proyecto docente informática aplicada a la biología grupo
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Datos básicos de la asignaturaTitulación: Grado en BiologíaAño plan de estudio: 2009
Curso implantación: 2009-10Centro responsable: Facultad de Biología
Nombre asignatura: Informática Aplicada a la BiologíaCódigo asigantura: 1530002Tipología: TRONCAL / FORMACIÓN BÁSICACurso: 1Periodo impartición: Primer cuatrimestre
Créditos ECTS: 6Horas totales: 150Área/s: Análisis MatemáticoDepartamento/s: Ecuaciones Diferenciales y Análisis Num.
Coordinador de la asignatura
PEREZ PEREZ M. TERESA
Profesorado
Profesorado del grupo principal:
SUAREZ GRAU FRANCISCO JAVIER
Profesorado de otros grupos de la asignatura:
FERNANDEZ ROMERO ANTONIO
MARIN GAYTE IRENE
Objetivos y competencias
OBJETIVOS:
Conocimientos y técnicas básicas de informática con el objetivo de resolver problemas con el
ordenador y tener capacidad para organizar y manipular bases de datos. Manejo básico de la
hoja de cálculo EXCEL (o similar) y del paquete informático MATLAB (o similar).
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Informática Aplicada a la Biología
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CURSO 2020-21
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COMPETENCIAS:
Competencias específicas:
1.- Conocimientos y técnicas básicas de informática.
2.- Destrezas prácticas en el manejo de programas informáticos útiles en el ámbito científico.
3. - Capacidad de resolución de problemas con el ordenador.
4. - Capacidad de organizar y manipular bases de datos.
5.- Capacidad de interpretación de resultados obtenidos por ordenador.
6.- Habilidades de presentación ordenada de información y resultados.
7.- Capacidad de autoaprendizaje.
8.- Capacidad de trabajo en grupo.
9.- Capacidad de modelado y simulación de problemas experimentales.
Competencias genéricas:
Capacidad de organizar y planificar
Conocimientos generales básicos
Habilidades elementales en informática
Resolución de problemas
Toma de decisiones
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Trabajo en equipo
Habilidades para trabajar en un equipo interdisciplinario
Habilidad para trabajar de forma autónoma
Capacidad para aplicar la teoría a la práctica
Habilidades para trabajar en grupo
Capacidad de análisis y síntesis
Habilidades para recuperar y analizar información desde diferentes fuentes
Contenidos o bloques temáticos
1.- Manejo básico de una hoja de cálculo (EXCEL o similar).
2.- Introducción a las bases de datos.
3.- Introducción a algunas herramientas informáticas de cálculo matemático y simulación, de utilidad
en Biología (MATLAB o similar).
4.- Herramientas informáticas para el Cálculo numérico elemental.
5.- Resolución con ordenador de ecuaciones diferenciales.
6.- Introducción al cálculo simbólico.
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Relación detallada y ordenación temporal de los contenidos
Sesiones de Teoría (26 horas):
Tema 1. Introducción. Bioinformática y Biocomputación. Motivación histórica. (1 hora aprox.)
Parte 1: Bioinformática (15 horas aprox.).
Tema 2. Introducción básica a los ordenadores. Elementos del software. (2 horas aprox.).
Tema 3. Introducción a la programación: Algoritmos y diagramas de flujo. (9 horas aprox.).
Temas 4 y 5. Internet. Bases de datos. (2 horas aprox.)
Tema 6. Sistemas binario y decimal. Errores. (2 horas aprox.)
Parte 2: Biocomputación (aprox. 10 horas).
Tema 7. Introducción a los sistemas dinámicos: Modelado de la realidad.(1 hora aprox.)
Tema 8. Modelos continuos unidimensionales en sistemas biológicos:
Conceptos básicos. Modelos de poblaciones: ecuación logística,
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modelos de pesca. Otros modelos. (5 horas aprox.).
Tema 9. Modelos continuos bidimensionales en sistemas biológicos:
Conceptos básicos. Modelos de Lotka-Volterra. Otros modelos.
(4 horas aprox.).
Sesiones de Práctica (30 horas):
Tema 0. Introducción (0'5 horas aprox.)
Introducción a la Enseñanza Virtual.
Tema 1. MATLAB 1 (14'5 horas aprox.)
Introducción. Tipos de datos. Operaciones elementales. Introducción al cálculo simbólico.
Funciones matemáticas intrínsecas. Variables. Vectores y matrices. Gráficas.
Cálculo numérico con MATLAB: raíces de ecuaciones.
Introducción a la programación.
Introducción al manejo de cadenas de caracteres.
Tema 2. OpenOffice Calc (10 horas aprox.)
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Introducción. Fórmulas y funciones. Referencias absolutas y relativas. Gráficas. Funciones
lógicas.
Bases de datos: filtros, ordenación. Funciones de bases de datos.
Tema 3. MATLAB 2 (4 horas aprox.)
Resolución numérica de modelos continuos de sistemas biológicos.
Interpretación de resultados. Ejemplos de modelos aplicados a la Biología.
Tema 4. Bases de datos con interés en Biología. Ejemplos prácticos (1 hora aprox.)
Actividades formativas y horas lectivas
Actividad Créditos Horas
A Clases Teóricas 2,6 26
G Prácticas de Informática 3,4 34
Metodología de enseñanza-aprendizaje
Prácticas informáticas
El alumno trabajará en el ordenador del aula los contenidos teóricos y prácticos que se le vayan
impartiendo.
Se ampliarán explicaciones, soluciones de problemas, dudas, tutorías, seminarios y discusión de las
conclusiones de los grupos de trabajo.
Los alumnos realizarán búsqueda, consulta y tratamiento de la información, elaboración de
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trabajos en grupo, experimentación y observación.
Clases teóricas
La asignatura incidirá en el manejo del ordenador. El alumno trabajará en el ordenador del aula los
contenidos teóricos que se le vayan impartiendo.
Se realizarán clases magistrales, se ampliarán explicaciones, soluciones de problemas, dudas,
tutorías, seminarios y discusión de las conclusiones de los grupos de trabajo.
Los alumnos realizarán búsqueda, consulta y tratamiento de la información, elaboración de
trabajos en grupo, experimentación y observación.
Actividades académicas dirigidas con presencia del profesor
Se podran proponer cuestiones mas o menos detalladas y relacionadas con la materia
para ser desarrolladas por los alumnos de manera individual o en grupo.
Actividades académicas dirigidas sin presencia del profesor
Investigación, recopilación y concreción de información a partir de los recursos bibliográficos
disponibles.
Sistemas y criterios de evaluación y calificación
Valorando la adquisición de las competencias y conocimientos que persigue la
materia.
Propuestos tanto para las sesiones presenciales como para trabajo individual del alumno.
Examen final del programa completo de la asignatura para los alumnos que no aprueben por
curso y para los de las convocatorias extraordinarias.
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Se valorará la asistencia a clase.
Criterios de calificación del grupo
La asignatura podrá aprobarse a través de dos vías:
Primera vía: con anterioridad a la primera convocatoria, mediante la realización de dospruebas
parciales de seguimiento.
Cada prueba parcial consistirá en un examen con una parte teórica y otra práctica. Estas pruebas
se realizarán en la fecha, hora y aula a determinar. La convocatoria de dichos exámenes será
publicada con la suficiente antelación en el espacio de la asignatura de la plataforma de Enseñanza
Virtual.
La nota final de cada prueba será la ponderación de la nota de la parte práctica y de la teórica,
de acuerdo a 60% las prácticas y 40% la teoría.
Para superar la asignatura por esta vía, será necesario obtener una calificación igual o superior a5
en cada prueba parcial. Además, se valorará una participación activa en las clases.
La calificación final de la asignatura será la resultante de hacer la media aritmética entre lasnotas
de las dos pruebas parciales.
Segunda vía: si no se ha aprobado usando la opción anterior, deberá hacerse a través de los
exámenes de convocatorias oficiales (ver fechas de exámenes).
El examen final de la 1ª convocatoria (5 de febrero de 2021) constará de dos partes. En cadaparte
se evaluará la materia teórica y práctica correspondiente a cada prueba intermedia y el alumno
podrá examinarse sólo de la parte correspondiente a la prueba parcial que tenga suspensa o de la
asignatura completa. Esto sólo será posible en esta convocatoria.
El alumno que quiera subir nota podrá hacerlo en el examen final de la 1ª convocatoria
examinándose de la asignatura completa.
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En la 2ª y 3ª convocatorias (15 de septiembre de 2021 y 9 de diciembre 2020, respectivamente) los
alumnos deberán examinarse de la asignatura completa que
también constarán de dos partes.
La calificación final, por esta segunda vía, se obtendrá igualmente con la ponderación de un 60%de
la nota de la parte práctica y un 40% de la teórica. Los alumnos que se examinen de la asignatura
completa no tendrán que sacar una nota mínima en cada parte.
La entrega de todos los exámenes se hará a través de la Enseñanza Virtual, por este motivo, es
requisito imprescindible que el alumno sepa comprimir (en un fichero .zip o .rar) la carpeta creada
con los ficheros generados durante el examen, así como subir dicha carpeta comprimida a través de
la plataforma, por si mismo.
Además del escenario cero, descrito anteriormente, se tendrán en cuenta los siguientes escenarios
--- Escenario A : Reducción de la presencialidad en caso de imposición de medidas sanitarias de
distanciamiento interpersonal.
En este escenario la asistencia de los alumnos a las clases teóricas se ajustará al sistema rotatorio
que disponga la Facultad de Biología. Los días restantes se seguirán las clases on-line, mediante el
uso de la plataforma Blackboard Collaborate Ultra o similar.
En cuanto a las clases prácticas se realizarán en su totalidad en modalidad on-line y mediante el
uso de la plataforma Blackboard Collaborate Ultra o similar.
En todo momento se incentivará una participación lo más activa posible, proporcionando a los
alumnos un programa detallado de los contenidos objeto de estudio, además de material impreso
y/o audiovisual para complementar los aspectos más teóricos de la materia.
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Se mantiene el sistema de evaluación estándar, realizándose las pruebas parciales y los exámenes
finales de manera presencial.
En el caso de que las condiciones sanitarias y las autoridades académicas no permitan la
realización presencial de los exámenes, introducimos una única modificación: en esta situación, no
tendrán lugar dos exámenes parciales, sino un único examen previo al examen final.
En este contexto de aislamiento más severo, todas las pruebas se realizarán de forma telemática
adoptándose los mecanismos de garantía de autoría del mismo, que la Universidad de Sevilla
determine y ponga a disposición del profesorado.
--- Escenario B : Suspensión total de la actividad presencial
En este escenario todas las clases se impartirán on-line, utilizando la herramienta Blackboard
Collaborate Ultra o similar.
En todo momento se incentivará una participación lo más activa posible, proporcionando a los
alumnos un programa detallado de los contenidos objeto de estudio, además de material impreso
y/o audiovisual para complementar los aspectos más teóricos de la materia.
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En este contexto, todas las pruebas se realizarán de forma telemática adoptándose los mecanismos
de garantía de autoría del mismo, que la Universidad de Sevilla determine y ponga a disposición del
profesorado. Asimismo, tampoco en esta situación tendrán lugar dos exámenes parciales, sino un
único examen previo al examen final.
Horarios del grupo del proyecto docente
https://biologia.us.es/es/docencia/titulaciones/
Calendario de exámenes
https://biologia.us.es/es/docencia/titulaciones/
Tribunales específicos de evaluación y apelación
Presidente: TOMAS CARABALLO GARRIDO
Vocal: ANTONIO SUAREZ FERNANDEZ
Secretario: ANNA DOUBOVA KRASOTCHENKO
Suplente 1: JUAN CASADO DIAZ
Suplente 2: JOSE ANTONIO LANGA ROSADO
Suplente 3: MARIA ANGELES RODRIGUEZ BELLIDO
Bibliografía recomendada
BIBLIOGRAFÍA GENERAL:
Introducción a la computación.
Autores: Peter Norton
Edición: Ed. McGraw-Hill, 2006
Publicación: libro
ISBN: 9788467628708
Bioinformática: simulación, vida artificial e inteligencia artificial,
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Autores: R. Lahoz-Beltrá
Edición: Ed. Diaz de Santos, 2004.
Publicación: libro
ISBN: 978-84-368-1924-3
BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA:
Introducción a la Bioinformática
Autores: Attwood, T.K., y Parry-Smith, D.J
Edición: Prentice-Hall, 2002
Publicación: libro
ISBN: 9788467628708
Bioinformatics for dummies
Autores: Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame
Edición: Indianapolis, IN : Wiley Pub., 2007.
Publicación: libro
ISBN: 9788467628708
Resolución de problemas en ingeniería química y bioquímica con POLYMATH, Excel y MATLAB.
Autores: Michael B. Cutlip, Mordechai Shacham
Edición: Ed. Pearson Educación, cop. 2008.
Publicación: libro
ISBN: 9788467628708
Calculus for Biology and Medicine.
Autores: Neuhauser, C.
Edición: 2 ed. Pearson Education.
Publicación: libro
ISBN: 9788467628708
Ecología
Autores: Jaime Rodríguez Martínez y colaboradores.
Edición: Ed. Pirámide - Grupo Anaya, 2013
Publicación: libro
ISBN: 9788467628708
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OpenOffice.org 3.1: Writer y Calc
Autores: Varios autores
Edición: MAD, 2009
Publicación: libro
ISBN: 9788467628708
HOJAS DE CALCULO 00-CALC
Autores: MARTINEZ PEREZ, FRANCISCO MIGUEL ( Coordinador)
Edición: EDITORIAL CLUB UNIVERSITARIO, 2010
Publicación: e-libro (recurso electrónico)
ISBN: 9788484549703
INFORMACIÓN ADICIONAL
Manual de OpenOffice Calc de Valentín Roldán y Máximo Prudencio:
http://www.um.es/docencia/barzana/PRACTICAS/PDF/OpenOffice_Calc.pdf
Manual de OpenOffice Calc del Grupo Universitario de GNU/Linux de Entre Ríos:
http://www.gugler.com.ar/pdfs/manuales/calc.pdf
OpenOffice Calc a tu alcance de Antonio Roldán Martínez:
http://www.lulu.com/items/volume_66/6166000/6166296/14/print/6166296.pdf
Aprenda Matlab como si estuviera en primero de Javier García de Jalón, José Ignacio Rodríguez,
Jesús Vidal (Univ. Politécnica de Madrid):
http://www.etnassoft.com/biblioteca/aprenda-matlab-como-si-estuviera-en-primero/
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