raciel j. estrada león juan g. magaña monforte josé c. segura correa
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ESTRUCTURA DE UNA BASE DE DATOS UTILIZADA PARA ESTIMAR PARÁMETROS GENÉTICOS DE CARACTERES DE CRECIMIENTO EN GANADO BRAHMAN. Raciel J. Estrada León Juan G. Magaña Monforte José C. Segura Correa. Introducción. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
ESTRUCTURA DE UNA BASE ESTRUCTURA DE UNA BASE DE DATOS UTILIZADA PARA DE DATOS UTILIZADA PARA
ESTIMARESTIMAR PARÁMETROS GENÉTICOS PARÁMETROS GENÉTICOS
DE CARACTERES DE DE CARACTERES DE CRECIMIENTO EN GANADO CRECIMIENTO EN GANADO
BRAHMANBRAHMAN
Raciel J. Estrada LeónRaciel J. Estrada LeónJuan G. Magaña Juan G. Magaña MonforteMonforteJosé C. Segura CorreaJosé C. Segura Correa
IntroducciónIntroducción
Los trópicos, han sido considerados Los trópicos, han sido considerados un lugar de retos para el un lugar de retos para el mejoramiento genético animal.mejoramiento genético animal.
Los sistemas de producción de Los sistemas de producción de carne son importantes.carne son importantes.
Ganado Ganado Bos indicus, Bos indicus, tolerancia a tolerancia a condiciones extremas, rusticidad, condiciones extremas, rusticidad, capacidad de aprovechar forrajes capacidad de aprovechar forrajes tropicales, resistencia a endo y ecto tropicales, resistencia a endo y ecto parásitosparásitos
En Yucatán, el mejoramiento En Yucatán, el mejoramiento genético se ha limitado a la genético se ha limitado a la importación de germoplasma.importación de germoplasma.
BrahmanBrahman importante evaluar, identificar importante evaluar, identificar
mejores individuos a seleccionar.mejores individuos a seleccionar. Objetivo del sistema de Objetivo del sistema de
producción carne, mejorar los producción carne, mejorar los caracteres de crecimiento. caracteres de crecimiento.
Selección
Efectos MaternosEfectos Maternos Efectos Aditivos Directos
Efectos ambientales
Medio Ambiente
ram
A AAM
Sexo
Época de Nacimiento
Año de Nacimiento
Fuentes de VariaciónFuentes de Variación
Efectos Fijos
ObjetivosObjetivos Describir la estructura de los datos Describir la estructura de los datos
utilizados.utilizados. Estimar componentes de (co)varianzaEstimar componentes de (co)varianza Parámetros genéticosParámetros genéticos
Heredabilidad directa (hHeredabilidad directa (h22d d ))
Heredabilidad Materna (hHeredabilidad Materna (h22m m ))
Correlación entre ambas (rCorrelación entre ambas (rdmdm))
Para Características de crecimiento Para Características de crecimiento predestetepredestete Peso al nacimineto (PN)Peso al nacimineto (PN) Peso ajustado a 205 días (PA205).Peso ajustado a 205 días (PA205). Ganancias de peso predestete (GDP).Ganancias de peso predestete (GDP).
La meta de todo programa de La meta de todo programa de mejoramiento genético es mejoramiento genético es generar una evaluación precisa y generar una evaluación precisa y confiable.confiable.
Materiales y MétodosMateriales y Métodos
Descripción de la UnidadDescripción de la Unidad
Rancho ubicado en la zona oriente del Rancho ubicado en la zona oriente del Estado.Estado.
Cría de ganado Brahman de registro.Cría de ganado Brahman de registro. Destete 8 meses.Destete 8 meses. Suplementación en secas.Suplementación en secas. Reproducción por IA y monta Reproducción por IA y monta
controladacontrolada Semen y toros importados de TEXAS Semen y toros importados de TEXAS
(EUA) o descendientes de los mismos.(EUA) o descendientes de los mismos.
Recopilación de datos
1875 becerros nacidos entre 1981 y 2003.1875 becerros nacidos entre 1981 y 2003. Tarjetas individuales de 573 vacas.Tarjetas individuales de 573 vacas. 75 sementales. 75 sementales. Base de datos.Base de datos. Datos desbalanceadosDatos desbalanceados
Indicadores de crecimiento Indicadores de crecimiento evaluadosevaluados
Peso al NacimientoPeso al Nacimiento ( (PNPN)) 18751875
Peso Ajustado a 205 díasPeso Ajustado a 205 días ( (PA205PA205)) 11605605
Ganancias de peso predestete Ganancias de peso predestete ((GDPGDP)) 11606055
No. observaciones
Peso al NacimientoPeso al Nacimiento
0
50
100
150
200
250
300
Fre
cuen
cia
23 26 29 32 35 38 41 44Peso al Nacimiento en Kilogramos
Peso Ajustado a 205 díasPeso Ajustado a 205 días
0
20
40
60
80
100
120
140
160
Fre
cuen
cia
119 134 149 164 179 194 209 224 239 254
Peso Ajustado a 205 días en Kilogramos
Ganancias Diarias de Ganancias Diarias de PesoPeso
0
20
40
60
80
100
120
140
Fre
cuen
cia
390 470 550 630 710 790 870 950 1030
Ganancias Diarias de Peso en Gramos
Análisis estadísticoAnálisis estadístico
Grupo contemporáneo de nacimientoGrupo contemporáneo de nacimiento (año-época-sexo).(año-época-sexo).
Año de Nacimiento (AN):Año de Nacimiento (AN): De De 1981981 al 1 al 20020033..
Época de parto (EP) o nacimiento (EN): Época de parto (EP) o nacimiento (EN): Época 1: Secas (Febrero a Mayo).Época 1: Secas (Febrero a Mayo). Época 2: Lluvias (Junio a Septiembre).Época 2: Lluvias (Junio a Septiembre). Época 3: Nortes (Octubre a Enero).Época 3: Nortes (Octubre a Enero).
Sexo del becerro (Sexo del becerro (macho o hembramacho o hembra).). Número de Parto (NP):Número de Parto (NP): 1, 2, 3, 4, 5, 1, 2, 3, 4, 5, ≥6≥6
Efectos fijos:
Distribución de Sementales Distribución de Sementales por Añopor Año
0
5
10
15
20
25
No.
de
Sem
enta
les
2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
Años de Nacimiento
Para Peso al Nacimiento
Distribución de Sementales Distribución de Sementales por Año por Año
0
2
4
6
8
10
12
14
16
18
20
No.
de
Sem
enta
les
2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
Años de Nacimiento
Para Peso Ajustado a 205 días y Ganancias de Peso Predestete.
ID Semental 1987 1988 1989 1990 1991 1992 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 No. Crias1 40 10 24 5 10 1 902 28 13 21 14 10 7 933 6 1 1 84 2 7 4 9 225 3 1 3 4 116 14 5 18 4 417 9 8 9 1 278 4 17 4 259 3 14 19 3610 1 7 11 1911 4 412 2 213 2 214 28 3 3 3415 8 816 6 617 5 518 2 219 3 35 17 5520 4 421 1 3 422 1 3 423 3 4 724 7 725 3 5 2 1026 1 1 2 427 7 1 828 2 229 1 1 230 2 231 4 432 3 333 4 2 634 1 11 3 1535 6 1 736 1 1 237 8 838 1 2 1 439 8 1 6 1 1640 1 3 12 31 44 20 34 14 5 16441 4 1 542 3 20 6 3 3243 2 5 15 3 1 2644 4 8 4 8 2445 4 7 1146 2 9 16 26 4 5747 3 2 548 10 24 3449 5 10 8 2350 5 27 22 33 17 10451 5 4 6 5 2052 9 5 22 41 12 8953 3 26 43 18 9054 10 29 17 5655 5 556 1 11 6 1857 3 1 458 1 10 1159 1 8 4 5 1860 4 5 2 1161 1 3 462 5 6 10 12 3363 2 5 12 26 22 6764 1 1 8 3 3 3 2 2165 3 1 466 30 7 25 6267 4 1 568 1 14 1 9 8 3 3669 1 1 3 2 17 24 4 5270 1 7 12 15 11 13 10 17 8671 13 9 2272 7 2 9
AÑOS DE NACIMIENTO
Distribución de Sementales Distribución de Sementales por GCpor GC
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
No
. d
e S
em
en
tale
s
1 5 9 13 17 21 25 29 33 37
No. de Grupos contemporáneos
Peso al Nacimiento
Análisis estadísticoAnálisis estadístico
Efectos aditivos directos (Efectos aditivos directos (aa)) Efectos aditivos maternos (Efectos aditivos maternos (mm)) Efectos ambientales permanentes (Efectos ambientales permanentes (pepe)) Error aleatorio (Error aleatorio (ee)) Modelo Animal Univariado.Modelo Animal Univariado. Máxima Verosimilitud Restringida Libre de Máxima Verosimilitud Restringida Libre de
Derivadas (Derivadas (DF-REMLDF-REML) () (Meyer, 1998Meyer, 1998). ).
Efectos aleatorios:
y = Xβ + Zy = Xβ + Z11a a + Z+ Z22mm + Z + Z33pepe + + eeDonde:Donde: yy = Vector que contiene las variables de respuesta. = Vector que contiene las variables de respuesta. XX = Matriz de incidencia relaciona las observaciones con los = Matriz de incidencia relaciona las observaciones con los
efectos fijos. efectos fijos. ββ = Vector que contiene los efectos fijos. = Vector que contiene los efectos fijos. ZZ11 = Matriz de incidencia relaciona observaciones con los efectos = Matriz de incidencia relaciona observaciones con los efectos
genéticos directos de cada animal. genéticos directos de cada animal. aa = Vector que contiene los efectos genéticos aditivos aleatorios.= Vector que contiene los efectos genéticos aditivos aleatorios. ZZ22 = Matriz de incidencia relaciona observaciones con los efectos = Matriz de incidencia relaciona observaciones con los efectos
genéticos aditivos maternos de cada animal.genéticos aditivos maternos de cada animal. mm = Vector que contiene efectos genéticos aditivos maternos . = Vector que contiene efectos genéticos aditivos maternos . ZZ33 = = Matriz de incidencia del efecto ambiental permanente de la Matriz de incidencia del efecto ambiental permanente de la
madre.madre. pe pe = Vector de efectos aleatorios efecto ambiental permanente = Vector de efectos aleatorios efecto ambiental permanente
de la madre.de la madre. ee = Vector de efectos residuales aleatorios. = Vector de efectos residuales aleatorios.
Modelo
ResultadosResultados
Indicadores de Crecimiento Indicadores de Crecimiento
PN(Kg)
PA205(Kg)
GDP(Gr)
Media Media 32.7032.70 179.99179.99 717.56717.56
Desviación Desviación estándarestándar
3.77 25.76 121.85
PN = Peso al Nacimiento; PA205 = Peso Ajustado a 205 días; GDP = Ganancias de Peso Predestete.
Componentes de Componentes de (Co)Varianza(Co)Varianza
VariablVariablee
σσ22dd σσ22
mm σσdmdm σσ22cc σσ22
ee σσ22pp
PNPN 5.485.48 0.350.35 0.290.29 0.230.23 8.028.02 14.3714.37
PA205PA205 361.8361.866
100.0100.044
-36.94-36.94 0.000.00 239.0239.055
664.0664.011
GDPGDP 8377.8377.9696
1209.1209.6767
--128.4128.4
330.060.06 5389.5389.
92921489914899
.13.13
σ2d= Varianza aditiva directa,σ2
m= Varianza aditiva materna,σdm= Covarianza directa-materna,,σ2c= Varianza ambiental permanente,
σ2e= Varianza del error,σ2
p= Varianza fenotípica PN= Peso Nacimiento, PA205= Peso ajustado a 205 días de edad, GDP= Ganancias de
peso predestete
Parámetros genéticosParámetros genéticos
VariablVariablee
hh22dd hh22
mm hh22tt rrdmdm cc22 ee22
PNPN 0.380.38 0.020.02 0.420.42 0.210.21 0.020.02 0.560.56
PA205PA205 0.540.54 0.150.15 0.540.54 -0.19-0.19 0.000.00 0.360.36
GDPGDP 0.560.56 0.080.08 0.590.59 -0.04-0.04 0.000.00 0.360.36
h2d= Heredabilidad directa; h2
m= Heredabilidad materna; h2t = Heredabilidad
total = [σ2d + 0.5 σ2
m + 1.5 σdm / σ2p ]; c2 = Efecto ambiental permanente; e2 =
Error.
ConclusionesConclusiones
La amplia variabilidad para efectos La amplia variabilidad para efectos aditivos directos en las tres aditivos directos en las tres características evaluadas y para efectos características evaluadas y para efectos maternos en PA205, sugiere una maternos en PA205, sugiere una probable mejora a través de selección probable mejora a través de selección en la población evaluada. Sin embargo, en la población evaluada. Sin embargo, se debe de considerar la importancia se debe de considerar la importancia que tienen los efectos maternos sobre que tienen los efectos maternos sobre la respuesta esperada de la progenie.la respuesta esperada de la progenie.
Aportación al TallerAportación al Taller
¿ Que estrategias se podrían realizar ¿ Que estrategias se podrían realizar en las bases de datos de campo para en las bases de datos de campo para mejorar la precisión de las mejorar la precisión de las evaluaciones genéticas en Yucatán y evaluaciones genéticas en Yucatán y en el Trópico ?en el Trópico ?
Gracias por su Gracias por su atenciónatención