potensi tanaman endemik sumatera utara...
TRANSCRIPT
POTENSI TANAMAN ENDEMIK
SUMATERA UTARA
SEBAGAI ANTIVIRAL COVID-19
DAN CARA SKRININGNYA
Dr. Diky Setya Diningrat
Diskusi Ilmiah Online ke-6 HPPBI Pusat
15 Juni 2020
http://hppbi.or.id
Tanaman Endemik Sumatera UtaraDikembangkan Peneliti UNIMED
Andaliman
Zanthoxylum acanthopodium
Family : Rutaceae
Genus : Zanthoxylum
Jamblang
Sygyzium cumini (L.) Skeels
Famili: Myrtaceae
Genus: Syzygium
Hanjeli
Coix lacryima-jobi
Family: Poaceae
Genus: Coix
Buasbuas
Premna pubescens
Famili: Lamiaceae
Genus: Premna
http://hppbi.or.id
Pemanfaatan Tanaman Berkhasiat
Obat di Indonesia
100 Top Tanaman Obat Indonesia,
Kemenkes RI, 2011
http://hppbi.or.id
Metabolit Sekunder
Obat, pewarna contoh Aspirin, salicylate dll
Industri Farmasi 01
Bumbu penyedap rasa
Flavour 02
minyak wangi, perona wajah dll
Cosmetics 03
Antimikroba, Bioinsektisida, Biofungisida, obat tradisional
Biocidal 04
http://hppbi.or.id
Sulit ditemukan dipasar ---> baru ±15% dari spesies
tanaman yang sudah diisolasi
Umumnya struktur lebih kompleks ---> sulit disintesis
Konsentrasi kecil dan persediaan terbatas
Tidak berperan penting dalam metabolisme primer
tapi untuk kelangsungan hidup dihabitatnya (peran
ekologi)
Disintesa pada sel tertentu dan pada group
taksonomi
tertentu
Disintesa pada tingkat pertumbuhan tertentu atau
adanya stressMetabolit Sekunder
FUNGSI DALAM TANAMAN
• Antraktan untuk
serangga/hewan lainnya :
polinasi
• Melindungi dari stress
lingkungan
• Mekanisme pertahanan dari
serangan hama, penyakit,
herbivora,molusca & vertebrata
(phytoalexins)
• Zat pengatur tumbuh
• Meningkatkan kemampuan
tanaman dalam bersaing
dengan tanaman lain (alelopati)
mis : monoterpenoid
• Penyimpan & sistim transport
nitrogen
• Proteksi terhadap ultra violet
http://hppbi.or.id
Strategi Meningkatkan Akumulasi Metabolit Sekunder
Seleksi gen yang berperan
atau pohon induk
Seleksi sel
Manipulasi lingkungan
Mutasi
Rekayasa genetik
http://hppbi.or.id
Jalur Produksi Metabolit Sekunder
1. Asam
Sinamat
(Fenol)
2. Asam
benzoik
3. Lignin
4. Koumarin
5. Tanin
6. Asam amino
benzoik
7. Quinon
Asam shikimat
1. Asam lemak
Laurat, Miristat,
Palmitat,
Stearat,Oleat,
Linoleat dan
Linolenik
2. Poliasetilen
3. Gliserid
4. Fosfolipid
5. Glikolipid
Malonat asetat
1. Essential oil
2. Squalent
3. Monoterpenoid
4. Mentol
5. Korosinoid
6. Streoid
7. Terpenoid
8. Sapogenin
9. Geraniol
10 ABA GA3
Mevalonat asetat
http://hppbi.or.id
Teknik Ekstraksi Herbal
Conventional
Technique
Soluble
Component
Heat
Component
New
Technique
-Water extraction,
-Organic solvent extraction
-Fat soluble
-Water soluble
-Heat resistant component
-Heat labile component
-Semibionic extraction
-Microwave extraction
-Supercritical fluid extraction
-Steam distilation
-Enzyme method
Pan et al, 2013
http://hppbi.or.id
COVID-19BAGAIMANA BIOTEKNOLOGI METABOLIT
SEKUNDER UNTUK ANTIVIRAL COVID-19
DAN CARA PRODUKSINYA
http://hppbi.or.id
Selain Pada Vaksin
harapan itu dijatuhkan
pada
Metabolit Sekunder
Tanaman
http://hppbi.or.id
30
HERBAL Medicine
telah digunakan di
Wuhan
http://hppbi.or.id
Coix oil
memiliki
bioaktivitas
sebagai
Antiviral
http://hppbi.or.id
Herbal Screening Method
Screening up to 1000 -
100.000 cmpounds a day for
activity against a target
protein
High Throughput Screening
Computer graphics and
model help improve activity
Molecular Modeling
Using a computer to
predict activity
Virtual Screening
Tissue and computer
begin to replace animal
testing
In vitro and silico
adme models
Preclinic Testing and
ClinicalTesting
Identify disease
Genomics, Transcriptomic,
Proteomics & Biopharm:
Potentially producing many
targets
.
http://hppbi.or.id
Database Drug & Herbal Medicine Discovery
-Indian Plant Anticancer compound database
-Traditional Chinese medicine information database (TCHM-ID)
-Traditional Chinese medicine integrated database (TCHM-ID)
-The herb information knowledge base (THINKherb)
-HerbalDB-UI
IJAH-IPB
Herbal Medicine Discovery
Drug Discovery
-Pubchem
-Bioassay
-Therapeutic Targets Database (TTD)
-Potential Drug Targets Database (PDTD)
-World Molecular Bioactivity (WOMBAT)
-Online Mendelian Inheritance in Man (OMNI)
Database Drug Discovery
Database Herbal Discovery
Pan et al, 2013
http://hppbi.or.id
Hubungan ACE2 dengan SARS-CoV2
Angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) adalah enzim yang menempel pada permukaan luar
(membran) sel-sel di beberapa organ, seperti paru-paru, arteri, jantung, ginjal, dan usus. ACE2 bekerja
mengkatalisis perubahan angiotensin II (suatu vasokonstriktor peptida) menjadi angiotensin 1-7 (suatu
vasodilator). ACE2 melawan aktivitas enzim angiotensin converting enzyme (ACE) dengan mengurangi
jumlah angiotensin-II dan meningkatkan Angiotensin (1-7).
ACE2 merupakan suatu protein membran tipe I yang menembus membrane sebanyak sekali (single
transmembrane), dengan bagian yang aktif secara enzimatik berada pada permukaan sel di paru-paru
dan jaringan lain. Bagian ekstrasel ACE2 dapat dipotong dari bagian trans-membrannya oleh enzim
lain yang dikenal dengan nama sheddase, membentuk protein yang larut dan akan masuk ke
pembuluh darah untuk kemudian diekskresikan melalui urin
virus SARS-CoV (penyebab SARS) dapat
masuk ke dalam sel inangnya dengan
berikatan dengan ACE2 sebagai reseptornya.
Protein spike (yang berbentuk seperti paku-
paku yang menancap pada permukaan) virus
SARS-CoV memiliki afinitas ikatan yang kuat
dengan ACE2 manusia berdasarkan studi
interaksi biokimia dan analisis struktur kristal
protein spike mereka benar-benar homolog..
Hal ini artinya kedua coronavirus ini memiliki
cara yang sama untuk menginfeksi sel
inangnya. Yang lebih menarik adalah
penemuan bahwa nampaknya virus SARS-
CoV-2 dapat mengenali reseptor ACE2
manusia secara lebih efisien dari pada SARS-
CoV, yang menyebabkan lebih tingginya
kemampuan SARS-CoV2 untuk menular dari
manusia ke manusia
Ikatan dengan reseptor ACE2 inilah yang
akan membantu virus SARS-CoV masuk
ke dalam sel inangnya. Jika
dibandingkan, ternyata protein spike
SARS-CoV2 (atau virus Covid-19)
memiliki 76,5% kesamaan sekuen asam
amino dengan SARS-CoV
Hal ini dibuktikan dengan sangat mudahnya
virus Covid-19 ini menyebar ke seluruh dunia
sampai menyebabkan pandemik
dibandingkan SARS-CoV. Adapun adanya
ekspresi ACE2 yang berlebihan pada
manusia akan meningkatkan keparahan dari
penyakit infeksi Covid-19.http://hppbi.or.id
ACE2 berperan sebagai pintu masuk COVID-19http://hppbi.or.id
Coix - Syzigium oil
mampu bekerja sebagai
ACEi atau ARB
Pengembangan
Obat COVID-19Bertarget ACE2
Angiotensin Receptor Blocker (ARB)
ACE2 inhibitor (ACEi)
http://hppbi.or.id
Wang et al, 2020
http://hppbi.or.id
Wang et al, 2020
http://hppbi.or.id
Wang et al, 2020http://hppbi.or.id
http://hppbi.or.id
Haturnuhun
http://hppbi.or.id