Drift Space. PSD では、リフレクターモードで測定する理由. PSD が起きたとして・・・. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
Post Source Decay : PSD とは?
ポストソース分解( Post Source Decay; PSD )は、 MALDI-TOF-MS で、レーザー照射後に生成したイオンが、イオン源の加速電場を出た後の Drift Space (無電場領域)で、イオン自身の過剰な内部エネルギーまたは残留ガスとの衝突によって励起分解する現象である。
イオン源
+
Drift Space
PSD イオン
+
+
+
+
+ + + +
PSD では、リフレクターモードで測定する理由
++
+
+
+ + +
+
+
+
+
+
Drift Space
PSD が起きたとして・・・
飛んでいる間に分解していくので、各イオンの運動エネルギーはバラバラ。
(イオン化したときに、全てのイオンが同じ場所で、同じ速度で飛んでいる訳ではない。)
このまま、例えば、リニアモードで測定すると、同じ質量のイオンでも、バラバラに検出器に到達するので、分解能が悪くなる。
分解能を上げるため、イオンの運動エネルギーのバラツキの補正をする必要がある。
たくさんの電極を並べて、電場勾配をつくるイオン反射器を使うと、イオンの運動エネルギーのバラツキを打ち消すことができる。
高圧電源
++
運動エネルギーが大きいイオンは速いので、反射器に先に到着して、反射電場に逆らって奥まで入り込み、遠回りしてはね返る。運動エネルギーが小さいイオンは遅く到着するが、奥まで入れず近道をしてはね返る。
はね返ってきたイオンを検出することで、運動エネルギーのバラツキを揃える事ができるので、同じ質量電荷比を持つイオンを揃えて検出でき、分解能が上がる。
よって、 PSD では、イオン反射器を備えたリフレクターモードで解析を行う。
De novo sequencing とは、ペプチドの MS/MS スペクトルから、数学的演算によりアミノ酸配列を算出する技術のことをいう。 De novo はラテン語で、「初めから、新たに」を意味する。各アミノ酸のペプチド結合部分で順次切断された( y or b イオン)一連のプロダクトイオンピークが検出されたスペクトルが得られれば、ピーク間の質量差がアミノ酸残基質量に相当するので、演算により推定アミノ酸配列を決定できる可能性が高くなる。
De novo sequencing とは?
・・ Q N A G F
m/z
Q N A G F
y1y2y3y4
y1
y2
y3
y4
このように表されるはず
イオン化した
よって、ピーク間の質量差より元のアミノ酸配列を決定できる。 ( De novo sequencing )
F G A N ・・
・・
y5Q
y5
例えば、右のようなペプチドを考えてみる
解析する際、 1 残基アミノ酸、測定時に生じるその誘導体、2 残基アミノ酸などのモノアイソトピック質量 で、質量が非常に近接したものを考慮する必要がある。例えば、ピーク間の質量差が 147.0 だった場合、この質量差に相当するアミノ酸残基は F ( Phenylalanine )であるという予想がされがちであるが、実際は、 147.068であれば F であるが、 147.035であれば Met-O ( Methionine の酸化物)となる。これを識別するためには、小数点以下の桁数をより多く読み取れる高質量精度( Q-TOF型の質量分析装置による)のスペクトルを得ることが必要となる。
De novo sequencing の注意点
モノアイソトピック質量
Lys ( K )= 128.0949Gln ( Q )= 128.0585
⊿= 0.0364
Trp ( W )= 186.0793AD( GE)= 186.0640
1 残基アミノ酸と 2 残基アミノ酸1 残基アミノ酸同士
⊿= 0.0153 etc・・・・
PSD ( MS/MS 解析)で De novo sequencing
++ +
+
イオン化
m/zm1 m2 m3
特定イオンの選択
励起分解
m/zm1
+
+
++
+
+ ++
m1m/z
PSD イオン
PSD イオンの中からy or bイオンを探し、y1、y2、y3、・・・・・と各々のピークの差から順々に並べると、元の m1 のアミノ酸配列を決定することができる。
ただし、一般に PSD スペクトルには、通常の生成イオンの他に脱アンモニアや、脱 H2O などの分解物のピークも観測され、分解が進みすぎて解析が困難になることも多いと言われている。
検出器
イオン化していない分解産物は反射しない
リフレクター