programmes de travail des laboratoires - anses.fr · une première thématique est liée à...

ANSES/PR2/01-01 [version a] sur 33

DIRECTION SCIENTIFIQUE DES LABORATOIRES

Programmes de travail

des laboratoires

pour l’année 2014

Laboratoire de Lyon


Sommaire

Laboratoire de Lyon ............................................................. 3

Unité de Maladie Neuro-Dégénératives (MND) .................................................................................. 4

Unité Mixte de Recherches (UMR) Mycoplasmoses des ruminant, équipe Anses ........................... 10

Unité Antibiorésistance et Virulence Bactériennes .......................................................................... 15

Unité d’Epidémiologie ....................................................................................................................... 19

Unité de Virologie .............................................................................................................................. 23

Unité Résistance aux Produits Phytosanitaires (RPP) ....................................................................... 28


Laboratoire de Lyon

Le laboratoire

Le Laboratoire Anses de Lyon est composé de 6 Unités de Recherche et Référence, une Plateforme

d’expérimentation animale et des services supports :

- Deux Unités consacrées à la bactériologie,

o l’UMR-Mycoplasmoses des ruminants (Anses/VetAgroSup), sur les thèmes surveillance (à

travers notamment le réseau Vigimyc), diversité et virulence ; depuis 2013, l’unité a

développé une thématique antibio-résistance forte ;

o l’Unité AVB (Antibiorésistance et Virulence Bactérienne), qui anime le Resapath et étudie

les mécanismes de résistance des bactéries isolées des ruminants et la relation virulence-

antibiorésistance ;

- Une Unité de Virologie consacrée aux virus émergent : Fièvre de la vallée du Rift et Hanta virus ;

- Une Unité Maladies Neuro-Dégénératives (MND) qui développe deux axes, l’un, historique, sur

les maladies à prion animales (encéphalopathie spongiforme bovine et tremblante des petits

ruminants) et l’autre sur les relations entre MND humaines et environnement (pesticides …) ;

- Une Unité d’épidémiologie avec deux thèmes : l’épidémiologie de l’antibiorésistance et les

méthodologies de surveillance syndromique ;

- Une Unité sur la Résistance des bioagresseurs des cultures aux Produits Phytosanitaires (RPP)

qui couvre les champs larges de l’entomologie agricole, de la mycologie, la bactériologie et de la

malherbologie.


Unité de Maladie Neuro-Dégénératives (MND)

Chef d’unité : Thierry BARON

Une première thématique est liée à l’activité de Laboratoire National de Référence sur les maladies à

prion des ruminants, centrée sur le typage moléculaire et biologique des « souches » de maladies à

prion, dont la diversité s’est considérablement accrue dans les années récentes. Ces travaux visent à

contribuer à une meilleure appréciation des risques représentés par les différentes maladies à prion,

en santé publique et animale. Les travaux en cours amènent à la fois des questions et des éléments

de réponse cruciaux concernant les phénomènes de sélection de souches en fonction de l’hôte de la

maladie, et notamment de sa susceptibilité génétique. Les connaissances obtenues participent à la

compréhension des possibilités d’émergence de ces maladies transmissibles.

Une autre thématique de recherche concerne l’évaluation du rôle neurotoxique de substances

chimiques, comme les pesticides, en lien avec les altérations de l’alpha-synucléine, protéine centrale

dans des maladies neuro-dégénératives fréquentes chez l’homme, telles la maladie de Parkinson et

certaines démences. Ces travaux sont motivés par la nécessité de disposer de méthodes d’évaluation

de la neurotoxicité à long terme de telles substances, notamment dans le contexte de la

reconnaissance du lien entre exposition professionnelle aux pesticides et maladie de Parkinson.


Référence

L’unité ne fait pas de référence (cocher, passer à la rubrique D)

L’unité a un programme de travail spécifique LR-UE et ne l’intègre pas ici (cocher)

L’unité a un programme de travail spécifique LR-UE intégré dans les rubriques ci-après (cocher)

1. Développement ou acquisition de méthodes

Rien à signaler.

2. Expertise scientifique et technique relative aux méthodes d’analyse (dont participation aux instances de normalisation nationales ou internationales)

Rien à signaler.

3. Animation des réseaux de laboratoires officiels

Mandat : EST

Titre de l’EIL que vous prévoyez d’organiser en 2014

Type d’EIL (EILA, EILV)

Priorité (impératif, programmé)

Champ (matrice / analyte / méthode…)

Périodicité, le cas échéant, telle que validée avec la tutelle (tous les 6,12,18 ou 24 mois)

Dépistage des EST par tests rapides

EILA impératif Tests ELISA ou Western blot sur extraits cérébraux congelés

24 mois

Nombre et type des EIL (EILA, EILV) que vous avez prévu d’organiser en 2014 (Indicateur COP)

Mandat(s) EILA EILV

EST 1 0

4. Accréditation

Mandat : EST

Ligne(s) d’accréditation prévue(s) d’ajouter dans l’annexe technique sur 2014


- Accréditation COFRAC pour le typage moléculaire des EST des bovins

impératif

Mandat :

Entretien des lignes d’accréditation Oui


5. Participation à des EIL

Mandat : EST

Titre de l’EIL auquel vous avez prévu de participer en 2014




Cocher la case si cette activité est régulière (annuelle, bisannuelle)

-confirmation diagnostique des EST par Western blot et par immunohistochimie chez les bovins et les petits ruminants - typage moléculaire par Western blot discriminant chez les petits ruminants et chez les bovins - test de dépistage rapide ELISA Idexx HerdCheck chez les bovins et les petits ruminants

EILA Impératif Western blot / ELISA sur extraits cérébraux Immunohistochimie sur coupes de tissus cérébraux fixés

x

6. Contrôle de kits et de réactifs

Mandat : EST Demandes de contrôles attendues en 2014

Contrôle des lots de tests de dépistage des EST délivrés en Europe par la société Idexx

Analyse des dossiers fournisseurs par lot et contrôle interne par la technique ELISA Idexx HerdCheck

7. Souchothèques

Mandat :

Entretien des collections Oui

Opérations particulières

8. Autre action dans le domaine de la référence

Rien à signaler.

Contribution à la surveillance

L’unité ne contribue pas aux réseaux de la surveillance

9. Plans de contrôle et de surveillance ou campagnes d’analyse programmées par l’autorité en 2014

Plans de surveillance des EST chez les bovins et chez les petits ruminants à l’abattoir et à l’équarrissage


10. Animation ou contribution à l’animation de dispositifs de surveillance Rien à signaler.

Recherche

11. - Projets de recherche initiés avant 2014, toujours en cours au 01/01/2014 non détaillés, intégration de la liste des conventions en cours enregistrées à la DFT souhaitée

(passer à la rubrique 1) listés et détaillés ci-dessous :

Thématique : Maladies à prion

Titre du projet Priorité (impératif, programmé)

Sujet dans le champ de la lettre d’orientation recherche (LOR)

Caractérisation des souches de prions dans les formes atypiques d’EST des ruminants

programmé oui

Période Début (mois année) : Fin prévue (mois année) :

Positionnement de l’équipe Indépendant

Organisme(s) financeur(s) Anses - Caractérisation des deux formes atypiques d’ESB (H et L) après transmission dans des modèles

expérimentaux: évaluation des possibilités d’émergence de l’agent responsable de l’ESB dite « classique », et pour l’ESB-L, caractérisation après transmission au mouton, celle-çi montrant des modifications majeures chez le mouton porteur d’un gène de résistance aux maladies à prion (R171) qui rendent difficile la reconnaissance moléculaire du lien avec l’ESB

- Caractérisation moléculaire et lésionnelle après transmission dans des modèles expérimentaux de cas naturels de tremblante des petits ruminants (« CH1641-like ») identifiés par certaines similitudes moléculaires avec l’ESB (C ou L) lors des tests de typage moléculaire.

CDD associé(s) (y compris thèses et post-doctorats)

Nombre de mois sur l’année : Période : -

Transversalité intra–Anses ou partenaires hors Anses

Entités/unités partenaires ou noms des établissements :

Partenaires (préciser les pays pour les équipes internationales)

ISS, Italie (ESB-L ovine)

Thématique : Neurotoxicologie



Evaluation in vitro de l’impact des pesticides en relation avec les maladies neuro-dégénératives humaines

programmé oui



Organisme(s) financeur(s) Anses

Caractérisation qualitative et quantitative de l’alpha-synucléine humaine dans des lignées cellulaires humaines : étude des effets de l’exposition in vitro à des pesticides et applications de méthodes adaptées à des analyses à large échelle.

CDD associé(s) (y compris thèses et Nombre de mois sur l’année : 12


post-doctorats) 1 thèse Période : 01/14 – 12/14




SFR Biosciences (plateforme AniRA, Dr T. Andrieu)




Evaluation de l’impact des pesticides en relation avec les maladies neuro-dégénératives humaines

programmé oui


Positionnement de l’équipe indépendant

Organisme(s) financeur(s) Anses Utilisation de modèles de drosophiles transgéniques exprimant l’alpha-synucléine humaine : caractérisation des altérations moléculaires suite à l’exposition in vivo à des pesticides. CDD associé(s) (y compris thèses et post-doctorats)

Nombre de mois sur l’année : Période :




SFR Biosciences (plateforme ARTHRO-TOOLS)

12. Projets de recherche qui démarrent en 2014


Titre du projet



Modèles expérimentaux de propagation des altérations de l’α-synucléine par un mécanisme de type prion : étude des effets de la surexpression de la β-synucléine à l’aide d’un vecteur viral adéno-associé (AAV)

programmé Oui

Période Début (mois année) : janvier 2014 Fin prévue (mois année) : décembre 2015

Positionnement de l’équipe Coordinateur

Organisme(s) financeur(s) France Parkinson

Des données expérimentales récentes indiquent que la plupart des maladies neuro-dégénératives humaines impliqueraient la propagation de l’agrégation de protéines par un mécanisme de type prion. Notre projet porte sur l’évaluation d’une stratégie thérapeutique

contre la propagation de l’agrégation de la protéine α-synucléine (-SYN), impliquée notamment dans la maladie de Parkinson ou la démence à corps de Lewy, fondée sur la surexpression d’une protéine apparentée, la β-synucléine (β-SYN), à l’aide de vecteurs viraux Adéno-Associés (AAV). Nous étudierons la propagation de type prion de l’agrégation


de l’-SYN et l’impact de la surexpression de la β-SYN humaine.






- Centre international de Recherche en Infectiologie (CIRI) - INSERM U1111- UMR 5308 - Ecole Normale Supérieure de Lyon, France (Dr A. Salvetti) - Institut Fédératif Génomes, Transcriptomes, Proteomes (IFR115), Gif-sur-Yvette, France (Dr R. Melki)

13. Récapitulatifs des thèses et post-doctorats

Doctorats prévus (sujets acceptés) et en cours, qu’elles soient encadrées ou co-encadrées par un scientifique de l’Anses

Titre Nom du doctorant

Durée : mois année-mois année Financeurs

Développement d’un modèle d’étude in vitro d’évaluation de l’impact des pesticides sur les pathologies humaines associées à l’alpha-synucléine

Areski CHORFA

02/2012 – 02/2015 Anses

-

14. Habilitation à diriger les recherches

Rien à signaler.

15. Organisation de manifestations scientifiques Rien à signaler.

16. Autre(s) action(s) nationale(s) ou internationale(s)

Rien à signaler.


Unité Mixte de Recherches (UMR) Mycoplasmoses des ruminant, équipe Anses

Chef d’unité : Florence TARDY

En l’absence de vaccins efficaces et en raison de leur caractère exotique et/ou rebelle à

l’antibiothérapie pour certaines, les mycoplasmoses sont des maladies animales dont l’émergence ou

la ré-émergence est à redouter (3 sont reprises sur la liste de l’OIE). Elles sont à l’origine de pertes

économiques majeures dans le monde. Grâce au réseau d’épidémiosurveillance qu’elle anime

(VIGIMYC) notre UMR possède à la fois une connaissance approfondie de la circulation des

mycoplasmes chez les ruminants en France et une collection de souches d’une grande richesse. C’est

sur cette collection que s’appuient les travaux scientifiques de l’UMR qui portent sur la biodiversité

des bactéries du genre Mycoplasma et les conséquences de cette diversité sur l’expression clinique

des maladies chez les ruminants. Des thématiques transversales sont développées pour établir des

liens entre observations cliniques (évolution clinique, émergence, usages thérapeutiques, incidence

économique) et caractérisation des agents étiologiques (identification, antibiosensibilité, sous-

typage, polymorphisme génétique, virulence et évolution) et ce en collaboration avec divers

partenaires nationaux (CIRAD, INRA, Universités, LVD…) et internationaux. Dans les années à venir,

l’UMR entend pérenniser cette double approche du Suivi Sanitaire des maladies et de l’analyse de la

Diversité et Virulence des mycoplasmes associés.

Référence




1. Développement ou acquisition de méthodes Rien à signaler.


Rien signaler.

3. Animation des réseaux de laboratoires officiels Rien à signaler.

4. Accréditation Rien à signaler.

5. Participation à des EIL Rien à signaler.

6. Contrôle de kits et de réactifs Rien à signaler.

7. Souchothèques

Mandat : néant

Entretien des collections Oui

Opérations particulières program-mées : Refonte du logiciel de gestion de la collection



Concernant plus spécifiquement le sérodiagnostic de la péripneumonie contagieuse bovine (PPCB)

par immunoblotting qui est un test entièrement produit par l’unité selon une méthode interne basée

sur le manuel des tests de diagnostic des animaux terrestres de l’OIE, l’objectif d’accréditation a été

abandonné en l’absence d’un mandat de LNR et en l’absence de réception régulière de prélèvements

positifs PPCB (Europe indemne et importation de sérums africains extrêmement limitée par les

contraintes sanitaires). Cette irrégularité de l’activité rend toute démarche d’accréditation

chronophage et coûteuse. L’effort consenti pour la production, le contrôle des réactifs et le maintien

des compétences a été adapté au nombre d’analyses réalisées par an et à la part que représente le

sérodiagnostic PPCB par immunoblotting dans les activités d’expertise de l’unité. L’objectif de cette

nouvelle organisation est de maintenir un savoir-faire technique à travers des procédures allégées

(fréquence de renouvellement et volume des réactifs) qui pourront être facilement révisées à la

hausse en cas de crise sanitaire.




Rien à signaler.

10. Animation ou contribution à l’animation de dispositifs de surveillance

Nom du dispositif de surveillance

Activités à conduire en 2014 Délivrable pour 2014

VIGIMYC, réseau d’épidémiosurveillance des mycoplasmoses de ruminants

Faire évoluer les méthodologies sur lesquelles repose VIGIMYC (technique d’identification, recueil de données auprès des laboratoires) Adosser à VIGIMYC une activité de surveillance de l’antibiosensibilité des souches de mycoplasmes

Renouvellement de la convention Validation et pérennisation d’une méthode de suivi

VIGIMYC, réseau d’épidémiosurveillance des mycoplasmoses de ruminants

Le réseau VIGIMYC permet de suivre l’évolution des mycoplasmoses des ruminants sur le territoire national (particulièrement celles inscrites sur la liste de l’OIE) et de détecter l’émergence de nouvelles espèces et nouveaux variants. Il permet de constituer une collection représentative de souches de mycoplasmes isolées chez les ruminants sur l’ensemble du territoire. Cette collection assure la base du matériel biologique nécessaire à nos développements en recherche sur la biodiversité et la virulence. En outre VIGIMYC fournit une base pérenne pour initier des enquêtes épidémiologiques plus ciblées. VIGIMYC en chiffres, c’est en moyenne 350 identifications de souches par an, envoyées par 40 laboratoires départementaux partenaires et issues de 300 foyers répartis sur 51 départements différents. En 2014, il est prévu de faire évoluer VIGIMYC afin que celui-ci serve de base à la construction d’un observatoire de l’antibiosensibilité des souches de mycoplasmes.


Recherche

11. Projets de recherche initiés avant 2014, toujours en cours au 01/01/2014 non détaillés, intégration de la liste des conventions en cours enregistrées à la DFT souhaitée listés et détaillés ci-dessous :

Thématique : Suivi sanitaire des maladies - Antibiorésistance des Mycoplasmes, surveillance des phénotypes



AB_MYCO (MYCANTIBIO_suite) Programmé oui

Période Début (mois année) : 01/2013 Fin prévue (mois année) : pérenne


Organisme(s) financeur(s) Interne (suite d’une transversalité Intra-Anses)

Ce projet vise à créer un référentiel en termes d’antibiosensibilité des principaux mycoplasmes pathogènes des ruminants en lien avec les pratiques d’antibiothérapie par filière. Une première étape (réalisée dans le cadre d’une transversalité intra Anses) a d’ores et déjà permis de démontrer que l’espèce M. bovis impliquée notamment dans les bronchopneumonies infectieuses des veaux était devenue, au cours des 30 dernières années, résistante à la grande majorité des molécules antibiotiques actuellement sur le marché. En 2014, les autres espèces pathogènes majeures (notamment pour les petits ruminants) seront évaluées en tenant compte des particularités d’élevage et des intrants antibiotiques.




Entités/unités partenaires ou noms des établissements : Projet initial issu d’une transversalité avec Ploufragan- Le transfert de compétences devrait être acté fin 2013

Partenaires

Thématique : Diversité et Virulence des mycoplasmes - Rôle des exopolysaccharides dans la virulence des mycoplasmes



PERIVIRULANE_suite Programmé oui

Période Début (mois année) : 01/2013 Fin prévue (mois année) : à définir


Organisme(s) financeur(s) Interne (suite d’une thèse co financée CIRAD/ANSES)

Les objectifs du projet Périvirulane (octobre 2010 – décembre 2013) étaient de caractériser les exopolysaccharides (EPS) sécrétés par Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC (Mmm), l’agent de la péripneumonie contagieuse bovine et d’évaluer leur implication dans sa virulence. En 2014, les techniques de production et caractérisation des EPS développées pour Mmm seront appliquées aux autres mycoplasmes isolés chez les ruminants afin d’étudier la diversité des EPS sécrétés et leur implication potentielle dans la virulence des souches en lien avec les tableaux cliniques observés.




UMR15 contrôle des maladies animales exotiques et émergentes. CIRAD-BIOS, Campus International de Baillarguet, TA A-15/G 34398 Montpellier cedex 5


Thématique : Diversité et Virulence des mycoplasmes - Flux de gènes entre espèces

Titre du projet : Priorité (impératif, programmé)


Suite de MycXgene fev10->juil13 (ANR_09_MIEN_016_01)

impératif oui

Période : février 2010- juillet 2013 Début (mois année) : janvier 10 Fin prévue (mois année) : à définir

Positionnement de l’équipe Pour le projet ANR, Coordinateur tâche n°1

Organisme(s) financeur(s) ANR pour le début du projet, suite à définir 2nd semestre 2013

Le projet MYCxGENE visait à établir l’étendue des transferts horizontaux de gènes (THG) entre mycoplasmes de ruminants, la nature des éléments potentiellement échangés entre espèces, les moteurs moléculaires, les modalités des échanges et enfin la répercussion de ces THG sur l’identification des différentes espèces, l’épidémiologie des mycoplasmoses voire sur le pouvoir pathogène des souches. 2014 sera essentiellement une année de réflexion concernant les voies de continuité possibles de ce projet et les moyens de mettre en relation nos nouvelles connaissances en termes de plasticité génomique et nos observations terrain (émergence de nouvelles espèces, variants, émergence de résistance…).

CDD associé(s)(y compris thèses et post-doctorats)

Nombre de mois sur l’année : 0 Période : -




UMR 1225 INRA, ENVT (Ecole Nationale Vétérinaire) Université Bordeaux Segalen, UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie INRA, IBVM Veterinary Microbiology, Univ. of Melbourne, Australia

Thématique : Diversité et Virulence des mycoplasmes - Mécanismes moléculaires sous-tendant l’antibiorésistance des Mycoplasmes

Titre du projet : Priorité (impératif, programmé)


MycRESIS Programmé Oui

Période Début (mois année) : octobre 13 Fin prévue (mois année) : octobre 16

Positionnement de l’équipe Coordinateur _ Direction de la thèse

Organisme(s) financeur(s) Anses + VetAgro Sup

Ce projet vise à caractériser les différents mécanismes sous-tendant les résistances aux antibiotiques observées récemment pour les souches françaises de mycoplasmes, leur support génétique et leur évolution. Cette connaissance est nécessaire pour i) maîtriser le risque d’une diffusion inter espèces des résistances (si les déterminants génétiques sont portés par des Eléments Génétiques Mobiles, EGM) et le risque d’émergence de clones multirésistants et ii) développer des outils de suivi en routine de l’antibiosensibilité (techniques moléculaires). En 2014, le focus sera porté sur l’espèce dont les phénotypes de résistance ont été décryptés le plus finement et qui a été choisie comme organisme modèle, à savoir M. bovis. Ceci nous permettra par ailleurs de mettre en lien le projet de thèse et les résultats récemment acquis concernant le typage des souches de M. bovis sur le territoire national.

CDD associé(s) : 1 THESE DE DOCTORAT Nombre de mois sur l’année : 12 Période : octobre 13 - octobre 16




Partenaires)

12. Projets de recherche qui démarrent en 2014 Rien à signaler.



Titre Nom du doctorant Durée : mois année-mois année Financeurs

PERIVIRULANE BERTIN octobre 10 - décembre 13 CIRAD ANSES

MYCRESIS KHALIL octobre 13 - octobre 16 ANSES VETAGRO SUP

14. Habilitation à diriger les recherches : 1 (personnel VetAgro Sup)

15. Organisation de manifestations scientifiques

Titre de la manifestation Priorité (impératif, programmé)

Période Public Enjeux pour l’Anses

Cocher la case si cette activité est régulière

Journée VIGIMYC Programmé Automne 2014

LVD Animation réseau


La faisabilité d’un projet de recherche consistant à décliner en termes finalisés les nombreuses données acquises lors des deux projets ANR menés sur ces 5 dernières années sera examinée. Les deux projets passés (ANR GMGE 2007-2010 et MIE 2010-2013) ont contribué à générer une masse très importante de connaissances nouvelles en termes d’évolution des génomes, analyse des éléments génétiques mobiles (plasmides, phages, ou Eléments Conjugatifs Intégratifs) et définition d’un ancêtre commun aux mycoplasmes. Nos résultats indiquent que très peu de familles de gènes distinguent clairement les souches selon leur pathogénicité ou leur hôte, ce qui suggère que peu de facteurs sont impliqués et/ou que les différences phénotypiques entre souches pourraient être surtout liées à des variations d’expression. Par contre, les mycoplasmes que l’on considérait jusque récemment comme des bactéries vouées à une évolution exclusivement régressive s’avèrent posséder des génomes extrêmement dynamiques en évolution rapide et ce en lien avec les pratiques d’élevage notamment. La suite logique à ces projets sera d’examiner les conséquences que les flux horizontaux de gènes (par ailleurs observés in vitro) pourraient avoir sur la spéciation (et donc le diagnostic), le typage (et donc le suivi de foyer), la spécificité d’hôte, le pouvoir pathogène des souches et leur antibiosensibilité. Cette exploration est nécessaire pour maîtriser le risque d’une diffusion inter espèces des résistances et le risque d’émergence de clones multirésistants ou hypervirulents. Trois autres projets dont le responsable est un Enseignant chercheur de l’UMR sont en cours : Mycaptank qui devrait démarrer au 1er janvier 2014 et concerne la faisabilité de l’utilisation du lait de tank pour la détermination du statut des cheptels caprins vis-à-vis des mycoplasmoses ; Bovityp, en cours de finalisation, qui concerne le sous-typage des souches de Mycoplasma bovis collectées en France depuis plus de 40 ans; enfin un troisième projet devrait voir le jour dès janvier 2014 qui est en fait une enquête régionale dont le but est de faire le point sur l’éventuel surcoût économique induit par la présence de M. bovis lors d’affections respiratoires multifactorielles dans des élevages de veaux. Un projet nourri des connaissances précédemment acquises et reprenant le même consortium d’équipes devrait voir le jour en 2014 (si publication d’un Appel d’Offre compatible) avec des attendus davantage finalisés. L’an passé, le montage d’un projet dans le cadre d’Era-net Anihwa s’était révélé prématuré.


Unité Antibiorésistance et Virulence Bactériennes

Chef d’unité : Jean-Yves MADEC Le champ de l’unité s’inscrit au sein du double enjeu de santé publique et vétérinaire que constitue la résistance aux antibiotiques chez l’animal, en lien avec la problématique miroir chez l’Homme. La part contributive du monde animal à cette question a fait l’objet de nombreuses réflexions internationales (OIE, OMS, FAO) en appui de dispositions européennes (DG SANCO, ECDC, Efsa). En novembre 2011), un plan national de réduction des risques d’antibiorésistance en médecine vétérinaire a été initié par le Ministre de l’Agriculture (Plan EcoAntibio 2017) et une auto-saisine de l’Anses est en cours. C’est dans ce contexte scientifique et politique que l’activité de l’unité AVB se situe. Les objectifs plus spécifiques de l’unité résultent des missions définies au titre de LNR associé pour la résistance aux antimicrobiens, incluant le développement, la validation et l’optimisation de méthodes, l’animation d’un réseau de laboratoires (Résapath), la réalisation d’analyses officielles (plan de surveillance) et la mise en oeuvre d’activités de recherche associées. Une partie des missions du LNR s’inscrit également dans le cadre d’obligations communautaires (directive 2003/99/CE du 17/11/03). Depuis 2004 (nouveau chef d’unité), les objectifs ont été de renforcer le dispositif de surveillance national de l’antibiorésistance animale (Résapath) et de développer une activité de recherche adossée à cette référence (caractérisation des mécanismes moléculaires). L’unité a également une approche conjointe de l’antibiorésistance et de la virulence bactériennes, indispensable à une compréhension pertinente des risques pour l’Homme associés aux clones bactériens animaux multi-résistants (SARM, E. coli BLSE, …).

Les objectifs pour 2014 visent la poursuite (i) de l’élargissement du périmètre de la surveillance de l’antibiorésistance animale en France (réseau Résapath), tel qu’inscrit dans le plan EcoAntibio 2017 (mesure n°11) et (ii) de l’ensemble des actions d’expertise et de recherche autour de cette question.

Référence





Mandat : LNR associé Résistance antimicrobienne

Titre explicite de la méthode : NF U47-107

Priorité (impératif, programmé) : Révision en 2013

Technique / Matrice / Type de méthode Antibiogramme par diffusion en milieu gélosé

Délivrable pour 2014 Pas de révision prévue

Officialisation de méthodes

Mandat(s)

LNR associé Résistance antimicrobienne 0

2. Expertise scientifique et technique relative aux méthodes d’analyse (dont participation aux

instances de normalisation nationales ou internationales)

Mandat Demandes d’EST attendues en 2014

LNR associé Résistance antimicrobienne

Antibiogramme


Mandat Participation à des comités, commissions, GT de normalisation de méthodes d’analyse ISO, CEN, AFNOR, FAO, OIE…


GT2, commission U47 (AFNOR). Présidence du Comité Vétérinaire de l’Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie








Antibiorésistance animale

EILA Impératif Souches bactériennes caractérisées, méthode U47-107

Annuelle


Mandat(s) EILA EILV


1 (62 laboratoires) 0


Titre de session(s) de formation/atelier/séminaire dispensée(s) aux laboratoires officiels



Journée Résapath Impératif X (annuelle)

4. Accréditation




Aucune Sans objet

Mandat : Maintien de l’accréditation COFRAC pour l’antibiogramme par diffusion en milieu gélosé

Au travail s’ajoute l’entretien des lignes d’accréditation Oui (maintien de l’accréditation COFRAC pour l’antibiogramme par diffusion en milieu gélosé)








EILA organisés par le LR-UE (antibiorésistance) - EILA Escherichia coli - EILA Salmonella

EILA Impératif Souches bactériennes caractérisées, méthode U47-

X (annuelle)


- EILA Campylobacter - EILA staphylocoques - EILA entérocoques

107


Mandat Demandes de contrôles attendues en 2014

Sans objet Sans objet

7. Souchothèques


Au travail s’ajoute l’entretien des collections Oui

Si oui, Opérations particulières programmées : non

8. Autre action dans le domaine de la référence Rien à signaler.




Non encore défini par l’autorité




Résapath Animation Rapport 2013

Recherche

11. Projets de recherche initiés avant 2014, toujours en cours au 01/01/2014

non détaillés, intégration de la liste des conventions en cours enregistrées à la DFT souhaitée listés et détaillés ci-dessous :

12. Projets de recherche qui démarrent en 2014 : Pas de projet qui ne soit déjà démarré en 2013 sur convention (cf 11)



Titre Nom doctorant Durée : m/an-m/ an Financeurs

Diversité, acquisition et expression de la virulence d’Escherichia coli associé aux pathologies bovines, lien avec l’antibiorésistance

Morgan Bihannic 02/2012 – 02/2015 Anses-INRA

Diffusion d’îlots génomiques de multirésistance aux antibiotiques chez Proteus mirabilis : épidémiologie moléculaire, réservoir animal, potentiel de dissémination

et d’acquisition de gènes de -lactamase à spectre étendu et

Eliette Schultz 01/2013 – 01/2016 Anses-INRA


conditions expérimentales associées

Caractérisation des mécanismes moléculaires de résistance aux béta-lactamines chez l’animal en Tunisie

Raoudha Grami (Tunisie)

09/2011 – 09/2014 Ministère recherche Tunisie – région Rhône -Alpes

Post-doctorats prévus (sujets acceptés) et en cours

Titre Nom du postdoc

Durée : mois année-mois année

Financeurs

Etude des relations entre spécificité d’hôte, groupes phylogénétiques, pathotypes et production de Béta-Lactamases à Spectre Etendu (BLSE) dans l’espèce Escherichia coli chez les bovins

Romain Dumoulin

01/2012- 06/2014 Anses

14. Habilitation à diriger les recherches Sans objet


Titre de la manifestation




Journée Résapath Impératif Automne 2014

Laboratoires agréés

Responsabilité de LNR

X (annuelle)


Rien à signaler.


Unité d’Epidémiologie

Chef d’unité : Didier Calavas

Depuis 2007, l’activité de l’unité Epidémiologie s’est progressivement réorientée, en faisant diminuer la part consacrée à la thématique historique des EST. Les deux grandes thématiques de recherche de l’unité Epidémiologie sont actuellement l’antibiorésistance (en lien étroit avec l’unité Antibiorésistance et Virulence Bactériennes) et la recherche en méthodologie de la surveillance (surveillance syndromique et surveillance basée sur le risque). Au-delà de ses recherches propres, l’unité apporte un appui méthodologique aux autres unités, contribue au programme d’activité de la Plateforme ESA, répond à des demandes DGAl, co-anime les réseaux Résapath et Vigimyc et participe aux dispositifs de surveillance des ESST. Les objectifs pour 2014 sont de i) poursuivre les projets en cours en antibiorésistance, notamment l’exploration du lien usage-résistance, ii) développer l’exploitation épidémiologique des données issues du Résapath, plus précisément l’aspect multirésistance, iii) poursuivre les travaux en cours sur la surveillance syndromique, et iv) développer une approche de surveillance basée sur le risque.

Référence

L’unité ne fait pas de référence

L’unité a un programme de travail spécifique LR-UE et ne l’intègre pas ici L’unité a un programme de travail spécifique LR-UE intégré dans les rubriques ci-après

1. Développement ou acquisition de méthodes Sans objet


Sans objet


Mandat :






Antibiorésistance animale

EILA Impératif Souches bactériennes caractérisées, méthode U47-107

Annuelle


Mandat(s) EILA EILV


1 (62 laboratoires) 0


Titre de session(s) de formation/atelier/séminaire dispensée(s) aux laboratoires officiels




Journée Résapath Impératif (annuelle)

4. Accréditation Sans objet

5. Participation à des EIL Sans objet

6. Contrôle de kits et de réactifs Sans objet

7. Souchothèques Sans objet

8. Autre action dans le domaine de la référence Rien à signaler



Non encore défini par l’autorité




Résapath Animation Rapport 2013

Surveillance des EST Synthèse annuelle de la surveillance Articles dans le Bulletin Epidémiologique

Vigimyc Analyse des données de surveillance Contribution au rapport 2013

Recherche

11. Projets de recherche initiés avant 2014, toujours en cours au 01/01/2014 non détaillés, intégration de la liste des conventions en cours enregistrées à la DFT souhaitée

listés et détaillés ci-dessous :

Thématique : Antibiorésistance



Multirésistance des E. coli pathogènes Programmé oui

Période Début (mois année) : septembre 13 Fin prévue (mois année) : décembre 14



Décrire les objectifs à atteindre et tâches à réaliser au cours de l’année 2014 (max 10 lignes) : Valorisation épidémiologique des données issues du Résapath : multirésistance des Escherichia coli au sein des différentes espèces animales







Thématique : Antibiorésistance


Sujet dans le champ de la lettre d’orientation (LOR)

Usage des antibiotiques et antibiorésistance en filière veaux de boucherie

Programmé oui

Période Début (mois année) : octobre 13 Fin prévue (mois année) : octobre 15

Positionnement de l’équipe coordinateur

Organisme(s) financeur(s) Ministère en charge de l’agriculture

Décrire les objectifs à atteindre et tâches à réaliser au cours de l’année 2014 (max 10 lignes) : Fin de collecte des données usage en élevage, fin de réalisation des prélèvements, saisie, analyses en laboratoire, début de l’analyse statistique


Nombre de mois sur l’année : 13 Période : 01/14 – 09/14


Entités/unités partenaires ou noms des établissements : Idele, Interveau

Thématique : Surveillance syndromique



Développement d’outils de surveillance syndromique chez les bovins

Programmé oui

Période Début (mois année) : janvier 08 Fin prévue (mois année) : décembre 15



- Décrire les objectifs à atteindre et tâches à réaliser au cours de l’année 2014 (max 10 lignes) : - Mortalité des bovins : étude par simulations de la sensibilité de détection du système de

surveillance à l’échelle nationale, étude de l’influence des conditions météorologiques sur la mortalité, étude des causes de mortalité, mise en place du projet pilote OMAR

- Données d’inspection en abattoirs des bovins : étude de la cysticercose, modélisation des données de surveillance

- Avortements des bovins : création d’un indicateur indirect, modélisation spatio-temporelle


Nombre de mois sur l’année : 21 Période : 01/14 – 12/14




Thématique : Surveillance



Analyse des visites sanitaires bovines Impératif oui

Période Début (mois année) : septembre 12


Fin prévue (mois année) : juin 14



Décrire les objectifs à atteindre et tâches à réaliser au cours de l’année 2014 (max 10 lignes) : Conception du questionnaire et du plan d’échantillonnage et analyse statistique des visites sanitaires bovines 2013 et 2014.






12. Projets de recherche qui démarrent en 2014 Sans objet



Titre Nom du doctorant

Durée : mois année-mois année

Financeurs

Analyse et modélisation des données d’inspection en abattoir dans l’objectif de contribuer à la surveillance épidémiologique de la population bovine

Céline Dupuy 09/11 – 09/14 ENSV

Surveillance des avortements chez les bovins : évaluation du dispositif actuel et analyse des données démographiques et de reproduction à des fins d’élaboration d’un outil complémentaire de surveillance syndromique

Anne Bronner

09/12 – 09/15

14. Habilitation à diriger les recherches : 1


Titre de la manifestation




Journée Résapath impératif Automne 2014

Laboratoires du réseau

Responsabilité de LNR et d’animateur de réseau

(annuelle)

Journée Vigimyc Impératif Automne 2014

Laboratoires du réseau

Responsabilité d’animateur de réseau

(annuelle)

16. Autre(s) action(s) nationale(s) ou internationale(s) : Rien à signaler.


Unité de Virologie

Chef d’unité : Philippe MARIANNEAU

Les activités de l’Unité Virologie se répartissent selon deux thématiques : le virus de la Fièvre de la

Vallée du Rift et les hantavirus, tous membres de la famille des Bunyaviridae.

Le développement de la thématique Fièvre de la Vallée du Rift (FVR) a été souhaité par les directions

générale et scientifique de l’Anses pour répondre à des recommandations faites par les experts de

l’Anses visant à une meilleure préparation face à une éventuelle émergence de cette zoonose en

Europe et en France métropolitaine (recommandations dans le « Rapport sur le risque de

propagation de la FVR dans l’Océan Indien », Afssa 2008). Le but de cet axe d’activités est de pouvoir

disposer de méthodes et d’outils sensibles et spécifiques pour le diagnostic sérologique et

moléculaire du virus de la Fièvre de la Vallée du Rift (vFVR). Le laboratoire a été officiellement

nommé par le Ministère de l’Alimentation, de l’Agriculture et de la Pêche, Laboratoire National de

Référence (LNR) pour la Fièvre de la Vallée du Rift (diagnostic sérologique) (Arrêté du 19 octobre

2011 paru au JO du 28 octobre 2011). Il est également, en association avec 3 unités de l’Institut

Pasteur, laboratoire de référence OIE pour les virus FVR et CCHF (Fièvre Hémorragique de Crimée-

Congo). Outre la mise en place des techniques de diagnostic, un des axes de recherche prioritaire de

l’unité est le développement d’un modèle animal pertinent pour l’étude des interactions virus-hôte

et pour les tests de vaccins ou candidats vaccins sur le territoire français.

La thématique sur l’expertise et la recherche sur les hantavirus a été plus récemment développée et

vise à mieux comprendre la circulation des hantavirus dans les populations de rongeurs en France

mais également les relations du virus avec son réservoir et les phénomènes de franchissement de la

barrière d’espèces notamment à partir d’infections expérimentales de rongeurs sauvages.

Référence





Mandat : LNR Sérologie RVF

Titre explicite de la méthode : ELISA IgM avec antigènes produits au LNR

Priorité (impératif, programmé) : Programmé

Technique / Matrice / Type de méthode Détection IgM/Sérum/ELISA

Délivrable pour 2014


Titre explicite de la méthode : Isolement sur cerveaux de souriceaux


Technique / Matrice / Type de méthode Isolement viral/Sérum ou broyat/inoculation intracraniale



Titre explicite de la méthode : Lamp PCR



Technique / Matrice / Type de méthode Détection moléculaire/Sérum/amplification génétique isothermale



Mandat(s) Indiquer le nombre de méthodes que vous prévoyez de proposer à la tutelle pour officialisation au cours de l’année 2014 (indicateur COP)

2. Expertise scientifique et technique relative aux méthodes d’analyse (dont participation aux

instances de normalisation nationales ou internationales) Rien à signaler.

3. Animation des réseaux de laboratoires officiels Rien à signaler.

4. Accréditation




Accréditation COFRAC envisagée pour 2014 programmé


Mandat :






Détection de la FVR EILA programmé Détection moléculaire et détection sérologique


Rien à signaler.

7. Souchothèques

Mandat : LNR RVF

Au travail s’ajoute l’entretien des collections Non

Si oui, Opérations particulières programmées





Recherche

9. Projets de recherche initiés avant 2014, toujours en cours au 01/01/2014 non détaillés, intégration de la liste des conventions en cours enregistrées à la DFT souhaitée


Thématique : FVR

Titre du projet



Vaccins contre la menace du virus de la Fièvre de la Vallée du Rift

Impératif Oui

Période Début (mois année) : 04/2013 Fin prévue (mois année) : 04/2016

Positionnement de l’équipe Partenaire

Organisme(s) financeur(s) ANR Astrid

Décrire les objectifs à atteindre et tâches à réaliser au cours de l’année 2014 : Le but de RiftVac est de développer des vaccins RVFV protéiques ou à ADN ciblant les DC SIRP- ovines ainsi que des vaccins pox recombinants, seuls ou association, dans le modèle préclinique ovin.




Entités/unités partenaires ou noms des établissements : INRA (Nouzilly et Jouy en Josas) et IRBA (Lyon)

Thématique : FVR



Etude sérologique, moléculaire et épidémiologique de l’infection par le virus de la Fièvre de la Vallée du Rift en Tunisie

Impératif Oui


Positionnement de l’équipe Co-Coordinateur

Organisme(s) financeur(s) PHC-Utique, CMCU

Décrire les objectifs à atteindre et tâches à réaliser au cours de l’année 2014 (max 10 lignes) : Mise en place d’outils de diagnostic et d’un système de surveillance active de la santé animale et de la santé publique en Tunisie.




Entités/unités partenaires ou noms des établissements : unité Epidémiologie-Laboratoire de Lyon


IRVT (Tunisie)


Thématique : Hantavirus

Titre du projet



Recherche et isolement d’hantavirus à partir de différentes population de rongeurs et soricomorphes en France

Programmé oui


Positionnement de l’équipe

Organisme(s) financeur(s)

Décrire les objectifs à atteindre et tâches à réaliser au cours de l’année 2014 (max 10 lignes) : Essayer d’isoler le virus Puumala (hôte naturel : campagnol roussâtre) qui circule dans les régions du quart NE de la France et qui est responsable d’une fièvre hémorragique à syndrome rénale modérée. Caractériser la circulation d’autres hantavirus chez les rats (virus Seoul), chez le campagnol commun (virus Tula) ou dans les soricomorphes.




VetAgroSup (Lyon), UCBL (Lyon), INRA (Clermont Ferrand)


10. Projets de recherche qui démarrent en 2014

Thématique : Hantavirus



Importance de la réponse inflammatoire et de sa régulation dans la distribution de l’hantavirus Puumala au sein des populations de campagnols roussâtres (Myodes glareolus) en Europe.

Impératif oui


Positionnement de l’équipe Coordinateur

Organisme(s) financeur(s) ANSES/INRA

Décrire les objectifs à atteindre et tâches à réaliser au cours de l’année 2014 (max 10 lignes) : Ce projet de thèse

s’articule autour de trois questions majeures concernant 1) la mise en évidence de la tolérance des

campagnols roussâtres à l'hantavirus Puumala (PUUV), 2) la recherche des régions génomiques

évoluant sous sélection en réponse à l’adaptation à PUUV et pouvant être liées aux mécanismes de

tolérance, et 3) l’analyse de l’impact des infections des campagnols par des helminthes sur leur

sensibilité à PUUV.




Entités/unités partenaires ou noms des établissements : CGBP INRA Montpellier




Titre Nom du doctorant Durée : m/an-m/an Financeurs

Importance de la réponse inflammatoire et de sa régulation dans la distribution de l’hantavirus Puumala au sein des populations de campagnols roussâtres (Myodes glareolus) en Europe.

A recruter 10/2013 – 10/2016 ANSES/INRA

12. Habilitation à diriger les recherches

Philippe Marianneau

13. Organisation de manifestations scientifiques Rien à signaler.


Rien à signaler


Unité Résistance aux Produits Phytosanitaires (RPP)

Chef d’unité : Annie MICOUD

L’unité surveille l'émergence et l'évolution des phénomènes de résistance chez les principaux

bioagresseurs d'intérêt économique (champignons, ravageurs, bactéries et adventices). Elle

contribue à la mise en place et à la réalisation des plans de surveillance de la DGAl concernant le

volet Résistances des Effets Non Intentionnels (ENI) des produits phytosanitaires.

Elle apporte son expertise à l'évaluateur du risque (expertise de dossiers de demandes d'AMM pour

la DPR) et au gestionnaire (participation avec la DGAl, l'INRA et les Instituts techniques à l'élaboration

des notes techniques communes Résistances).

Ces travaux de recherche portent sur l'étude des mécanismes en jeu dans les phénomènes de

résistance. Ils sont réalisés en collaboration avec les partenaires des quatre unités INRA spécialisées

dans ce domaine.

Les objectifs de l’unité RPP pour 2014 peuvent être déclinés selon deux axes :

- Renforcer l'activité de référence en axant l'activité de l'unité sur la recherche de la sensibilité de base de divers bio-agresseurs vis-à-vis de nouvelles familles de substances actives ainsi que sur la formalisation des méthodes,

- Consolider l'activité de recherche sur deux sujets d'intérêt : Myzus persicae, Botrytis cinerea (collaboration INRA Grignon).


Référence



L’unité a un programme de travail spécifique LR-UE intégré dans les rubriques ci-après (cocher


Mandat : Champ RPP

Titre explicite de la méthode : Définition de la sensibilité de base du Mildiou de la pomme de terre vis-à-

vis des fongicides de la famille des Carboxylic Acide Amides (CAA) Priorité (impératif, programmé) : programmé

Technique / Matrice / Type de méthode Méthode biologique / détermination du seuil de sensibilité

Délivrable pour 2014 Premiers résultats de sensibilité de base (à conforter par des données supplémentaires à collecter au cours de nouvelles campagnes de prélèvements)

Mandat : Mandat RPP

Titre explicite de la méthode : Définition de la sensibilité de base de la Tavelure vis-à-vis du boscalid

Priorité (impératif, programmé) : programmé

Technique / Matrice / Type de méthode Méthode biologique / détermination du seuil de sensibilité

Délivrable pour 2014 Fonction du nombre d'échantillons qui pourront être traités au cours des campagnes 2013 et 2014


Mandat(s) Indiquer le nombre de méthodes que vous prévoyez de proposer à la tutelle pour officialisation au cours de l’année 2014 (indicateur COP)

Mandat RPP 2 lignes directrices et 1 méthode


Mandat Demandes d’EST attendues en 2014

Pas d’EST programmées à ce stade

Mandat Participation à des comités, commissions, GT de normalisation de méthodes d’analyse ISO, CEN, AFNOR, FAO, OIE…

Mandat RPP Groupe de travail Résistance de l'OEPP


Mandat :






... Cliquer ici Cliquer ici


4. Accréditation

Mandat

Entretien des lignes d’accréditation Oui


RIEN À SIGNALER.

6. Contrôle de kits et de réactifs RIEN À SIGNALER.

7. Souchothèques RIEN À SIGNALER.

8. Autre action dans le domaine de la référence : RIEN À SIGNALER.



Note de service Résistance 2014 en cours d'élaboration.

L'unité RPP a participé à la première étape d'élaboration de ce plan de surveillance 2014 (en pièce jointe, document listant les thèmes qui concerneront l'unité RPP).


RIEN À SIGNALER.

Recherche

11- Projets de recherche initiés avant 2014, toujours en cours au 01/01/2014

non détaillés, intégration de la liste des conventions en cours enregistrées à la DFT souhaitée

(passer à la rubrique 1)


Thématique : Résistances aux insecticides



Résistance et structure génétique des populations de Myzus persicae

Programmé oui


Positionnement de l’équipe Coordination et encadrement technique

Organisme(s) financeur(s) Financement France Agri Mer (FAM) Décrire les objectifs à atteindre et tâches à réaliser au cours de l’année 2014 (max 10 lignes) : Objectifs : Etablir les facteurs influant sur la distribution des allèles et génotypes résistants et sur leur propagation entre les espèces culturales hôtes du puceron 2014 : Collecte des isolats de Myzus persicae dans les différentes cultures-hôtes ciblées, génotypage neutre et sélectionné sur les différents échantillons prélevés et exploitation des données obtenues



Nombre de mois sur l’année : 12 Période : 1/10/2013 – 30/09/2014


Entités/unités partenaires ou noms des établissements : Intra-Anses : Unité Epidémiologie Anses-Lyon, Anses-DPR Hors Anses : INRA Rennes (porteur du projet)


12- Projets de recherche qui démarrent en 2014 RIEN À SIGNALER.

13- Récapitulatifs des thèses et post-doctorats


Titre Nom doctorant Durée : m/an-m/ an Financeurs Caractérisation du cytochrome P450 Cyp62 impliqué dans la résistance au fenhexamid et analyse de la distribution / prévalence de génotypes résistants dans les populations de Botrytis cinerea.

Saad AZEDDINE 12/2010 – 12/2013 Soutenance début 2014

Anses - INRA

-

Post-doctorats prévus (sujets acceptés) et en cours

Titre Nom du postdoc Durée : mois année-mois année Financeurs Résistance et structure génétique des populations de Myzus persicae

Cécile Capderrey

1/10/2013 – 30/09/2014 Emploi porté par l'INRA de Rennes

FAM

14- Habilitation à diriger les recherches

RIEN À SIGNALER.

15- Organisation de manifestations scientifiques RIEN À SIGNALER.

16- Autre(s) action(s) nationale(s) ou internationale(s)

RIEN À SIGNALER.

32

PROJET NS 2014 (Propositions du Groupe technique d'EXPERTS RESISTANCE)

CULTURE

THEMES STATUT

Type de test CONTEXTE /

OBSERVATIONS LABO

concernés Bioagresseur substance active

ou famille Référence (R)

Surveillance (S)

VIGNE

Mildiou

QiI R biotest Surveillance de l'émergence de résistances à cette famille de s.a. Parcelles ciblées avec historique "lourd" en QiI Anses Lyon

CAA S biotest Surveillance progression de la résistance au terrain. Choix des parcelles : aléatoire

POMMIER

Tavelure

QoI S test biomol. Surveillance de l'évolution de la résistance Anses Lyon

boscalid R biotest Recherche des premières dérives de sensibilité

Anses Lyon

Triazoles (tébuco, difénoconazole…)

S biotest Anticiper les associations avec SDHI Anses Lyon

Carpocapse chlorpyriphos R biotest +

enzym

Surveillance de l'émergence de résistances à cette s.a. qui reste une solution "stratégique" dans la lutte

Anses Lyon

PECHER Fusicoccum thiophanate-méthyl R biotests Acquisition de la méthode Anses Lyon

Myzus néonicotinoïdes R / S

biotests et test biomol.

Recherche de la mutation de cible R81T (et, en parallèle, des mutations liées à la R aux pyréthrinoïdes)

Anses Lyon

COLZA Sclérotinia boscalid R biotests Recherche des

premières dérives (parcelles ciblées) Anses Lyon

33

Myzus

persicae néonicotinoïdes pyréthrinoïdes

R / S biotests +

test biomol.

Recherche de la mutation de cible R81T (et, en parallèle, des mutations liées à la R aux pyréthrinoïdes, compte tenu des associations disponibles au terrain)

Anses Lyon

POMME DE TERRE

Mildiou dimétomorphe fluazinam cyazifamide

R biotests Acquisition de la méthode (1 population Sensible et 1 population à pression de sélection)

Anses Lyon

GRANDES CULTURES

Ivraie raide / Ray-Grass

Glyphosate S biotests Surveillance de l'éventuel passage de la résistance des cultures pérennes vers les GC. Parcelles ciblées.

Anses Lyon

SALADES Nasonovia ribis-nigri acetamipride thiametoxam

R biotests Acquisition de la méthode Anses Lyon (avec INRA Avignon)

MELON Oïdium bupirimate R biotests Etablissement de la ligne de base / bupirimate (1 sensible et 1 à pression de sélection)

Anses Lyon

TOMATE sous abris

Botrytis

pyriméthanil fenhexamid iprodione boscalid

S biotests Surveillance de l'émergence de résistance à ces s.a. dans cette culture

Anses Lyon

FRAISE Botrytis boscalid pyraclostrobine iprodione

S biotests Surveillance de l'émergence de résistance à ces s.a. dans cette culture

Anses Lyon

programmes de travail des laboratoires - anses.fr · une première thématique est liée à...

Documents