Primjena genetskog programiranja zarjesavanje problema prijanjanja

proteina

Diplomski rad br. 54

Ivan Kokanmentor: doc. dr. sc. Marin Golub

Zavod za elektroniku, mikroelektroniku, racunalne i inteligentne sustave

Fakultet elektrotehnike i racunarstvaSveuciliste u Zagrebu

5. srpnja 2010.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 1 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 2 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 2 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 2 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 2 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 2 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 2 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 3 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritamaI bioloska inspiracijaI radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritmaI Nichael Lynn Cramer: A Representation for the Adaptive

Generation of Simple Sequential Programs, 1985.I jedinka = racunalni programI generacija = iteracija evolucijskog algoritmaI John Reed Koza: Genetic Programming: On the

Programming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritamaI bioloska inspiracijaI radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritmaI Nichael Lynn Cramer: A Representation for the Adaptive

Generation of Simple Sequential Programs, 1985.I jedinka = racunalni programI generacija = iteracija evolucijskog algoritmaI John Reed Koza: Genetic Programming: On the

Programming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritama

I bioloska inspiracijaI radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritmaI Nichael Lynn Cramer: A Representation for the Adaptive

Generation of Simple Sequential Programs, 1985.I jedinka = racunalni programI generacija = iteracija evolucijskog algoritmaI John Reed Koza: Genetic Programming: On the

Programming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritamaI bioloska inspiracija

I radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritmaI Nichael Lynn Cramer: A Representation for the Adaptive

Generation of Simple Sequential Programs, 1985.I jedinka = racunalni programI generacija = iteracija evolucijskog algoritmaI John Reed Koza: Genetic Programming: On the

Programming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritamaI bioloska inspiracijaI radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritmaI Nichael Lynn Cramer: A Representation for the Adaptive

Generation of Simple Sequential Programs, 1985.I jedinka = racunalni programI generacija = iteracija evolucijskog algoritmaI John Reed Koza: Genetic Programming: On the

Programming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritamaI bioloska inspiracijaI radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritma

I Nichael Lynn Cramer: A Representation for the AdaptiveGeneration of Simple Sequential Programs, 1985.

I jedinka = racunalni programI generacija = iteracija evolucijskog algoritmaI John Reed Koza: Genetic Programming: On the

Programming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritamaI bioloska inspiracijaI radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritmaI Nichael Lynn Cramer: A Representation for the Adaptive

Generation of Simple Sequential Programs, 1985.

I jedinka = racunalni programI generacija = iteracija evolucijskog algoritmaI John Reed Koza: Genetic Programming: On the

Programming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritamaI bioloska inspiracijaI radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritmaI Nichael Lynn Cramer: A Representation for the Adaptive

Generation of Simple Sequential Programs, 1985.I jedinka = racunalni program

I generacija = iteracija evolucijskog algoritmaI John Reed Koza: Genetic Programming: On the

Programming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritamaI bioloska inspiracijaI radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritmaI Nichael Lynn Cramer: A Representation for the Adaptive

Generation of Simple Sequential Programs, 1985.I jedinka = racunalni programI generacija = iteracija evolucijskog algoritma

I John Reed Koza: Genetic Programming: On theProgramming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Uvod u genetsko programiranje

I automatizirana metoda optimiranja racunalnih programa

I razvila se iz evolucijskih algoritamaI bioloska inspiracijaI radanje i umiranje jedinki unutar populacije

I stablasta jedinka evolucijskog algoritmaI Nichael Lynn Cramer: A Representation for the Adaptive

Generation of Simple Sequential Programs, 1985.I jedinka = racunalni programI generacija = iteracija evolucijskog algoritmaI John Reed Koza: Genetic Programming: On the

Programming of Computers by Means of NaturalSelection, 1992.

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 4 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 5 / 14

Jedinka genetskog programiranja

I nelinearna struktura — stabloI cvorovi stabla

I unutarnji cvorovi — operatori (sin , AND, do)I zavrsni cvorovi — operandi (1,64, true, x)

I rekurzivni obilazak (postorder)

I dobrota (eng. fitness) — mjerilo kvalitete jedinke

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 6 / 14

Jedinka genetskog programiranja

I nelinearna struktura

— stabloI cvorovi stabla

I unutarnji cvorovi — operatori (sin , AND, do)I zavrsni cvorovi — operandi (1,64, true, x)

I rekurzivni obilazak (postorder)

I dobrota (eng. fitness) — mjerilo kvalitete jedinke

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 6 / 14

Jedinka genetskog programiranja

I nelinearna struktura — stablo

I cvorovi stablaI unutarnji cvorovi — operatori (sin , AND, do)I zavrsni cvorovi — operandi (1,64, true, x)

I rekurzivni obilazak (postorder)

I dobrota (eng. fitness) — mjerilo kvalitete jedinke

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 6 / 14

Jedinka genetskog programiranja

I nelinearna struktura — stabloI cvorovi stabla

I unutarnji cvorovi — operatori (sin , AND, do)I zavrsni cvorovi — operandi (1,64, true, x)

I rekurzivni obilazak (postorder)

I dobrota (eng. fitness) — mjerilo kvalitete jedinke

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 6 / 14

Jedinka genetskog programiranja

I nelinearna struktura — stabloI cvorovi stabla

I unutarnji cvorovi — operatori (sin , AND, do)

I zavrsni cvorovi — operandi (1,64, true, x)

I rekurzivni obilazak (postorder)

I dobrota (eng. fitness) — mjerilo kvalitete jedinke

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 6 / 14

Jedinka genetskog programiranja

I nelinearna struktura — stabloI cvorovi stabla

I unutarnji cvorovi — operatori (sin , AND, do)I zavrsni cvorovi — operandi (1,64, true, x)

I rekurzivni obilazak (postorder)

I dobrota (eng. fitness) — mjerilo kvalitete jedinke

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 6 / 14

Jedinka genetskog programiranja

I nelinearna struktura — stabloI cvorovi stabla

I unutarnji cvorovi — operatori (sin , AND, do)I zavrsni cvorovi — operandi (1,64, true, x)

I rekurzivni obilazak (postorder)

I dobrota (eng. fitness) — mjerilo kvalitete jedinke

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 6 / 14

Jedinka genetskog programiranja

I nelinearna struktura — stabloI cvorovi stabla

I unutarnji cvorovi — operatori (sin , AND, do)I zavrsni cvorovi — operandi (1,64, true, x)

I rekurzivni obilazak (postorder)

I dobrota (eng. fitness) — mjerilo kvalitete jedinke

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 6 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 7 / 14

Genetski operatori

I reprodukcija

I krizanje +

− ˆ

x sin x

5.8

·

π cos

x

I mutacija+

− ˆ

x sin x

5.8

·

x3

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 8 / 14

Genetski operatori

I reprodukcija

I krizanje +

− ˆ

x sin x

5.8

·

π cos

x

I mutacija+

− ˆ

x sin x

5.8

·

x3

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 8 / 14

Genetski operatori

I reprodukcija

I krizanje

+

− ˆ

x sin x

5.8

·

π cos

x

I mutacija+

− ˆ

x sin x

5.8

·

x3

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 8 / 14

Genetski operatori

I reprodukcija

I krizanje +

− ˆ

x sin x

5.8

·

π cos

x

I mutacija+

− ˆ

x sin x

5.8

·

x3

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 8 / 14

Genetski operatori

I reprodukcija

I krizanje +

− ˆ

x sin x

5.8

·

π cos

x

I mutacija

+

− ˆ

x sin x

5.8

·

x3

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 8 / 14

Genetski operatori

I reprodukcija

I krizanje +

− ˆ

x sin x

5.8

·

π cos

x

I mutacija+

− ˆ

x sin x

5.8

·

x3

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 8 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 9 / 14

Prijanjanje proteina

I racunalno modeliranje interakcija dvaju ili vise proteina

I cilj: predvidjeti formiranje kompleksnih trodimenzionalnihstruktura

I vrste prijanjanjaI prijanjanje cvrstih proteina (eng. rigid-body docking)I prijanjanje savitljivih proteina (eng. flexible-body docking)

I geometrijske i elektrostatske znacajke

I Protein Data Bank

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 10 / 14

Prijanjanje proteina

I racunalno modeliranje interakcija dvaju ili vise proteina

I cilj: predvidjeti formiranje kompleksnih trodimenzionalnihstruktura

I vrste prijanjanjaI prijanjanje cvrstih proteina (eng. rigid-body docking)I prijanjanje savitljivih proteina (eng. flexible-body docking)

I geometrijske i elektrostatske znacajke

I Protein Data Bank

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 10 / 14

Prijanjanje proteina

I racunalno modeliranje interakcija dvaju ili vise proteina

I cilj: predvidjeti formiranje kompleksnih trodimenzionalnihstruktura

I vrste prijanjanjaI prijanjanje cvrstih proteina (eng. rigid-body docking)I prijanjanje savitljivih proteina (eng. flexible-body docking)

I geometrijske i elektrostatske znacajke

I Protein Data Bank

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 10 / 14

Prijanjanje proteina

I racunalno modeliranje interakcija dvaju ili vise proteina

I cilj: predvidjeti formiranje kompleksnih trodimenzionalnihstruktura

I vrste prijanjanja

I prijanjanje cvrstih proteina (eng. rigid-body docking)I prijanjanje savitljivih proteina (eng. flexible-body docking)

I geometrijske i elektrostatske znacajke

I Protein Data Bank

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 10 / 14

Prijanjanje proteina

I racunalno modeliranje interakcija dvaju ili vise proteina

I cilj: predvidjeti formiranje kompleksnih trodimenzionalnihstruktura

I vrste prijanjanjaI prijanjanje cvrstih proteina (eng. rigid-body docking)

I prijanjanje savitljivih proteina (eng. flexible-body docking)

I geometrijske i elektrostatske znacajke

I Protein Data Bank

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 10 / 14

Prijanjanje proteina

I racunalno modeliranje interakcija dvaju ili vise proteina

I cilj: predvidjeti formiranje kompleksnih trodimenzionalnihstruktura

I vrste prijanjanjaI prijanjanje cvrstih proteina (eng. rigid-body docking)I prijanjanje savitljivih proteina (eng. flexible-body docking)

I geometrijske i elektrostatske znacajke

I Protein Data Bank

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 10 / 14

Prijanjanje proteina

I racunalno modeliranje interakcija dvaju ili vise proteina

I cilj: predvidjeti formiranje kompleksnih trodimenzionalnihstruktura

I vrste prijanjanjaI prijanjanje cvrstih proteina (eng. rigid-body docking)I prijanjanje savitljivih proteina (eng. flexible-body docking)

I geometrijske i elektrostatske znacajke

I Protein Data Bank

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 10 / 14

Prijanjanje proteina

I racunalno modeliranje interakcija dvaju ili vise proteina

I cilj: predvidjeti formiranje kompleksnih trodimenzionalnihstruktura

I vrste prijanjanjaI prijanjanje cvrstih proteina (eng. rigid-body docking)I prijanjanje savitljivih proteina (eng. flexible-body docking)

I geometrijske i elektrostatske znacajke

I Protein Data Bank

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 10 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 11 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteinaI geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobroteI EvalOpCenterI EvalOpMinDistanceI EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteina

I geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobroteI EvalOpCenterI EvalOpMinDistanceI EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteinaI geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobroteI EvalOpCenterI EvalOpMinDistanceI EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteinaI geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobroteI EvalOpCenterI EvalOpMinDistanceI EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteinaI geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobroteI EvalOpCenterI EvalOpMinDistanceI EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteinaI geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobroteI EvalOpCenterI EvalOpMinDistanceI EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteinaI geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobrote

I EvalOpCenterI EvalOpMinDistanceI EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteinaI geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobroteI EvalOpCenter

I EvalOpMinDistanceI EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteinaI geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobroteI EvalOpCenterI EvalOpMinDistance

I EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Programsko rjesenje

I rjesava problem prijanjanja dvaju cvrstih proteinaI geometrijske znacajke

I Evolutionary Computation Framework (ECF)

I jedinka = kompozicija geometrijskih transformacija dvajuproteina

I rotacije i translacije u prostoru

I funkcije dobroteI EvalOpCenterI EvalOpMinDistanceI EvalOpPairwise

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 12 / 14

Sadrzaj

Uvod u genetsko programiranje

Jedinka genetskog programiranja

Genetski operatori

Prijanjanje proteina

Programsko rjesenje

Zakljucak

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 13 / 14

Zakljucak

I vrlo dobra prilagodba problemuI konvergencija rjesenju kroz nekoliko desetaka generacijaI na pocetku veci utjecaj translacijaI u konacnici “podesavanja” rotacijama

I veca populacija = veci “genetski materijal” = kvalitetnijarjesenja

I mutacije nemaju znacajnog utjecaja na dobrotu

I elektrostatske znacajke proteina?

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 14 / 14

Zakljucak

I vrlo dobra prilagodba problemu

I konvergencija rjesenju kroz nekoliko desetaka generacijaI na pocetku veci utjecaj translacijaI u konacnici “podesavanja” rotacijama

I veca populacija = veci “genetski materijal” = kvalitetnijarjesenja

I mutacije nemaju znacajnog utjecaja na dobrotu

I elektrostatske znacajke proteina?

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 14 / 14

Zakljucak

I vrlo dobra prilagodba problemuI konvergencija rjesenju kroz nekoliko desetaka generacija

I na pocetku veci utjecaj translacijaI u konacnici “podesavanja” rotacijama

I veca populacija = veci “genetski materijal” = kvalitetnijarjesenja

I mutacije nemaju znacajnog utjecaja na dobrotu

I elektrostatske znacajke proteina?

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 14 / 14

Zakljucak

I vrlo dobra prilagodba problemuI konvergencija rjesenju kroz nekoliko desetaka generacijaI na pocetku veci utjecaj translacija

I u konacnici “podesavanja” rotacijama

I veca populacija = veci “genetski materijal” = kvalitetnijarjesenja

I mutacije nemaju znacajnog utjecaja na dobrotu

I elektrostatske znacajke proteina?

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 14 / 14

Zakljucak

I vrlo dobra prilagodba problemuI konvergencija rjesenju kroz nekoliko desetaka generacijaI na pocetku veci utjecaj translacijaI u konacnici “podesavanja” rotacijama

I veca populacija = veci “genetski materijal” = kvalitetnijarjesenja

I mutacije nemaju znacajnog utjecaja na dobrotu

I elektrostatske znacajke proteina?

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 14 / 14

Zakljucak

I vrlo dobra prilagodba problemuI konvergencija rjesenju kroz nekoliko desetaka generacijaI na pocetku veci utjecaj translacijaI u konacnici “podesavanja” rotacijama

I veca populacija = veci “genetski materijal” = kvalitetnijarjesenja

I mutacije nemaju znacajnog utjecaja na dobrotu

I elektrostatske znacajke proteina?

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 14 / 14

Zakljucak

I vrlo dobra prilagodba problemuI konvergencija rjesenju kroz nekoliko desetaka generacijaI na pocetku veci utjecaj translacijaI u konacnici “podesavanja” rotacijama

I veca populacija = veci “genetski materijal” = kvalitetnijarjesenja

I mutacije nemaju znacajnog utjecaja na dobrotu

I elektrostatske znacajke proteina?

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 14 / 14

Zakljucak

I vrlo dobra prilagodba problemuI konvergencija rjesenju kroz nekoliko desetaka generacijaI na pocetku veci utjecaj translacijaI u konacnici “podesavanja” rotacijama

I veca populacija = veci “genetski materijal” = kvalitetnijarjesenja

I mutacije nemaju znacajnog utjecaja na dobrotu

I elektrostatske znacajke proteina?

Ivan Kokan (FER) Diplomski rad srpanj, 2010. 14 / 14