powerpoint プレゼンテーション...dda sample iterative dda exclusion list inclusion list...

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サーモフィッシャーサイエンティフィック株式会社クロマトグラフィー&MS事業部

新製品紹介 2018

2

ASMS 2018にて発表された主要な新製品

Thermo Scientific™

Data Acquisition &

Algorithms

Xcalibur™ 4.2 software

AcquireX™ intelligent acquisition

mzLogic™ analysis algorithm

Thermo Scientific™

Data Processing Software

Thermo Scientific™ Instruments

Orbitrap HRAM LC-MS

Triple Quadrupole LC-MS

Orbitrap ID-X™

Tribrid MS

TSQ Fortis™ MS

Q Exactive™ UHMR

MS

Digital Science

mzCloud spectral

library

Small Molecule Analysis

Protein Analysis

Cloud Applications

TraceFinder™ Software

Compound Discoverer™ Software

Mass Frontier™Software

Proteome Discoverer™

Software

Be Selective – Rise Above the Noise

3

Protein Structure

Characterization

4

統合構造生物学

www.thermofisher.com/MS-structure

タンパク質と複合体構造を明らかにする全くユニークな性能

質量分析計とクライオ電子顕微鏡を相補的に活用

http://www.thermofisher.com/MS-structure

5

Thermo Scientific Q Exactive UHMR Mass Spectrometer

“ネイティブMS”および“ネイティブトップダウン分析”のための卓越した性能

• “In-source trapping” と 80,000 m/zまで拡張された質量上限

• 構造生物学とバイオファーマ研究を前進

• インタクトタンパク質やタンパク質複合体の正確なキャラクタリゼーション

• 高分解能によりリガンドの結合を検出

• 生物学プロセスを深く理解するためのタンパク質相互作用の研究

6

Q Exactive UHMRの構造：Native MSのための最適化

2

HCD Cell

C-Trap

Orbitrap Mass Analyzer

HyperQuad Mass Filter with Advanced Quadrupole

Technology (AQT)

RF-Lens

Advanced Active Beam Guide

(AABG)

4

8

9

7

5

6

Transport multipole

Injection Flatapole

3

Inter-Flatapole Lens

1

M. Belov, US2015340213 (2015), US9887074 (2018)

In-source trapping

脱溶媒効率の改善サブユニットへの断片化（膜タンパク質から）界面活性剤ミセルの除去

7

MDaレベルの巨大複合体の分析 Flock House virus (9.3 MDa)

Nature Methods. 2017, Mar14(3): 283-6

8

Native Top-down Pseudo-MS3 Analysis: GroEL複合体

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Rela

tive

Inte

nsity

groel

800746.38

400454.25

500000 1000000Mass

500 1000 1500 2000 2500 3000 3500 4000

m/z

0

20

40

60

80

100

Re

lati

ve

Ab

un

da

nce

1406.7993z=3

2682.5039z=21046.5243

z=11789.0018

z=32753.4817

z=22109.6936

z=2

2604.7175z=2

3019.5930z=3

2330.5786z=6

885.3068z=1 3801.2073

z=2

MS3

(HCD)

14-mer

12-mer

5000 10000 15000 20000 25000 30000 35000 40000 45000

m/z

0

20

40

60

80

100

Quadrupole selection

5000 10000 15000 20000 25000

m/z

0

20

40

60

80

100

Re

lati

ve

Ab

un

da

nce

5361.9769

2696.3860

13970.33329051.7368

15069.929612460.5581 18327.545421500.203725558.2598

MS3

(deconvoluted)

…

0

20

40

60

80

100

MS1

ReSpectdeconv.

21% Residue Cleavages

0

20

40

60

80

100

Re

lati

ve

Ab

un

da

nce

14-mer

13-mer

Monomer

MS2 (In-source trapping)

9

Q Exactive UHMR

P1 Thermo Scientific Q Exactive UHMR Mass Spectrometer

ポスター発表で詳しくご紹介しております。

電子顕微鏡

P15 クライオ電子顕微鏡法: Resolution Revolutionからの未来

P16 3つの環状型カラム/レンズ内検出器を用いた試料最表面SEM観察技法

LA-ICP-MSイメージング

P17 マウス腎臓中のリチウムイメージング分析におけるレーザーアブレーション-ICP-MSの有用性

10

Small Molecule

Structure

Characterization

11

低分子構造同定における20年周年のパートナーシップ

2013

Introduction of mzCloudFirst Tribrid™ MS

Compound Discoverer 1.0With MF Fragmentation Library

and mzCloud

2007

Mass Frontier 5.0 for Orbitrap MS

Mass Frontier 1.0for Ion trap MSn

1998

Established partnership

YEARS

20

2002

Mass Frontier 3.0Linear Ion Trap MSn

Mass Frontier 4.0 for Ion Trap FT-ICRWorld’s first Fragmentation LibraryTM

Precursor Ion fingerprinting (PIF)Introduction of Spectral TreesTM

2004 2015 2016

“マススペクトルから構造へ” これまでの道のり

in 2018…

12

Orbitrap ID-X Tribrid Mass Spectrometer

トライブリッド構造を搭載低分子解析に最適化

構造解析に有用なデータをより多く取得AquireX自動データ取得ワークフロー

強化されたスペクトルアノテーションツールMSn ライブラリ作成ツール候補化合物をランキングするmzLogicアルゴリズム

未知化合物の解明を強力支援多段階MSnスペクトルHCD/CID フラグメンテーション

低分子構造解析のための強力な新規アプローチ

リリースキャンペーンを実施予定です。ご興味の方はアンケートにチェックください

13

全く新しいワークフロー：ハードウェアからソフトウェアまで

ボトルネックである低分子化合物同定を加速

MS3

MS1

MS2

Thermo Scientific

Orbitrap ID-X

Tribrid Mass Spectrometer

Thermo Scientific

Compound Discoverer™

Software

mzCloud スペクトルライブラリ

Thermo Scientific

Mass Frontier software

装置を低分子に最適化解析意義のあるデータを取得するストラテジー

確度の高い同定のための強力な解析ソフトウェア

AcquireX

解析に必要な標的成分（微量成分まで）から効率的に自動データ取得

MSn

幅広いフラグメンテーション情報から分子構造を組み立てる

Data Acquisition

Data ProcessingAutomated

Method Update

AcquireX

14

AcquireX –新しいデータ取得パラダイム

直近の測定データを利用して構造同定に必要なデータ取得を推進

BlankFull MS

SampleFull MS

Sampleiterative

DDA

Sampleiterative

DDA

Sampleiterative

DDA

Exclusion List

Inclusion List

測定ごとにinclusion/exclusion list

を自動アップデート

“AcquireX – Identification MS2” method

15

AcquireX による効果

1 2 3

traditional DDA DDA w/AcquireX

より多くのユニークな未知化合物情報を微量成分まで取得

915

1578

1013

2282

1061

2534

NIST1950 Human Metabolite Plasma Standard

Compounds with Fragmentation Spectra

Injection 1 Injection 2 Injection 3

16

1 2 3

traditional DDA DDA w/AcquireX915

1578

1013

2282

1061

2534






17

1 2 3

traditional DDA DDA w/AcquireX915

1578

1013

2282

1061

2534

Injection 1

Injection 2

Injection 3

Injection 1

Injection 2



Injection 3




18

Orbitrap ID-X

P2 新製品Thermo Scientific Orbitrap ID-X Tribrid Mass Spectrometer のご紹介

P3 Compound Discoverer 3.0 Software：新機能のご紹介

P4 医薬品に関連する抽出物・浸出物の構造解析のワークフローの最適化

P5 Orbitrap ID-XおよびLipid Search 4.2 を用いた脂質解析ソリューション


19

Confident

Quantitation

20

Thermo Scientific TSQ Fortis Triple Quadrupole MS

TSQ Fortis MS TSQ Quantis MS TSQ Altis MS

信頼できる定量～すべてのユーザーが、どんなマトリクスでも、どんな化合物でも～

Performance

Unprecedented Confidence,

Day after Day

Affordable Productivity,

for Everyone

Sensitivity and Robustness,

Without Compromise

21

Thermo Scientific TSQ Fortis Triple Quadrupole MS

より迅速に信頼できる性能を発揮

セットアップから解析まで素早く実施

Robust

Linear

Sensitive

定評のある堅牢性・安定性（AIM+）ソフトの操作性・運用性をさらに強化

22

TSQ Fortis

P6 堅牢性に優れた新製品TSQ Fortisを用いた測定例のご紹介

P7 イムノアフィニティーを利用した前処理とCapillary LC-MSによるThyroglobulinの測定


Orbitrapによる定量

P8 探索薬物動態試験におけるOrbitrap質量分析計の活用と効率化

TSQ Altis 実機展示

23

ポスター発表: ユニークなプロダクト

Q Exactive GC

P9 TraceFinder 4.1とCompound Discoverer 2.1を組み合わせたGC Orbitrapシステムのための探索的解析ワークフロー

荷電化粒子検出器（Charged Aerosol Detectoer: CAD）

P10 探索荷電化粒子検出器と質量分析計を用いたスペクチノマイシンの不純物分析

24

ポスター発表：プロテオミクス

プロテオミクス

P11 DDA+ & HR-DIA : ラベルフリー定量（LFQ）ワークフローのご紹介

P12 効率的なプロテオミクスデータの取得を可能にする高スループット低流量LC-MS法とタンデム低流量LC-MS法

P13 Proteome Discovererを使用したTMT標識クロスリンクタンパク質の相対定量解析

P14 ヒト血漿サンプルにおけるアバンダントタンパク質の除去およびマルチプレックスタンパク質定量解析

25

New Separation

Option for MS

26

Vanquish Duo システム：生産性向上・フットプリント削減

Dual LC

完全2チャンネルLC

Tandem LC or LC-MS

洗浄、平衡化時間を短縮

Inverse Gradient

荷電化粒子検出器で定量分析を行うための逆グラジエントシステム

実機を展示しております

用途に合わせて豊富なラインナップからモジュールを選択

27

ZipChipシステム

MSのためにデザインされたポータブルかつMSインターフェイス一体型CEシステム

測定目的に応じて調製済みの試薬

ディスポーザブルチップ

28

ZipChipの詳細図

MS Inlet

PEEK筐体中のガラスマイクロ流体チップ

+HV1

+HV2

Well 1Waste

Well 2BGE

Well 3Sample

Well 4

BGE

Well 2BGE

Well 3Sample

Well 1Waste

Well 4

BGE

• ユニット装着するだけの簡易セッティング

• ESIと統合されており、イオン源の設定不要

• ナノ流量（150 nL/min）のため高感度

29

適切なアッセイキットとZipChipを選択

1

ZipChip-MS分析ワークフロー

ZipChipをセットし、システム準備

3

簡単なサンプル調製

2

シーケンスを設定し、CE-MSデータの取得

4

30

アミノ酸の高速分析: 5 uM amino acid mix

ZipChip Microfluidic CE-ESI

1.8

min

Conventional Capilliary CE

24

min

100

Metabolite BGE (MeOH/H2O/HCOOH)HS Chip (1000 V/cm)

31

システムテスト：Migration Timeの再現性（Arginine）

0.5

0.7

0.9

1.1

1.3

1.5

1 11 21 31 41 51 61 71 81 91

Mig

rati

on

Tim

e (

min

)

Injections

1st to 50th injections from a single vial

RSD= 1.76%

51st to 100th injections from 96-well plate

RSD= 0.84%

RSD= 1.85% (1st to 100th injections)

RSD=0.54% (8th to 50th injections)

32

NIST モノクローナル抗体のインタクト分析

2.85 2.90 2.95 3.00 3.05 3.10 3.15

Time (min)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

55

60

65

70

75

80

85

90

95

100

Rela

tive

Abundance

0K

1K

2K

3500 4000 4500 5000 5500 6000

m/z

0

20

40

60

80

100

0

20

40

60

80

100

Re

lativ

e A

bu

nd

an

ce

0

20

40

60

80

1005111.38

4941.03

5293.90

4781.66

5489.92

5115.79

5298.454945.24

5494.674785.76

5120.16

5303.074949.57

5499.324789.84

5080 5100 5120 5140 5160

m/z

0

20

40

60

80

100

0

20

40

60

80

100

Re

lativ

e A

bu

nd

ance

0

20

40

60

80

1005111.38

5116.93

5105.84

5122.42

5115.79

5121.34

5110.23

5126.83

5120.16

5125.80

5114.64

5131.40

チャージバリアント間のマスシフトを容易に観測

33

実機を展示しております。ご覧ください。

MSのためにデザインされたポータブルかつMSインターフェイス一体型CEシステム

ZipChip with Q Exactive HF-X

powerpoint プレゼンテーション...dda sample iterative dda exclusion list inclusion list...

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