PubMedPubMedの使い方の使い方（基礎編）

京都府立医科大学附属図書館京都府立医科大学附属図書館

2008.11.52008.11.5--66

本日の予定本日の予定

PubMedPubMed基礎編基礎編 PubMedPubMed上級上級編編

１ 忙しい人の基本検索PubMedとは検索方法

Limitsによる絞込み検索結果の見かた

電子ジャーナルリンク

印刷・ダウンロード

２ 少し慣れてきたらAuto Term MappingとはDetailsHistoryを使った検索

１ 忙しいときの検索技Clinical Queries

２ 自分用カスタマイズの技My NCBI、Clipboard

３ 図書館員の秘密技MeSHタグを使った検索

４ PubMedの最新機能Advanced SearchMy BibliographyPatiants Drug Information等

①① 忙しい人のための基本検索忙しい人のための基本検索

PubMedPubMedとはとはNLMNLMがインターネットで無料公開しているがインターネットで無料公開しているMEDLINEMEDLINE

では、では、MEDLINEMEDLINEとは？とは？

NLM（米国立医学図書館）作成の医学文献データベース。学術雑誌を中心とした4,000タイトルから1,600万件を収録医学に加え、歯学・看護学・獣医学等の論文も収録

日本語の雑誌からも70タイトルほど収録。収録範囲は、1966年から現在まで。MEDLINEはPubmedのほかにも有料・無料の様々な製品として提供されている（Ovid MEDLINEなど）

PubMedでできること

インターネットで無料公開されているインターネットで無料公開されている

収録内容は、収録内容は、MEDLINEMEDLINE＋＋OLDMEDLINEOLDMEDLINEでで19491949年から収録年から収録

医学文献についての情報を検索できる医学文献についての情報を検索できる

本文は収録されていないので、冊子体の雑誌または本文は収録されていないので、冊子体の雑誌または電子ジャーナルで読む。電子ジャーナルで読む。

京都府立医大では、リンクリゾルバを経由して冊子体京都府立医大では、リンクリゾルバを経由して冊子体の所蔵情報、電子ジャーナル本文等へリンクしているの所蔵情報、電子ジャーナル本文等へリンクしている

PubMedの基本

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijpkpumlib （京都府立医大専用入口）

Query Box

Feature Tab

Side bar

My NCBIへのリンク

キーワードによる検索

クエリーボックスにキーワードを入力

複数入力する時はスペースで区切る

大文字と小文字はどちらでもOKギリシャ文字は、α→alpha β→beta記号は、ハイフン→スペース !?%$などは省略ストップワードに注意

and, for, of, the, toなどは入力しても無視される

著者名による検索

姓 と 名のイニシャルTanaka Y

ミドルネームはイニシャルを続けるO’Regan RM

1999年以前は収録著者数に制限あり

雑誌名による検索

正式誌名New England Journal of Medicine

ISSN0028-4793 ※間のハイフンも必要

タグを使うNature[ta]

絞り込み：絞り込み：LimitsLimits

著者・雑誌名・フルテキスト著者・雑誌名・フルテキスト

絞り込み：絞り込み：LimitsLimits

出版年月日・データ追加日出版年月日・データ追加日

期間の指定または日付の指定

日付の指定は年だけでもOK

絞り込み：絞り込み：LimitsLimits

言語の指定言語の指定

サブセットサブセット

雑誌の分野、トピックで絞る雑誌の分野、トピックで絞る

絞り込み：絞り込み：LimitsLimits

論文タイプ論文タイプ

被験者の年齢被験者の年齢

LimitsLimitsの使用例の使用例

インフルエンザインフルエンザ influenzainfluenzaノイラミニダーゼ阻害薬の効果ノイラミニダーゼ阻害薬の効果neuraminidaseneuraminidase

７０歳７０歳 男性の文献への絞り込み男性の文献への絞り込みLimits: MaleLimits: Male Aged 65+ yearsAged 65+ years

検索結果の表示

抄録

なし

抄録

あり

無料EJあり

無料EJあり

略誌名，出版年月；巻（号）；ページ

記述言語（英語以外の場合）

電子ジャーナルへのリンク

・専用入口から入ってAbstractを表示させると、京都府立医科大学のアイコンを表示

・大学で契約している電子ジャーナルがあれば、本文へのリンクを表示・図書館蔵書検索へのリンクも表示

検索結果の表示変更・ダウンロード検索結果の表示変更・ダウンロード

DisplayDisplay（表示形式）について（表示形式）について

SummarySummary形式形式基本的な事項基本的な事項 著者、論題、雑誌名など著者、論題、雑誌名など

AbstractAbstract形式形式抄録、電子ジャーナルへのリンクアイコン抄録、電子ジャーナルへのリンクアイコン

Abstract PlusAbstract Plus形式形式AbstractAbstract形式形式++関連文献へのリンク関連文献へのリンク

MEDLINEMEDLINE形式形式全てのデータ全てのデータ EndNoteEndNoteへの取込時に使用への取込時に使用

Send ToSend Toによるデータの保存によるデータの保存

FileFileテキストファイルとして保存するテキストファイルとして保存する

ClipboardClipboardチェックした文献を一時的に保存する（８時間）チェックした文献を一時的に保存する（８時間）

CollectionCollectionチェックした文献を、「チェックした文献を、「My NCBIMy NCBI」に保存する」に保存する

PubMedPubMedデータの変遷データの変遷

[PubMed [PubMed ‒‒ as supplied by publisher]as supplied by publisher]雑誌出版社からデータが送られてくる雑誌出版社からデータが送られてくる

[PubMed [PubMed ‒‒ in process] in process] 書誌事項の確認や索引付けなどを行う書誌事項の確認や索引付けなどを行う

[PubMed [PubMed ‒‒ indexed for MEDLINE]indexed for MEDLINE]MEDLINEMEDLINEデータとして登録するデータとして登録する

[PubMed][PubMed]索引付けしないが索引付けしないがPubMedPubMedデータとして残すものデータとして残すもの

② 少し慣れてきたらDetailsDetails

ＰｕｂＭｅｄがどんな検索をしたのかを見ることＰｕｂＭｅｄがどんな検索をしたのかを見ることができるができる

ＰｕｂＭｅｄのＰｕｂＭｅｄのAuto Term MappingAuto Term Mappingにより、検により、検

索者が入力したキーワードは、自動的に関連索者が入力したキーワードは、自動的に関連語を広く検索している語を広く検索している

MeSHMeSH（（Medical Subject HeadingsMedical Subject Headings））が使用が使用

されているされている

MeSHMeSHととAuto Term MappingAuto Term Mapping

MeMedical dical SSubject ubject HHeadingseadings（医学件名標目）（医学件名標目）

検索を効率的にするためのシソーラス検索を効率的にするためのシソーラス

１つの１つのPubMedPubMedデータに１０以上付与データに１０以上付与

cancer

neoplasm

tumor

neoplasms

論文の著者 PubMed索引者 PubMed検索者

neoplasms

腫瘍に関する文献には、索引語としてneoplasmsを付与する

cancer

Details “SARS”

Details “Severe Acute Respiratory Syndrome ”

検索件数はあまり変わらないが、内容には大きな違いが！

MeSHMeSHととAuto Term MappingAuto Term Mapping

MeMedical dical SSubject ubject HHeadingseadings（医学件名標目）（医学件名標目）

検索を効率的にするためのシソーラス検索を効率的にするためのシソーラス

１つの１つのPubMedPubMedデータに１０以上付与データに１０以上付与

SARS

Severe acute respiratory syndrome

Severe acute respiratory syndrome

論文の著者 PubMed索引者 PubMed検索者

SARSＳＡＲＳに関する文献には、索引語としてSevere acute respiratory syndromeを付与する

Severe acute respiratory syndrome

トランケーション、フレーズ検索

トランケーション（＊）

前方一致の検索bacter* と入力すると、bacteria, bacterium, bacteriophageなど前方一致で検索Infect* ではinfection controlは検索できない600パターンまで検索可能

フレーズ検索（“”）

※Auto Term Mappingは無効になるので注意

検索検索履歴を使いこなす履歴を使いこなす：：HistoryHistory

AND AND OR NOTOR NOTＡＮＤ：ＡＮＤ： 検索結果ＡとＢに共通するデータ検索結果ＡとＢに共通するデータ

ＯＲ：ＯＲ： 複数キーワードのどれか１つ以上を含む複数キーワードのどれか１つ以上を含む

データデータ

ＮＯＴ：ＮＯＴ： 検索結果Ａから検索結果Ｂに関する検索結果Ａから検索結果Ｂに関する

文献を除いたデータ文献を除いたデータ

Ｈｉｓｔｏｒｙ

＃１：高血圧＃１：高血圧

Ｐｒｅｖｉｅｗボタン

＃２：薬物療法＃２：薬物療法

ＡＮＤ検索

高血圧高血圧××薬物療法薬物療法 ＃１＃１ ＡＮＤＡＮＤ ＃２＃２

ＮＯＴ検索

高血圧ー薬物療法高血圧ー薬物療法 ＃１＃１ ＮＯＴＮＯＴ ＃２＃２

演習

１．うつ病（depression）と薬物療法（drug therapy）に関する文献で、最新３年分のもの。看護関係の雑誌に掲載された論文に絞りたい。

２．アトピー性皮膚炎（atopic dermatitis)の食事療法（diet therapy）に関する文献で、京都府立医大で電子ジャーナルを見られるもの。