rangkuman paper datmin
DESCRIPTION
Rangkuman dari Paper Data MiningTRANSCRIPT
VERA RUSMALAWATI
135150201111194
DATA MINING / INFORMATIKA – C
Judul : Application of Data Mining In Bioinformatics
Kategori : Data Mining, Bioinformatics, Protein Sequence Analysis, Bioinformatics tools
Tujuan :
- Menjelaskan konsep dasar dari Bioinformatika dan data mining
- Menjelaskan penerapan data mining dalam Bioinformatika, serta penjelasan tentang
tantangan tantangan dan peluang pengembangan penggunaan data moning dalam
Bioinformatika
Data :
Bioinformatika memiliki set data biologi yang sangat besar, yang semuanya ditafsirkan
menggunakan teknologi informasi dan ilmu komputer. Contoh dari jenis analisis set data
biologi tersebut meliputi prediksi struktur protein, klasifikasi gen, klasifikasi kanker
berdasarkan data microarray, pengelompokan data ekspresi gen, pemodelan statistik
interaksi protein-protein, dll.
Hasil :
Aplikasi data mining untuk bioinformatika termasuk adalah finding gen, deteksi fungsi
domain protein, diagnosis penyakit, optimasi pengobatan penyakit. Contohnya adalah
teknologi microarray digunakan untuk memprediksi hasil pasien. Atas dasar genotype pasien
dalam data microarray, waktu kelangsungan dan resiko metastasis tumor atau kambuhnya
penyakit dapat diperkirakan.
Pendekatan data mining tampaknya ideal dan cocok untuk bioinformatika, karena
bioinformatika kaya data tetapi tidak memiliki teori yang komprehensif tentang organisasi
hidup di tingkat molekuler. Namun data mining dalam bioinformatika terhambat oleh
banyaknya aspek dari database biologi, termasuk ukuran, jumlah data, keragaman dan
kurangnya ontology standar untuk membantu penentuan query. Serta kualitas dan asal data
yang heterogen. Masalah yang lain adalah adanya berbagai macam tingkat domain dari
pengguna data sehingga menjadi sulit untuk penentuan mekanisme akses database yang tepat
untuk semua. Selain itu integrtas dari database biologis juga menjadi kendala, karena
perkembangannya yang sangat cepat, penting untuk memeriksa apakah penelitian biologi
tersebut penting. Sehingga sangat penting untuk menentukan bagian yang penting untuk
dilakukan penelitian dan mengembangkan metode data mining untuk analisis yang efektif
dan terukur.