primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov hb, pfk...
TRANSCRIPT
![Page 1: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/1.jpg)
Jure Stojan7. predavanje
Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov
Hb, PFK, PK, ATC
![Page 2: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/2.jpg)
Stacionarno stanje
![Page 3: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/3.jpg)
Alosterični pojavi
1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka kontrola funkcije z drugega mesta
2 kooperativnost: sistem je sposoben vplivati sam nase
3 kinetika: sigmoidna krivulja v:[S]
4 matematična formulacija:
5 molekulski modeli: sočasni MWC
zaporedni AKNF
6 psevdo-kooperativnost: sistem ni iz podenot
[ ][ ] KS
SVv n
nMAX
+=
![Page 4: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/4.jpg)
![Page 5: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/5.jpg)
Hemoglobin - Hb
HeterotetramerTransportna beljakovina
Hb + 4 O2 Hb(O2)4
![Page 6: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/6.jpg)
Hemoglobin - Hb
![Page 7: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/7.jpg)
Hemoglobin - Hb
![Page 8: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/8.jpg)
Hemoglobin - Hb
![Page 9: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/9.jpg)
Hemoglobin - Hb
![Page 10: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/10.jpg)
Hemoglobin - Hb
![Page 11: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/11.jpg)
Hemoglobin - Hb
![Page 12: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/12.jpg)
( )424321
32321
222121
424321
32321
22211
)()()()(14
)(4)(3)(2
OKKKKOKKKOKKOK
OKKKKOKKKOKKXKY
+++++++=
[ ][ ]
[ ][ ]n
n
n
nMAX
OB
OAy
KS
SVv
2
2 +
=+
=
K1
K2
K3
K4
Adair-ova enačba
Hemoglobin - Hb
![Page 13: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/13.jpg)
Hemoglobin - Hb
Vpliv pH na vezavo kisika - Bohrov efekt
![Page 14: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/14.jpg)
Hemoglobin - Hb
![Page 15: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/15.jpg)
Hemoglobin - Hb
E6V
Srpasta anemija
![Page 16: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/16.jpg)
Fosfofruktokinaza - PFK1
PDB koda 1MTO: homodimer dimerov
Fruktoza-6-P Fruktoza-1,6-biP
![Page 17: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/17.jpg)
Fosfofruktokinaza - PFK1
Fruktoza-6-P Fruktoza-1,6-biP
ATP, PEP, Citrat
AMP, F-2,6 bi P
+++
---
![Page 18: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/18.jpg)
Fosfofruktokinaza - PFK1
![Page 19: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/19.jpg)
Aspartat transkarbamoilaza - ATC
![Page 20: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/20.jpg)
Aspartat transkarbamoilaza - ATC
karbamoil-P karbamoil-aspartataspartat
![Page 21: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/21.jpg)
Proteinska kinaza - PK
Regulatorna podenota
Katalitska podenota
![Page 22: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/22.jpg)
Proteinska kinaza - PK
Regulatorna podenotaKatalitska podenota
cAMPATP
![Page 23: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/23.jpg)
Laktat dehidrogenazaPiruvat Laktat
tetramer: M, H verigePDB koda: 1CET, P. malariae
chloroquine
![Page 24: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/24.jpg)
Laktat dehidrogenaza
Aktivna oblika Neaktivna oblikaAktivna oblika
PDB koda: 3LDH, M tetramer PDB koda: 1LDH, M dimer + H dimer
Piruvat Laktat+++
Fruktoza 1,6 bi fosfat
![Page 25: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/25.jpg)
Laktat dehidrogenaza
![Page 26: Primeri delovanja alosteričnih proteinov in encimov Hb, PFK ...ibk.mf.uni-lj.si/teaching/lab_medicina/predavanje_7.pdfAlosterični pojavi 1 alosterija: v sistemu iz podenot poteka](https://reader033.vdocuments.pub/reader033/viewer/2022060918/60aaf1ee8fb54c5c54678f34/html5/thumbnails/26.jpg)
Matjaž Zorko8. predavanje
Klasifikacija encimov
Primeri delovanja predstavnikov različnih encimskih razredov